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青岛能源所糖苷水解酶底物特异性机制研究获得进展

木质纤维素是地球上最丰富的可再生资源之一,其合成与降解是自然界碳素循环的中心环节。植物细胞壁在进化过程中形成了天然的“抗降解屏障”,特别是在半纤维素中,大多数多糖均含有侧链修饰,降解困难。中国科学院青岛生物能源与过程研究所微生物资源团队致力于嗜热微生物降解木质纤维素的机制研究,近期与美国北卡罗来纳州立大学教授Robert Kelly合作,阐明了极端嗜热微生物Caldicellulosiruptor阿拉伯呋喃的酶解机制及其与木聚糖酶协同降解效应,对于木质纤维素的生物降解有重要意义,研究成果发表在Applied Environmental Microbiology (AEM)上。 此外,纤维素降解糖苷水解酶中,5家族为数众多,具有纤维素酶和地衣多糖酶等活性,但双功能纤维素酶/地衣多糖酶底物的选择性机制尚不清楚。青岛能源所微生物资源团队与代谢物组学团队研究员冯银刚、仿真模拟团队研究员姚礼山以及清华大学教授王新泉合作,解析了极端嗜......阅读全文

青岛能源所纤维素酶研究取得进展

  近日,在国家重点基础研究发展计划(973计划)和科技部科技支撑计划等项目支持下,中国科学院青岛生物能源与过程研究所在细菌纤维素酶表达调控机制研究中取得进展。   木质纤维素的高效降解是发展纤维素液体燃料的主要技术瓶颈之一。自然界中一些厌氧细菌能够通过合成组装一种名为“纤维小体”的蛋白质分子机器

谭蔚泓院士课题组发文:小分子荧光探针应用于癌症成像

据世卫组织估计,到2035年全世界每年将有2400万新癌症病例和1450万癌症相关死亡案例。在与癌症相关的死亡中,如果可以早期诊断出癌症,约30%的人会有获救的希望。因此对癌症早期准确的诊断对于增加治愈癌症和提高癌症存活率的几率是非常重要的。癌症相关生物标志物的临床检测在癌症诊断和治疗方面具有重要意

ICAS 2017分会(二):无处不在的质谱分析

  分析测试百科网讯 2017年5月7日,由国际纯粹与应用化学联合会(IUPAC)和中国化学会(CCS)主办的2017 年国际分析科学大会(ICAS 2017)质谱分析分会在海南国际会展中心举行。分会邀请了复旦大学教授杨芃原、俄罗斯科学院院士Evgeny Nikolaev、香港浸会大学化学系教授蔡宗

研究人员实现纤维小体原位关键酶的纯化及解析

  纤维小体是细菌分泌的高效降解木质纤维素的多酶复合体,其高效降解机制及产纤维小体细菌的遗传改造是木质纤维素降解利用研究中的重要方向之一。热纤梭菌的Cel48S是其纤维小体的主要外切葡聚糖酶,是其纤维小体中含量最高的组分,在纤维素降解过程中起关键作用。但Cel48S的内在性质使得对Cel48S的纯化

分子生物学常用实验技术(page 2)

一、RNA 制备   模板mRNA 的质量直接影响到cDNA 合成的效率。由于mRNA 分子的结构特点,容易受RNA 酶的攻击反应而降解,加上RNA 酶极为稳定且广泛存在,因而在提取过程中要严格防止RNA 酶的污染,并设法抑制其活性,这是本实验成败的关键。所有的组织中均存在RNA 酶,人

科技部“十二五”现代生物制造科技发展专项规划发布

关于印发十二五现代生物制造科技发展专项规划的通知国科发计〔2011〕587号  各省、自治区、直辖市、计划单列市科技厅(委、局),新疆生产建设兵团科技局,国务院有关部门科技主管单位,各有关单位:  为了贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》,指导现代生物制造科技发展,加

中秋前夕话“甜蜜” 2018年全国糖生物学会议召开

  分析测试百科网讯 2018年9月22日,由中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业委员会主办,复旦大学承办的2018年全国糖生物学会议在上海举行。本次会议邀请了国内糖化学及糖生物学研究领域知名的专家和学者,介绍糖化学生物学合成、糖生物学、糖药物、糖组学、糖链结构分析、糖生物工程与技术等糖相关领域的

