爆炸性新闻:垃圾DNA的神秘力量

置身于浩瀚基因组海洋中的遗传控件们需要在恰当的时机被激活,才能玩转复杂的人类生理特征发育。 位于基因前端的启动子序列必须精准地与增强子集团配对。为了成功接轨,遥远的启动子是如何靠近增强子的呢?如果双方配合的时机不对或不同步就容易造成白血病和淋巴瘤等疾病。导致疾病的关键又是什么呢? 加州大学圣地亚哥分校Cornelis Murre实验室的Takeshi Isoda团队找到了答案。 这一新发现被9月21日发表在《Cell》杂志的文章总结为免疫细胞发育的“大爆炸(big bang)”。 通过遗传实验和小鼠基因组分析,科学家们发现曾被忽视的非编码DNA区域能激活DNA三维结构变化,让启动子和增强子无比精确地对接在一起。 Murre描述该机制有点像掰弯长钢丝,位于钢丝两端的启动子和增强子通过一道弧线聚在了一个点上。原本物理隔离的增强子和启动子的重聚足以启动T细胞的成熟和发育。 当“掰弯”机制失效时,T细胞发育受阻,就会导致......阅读全文

核心启动子元件的基本定义

中文名称核心启动子元件英文名称core promoter element定  义真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别元件(

启动子的的概念和特性

启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。启动子的特性最初是通过能增加或降低基因转录速率

基因内启动子的基本定义

中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定  义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

关于强启动子的基本介绍

  强启动子(strong promoter),指对RNA聚合酶有很高亲和力的启动子,它能指导合成大量的mRNA。 [1]  是对转录酶有较高的亲和力,可高效启动转录的启动子。主要有lacP(来源于大肠杆菌的乳糖操纵子,有乳糖存在可激活 [2] )、trpP(来自于大肠杆菌的色氨酸操纵子 [2] )

双向启动子的基本特征

双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。

启动子的基本结构及功能

启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子来说

关于启动子的名词解释

  启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。  起始时间和表达的程度。启动子(Promoters)就像“开关”,决定基因的活动。既然基因是成序列的核苷酸(nucleotides),那么启动子也应由DNA组成。启动子本身

分子遗传学词汇翻滚启动子

中文名称:翻滚启动子英文名称:flip-flop promoter定  义:可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基

翻滚启动子的功能和应用特点

中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定  义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表

启动子克隆方法研究进展(3)

1.4 利用载体或接头的染色体步行技术克隆基因启动子   这类方法的第一步都是酶切基因组DNA,连接载体或接头,既可以用pUCl8等质粒载体,也可以使用λDNA等噬菌体载体,只要选用的载体带有合适的酶切位点;同样根据实验需要,接头既可以是双链也可以是单链,然后根据基因组DNA序列设计的特异引物和载体

启动子克隆方法研究进展(1)

随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。  迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、

启动子克隆方法研究进展(2)

 1.3 环状PCR  环状PCR包括I-PCR(Inverse-PCR)和P-PCR(Panhandle-PCR)。这2种PCR都是根据一端已知序列设计的嵌套式引物进行PCR。  1.3.1 I-PCR I-PCR是1988年由Triglia最早提出的一种基于PCR的改进的染色体步行方法。    

分子遗传学词汇启动子阻抑

中文名称:启动子阻抑英文名称:promoter suppression定  义:由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇启动子解脱

中文名称:启动子解脱英文名称:promoter escape定  义:发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与

分子遗传学词汇启动子清除

中文名称:启动子清除定义:聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。

基因外启动子的基本定义

中文名称基因外启动子英文名称extragenic promoter定  义位于基因转录区以外的启动子。许多小RNA基因、H1 RNA基因和U6 RNA基因等具有基因外启动子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

启动子克隆方法研究进展(4)

1.6 TAlL-PCR  很早就有用随机引物的PCR,但由于无法有效地控制由随机引物引发的非特异产物的产生,所以一直未能广泛应用。近年来由IJiu等设计的TAIL-PCR(Termal Asymmetric Interlaced PCR)又叫热不对称交错PCR,则解决了这个问题,后来有研究表明,经

信使RNA的启动子和转录因子

  一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。  二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。  三真核

启动子克隆方法研究进展(5)

2 讨论  以上介绍的几种方法基本代表了现有的启动子克隆方法,它们分别具有不同的特点和适用范围。  利用启动子探针载体筛选启动子时,不需要知道具体的基因序列,避免了引物设计,并能获得大量的启动子片段;其缺点是需要构建1个穿梭质粒,建库、转化、筛选,工作量大,费时费力,而且克隆、亚克隆的过程繁琐。因此

如何确定非编码rna的启动子?

  长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,成为遗传学

分子遗传学词汇核心启动子

中文名称:核心启动子定义:指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区。(Hogness区)

启动子—基因表达的发动机

  众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。

分子遗传学词汇启动子封堵

中文名称:启动子封堵英文名称:promoter occlusion定  义:上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇强启动子

中文名称:强启动子定义:强启动子(strong promoter),指对RNA聚合酶有很高亲和力的启动子,它能指导合成大量的mRNA。 学    科:生物

关于启动子的基本信息介绍

  启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。启动子的特性最初是通过能增加或降低基因转录

启动子—基因表达的发动机

众所周知,一段基因从转录开始,最终形成蛋白质执行功能,离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框,主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点,上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率,如图1。     

关于启动子区的基本信息介绍

  启动子区是RNA聚合酶的结合区,其结构直接关系到转录的效率。关于其结构特点,Pribnow设计了一个实验,他把RNA聚合酶全酶与模板DNA结合后,用DNase l水解DNA,然后用酚抽提,沉淀纯化DNA后得到一个被RNA聚合酶保护的DNA片段,约有41~44个核苷酸对。他先后分离了fd噬菌体、T

Science:多启动子调控大脑的神秘结构

  科学家们发现,非编码DNA序列影响着大脑的特征性折叠,他们找到了与大脑皮层折叠(cortical convolution)有关的基因。大脑皮层折叠是人类大脑表面的一种神秘结构,多年以来围绕着这一结构产生了各种各样的猜想和假说。而这项研究将帮助人们更好的理解这种大脑结构的形成和演化,以及它们对

顺式作用元件的结构启动子的介绍

  原核操纵子中启动序列的同义语。真核基因启动子是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件,每一组件含7~20bp的DNA序列。启动子包括至少一个转录起始点以及一个以上的机能组件。在这些机能组件中最具典型意义的就是TATA盒,它的共有序列是TATAAAA。TATA盒通常位于转录起始点上游-25~-

分子遗传学词汇基因内启动子

中文名称:基因内启动子英文名称:intragenic promoter定  义:被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)