昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图
新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作,已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平,具体有哪些重要的新基因起源机制,它们各自的角色是什么,却一直不清楚。 最近,马普小组的博士研究生周琦和张国捷等利用最新发表的12个果蝇种的全基因组序列,将新基因起源的研究提升到了阐明全基因组水平模式的高度。通过大规模的基因组比较,鉴定了300多个果蝇物种特异的年轻基因。对这些基因起源机制的分析发现,基因重复 (gene duplication)是产生新基因最主要的机制,80%的新生基因拷贝由串联重复产生,它们之后又可能转化成散在形式的基因重复。有趣的是,研究发现有12%左右的新基因是由非编码序列“变废为宝”而来。这一发现颠覆了该领域长期存在的“进化不可能从头......阅读全文
昆明动物所等采用新的比较基因组方法定位改良相关基因
经历过长期人工选育的具有独特性状的作物优良品种很可能固定了一些在祖先基因库中以低频状态存在的优质等位基因 (elite allele)。这些优质等位基因贡献了该优良品种的优良农艺性状。在传统的遗传学研究中,科学家使用数量性状位点连锁作图(Quantitative trait loci l
昆明动物所构建秀丽线虫脂代谢途径网络
动物模型对研究脂代谢调控和代谢性疾病是必不可少的。模式生物秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)是第一个全基因组被测序的真核生物(1998年)。在过去的10多年中,由于其生活周期短、低成本、易培养和操作等优点,秀丽线虫成为一个研究脂代谢调控、肥胖和肥胖相关代谢性疾
昆明动物所揭示肺癌侵袭转移新机制
肺癌是一种常见的恶性肿瘤。随着吸烟和环境因素影响的增加,肺癌发病率和病死率均迅速上升。肺癌已成为我国恶性肿瘤首位死亡原因。肿瘤细胞分子水平的改变,如染色体、基因改变,已被认为是恶性肿瘤发生的最主要机理。寻找新的肺癌相关基因——癌基因和抑癌基因——对深入研究肺癌发生、发展的病理机制,发现新的诊断标
昆明动物所金鱼起源研究取得新进展
金鱼是一种珍贵而独特的观赏鱼类,由于其颜色五彩缤纷,体形婀娜优美,深受人们的喜爱。以观赏为目的的长期人工选择,使得金鱼的外部形态(眼、背鳍、尾鳍、体型、鳞片等)同其野生鲫鱼相比存在着显著的变异,这在动植物的变异中是相当罕见的,也引起了研究者的关注。 中国科学院昆明动物研究所分子进化与进化基
昆明动物所揭示海豚水生适应的分子基础
随着基因组数据的迅速增加,通过比较基因组学及生物信息学的方法探讨物种适应性进化的遗传基础是目前分子进化的研究热点。 中科院昆明动物研究所张亚平院士课题组针对已公布的海豚基因组,通过与其他近缘物种的基因组进行比较,系统地鉴定出海豚中经历正选择的基因及位点,为理解海豚等鲸目动物的
昆明动物所揭示非洲家犬复杂的源流历史
近日,《遗传学和基因组学杂志》(Journal of Genetics and Genomics)发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组题为A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
昆明动物所瞳孔检测诊断疾病研究获突破
眼睛是心灵的窗户。中科院昆明动物所认知障碍病理实验室马原野研究员介绍说,早在唐朝,中国的珠宝商就发现,购物者对珠宝的喜爱程度越强,瞳孔就变得越大。珠宝商往往根据购物者瞳孔大小来喊价。在现代,瞳孔大小的变化特征一直是眼科和神经科检查的重要手段,国内外研究发现,瞳孔的动态变化与某些神经精神病关系密切
昆明动物所揭示rRNA加工机器的进化机制
