234岁的树却出奇的拥有一个年轻的基因组
瑞士洛桑大学校园里有一颗古老的橡树已经矗立在那里234年了,当1800年拿破仑的军队经过这座城市的时候,它还只是一颗小树,现在已经成长为参天大树,并且也变成了这座城市的地标。洛桑大学的研究人员采集了树木不同分支的样本进行基因组测序,然而让他们没有想到的是,这颗橡树的基因组依然“年轻”,在经过234年之后出现的突变不多,基因组保持着稳定。 这一研究发现公布在6月13日的生物学预印网站BioRxiv上。BioRxiv上的成果并没有经过同行评审,这一网站的目的是加速研究传播,并在科学家的论文正式开始同行评议前,使其获得论文反馈的机会。 每次细胞分裂时,由于复制基因组可能会发生错误,就会产生突变。动物通过在发育早期分离这些突变来保护其生殖细胞,以免出错。之后这些细胞(包含生殖系突变germline mutation)会遵循不同的发育途径,通常具有较低的细胞分裂率。 但是植物并不是这样,它们的干细胞不仅生成花的繁殖部分,而且也会......阅读全文
作物基因组单碱基编辑方法研究取得进展
单核苷酸点突变是作物许多重要农艺性状发生变异的遗传基础。单碱基的变异会导致氨基酸替换或蛋白质翻译终止,使基因功能发生改变,从而有可能产生优良的等位基因与优异性状。传统诱变及单碱基突变筛选技术(如TILLING)需要进行基因组规模的筛选,耗时、耗力且鉴定到的点突变数目和种类有限。基因组编辑技术,特
遗传发育所在作物基因组单碱基编辑方法研究中取得进展
单核苷酸点突变是作物许多重要农艺性状发生变异的遗传基础。单碱基的变异会导致氨基酸替换或蛋白质翻译终止,使基因功能发生改变,从而有可能产生优良的等位基因与优异性状。传统诱变及单碱基突变筛选技术(如TILLING)需要进行基因组规模的筛选,耗时、耗力且鉴定到的点突变数目和种类有限。基因组编辑技术,特
方兴未艾:单碱基基因编辑技术
近一年多来,全世界范围内多个实验室围绕“单碱基基因编辑技术”发表了大量的研究成果,而我国科学在此领域也取得了一系列重要进展。特别是近日,来自中山大学松阳洲和黄军就实验室在Protein & Cell杂志上发表了题为“Effective gene editing by high-fidelity
利用单碱基编辑器实现多位点单碱基编辑DMD及HGPS猪模型
6月28日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组在国际学术期刊Nature Communications(《自然-通讯》)发表了题为Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors
新方法对人类基因组进行有效地单碱基编辑
近日,来自格莱斯顿研究院的研究团队开发了一项新技术,可以对人类基因组进行单碱基编辑。这不仅增强了目前在干细胞中模拟疾病的能力,也为基因治疗新途径提供了基础。 相关研究论文发表在《自然方法学》(Nature Methods)上。其中提出如何有效并且精确地捕获罕见致病突变,以及如何修
CRISPR技术再升级——单碱基的精准编辑
CRISPR/Cas9基因组编辑系统来源于简单的细菌免疫系统组分,经过改造后可在真核细胞中实现高度灵活且特异的基因组编辑。该系统是单RNA(single-guide RNA, sgRNA) 介导的核酸酶系统,通过靶点特异的CRISPR RNA (crRNA)序列与靶序列进行碱基配对从而引导Cas
HIV基因组的碱基数约有多少
HIV基因组为两条相同的RNA单链,每条单链含有9749核酸,由结构基因和调节基因等组成。结构基因有3个:(1)gag基因(群抗原基因)、编码核心蛋白p24.(2)pol基因(多聚酶基因)、编码核心多聚酶医|学教育网搜集整理。(3)env基因(外膜蛋白基因)、编码外膜蛋白gp120和gp41.结构基
基因检测新突破:-单碱基突变检测
DNA序列中稍有变异就会对身体产生深远的影响。现代基因组学研究已经表明,只要一个突变就占领了决定是否成功治愈一种疾病还是使该病猖獗地蔓延到全身各部位的制高点。 研究人员通过一种新的方法检测特定DNA片段,找出单一突变位点,从而帮助疾病(如癌症、肺结核)的诊断和治疗。DNA序列中这
单碱基基因编辑技术之工具篇
今年5月,David R. Liu教授与张锋教授等人联合创立Beam Therapeutics公司,再一次将“单碱基编辑技术”送上了热搜榜,趁着热度还未散去,我们继上一期“单碱基编辑技术浅谈”后,又为大家准备了一篇超级实用性的深度分析,带你一起看看单碱基编辑的前世今生及如何一步步发展壮大的历程!
单碱基基因编辑技术之工具篇
前言 今年5月,David R. Liu教授与张锋教授等人联合创立Beam Therapeutics公司,再一次将“单碱基编辑技术”送上了热搜榜,趁着热度还未散去,我们继上一期“单碱基编辑技术浅谈”后,又为大家准备了一篇超级实用性的深度分析,带你一起看看单碱基编辑的前世今生及如何一步步发展
“Helicase-AID”实现多位点单碱基突变
近日,大连理工大学、中科院天津工业生物技术研究所研究团队在《Metabolic Engineering》上发表题为“Helicase-AID: A novel molecular device for base editing at randomgenomic loci”的研究论文,将DNA解旋
单碱基基因编辑技术之工具篇
前言今年5月,David R. Liu教授与张锋教授等人联合创立Beam Therapeutics公司,再一次将“单碱基编辑技术”送上了热搜榜,趁着热度还未散去,我们继上一期“单碱基编辑技术浅谈”后,又为大家准备了一篇超级实用性的深度分析,带你一起看看单碱基编辑的前世今生及如何一步步发展壮大的历程!
