微生物所研究发现小RNA中存在自我调控过程
真核生物非编码小RNA分子通过介导mRNA降解、抑制蛋白质翻译和染色质修饰负调控靶标基因的表达。小RNA在植物的生长发育、信号转导以及生物和非生物胁迫反应中起重要调控作用。 植物基因组学国家重点实验室方荣祥院士研究组在对水稻MAIF1(miRNAs regulated and abiotic stress induced F-box gene) 基因的研究中发现:该基因受植物激素脱落酸(abscisic acid,ABA)和干旱、高盐等非生物胁迫因素的诱导启动表达,同时又受小RNA(siR441和siR446)的转录后调控。作为MAIF1的负调控子,siR441和siR446的表达量受ABA和非生物胁迫抑制。但是令人感到意外的是,其前体RNA的积累却显著增加了。深入研究证明:siR441和siR446存在一个自我调控的过程,即当siR441和siR446的前体RNA的表达量升高时会形成一种自我配对现象,该配对影响了其被正确......阅读全文
蛋白质凝胶染色法实验(五)
磷 蛋 白 的 检 测作为基本的细胞信号机制, 指定氨基酸残基的可逆磷酸化作用的重要性已无需争辩。当前磷蛋白染料具有受ZL保护的构型,即磷酸基结合部分共价连接于荧光团。检测的方式是选择性结合磷酸化的氨基酸,但是没有荧光增强作用。从某种程度上讲, 许多可溶的荧光复合物都可作为总蛋白质染色剂
蛋白质电泳一般染色多久
SDS-PAGE,考马斯亮蓝染色30-60min不等,看你的染液配置使用时间而定。
免疫染色法检定蛋白质
实验概要转印到纸上的蛋白质抗原,可与其专一性抗体结合,再以二次抗体-酶结合体(2nd Ab-HRP) 或Protein A-HRP 呈色;可在一群转印色带中,专一性地挑出目标蛋白质,是最有用的检定工具。主要试剂1. 抗体溶液:可用传统抗血清或单株抗体,其最适使用浓度,随抗体效价不同而异,以下为一般适
蛋白质凝胶染色法实验(四)
(3) 用 10% 〇 //V ) 甲醇、7 % ( V /V ) 乙酸进行简单的凝胶脱色。利用基于微波炉的方案可以加快染色过程的进行。 SYPRO R uby 蛋白质凝胶染料具有相对较高的消光系数和量子产率,因此它十分亮眼, 化学稳定性和光稳定性都很高。光谱的激发可借助紫外线或是蓝光光源;
蛋白质凝胶染色法实验(二)
关键步骤通常如下所述。(1) 固定凝胶,以固定蛋白质条带,并移除凝胶中的干扰物质, 如 S D S 、缓冲液和盐,这些物质会结合银并造成背景染色。(2) 用能够结合蛋白质并提高银结合能力的物质, 或是能够干扰剩余未结合的银造成的背景染色的物质来孵育凝胶。总之,这些各种各样的方法都和敏化作用有关。(3
免疫染色法检定蛋白质
实验概要转印到纸上的蛋白质抗原,可与其专一性抗体结合,再以二次抗体-酶结合体(2nd Ab-HRP) 或Protein A-HRP 呈色;可在一群转印色带中,专一性地挑出目标蛋白质,是最有用的检定工具。主要试剂1. 抗体溶液:可用传统抗血清或单株抗体,其最适使用浓度,随抗体效价不同而异,以下为一般适
蛋白质凝胶染色法实验(一)
总蛋白质的检测1. 总蛋白质色度法染色简便的目视检测、相对简单的使用及广大熟悉方法的用户基础群,使得考马斯亮蓝(C B B )—直是最普遍使用的总蛋白质凝胶染色剂。如需要比考马斯亮蓝染色更高的检测敏感度,那么银染法是可选择的色度方法。如果需要对切下的蛋白质进行质谱分析,则首选不会引入共价蛋白
蛋白质凝胶染色法实验2
2. 总蛋白质荧光法染色荧光染色法结合了检测灵敏度 (可与银染法媲美) 与染色流程简便性 (与考马斯亮蓝染 色 或 Z n 2+ 反染法相同),且其线性定量范围较比色法大 10〜100 倍 。检测依赖于仪器,需要一个单色激发光源、能将波长较长的发射光从波长较短 (也更亮)的激发光中分离出来的选择性光
蛋白质凝胶染色法实验3
糖蛋白的检测1. 通用糖蛋白检测糖 基 化 是 真 核 细 胞 中 最 常 见 的 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 。寡 糖 通 常 连 接 于 天 冬 酰 胺 侧 链(iV-连 接 糖 基 化 ) 或 丝 氨 酸 和 苏 氨 酸 羟 基 侧 链 (〇 连 接 糖 基 化)。凝 胶 中 蛋 白 质
蛋白质染色实验——快速银染法
实验材料蛋白质试剂、试剂盒甲醛固定液硫代硫酸钠干胶液甲醇仪器、耗材摇床透析膜实验步骤1. 将凝胶置于塑料容器中,加入50 ml 甲醛固定液,在旋转摇床中缓慢摇动10 min。 2. 倾去固定液,用水冼两次,每次5 min,缓慢摇动。 3. 倾去水,凝胶浸泡在0.2 g/l 硫代硫酸钠溶液中1 m
蛋白质凝胶染色法实验(三)
尼罗红蛋白质凝胶染色剂尼罗红 (Nile red) 是一种吩囉嗪酮类染料, 当其从水转入到疏水环境,如 S D S 微粒或蛋白质-S D S 复合物中时,便显示出强烈的荧光增强作用。尼 罗 红 不 会 与 S D S 单体发生显著作用》利用这一特点开发出了一种适合 S D S 凝胶的迅速
脱氧核糖核酸的物质简介
DNA 分子结构中,两条多脱氧核苷酸链围绕一个共同的中心轴盘绕,构成双螺旋结构。脱氧核糖-磷酸链在螺旋结构的外面,碱基朝向里面。两条多脱氧核苷酸链反向互补,通过碱基间的氢键形成的碱基配对相连,形成相当稳定的组合。脱氧核糖核酸(DNA)是生物细胞内携带有合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息的一种核酸,是
关于脱氧核糖核酸DNA的物质简介
DNA 分子结构中,两条多脱氧核苷酸链围绕一个共同的中心轴盘绕,构成双螺旋结构。脱氧核糖-磷酸链在螺旋结构的外面,碱基朝向里面。两条多脱氧核苷酸链反向互补,通过碱基间的氢键形成的碱基配对相连,形成相当稳定的组合。 脱氧核糖核酸(DNA)是生物细胞内携带有合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息的一种
关于真核生物的基因调控的内容介绍