核糖体是蛋白质合成的分子机器。核糖体RNA的加工成熟及其与核糖体蛋白的结合是核糖体亚基装配的基本过程。真核生物的该过程是在核仁中进行的。在酵母上已有报道核糖体小亚基rRNA(SSU rRNA)的加工成熟,是由一个被称为SSU Processome(小亚基rRNA加工体)的核酸蛋白复合体所
昆明动物所Nature子刊水稻研究新成果
来自中科院昆明动物研究所、云南省农业科学院等机构的研究人员,在新研究中发现了一个重要的旱稻(upland rice)优良品种标签单核苷酸多态性等位基因(elite variety tag single-nucleotide polymorphism alleles ,ETASs)。相关论
昆明动物所等揭示澳洲野犬群体起源机制
澳洲野犬(Canis lupus dingo)英文名dingo,分类学上属于犬属,灰狼种,澳洲野犬亚种,是澳大利亚特有的一种野生动物。它也是一种非常有趣的动物,首先,它生活在与外界孤立的澳大利亚,却不是澳洲的原生物种,由于澳洲的特殊地理位置,澳洲野犬只会是人类迁移澳洲携带过去的,因此研究澳洲野犬
中科院昆明动物所摸清云南鱼类“家底”
记者8月15日从中科院昆明动物研究所获悉,该所副研究员陈小勇在《动物学研究》杂志 2013年第4期上发表了云南鱼类名录,种数达620种。该研究进一步印证了云南是中国淡水鱼类多样性最丰富的地区,并刷新了《云南鱼类志》的纪录,为全面摸清云南鱼类的“家底”、厘清相互关系奠定了基础。 陈小勇介
昆明动物所研发新的生物气味探测装置
在人类社会的多种场合中都有气味探测的需求,尤其现代社会中反恐、缉毒问题日益突出,而啮齿类动物在研发生物气味探测系统方面有独特的优势。中国科学院昆明动物研究所认知障碍病理实验室研究员马原野组的何静等开发设计了的一套新的生物气味探测装置,在该装置中5只受训合格的小鼠同时探测指定目标气味,正确率可达9
北京基因组所杨运桂研究员到昆明动物所进行学术交流
1月14日上午,应中国科学院、云南省动物模型和人类疾病机理重点实验室陈策实研究员邀请,中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究员到昆明动物研究所进行学术交流,并作了题为N6-methyl-adenosine (m6A) in RNA: An Old Modification with A Nov
昆明动物所在家养动物基因交流研究中取得进展
家养动物被人类成功驯化后,伴随着人类迁徙至世界各地。在这个过程中,家养动物会与当地各种野生近缘种相遇,从而发生杂交促使基因交流的发生。中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平、吴东东课题组近期利用大规模基因组数据,阐明了基因交流在牛属动物的驯化以及环境适应中的重要作用,相关工作发表在Nature E
昆明动物所等揭示动物适应性进化的第二套基因组学机制
动物适应青藏高原极端环境的过程中,逐渐形成了耐低氧、耐高寒、耐粗饲料等复杂性状的适应性。以往针对高原适应遗传机制的研究大多数局限在动物自身遗传物质的变异,很少了解与动物宿主共进化的第二套基因组(即肠道微生物组)的重要贡献,特别是能量代谢方面。 中国科学院昆明动物研究所研究员施鹏领导的团队和中国
昆明动物所解密树鼩为何可以缺失天然免疫基因RIGI
天然免疫是机体抵抗病毒入侵的第一道防线。细胞内抗病毒天然免疫过程的开启,有赖于模式识别受体(pattern-recognition receptors,PRRs)对于外源刺激的识别,产生大量的I型干扰素、细胞因子、补体和炎性因子等,广谱地清除病原微生物。目前公认的模式识别受体主要有Toll样受体
昆明动物所研究发现选择性剪切在果蝇新基因中的进化
选择性剪切(alternative splicing)是一个基因编码出不同转录本和蛋白质的重要途径,对满足生物体所需蛋白多样性具有重要意义。此前的研究显示,新基因通常在序列、基因结构和表达模式上与其祖先基因发生快速的分化。基因结构的改变可能伴随着选择性剪切的改变,但关于新基因选择性
