代谢途径延伸策略为生物标记物的鉴定提供新思路
随着精准医学等概念的提出,代谢组学技术在生物标记物的发现及相关疾病的诊断、治疗和预后等环节中的重要作用日益彰显。尽管分析仪器的发展极大推动了生物标记物的测定,目前代谢物的首要鉴定手段仍依赖于将样品中所获得的一级、二级信息与在线数据库如HMDB、METLIN中所含标准品的信息进行比对。然而,数据库仅能满足生物样品中约30%化合物的鉴定;如何对数据库中不包含的生物标记物进行快速、可靠的鉴定俨然成为制约代谢组学发展的瓶颈。 近日,中国药科大学郝海平教授团队建立了一种不依赖于数据库搜索的新策略——“代谢途径延伸策略”能够高效地解决生物标记物鉴定困难的问题。该策略基于一个“亚代谢组”的核心概念,即全代谢组是由数量有限的核心代谢物(如葡萄糖、脂肪酸、胆汁酸等)通过各种代谢反应(氧化、脱羧、甲基化等)衍生而成的亚代谢组构成;理论上,亚代谢组能够通过确定的核心物质和代谢反应桥连为网络。从核心化合物的结构出发,通过代谢反应的延伸能够推导整个......阅读全文
代谢途径延伸策略为生物标记物的鉴定提供新思路
随着精准医学等概念的提出,代谢组学技术在生物标记物的发现及相关疾病的诊断、治疗和预后等环节中的重要作用日益彰显。尽管分析仪器的发展极大推动了生物标记物的测定,目前代谢物的首要鉴定手段仍依赖于将样品中所获得的一级、二级信息与在线数据库如HMDB、METLIN中所含标准品的信息进行比对。然而,数据库
新型癌症生物标记物
近日,复旦大学的研究人员称,他们已证实IgG半乳糖基化(galactosylation)分布是多种癌症类型中用于癌症筛查的一个有前景的生物标记物。这一研究成果发布在7月1日的Cell Research杂志上。复旦大学的顾建新(Jian-Xin Gu)教授是这篇论文的通讯作者。顾教授的主要科研
什么是代谢途径?代谢途径的过程
习惯上把这种连续的化学反应叫作代谢途径。如酵解途径,三羧酸循环途径,戊糖磷酸途径,糖原合成途径,糖异生途径,脂肪酸合成途径等。中间代谢也称为细胞内代谢。在中间代谢过程中,机体借助于各种反应从营养素或消化产物中获得能量,以及机体构成所需要的“原材料”。整个中间代谢可以划分为两个过程,即分解代谢和合成代
生物体代谢途径主要特征
概括生物体代谢途径的重要特征为(1)由代谢的中间体产生许多分支,从而构成了复杂的代谢网;(2)正反应(A→X)与逆反应(X→A)的途径往往是不同的,因此防止达到单纯的平衡状态;(3)在代谢途径的一些中间过程有各种代谢调节作用。把代谢途径以线路图案形式来表示就是代谢图(metabolic map)。
γ氨酪酸的微生物代谢途径
在微生物中,GABA代谢是通过GABA支路完成的,利用微生物体内较高的GAD活性,将Glu脱羧形成 GABA,然后在GABA-T、SSADH作用下,GABA进入下游的分解过程生成琥珀酸半醛、琥珀酸参与微生物的生理代谢。微生物富集GABA就是通过对培养基的优化以及菌株的改良使其具有较高的GAD活性
肿瘤生物标记物的定义
目前,如何定义肿瘤生物标记物尚存在争议,美国国家癌症研究所(NCI)将生物标记物定义为“在血液、其他体液或组织中发现的生物分子,该分子能够作为异常过程或疾病的征兆,生物标记物还可以用于判断机体对于治疗的应答。生物标记物或被称为分子标志物或分子标记”。 [21] 我们可以认为,肿瘤生物标记物是能够
生物标记物:识别肿瘤侵袭
早期结肠癌患者将来可以从特定额基因测试中获益,并帮助他们在化疗方面做出正确的决定。其中两种生物标记物是MACC1基因,高水平促进肿瘤的生长和肿瘤的转移,以及一种有缺陷的DNA不匹配修复(dMMR)系统,它在肿瘤的形成中起着重要的作用。患有dMMR肿瘤和低MACC1基因活性的患者的预期寿命更长。
概述肿瘤生物标记物的作用
肿瘤生物标记物的作用贯串整个肿瘤诊疗过程,从肿瘤风险预测、诊断到治疗方案选择和疗效预测都离不开它。更重要的是,肿瘤生物标记物的发现和应用,使得靶向治疗和免疫治疗成为可能并有效改善疗效。 (1) 肿瘤风险预测 目前已经发现一些可用于预测肿瘤高危的生物标记物,例如BRCA1/2基因突变阳性的患者
利用代谢组学发现中医黄疸病证候的关键生物标记物
国际蛋白质组学领域权威杂志《Molecular & Cellular Proteomics》(5-Year IF:9.392)2012年第8期发表了黑龙江中医药大学中药血清药物化学国家中医药管理局重点研究室王喜军课题组利用代谢组学全面解析中医黄疸证的研究论文《尿液代谢组学分析黄疸证的关键生物
代谢组生物标记物与肾功能下降及高尿酸发病风险的关系
最近,国际临床医学研究期刊《美国肾脏病学会临床杂志》(Clinical Journal of the American Society of Nephrology)和《关节炎护理与研究》(Arthritis Care & Research)先后发表了中国科学院上海营养与健康研究所林旭研究组和中科
胆绿素的代谢途径
血红素氧合酶(Heme Oxygenase,HO)是血红素降解的限速酶,能将血红素转变为胆绿素,CO和铁,胆绿素随即被还原为胆红素,己知HO有3种同工酶,HO-1,HO-2,HO-3。HO-2和HO-3呈组成型大量表达,它们可能为正常细胞内的血红素结合而分别发挥其功能。而HO-1属诱导型,广泛分布于
什么是代谢途径?
