RNA-蛋白质的相互作用1
叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2.用DNA琼脂凝胶(Sambrook et al. 1989)分析线性化质粒以检查酶解是否完全。3.用乙醇沉淀DNA(Sambrook et al. 1989),并重悬DNA沉淀于水中,调整线性DNA终浓度为200μg/ml。 l DNA模板的转录1.向微量离心管加入下列反应液DNA模板 &n......阅读全文
RNA-蛋白质的相互作用1
叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2
RNA-蛋白质的相互作用2
叶绿体mRNA3’末端的体外加工l RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×) 0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg) Lμl缓冲液E
采用PACE分析RNA肽相互作用实验
聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelec
采用PACE分析RNA肽相互作用实验
实验方法原理 聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。
采用PACE分析RNA肽相互作用实验
实验方法原理 聚丙烯酰胺共电泳(poiyacrylamide coelectrophuresis,PACE ) 检测是相对较晚发展起来的定量分析蛋白质、肽与 DNA 或 RNA 相互作用的方法。实验材料 低放射性标记物RNA 底物试剂、试剂盒 TBE 凝胶储存缓冲液电泳缓冲液丙烯酰胺储存液过硫酸铵考
RNA蛋白质印迹法的技术应用
中文名称RNA-蛋白质印迹法英文名称Northwestern blotting定 义将经过电泳分离的蛋白质转移到膜上再与某种特异的RNA探针杂交,是研究蛋白质与RNA特异结合的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
蛋白质间相互作用研究方法1
LY: 宋体; mso-ascii-font-family: 'Times New Roman'; mso-hansi-font-family: 'Times New Roman'">融合蛋白进行Far Western印迹来检测蛋白质-蛋白质相互作用 放射标记蛋白探
蛋白质间相互作用研究方法1
确定各种可能与目标蛋白相互作用的蛋白质,“撒大网”l 双杂交和其他双成分系统第一阶段:诱饵-LexA融合蛋白的鉴定诱饵-LexA融合蛋白的构建1.将编码诱饵蛋白的靶DNA克隆到LexA融合载体的多聚接头处,以合成一种框架内的LexA融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻译终止序列。形成的
凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验
实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋
凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验
凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别的序列,建立反应常数(如亲
凝胶阻滞实验分析RNA蛋白质作用常数实验
实验方法原理 凝胶阻滞实验(gel reiardadon assay,又称为 mobthty shift assay)方法简单、灵敏,可以定量的特性使它在研究转录和基因调控中广泛的应用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 结合蛋白的纯化,确定一种已知或可能的 RNA 结合蛋白所识别
酵母三杂交系统检测和分析RNA蛋白相互作用
一、引入 RNA 质粒和 cDNA 文库通常首先将 RNA 质粒转化到宿主菌株-L40coat 内,得到包含 RNA 质粒的细胞,再转化一个融合了转录激活区的 cDNA 文库(杂交 RNA 对宿主细胞几乎没有毒性,与用于双杂交筛选的一些杂交蛋白
武汉病毒所在活体分子影像研究领域取得进展
中国科学院武汉病毒研究所崔宗强研究员和中科院生物物理研究所张先恩研究员联合研究团队在蛋白-蛋白及RNA-蛋白质相互作用的活体内分子成像方面取得重要进展,创建了远红光波段的荧光片段互补系统(Far-red fluorescence complementation systems),首次实现了动物活
酵母三杂交系统检测和分析RNA蛋白相互作用实验
酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方
酵母三杂交系统检测和分析RNA蛋白相互作用实验
实验方法原理 酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。试剂、试剂盒 YPD 和 SD 培养基鲑
如何分离DNA蛋白质复合体与RNA蛋白质复合体的混合物
可以借助一些多组分抽提试剂,比如TRIzol可以将RNA/DNA/蛋白质分开。经TRIzol处理后,RNA位于上层水相中,DNA处于中间层,蛋白质则在下层。可分别取出水相用异丙醇沉淀回收RNA;用乙醇沉淀中间层回收DNA;用异丙醇沉淀有机相回收蛋白质。
蛋白质相互作用
Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System· Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合,该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合,如果蛋白质和核酸结合,那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合,但是这种结合必须能够 承受过滤压力,并且蛋
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
实验方法原理 利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合,该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合,如果蛋白质和核酸结合,那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合,但是这种结合必须能够 承受过滤压力,并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合,
硝酸纤维素滤膜结合实验确定RNA蛋白质解离常数实验
利用硝酸纤维素滤膜结合可以测定蛋白与 DNA、RNA 间的结合,该方法的基础在于大多数蛋白可以与硝酸纤维素滤膜结合,如果蛋白质和核酸结合,那么该复合物也可以与硝酸纤维素滤膜结合,但是这种结合必须能够承受过滤压力,并且蛋白质在结合到硝酸纤维素滤膜上时还能够保持与核酸的结合。在本实验来源「RNA 实验指
RNAseq综述(九)
通过研究RNA分子内的相互作用来研究RNA的结构核糖体RNA和tRNA构成细胞的大部分RNA。它们与其他结构非编码RNA一起在细胞中发挥各种作用,例如从基因调节到翻译。现存主要有两种研究RNA结构的方法:基于核酸酶的方法和化学探针方法。核糖核酸酶消化于1965年首次用于研究RAN(tRNA(Ala)
蛋白质芯片的概念和功能
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
什么是蛋白质芯片?
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
蛋白质芯片的功能特点
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
结合蛋白质(1)
结合蛋白质的分子中除氨基酸组分之外,还含有非氨基酸物质,后者称为辅因子,二者以共价或非共价形式结合,往往作为一个整体从生物材料中被分离出来。单纯蛋白质是指分子组成中,除氨基酸构成的多肽蛋白成分外,没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合
蛋白质与水的相互作用
水和蛋白质是构成一切生命的基础材料。对人体来说,我们需要有二十种氨基酸才能保证细胞的正常工作。其中,有八种氨基酸是人体无法自行合成,必须由食物中摄取,称作“必需氨基酸”,又称作完全蛋白。资料表明:这八种中如果缺少任何一种,其他则毫无用处。另外十二种是人体可以自行合成的,称作“非必需氨基酸”。人体
蛋白质与水的相互作用
蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多:(1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高于蛋白质的p
GFP-和荧光共振能量转移技术测定蛋白质相互作用实验-1
实验材料 进行转染的细胞株按第二阶段所介绍的方法制备表达了蛋白质探针的细胞试剂、试剂盒 N-二羟乙基甘氨酸消化缓冲液NN-二甲基甲酰胺磷酸钠磷酸盐缓冲溶液TE木瓜蛋白酶Cy3 和 Cy5 OSu 单功能硫代吲哚花菁琥珀酰亚胺酯抗体SDS-聚丙烯酰胺凝胶明胶溶液聚-L-赖氨酸质粒 DNAGFP 融合载
蛋白质与水的相互作用:蛋白质的水溶性
蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。 影响蛋白质水溶性的应素很多: (1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高
JCIM:计算提升蛋白质蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展,但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋,相互作用区域比较明确,而蛋白质