单碱基基因编辑研究进展速览
本文中,小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展,分享给大家! 【1】Nat Commun:科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑 doi:10.1038/s41467-019-10421-8 近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪
植物所等破译构树基因组
构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开
单碱基编辑首次应用于非人灵长类模型
5月20日美国遗传学家团队近日首次在非人灵长类模型中,实现了对一种名为PCSK9基因剪接位点的高效精准编辑。这一成功意味着,只需单次注射,便可持久抑制肝脏中PCSK9基因的表达,其为心血管疾病的预防提供了全新的思路,并极大地推动了单碱基编辑技术的临床转化应用。研究报告19日公开于英国《自然》杂
天津工生所实现单窗口碱基编辑
碱基编辑器主要有3种类型:胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor, CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor, ABE)和糖基化酶碱基编辑器(Glycosylase base editor,GBE),它们在不需要DNA双链断裂和编辑模板的情况下可分别
世界首次证实单碱基基因编辑存在脱靶效应
基因编辑技术越来越火,然而针对基因编辑工具最大的风险——脱靶效应,一直以来缺乏良好的检测工具。记者从中科院神经科学研究所获悉,其团队与多家机构合作完成的研究,建立了一种在精度、广度和准确性上远超越之前的基因编辑脱靶检测技术,这一技术首次证实:近年来兴起的单碱基编辑技术有可能导致大量无法预测的脱靶
单碱基基因编辑系统,基因治疗又一利器
TaC9-ABE单碱基编辑技术原理。黄博纯 供图近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学与五邑大学副教授邹庆剑团队合作首次将腺苷脱氨酶与转录激活因子样效应子(TALE)融合,开发了一种不会产生Cas9依赖性脱靶的新型碱基编辑系统TaC9-ABE。相关研究3月24日在线发表于《细胞发现》(
科学家开发新型RNA单碱基编辑工具AMBER
中国科学院上海药物研究所研究员郝沛团队和中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员李轩团队合作,开发了一种新型RNA单碱基(C>U)编辑工具AMBER,并在细胞和小鼠动物模型体内实现对多个靶标基因RNA转录本的精准编辑,为基于RNA编辑的遗传病治疗策略开拓了新技术路径,同时进一步丰富了RNA编辑工具库
人分裂期胚胎介导高效的单碱基编辑研究获进展
5月23日,Genome Biology 发表了一篇题为《人分裂期胚胎介导高效的单碱基编辑》的研究论文,该研究由中国科学院神经科学研究所(中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室、中国科学院灵长类神经生物学重点实验室杨辉研究组与上海交通大学仁济医
从全基因组水平构建鸟类物种生命树
近日,“第一届万种鸟类基因组(B10K)项目国际研讨会——鸟类复杂性状的进化解析与调控”在北京召开。会议由中国科学院昆明动物研究所主办,中国科学院动物研究所协办。会议组织委员会主席由昆明动物所特聘讲座研究员张国捷和动物所研究员雷富民担任。 据悉,由中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所
草莓和可可树基因组图谱出炉
据美国物理学家组织网12月26日报道,在26日出版的《自然—遗传学》杂志上,两组科学家表示,他们分别解开了野生草莓和克里奥洛可可树的基因密码,新发现有助于育种专家培育出品质更高的草莓和可可树品种。 英国生物工艺学和生物学研究委员会(BBSRC)和其他4个国家的70名研究人员绘制出了野生草莓
中国科学家成功破译树鼩基因组
2013年2月6日,中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树进行了全基因组测序,并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。树基因组的完成,将为其在生物医学研究中用作动物模型奠定重要的遗传学基础,进而使其更好的应用于生物医药研究。研究成果在《自然•通讯》(Nature Communi
基因编辑大牛Nature子刊发文:CRISPR单碱基编辑准确!
来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature
单头昆虫基因组DNA的提取
实验概要一种简单快速提取单头小型昆虫基因组DNA的方法。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2EDT
新培育:单碱基突变的遗传性疾病动物模型
近日吉林大学动物医学学院赖良学团队利用新型单碱基编辑系统成功对家兔实现单碱基精确突变,培育出具有白化病、早衰症等遗传性疾病模型兔,这代表人类距离基因治疗时代更近一步。 团队成员、吉林大学动物医学学院博士李占军介绍,白化病、早衰症等遗传性疾病都是由于基因组发生单碱基突变所致。由于遗传性疾病产生的
我国科学家开发更高精度的单碱基基因编辑工具
单碱基编辑技术是一种是自2012年CRISPR/Cas9技术被发现以来最寄予厚望的高精度基因编辑技术,其中一种单碱基编辑技术BE3可以在不切断DNA双链的情况下精确地引入由C/G到T/A的点突变,另外一项单碱基编辑技术ABE7.10可以由T/A突变成C/G的技术,对于基因突变导致的遗传疾病的治疗
基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术
通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编
叶面积仪对柿树单叶面积测定
果树的光合作用离不开叶片的应用,叶面积系数显得更加的重要。但是对于柿树叶面积的测 定却还是一项空白,另外利用相关回归法测果树叶面积时,也仅仅是以一个自变量(如叶长、或叶宽、或长宽乘积值)的简单线性回归来进行估测,利用多元线性回 归分析进行果树单叶面积的测定也未见有报道。为此,我们采用了多种方法测定柿
科学家绘制出橡胶树基因组草图
日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图,这将有助于培育更加高产的橡胶树,提高天然橡胶的产量。 日本理化学研究所日前发布一份公报说,该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序,绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因