代谢中的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的,而且许多酶连续地按顺序地起作用,形成多酶体系,使第一个酶促反应产物变成第二个酶促反应的底物,依此类推。
糖的代谢途径
在人体内,葡萄糖代谢除了无氧酵解途径以外还有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途径、糖原的合成与分解途径、糖异生、糖醛酸途径等。 (一)糖的有氧氧化途径: 1.概念:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成水和二氧化碳的过程 2.过程 有氧氧化可分为两个阶段: 第一阶段:胞液反应阶段:从葡萄糖到丙酮酸,反
糖的代谢途径
在人体内,葡萄糖代谢除了无氧酵解途径以外还有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途径、糖原的合成与分解途径、糖异生、糖醛酸途径等。 (一)糖的有氧氧化途径: 1.概念:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成水和二氧化碳的过程 2.过程 有氧氧化可分为两个阶段: 第一阶段:胞液反应阶段:从葡萄糖到丙酮
人体脂肪代谢途径
人体脂肪代谢途径:人体代谢最终也是通过生成脂肪酶的方式,将脂肪分解为脂肪酸,后者β氧化为乙酰辅酶A,再经过呼吸作用,生物降解为代谢废物(二氧化碳和水)排出。胆固醇等脂质小分子具有重要的生物学功能,但过量的胆固醇会引起动脉粥样硬化,进而导致冠心病和脑中风等一系列严重疾病。因此,体内脂质水平必须受到严密
糖的代谢途径
在人体内,葡萄糖代谢除了无氧酵解途径以外还有很多其他方式,比如有氧氧化、磷酸戊糖途径、糖原的合成与分解途径、糖异生、糖醛酸途径等。(一)糖的有氧氧化途径:1.概念:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成水和二氧化碳的过程2.过程有氧氧化可分为两个阶段:第一阶段:胞液反应阶段:从葡萄糖到丙酮酸,反应过程同糖酵解
苏氨酸代谢途径
苏氨酸在机体内的代谢途径和其他氨基酸不同,是唯一不经过脱氢酶作用和转氨基作用,而是通过苏氨酸脱水酶(TDH)和苏氨酸脱酶(TDG)以及醛缩酶催化而转变为其他物质的氨基酸。途径主要有3条:通过醛缩酶代谢为甘氨酸和乙醛;通过TDG代谢为氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通过TDH代谢为丙酸和α-氨基丁酸。
代谢途径的特征
概括生物体代谢途径的重要特征为(1)由代谢的中间体产生许多分支,从而构成了复杂的代谢网;(2)正反应(A→X)与逆反应(X→A)的途径往往是不同的,因此防止达到单纯的平衡状态;(3)在代谢途径的一些中间过程有各种代谢调节作用。把代谢途径以线路图案形式来表示就是代谢图(metabolic map)。上
戊糖的代谢途径
磷酸戊糖途径,是糖有氧氧化的重要支路。它提供生物合成所需要的NADPH,为核酸代谢提供戊糖,并通过酵解的中间产物为生物提供能量。磷酸戊糖途径可划分为先后两个阶段,氧化为第一阶段,从葡萄糖开始通过脱氢和脱羧作用生成磷酸戊糖;非氧化为第二阶段,磷酸戊糖经过酶的转换和缩合作用(分子重排)又形成六碳糖和三碳
生物大分子药物代谢消除途径及体外代谢研究方法进展
摘要由于理化及生物学性质的差异,生物大分子药物与传统小分子药物相比,药代动力学机制更加复杂,在体内表现出不同的吸收、分布、代谢、排泄过程。大分子药物一般不经CYP 450 酶代谢,其体内消除途径主要有肾小球滤过、酶水解、受体介导的胞吞消除和抗药物抗体介导的消除。近年来,除了常用的免疫分析法、放射性同