真核生物的基因调控比原核生物复杂得多。这是因为这两类生物在三个不同水平上存在着重大的差别: ①在遗传物质的分子水平上,真核细胞基因组的DNA含量和基因的总数都远高于原核生物,而且 DNA不是染色体中的唯一成分,DNA和蛋白质以及少量的RNA构成以核小体为基本单位的染色质; ②在细胞水平上,真
精氨酸甲基化在RNA剪接和翻译全局调控中的关键作用
7月15日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰课题组在Science Bulletin上发表了题为A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g
癌症相关的基因突变类型及临床解释--AGO3
该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含PAZ结构域和PIWI结构域,可能在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用该基因位于1号染色体上,由Argonaute 4和真核翻译起始因子2C,1等家族成员串联而成。已鉴定出两个编码不同亚型的转录变体。
AGO3基因的结构特点和功能作用
该基因编码Argonaute家族的一个成员,在RNA干扰中起作用。编码的蛋白质是高度碱性的,包含PAZ结构域和PIWI结构域,可能在短干扰RNA介导的基因沉默中发挥作用该基因位于1号染色体上,由Argonaute 4和真核翻译起始因子2C,1等家族成员串联而成。已鉴定出两个编码不同亚型的转录变体。
血病相关的基因突变及临床解释-SRSF2基因
该基因编码的蛋白质是富含丝氨酸/精氨酸(SR)的前mRNA剪接因子家族的一员,构成剪接体的一部分。这些因子中的每一个都包含一个结合RNA的RNA识别基序(rrm)和一个结合其他蛋白质的rs域。RS域富含丝氨酸和精氨酸残基,促进不同SR剪接因子之间的相互作用。除了对mRNA剪接至关重要外,SR蛋白还被
SRSF2基因的结构特点和作用
该基因编码的蛋白质是富含丝氨酸/精氨酸(SR)的前mRNA剪接因子家族的一员,构成剪接体的一部分。这些因子中的每一个都包含一个结合RNA的RNA识别基序(rrm)和一个结合其他蛋白质的rs域。RS域富含丝氨酸和精氨酸残基,促进不同SR剪接因子之间的相互作用。除了对mRNA剪接至关重要外,SR蛋白还被
RNA-蛋白质的相互作用1
叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2
《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号
RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。 在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA)
RNA-蛋白质的相互作用2
叶绿体mRNA3’末端的体外加工l RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×) 0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg) Lμl缓冲液E
TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质4
注意事项:1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。常见问题分析:得率低:A.样品匀浆和裂解的
TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质2
5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0
TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(一)
TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA
TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质3
DNA污染:A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混
TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(二)
DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步骤:1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3分钟,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。2. 移去上清,(如需
DDX3X基因突变与药物因子介绍
该基因编码的蛋白是由保守的asp-glu-ala-asp(dead)基序决定的大死亡盒蛋白家族成员,具有atp依赖的rna螺旋酶活性。据报道,这种蛋白具有高水平的rna非依赖性atp酶活性,与大多数死盒螺旋酶不同,atp酶活性被认为是由rna和dna共同刺激的。这种蛋白质具有多个保守结构域,被认为在
DDX3X基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是由保守的asp-glu-ala-asp(dead)基序决定的大死亡盒蛋白家族成员,具有atp依赖的rna螺旋酶活性。据报道,这种蛋白具有高水平的rna非依赖性atp酶活性,与大多数死盒螺旋酶不同,atp酶活性被认为是由rna和dna共同刺激的。这种蛋白质具有多个保守结构域,被认为在
有救了!抑制结直肠肿瘤细胞的新机制来了
近日,德国维尔茨堡大学的科研人员在Nature Cell Biology上发表了题为“A MYC-GCN2-eIF2α negative feedback loop limits protein synthesis to prevent MYC-dependent apoptosis in co