中科院昆明动物所家鸡矮小化研究获得系列进展

中科院昆明动物所在家鸡矮小化研究中获得系列进展,相关研究成果发表在《分子生物学与进化》杂志上。 人类的驯化和选育使得家鸡成为表型多样性最为丰富的动物之一。在体型大小方面,大型肉鸡或斗鸡(>5 kg)和小型观赏鸡(约0.5 kg)可达到10倍以上的悬殊差异。其中,家鸡的矮小化在蛋鸡和观赏鸡选育中至关重要。然而,传统关于家鸡体型的研究难以精确锁定关键基因,家鸡体型大小的遗传学机制尚不清楚。 研究人员尝试采用基于高通量测序技术的群体基因组学分析方法,对我国矮小化观赏鸡——元宝鸡展开研究。结果显示,BMP10基因在元宝鸡受强烈的人工选择作用,其上游启动子区域的突变导致其在元宝鸡心脏中表达上调,是导致其矮小化的重要原因。该基因可以解释元宝鸡22.41%的体型变异。相关工作也表明,运用群体基因组分析有望在较小的群体样本水平发掘家鸡复杂性状的主效基因。 研究人员进一步选取了世界上体型最小的鸡——塞拉玛和我国云南小型鸡——大围......阅读全文

DNA-甲基化测序常用方法

随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向

关于矮小症的基本信息介绍

  矮小症是指儿童的身高低于同性别、同年龄、同种族儿童平均身高的2个标准差(-2SD,标准线称SD),每年生长速度低于5厘米者。以下情况提示患儿生长缓慢:①儿童的生长速度3岁前小于7厘米/年;②3岁到青春期小于5厘米/年;③青春期小于6厘米/年。  主要诊断依据:  ①身材矮小,身高落后于同年龄、同

垂体性矮小病的临床表现

  1.生长障碍:出生一、二年后生长逐渐减慢,身材矮小、匀称,成年后的容貌仍似儿童,皮下脂肪多,肌肉不发达;骨骼成熟迟缓,骨龄较年龄小,智力与年龄相当。   2.性发育障碍:男性阴茎小,隐睾、无胡须,声调似小孩。女性无月经,乳房不发育,子宫小,外阴幼稚,无腋毛。

家鸽(或家鸡)的外形及解剖实验(一)

实验方法原理 1.   通过对家鸽(或家鸡)外形、骨骼及解剖结构的观察,认识鸟类各系统的基本结构及其适应于飞翔生活的主要特征; 2.   学习解剖鸟类的方法。实验材料 标本活家鸽仪器、耗材 钟形罩乙醚解剖盘骨剪剪刀镊子实验步骤 一、家鸽(或家鸡)骨骼系统的观察 1.  脊柱区分颈椎、胸椎、腰椎、荐椎

家鸽(或家鸡)的外形及解剖实验(二)

二、家鸽(或家鸡)的内部解剖 在实验前20~30 min,将家鸽(或家鸡)放入装有乙醚的钟形罩中,使其麻醉致死。或紧捏实验动物的胁部,令其窒息而死。 解剖标本之前,先进行外形观察。家鸽(或家鸡)具有纺锤形的躯体。全身分头、颈、躯干、尾和附肢5部分。除喙及跗跖部具角质覆盖物以外,全身被覆羽毛。头前端有

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段(三)

注:已用454焦磷酸测序法发表的文章总结1、Archaea predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in soils—— (2006) Nature 442: 806-809——if 36.1012、454 Pyrosequencing ana

研究开发出小分子RNA高通量测序数据整合分析软件

  高通量测序技术的普及带来测序数据的高速增加,但分析工具的发展却远远跟不上研究的需要。目前大多数高通量测序数据分析工具的用户对象是具备一定数据分析能力的研究人员,大量的数据分析任务仍然落在少数生物信息实验室上,严重阻碍了整个研究领域的发展。功能更强大、使用更方便的生物信息分析工具亟待开发

高通量测序在微生物多样性研究中的应用

1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学,它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学,它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结构提供了新的技术平台,并

一文读懂高通量测序技术与研究(套路和实例分析)

导语  高通量测序技术和普通基因测序最大的不同在于,高通量测序能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,也就是基因测序里的“批处理”。  高通量测序经过近十年来的迅猛发展,已经深入到生命科学的各个领域,不仅有力地推动了基础研究的发展,也在逐渐征服临床应用。所谓的高通量测序技术,又名大规模平

410万-这家疾控中心采购一台高通量基因测序仪

 项目概况 上海市长宁区疾病预防控制中心(上海市长宁区卫生健康监督所)高通量自动化基因测序仪公开招标项目 招标项目的潜在投标人应在上海市政府采购网获取招标文件,并于2025年06月11日 10:00(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:310105000250312191210-05

高通量ITS测序成鉴定真菌性角膜炎诊断补充方法

   真菌性角膜炎是一种由致病真菌引起的高致盲性角膜炎。随着抗生素和糖皮质激素的广泛使用,其发病率不断增高。培养法一直被用作诊断真菌性角膜炎的金标准,但实际诊断效果并不尽如人意。  在真核生物的核糖体DNA中,ITS序列作为非编码区,其长度和序列在物种间的差异相对较大,因此可用于对不同真菌种属的分类

