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利用小分子极性光切割测定G四重折叠结构的构象

动物所利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构的构象 基因组中可以形成G-四重折叠结构的序列分布非常广泛,这些结构对诸如癌基因表达的影响使得其成为药物治疗的可能靶点。研究生理条件下基因组双链DNA中的G-四重折叠结构的结构对寻找和设计靶向药物具有非常重要的指导意义。目前的物理学和化学方法很难用于基因组双链DNA的样品测定。 中科院动物研究所谭铮研究组在研究G-四重折叠结构与化学小分子特异性识别时,建立了一种利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构构象的方法,可以在双链的单链核酸中解析出形成G-四重折叠结构的四条G-tract的5'-3'走向,从而了解整个G-quadruplex的结构类型。该方法还可以用于证明双链DNA中G-四重折叠结构的形成。 文章链接:Zheng KW, Zhang D, Zhang LX, Hao YH, Zhou X, Tan Z.......阅读全文

利用小分子极性光切割测定G-四重折叠结构的构象

动物所利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构的构象   基因组中可以形成G-四重折叠结构的序列分布非常广泛,这些结构对诸如癌基因表达的影响使得其成为药物治疗的可能靶点。研究生理条件下基因组双链DNA中的G-四重折叠结构的结构对寻找和设计靶向药物具有非常重要的指导意

空间构象揭示基因组的奥秘

  基因组测序项目为人们提供了丰富的信息,让人们可以解析基因表达的调控序列,研究不同基因序列对疾病的影响。不过除了基因组序列之外,还存在着一个关键元素,即基因组的空间构象。空间构象一直被视为基因表达的重要调控因素,在基因组中调控元件往往并不再目标基因附近,近年来科学家们开始借助新兴技术研究远距离染色

Nat Methods:利用光线按需定制基因组折叠

  你体内的每个细胞都有你的一个紧密缠绕并装入在细胞核中的基因组拷贝。由于每个基因组拷贝实际上是相同的,不同细胞类型及其生物学功能之间的差异可归结为基因组中哪些基因发生表达,基因的表达方式和时间。   科学家越来越了解基因组折叠在这一过程中所起的作用。线性基因序列被包装到细胞核中的方式决定了哪些

构象异构体的分子链构象

晶体中的高分子链构象晶体中的分子链构象有螺旋形构象、平面锯齿形构象等。1、两个原子或基团之间距离小于范德华半径之和时,将产生排斥作用。2、分子链在晶体中的构象,取决于分子链上所带基团的相互排斥或吸引作用的情况。3、有规立构高分子链在形成晶体时,在条件许可下总是尽量形成时能最低的构象形式。4、基本结构

Nature:基因组错误折叠或提供新的癌症研究思路

  近日,发表在Nature杂志上的一篇研究论文中,来自麻省总医院和博德研究所的科学家揭示了隐藏在癌症背后的一种新型生物学机制,文章中,通过对携带异柠檬酸脱氢酶基因(IDH)突变的脑瘤进行研究,研究者揭开了指导基因组自身折叠指令的罕见改变,这些指令改变可以靶向作用基因组的关键部分—绝缘子,绝缘子可

什么是构象?

构象(conformation),有机化学的一个重要概念。最简单的构象分析建立在乙烷分子上。最重要的构象分析则是建立在环己烷上的构象分析。

怎样判断极性还是非极性

两个原子相同则为非极性分子。不同为极性分子或非极性分子,主要看空间构型是否对称。对称为非极性分子,不对称为极性分子。CS2对称为非极性分子

色谱柱极性和非极性

极性色谱柱的固定相当然是极性的了,所谓的极性色谱柱就是指的固定相是极性的。一般在基质上键合一些羟基或是氰基,胺基等使固定相聚有一定的极性。非极性色谱柱,比如气相的DB-1或是液相色谱的C18,其在固定相表面还是有非常多的羟基的,有时为了尽量减少这些羟基的影响,还要进行小分子的封端,不过,有时这些羟基

β折叠的定义

在β折叠中,两条以上氨基酸链(肽链),或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列,成为“股”。

β折叠的结构

肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示。肽链的氮端在同侧为顺