指甲代谢标记物或可预测阿尔茨海默病
12月6日,记者从重庆医科大学附属第一医院获悉,该院老年医学科副主任吕洋教授团队近日在国际知名期刊《先进研究杂志》上发布最新研究成果。该研究显示,指甲代谢标记物或可早期诊断并预测阿尔茨海默病,这为未来诊断和预测阿尔茨海默病提供了新方法。 阿尔茨海默病是一种进行性发展的、以记忆障碍为主要表现的神
关于γ氨基丁酸的微生物代谢途径介绍
在微生物中,GABA代谢是通过GABA支路完成的,利用微生物体内较高的GAD活性,将Glu脱羧形成 GABA,然后在GABA-T、SSADH作用下,GABA进入下游的分解过程生成琥珀酸半醛、琥珀酸参与微生物的生理代谢。微生物富集GABA就是通过对培养基的优化以及菌株的改良使其具有较高的GAD活性
概述胆绿素的代谢途径
血红素氧合酶(Heme Oxygenase,HO)是血红素降解的限速酶,能将血红素转变为胆绿素,CO和铁,胆绿素随即被还原为胆红素,己知HO有3种同工酶,HO-1,HO-2,HO-3。HO-2和HO-3呈组成型大量表达,它们可能为正常细胞内的血红素结合而分别发挥其功能。而HO-1属诱导型,广泛分
脂蛋白代谢的途径
外源性代谢途径指饮食摄入的胆固醇和甘油三酯在小肠中合成CM及其代谢过程;内源性代谢途径由肝脏合成VLDL,后者转变为IDL和LDL,LDL被肝脏或其他器官代谢的过程。胆固醇逆转运途径:即HDL的代谢。血浆中的脂质和载脂蛋白一起构成各种脂蛋白颗粒,颗粒中的脂质和蛋白质处在经常不断的交换变化之中,来完成
甘露糖的代谢途径
甘露糖在人体内不能很好的代谢。所以,口服后甘露糖进入糖类代谢过程并不明显,即使从外部进入的g甘露糖,都会被身体内的组织发觉。哺乳动物内使用放射性标记物发现, 摄入的甘露糖90%都会在30-60分钟内原封不动地通过尿道排出体外。残余部分中 99%含量会在未来8小时内排出。这个过程中,血糖浓度不会显著升
脂蛋白的代谢途径
外源性代谢途径指饮食摄入的胆固醇和甘油三酯在小肠中合成CM及其代谢过程;内源性代谢途径由肝脏合成VLDL,后者转变为IDL和LDL,LDL被肝脏或其他器官代谢的过程。胆固醇逆转运途径:即HDL的代谢。血浆中的脂质和载脂蛋白一起构成各种脂蛋白颗粒,颗粒中的脂质和蛋白质处在经常不断的交换变化之中,来完成
瓜氨酸的代谢途径
精氨酸会被氧化为N-羟基-精氨酸,再行氧化成瓜氨酸并释出一氧化氮。
代谢途径的原理简介
习惯上把这种连续的化学反应叫作代谢途径。如酵解途径,三羧酸循环途径,戊糖磷酸途径,糖原合成途径,糖异生途径,脂肪酸合成途径等。 中间代谢也称为细胞内代谢。在中间代谢过程中,机体借助于各种反应从营养素或消化产物中获得能量,以及机体构成所需要的“原材料”。整个中间代谢可以划分为两个过程,即分解代谢
苏氨酸的代谢途径
苏氨酸在机体内的代谢途径和其他氨基酸不同,是唯一不经过脱氢酶作用和转氨基作用,而是通过苏氨酸脱水酶(TDH)和苏氨酸脱酶(TDG)以及醛缩酶催化而转变为其他物质的氨基酸。途径主要有3条:通过醛缩酶代谢为甘氨酸和乙醛;通过TDG代谢为氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通过TDH代谢为丙酸和α-氨基丁酸
苏氨酸的代谢途径
苏氨酸在机体内的代谢途径和其他氨基酸不同,是唯一不经过脱氢酶作用和转氨基作用,而是通过苏氨酸脱水酶(TDH)和苏氨酸脱酶(TDG)以及醛缩酶催化而转变为其他物质的氨基酸。途径主要有3条:通过醛缩酶代谢为甘氨酸和乙醛;通过TDG代谢为氨基丙酸、甘氨酸、乙酰COA;通过TDH代谢为丙酸和α-氨基丁酸 。