第三届“闵恩泽能源化工奖”评选结果公示

   按照《闵恩泽能源化工奖评选办法》的规定,经专家委员会评选,共评出第三届“闵恩泽能源化工奖”杰出贡献奖获奖者4名、青年进步奖获奖者7名。现公示评审结果。  如有异议,请在公示之日起10日内以书面形式向闵恩泽能源化工奖基金理事会秘书处提出,并提供必要的证明文件。个人提出异议的,应在书面异议材料上签

常规聚丙烯酰胺凝胶电泳实验——检测

实验方法原理常规聚丙烯酰胺凝胶电泳后的检测,对于不同的目的,应采用不同的检测方法。由于这种电泳方法不破坏蛋白质的生物活性,所以可选用的检测方法很多。试剂、试剂盒丙烯酰胺单体贮液Tris-甘氨酸缓冲液贮液电极缓冲液样品缓冲液过硫醆铵浓缩胶缓冲液贮液分离胶缓冲液贮液实验步骤一、早期染色方法用染料和生物大

研究提出结晶纤维素降解新模式

  纤维素的降解主要依靠细菌和真菌等微生物分泌纤维素酶完成。一般来说,纤维素酶按照其催化功能可分为3大类:外切-β-1,4-葡聚糖酶(exo-β-1,4-glucanases/cellobiohydrolases),内切-β-1,4-葡聚糖酶(endo-β-1,4-glucanases)和β-葡萄糖

微生物学检验基本技术(1)

随着现代医学及相关科学技术的发展,各学科相互交叉和渗透,医学微生物学检验技术已深入到细胞、分子和基因水平,许多新技术、新方法已在临床微生物实验室得到广泛应用。医学微生物学实验室的基本任务之一是利用微生物学检验技术,准确、快速检验和鉴定临床标本中的微生物,并对引起感染的微生物进行耐药性监测,为临床对感

冯银刚课题组揭示新细菌转录调控因子的结构功能机制

  近年来,在一些梭菌和杆菌中发现一类广泛存在的σ因子及其共转录的抗σ因子——SigI和RsgI,它们的一些结构域和已知蛋白没有同源性,代表了一类新的特殊的细菌σ/抗σ因子。热纤梭菌等一些产纤维小体细菌具有8-16对的SigI/RsgI因子,这在其他已知类型的σ/抗σ因子中比较少见。已有的研究表明这

植物蛋白质组学和糖基化实验

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶                                       &

微生物学检验基本技术(1)

第一节 微生物形态学检查   细菌形态学检查是细菌检验的重要方法之一,它是细菌分类和鉴定的基础,可根据其形态、结构和染色反应性等,为进一步鉴定提供参考依据。 一、显微镜检查   由于细菌个体微小,肉眼不能看到,必须借助显微镜的放大才能看到。一般形态和结构可用光学显微镜观察,其内部的超微结构则需用电

青岛能源所开发出新型梭菌可控基因操作系统

  解纤维梭菌(Clostridium cellulolyticum)及其他纤维素降解梭菌能够通过整合生物加工技术的策略实现木质纤维素基生物燃料及化学品的合成。日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队在前期开发和优化的一系列基因操作工具(Cui GZ, et al, J Microbi

铜绿假单胞菌耐药性的基因学研究进展

铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)又称绿脓杆菌,是引起急性或慢性感染的最常见的条件致病菌之一,由其引起的院内感染往往治疗难度极大,几乎具有目前已知的细菌主要耐药机制,已成为引起院内获得性肺炎多重耐药革兰阴性菌的代表。PA 感染是治疗的难题,归其原因,在于其广泛而多重的

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用  微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已在世界

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用   微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已

秸秆变废为宝 科研助力美丽中国

  我国是农业大国,农林废弃秸秆非常多,秸秆的种类随季节变化而变化,量大、低值、体积大、不便运输,而其自然降解的过程又极其缓慢,因此很容易导致以堆积、荒烧的形式直接倾入环境,造成极大的环境污染和资源浪费。近年来,农业机械化收割的普及,让留在地里的秸秆茬更高也更多了。尤其到夏收、秋收时节,秸秆的集中燃

天津工生所等1,3-1,4-β-葡聚糖酶结构研究取得进展

  1,3-1,4-β-葡聚糖是植物细胞壁中半纤维素的组成成分,是由葡萄糖与β-1,3-和β-1,4-糖苷键连接而成的多聚糖。1,3-1,4-β-葡聚糖酶广泛应用于不同的工业领域中,尤其是动物饲料和酿造业。  中国科学院天津工业生物技术研究所的郭瑞庭研究组和东莞泛亚太生技公司及台湾基酵生技公司合作,