高通量测序中的密度、产量、准确率分别是指什么

密度 应该是专业术语的覆盖度 代表你测序的数据覆盖到基因组的多少(比如90%,即有10%的序列没有测到)。产量,专业术语叫通量,即测序的产出值,一般分为以下几个说法:多少G,即你测序多少G的碱基数,多少条reads,即你测了多少个读长(不同的测序平台读长不一样)。准确率,即测序时可能出现的错误的概率

高通量测序技术实现绘制人类视网膜高精度发育细胞图谱

  人类胚胎发育从受精卵开始,经过着床前胚胎发育(胚内和胚外组织的产生),原肠胚产生(三胚层的特化)和器官发生等阶段,最终新生儿出生。人类胚胎发育从单个细胞到上万亿个细胞,历时二百八十天,整个过程的基因表达受到多种因素的精细调控,其中很多机制尚未明确。  为了解析人类胚胎发育各个阶段的基因表达调控网

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段(二)

二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性,或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group),通过某一功能群中物种的分类

454高通量测序——研究土壤微生物的新手段(一)

在陆地生态系统中,在土壤中生活有数量庞大的微生物种群,包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工,主要扮演“分解者”的角色,几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应,担负着地球C、N、P、S 等物

超高通量基因测序仪首发!真迈生物在新区创新启航

  10月15日,真迈生物南京公司启用揭牌仪式暨新品发布会在新区生物医药谷举行。中国科学院院士陈润生,市委常委、江北新区党工委书记陆卫东,江苏省药品监督管理局副局长陈和平,南京市科学技术局局长赵成军,江北新区党工委委员、管委会副主任王伟、陈文斌,真迈生物董事长颜钦出席活动。  真迈生物成立于2012

依托高通量测序技术-400多个水稻基因转基因克隆工作完成

  我国的水稻研究已进入了一个全新的领域,目前华大基因农能平台已经完成400多个水稻基因的转基因克隆工作,依托华大基因强大的高通量测序技术,今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。这是记者在6月29日结束的“水稻基因组学与农业应用研讨会”上获悉的消息。  作为世界上最早种植水稻的国家,水稻

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1

一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2

(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258

AEM:家鸡身上发现威胁人体健康的“超级细胞”

  从印度的鸟市上的常见家禽身上分离出能够抵抗多种抗生素的病原体。这项研究提供了幽门螺旋杆菌在印度流行和分离的第一手资料。该研究于11月4日发表在美国微生物学会期刊Applied and Environmental Microbiology上。  在研究中,研究者对来自印度海得拉巴市场的11只肉鸡和

家鸡卷羽性状的遗传机制研究获进展

  家鸡的羽毛具有丰富的表型多样性,其遗传基础一直是家鸡遗传学研究中的热点。相关研究在生产中具有重要的应用价值。例如,隐性白羽性状已成为肉鸡配套系中常用的标记之一。除了羽色,羽毛在结构上也表现出多种表型。相比于正常的片羽,卷羽(frizzle)表现为羽毛翻卷(图1),在观赏鸡育种中颇受青睐。此外,卷

线粒体全基因组测定揭示家鸡驯化史

  为探讨家鸡的驯化历史,中科院昆明动物研究所的研究人员发现了家鸡较为清晰的母系遗传背景信息。该研究成果日前在线发表于国际期刊《遗传》。   据介绍,从肉蛋供应到供人娱乐,家鸡在人类生产生活中扮演着重要角色。在被驯化之后,家鸡跟随人类扩散到世界各地,成为饲养最为广泛的家禽。而家鸡的驯化问题,自达尔

Predica与华大智造携手开启肿瘤精准医疗新纪元:高通量测序平台赋能靶向RNA测序技术

  7月11日,肿瘤诊断领域的领先创新者Predica Diagnostics与华大智造宣布达成合作,共同在华大智造高通量测序平台上开发Predica的靶向RNA测序技术,助力精准医疗。  此次合作旨在通过实现早期癌症检测和促进个性化靶向治疗策略,通过将Predica Diagnostics的先进测

高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍

  1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍   微生物环境基因组学又叫宏基因组学,它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学,它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法。   第二代高通量测序技术为研究微生物群落结

高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍

  1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍   微生物环境基因组学又叫宏基因组学,它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学,它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法。   第二代高通量测序技术为研究微生物群落结

Dolomite微流控芯片成功用于高通量单细胞DNA/RNA测序

随着现代生物学的发展,细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序通过对单个细胞进行测序,解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。 2011 年,《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

华大基因与SAMRC合作建成非洲首个高通量基因组测序中心

近日,南非医学研究理事会(SAMRC)基因组学中心在开普敦正式启用,成为非洲首个高通量基因组测序中心。  南非医学研究理事会(SAMRC)成立于1969年,是南非卫生部下属机构,旨在通过研发和技术转移,改善南非人口健康,使民众能够享受到更好的生活质量。SAMRC主要研究领域包括结核病、艾滋病、心血管

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

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高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收