天津工生所等解析出糖苷水解酶第120家族首个晶体结构

  近日,中科院天津工业生物技术研究所与江苏大学、佐治亚大学合作,成功解析出糖苷水解酶第120家族的新型木糖苷酶和底物(木二糖)、产物(木糖)复合体的结构,该结构为糖苷水解酶第120家族首个解析的晶体结构。   此次解析的新型木糖苷酶是CAZy资料库中第120个水解酶家族的木糖苷酶(ww

化学的贡献将得到更加极致的体现

  姚建年:化学的贡献将得到更加极致的体现   化学是一门在分子和原子水平上研究物质的性质、组成、结构、变化、制备及其应用,以及物质间相互作用关系的科学。作为一门极其重要的基础学科,化学与人类的衣食住行以及能源、信息、材料、国防、环境、医药等方面都有密切联系,在社会与经济发展以及人类生活质量的不断

青岛能源所开发新型木质纤维素糖化高效全菌催化剂

  如何实现木质纤维素生物质这一低值原料的高值化利用,一直是国内外的研究热点。中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队以打破国外技术垄断、突破木质纤维素糖化技术瓶颈为研究目标,长期致力于热纤梭菌等纤维素降解菌的遗传改造及代谢工程研究,利用团队前期开发的一系列基因操作工具(J Microbio

生物质废弃物厌氧发酵的研究进展

  1 前言  生物质包含了全体的动物植物微生物,相比较于传统的活化石而言有着更好的可再生性,能够用做资源。在用作资源的过程中需要经过厌氧发酵的过程,文章就此进行分析。  2 厌氧发酵在生物质发酵的应用  厌氧发酵技术是生物质废弃物实现资源化利用的有效途径之一。生物质厌氧发酵是在厌氧细菌的同化作用下

青岛能源所热纤梭菌纤维小体功能研究取得进展

  热纤梭菌(Clostridium thermocellum)纤维小体是自然界中最高效的纤维素降解系统。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队博士研究生洪伟、研究员崔球、副研究员刘亚君等对热纤梭菌纤维小体所有脚架蛋白功能进行了系统分析,揭示了各种脚架蛋白和不同协同作用对纤维小体活性

耐药机制详解之β-内酰胺酶

β-内酰胺类抗生素是目前临床抗感染治疗最普遍应用的一类抗生素,随着这类药物的广泛使用(特别是滥用和误用)和致病菌的变迁,产生了病原菌对药物的耐药性问题,而且耐药发生率相当高。细菌产生β-内酰胺酶(β-lactamase)是80%病原菌耐药的原因之一,另外约12%和8%病原菌的耐药分别与细菌细胞外膜通

青岛能源所发现纤维小体“家传配方”的编码与控制机制

  木质纤维素的高效降解是纤维素基液体燃料与沼气等清洁能源产业的关键瓶颈之一,也是生物圈碳循环和生态平衡的重要环节。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所在纤维素生物降解机制研究中取得突破,发现了一种基于RNA选择性剪切与保护的崭新调控方式。该工作于4月24日在线发表于Nature Communi

黄胜雄研究组阐明天然稀有弩箭子糖的生物合成机制

  天然糖类是活性天然产物的一个重要结构单元,糖苷化修饰有利于提高活性分子的生物相容性及靶点识别的特异性,迄今许多临床一线使用的药物如红霉素、阿霉素及万古霉素等都是糖苷类化合物。弩箭子糖(antiarose)是一类六碳脱氧糖,最初于1896年由水解剧毒木本植物见血封喉树汁液中的天然毒素——α-弩箭子

细菌耐药与临床对策

近年来由于抗生素的广泛应用,细菌的耐药问题越来越严重。历史和现实的教训告诉我们:任何一种抗生素一旦问世,很快就会产生耐药株,产生耐药株的时间周期短则几年,长则十几年(表1)。目前,细菌的耐药问题已成为全球的严重问题,为此WHO专门发表了针对细菌耐药问题的专家建议(WHO/CDS/CSR/DRS/20

石蜡包埋组织的DNA提取及其应用

近10年来,现代分子生物学技术越来越广泛地被用于人类疾病研究的诸领域,为了解病理状态下基因组DNA的变化积累了新资料。目前认为,人类基因组并非人们想像的那样稳定,诸如基因重排、扩增、缺失,突变和DNA甲基化类型改变等时有发生,这些改变对于基因表达和调控,以及疾病过程的发展与转归等方面均具有重要意义。