昆明动物所揭密两栖动物强大的免疫系统
任何生物包括人类面临的最大挑战在于如何适应环境,并在不同的有害因素(物理,化学,微生物等)刺激下保持自身的稳态。两栖类动物是从水生的鱼类演化到真正陆生动物之间的过渡类群,在脊椎动物的系统进化中占有非常关键的位置。两栖动物分布广泛,在平原、丘陵、高山的各种复杂生态环境中均可发现它们的踪影。一方面,
昆明动物所首次发现两栖动物Cathelicidin抗菌肽
抗菌肽是先天免疫的重要组成部分。抗菌肽由于其不易导致微生物耐药而成为新型抗感染药物研究的热点。 中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员领导的团队在抗菌肽的发掘和利用方面作了大量的工作,识别了500种以上的抗菌肽。Cathelicidin和Defensin是脊椎动物中的两类最主要的抗菌肽。Cat
昆明动物所关于母婴分离后果研究受到国际关注
近日,英国广播公司新闻(BBC news)详细报道了中国科学院昆明动物研究所胡新天、马原野课题组关于母婴分离后果的研究(http://www.bbc.co.uk/news/science-environment-14562120)。 母婴分离的后果研究对现代社会十分重要。单亲
昆明动物所血小板凋亡研究取得新进展
血小板的主要生理功能是参与止血及血栓形成,并在动脉粥样硬化,肿瘤转移和炎症反应等过程中起着重要的作用。体内是否存在独立于血小板激动剂的血小板凋亡诱导因子,血小板体内清除的机制是目前有待解决的重要问题。 随着基因组学的发展,大量测序结果显示除眼睛以外,betagamma-晶状体
昆明动物所等揭示核仁应激导致脂肪积累机理
脂滴(lipid droplets)是重要的细胞器,对维持细胞正常的能量代谢和生理功能至关重要。脂滴与其它细胞器相互作用,响应细胞内外环境变化,动态调节细胞的脂类代谢和能量平衡。当细胞器功能改变时,不仅会引起细胞器应激反应(如内质网非折叠蛋白反应、线粒体非折叠蛋白反应),还将导致能量代谢变化(肥
昆明动物所等揭示心境障碍易感机制
心境障碍是一类遗传力较高的精神疾病,主要包括双相情感障碍和抑郁症。然而,其表型的复杂性及参与因素的异质性导致心境障碍的神经生物学机制仍不特别明确,缺少明确的生物标记物。越来越多的基础和临床研究指出,参与情绪控制和认知功能的脑区(比如前额叶,海马和杏仁核等)的结构和功能在心境障碍病人中出现异常,而
昆明动物所蝙蝠回声定位研究取得新进展
小蝙蝠和某些鲸(包含海豚)各自独立进化出回声定位能力,关于它们回声定位分子机制的研究一直是热点,之前主要集中在耳蜗对高频声音的感知。 中国科学院昆明动物研究所沈永义副研究员和博士研究生梁璐在张亚平院士的指导下,注意到回声定位能力的形成不单单依赖耳蜗对超声的感知,还依赖大脑对声
昆明动物所人类大脑转录组进化研究获进展
人类在进化过程中,脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力,比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰,如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA,进而翻译成不同的蛋白质构体,是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展,转录后
昆明动物所参加2012年新疆产学研洽谈会
7月10日至12日,以“促进合作交流,推动跨越发展”为主题的“2012年新疆产学研洽谈会暨院士企业行”活动在新疆乌鲁木齐举行。 此次会议有来自国内外科研院所、高校、疆内各地州市、生产建设兵团各师及有关企业的代表逾千人参加。洽谈会规模大、层次高、内容丰富,是近年来新疆举办的最盛大的一届产学研
昆明动物所3项973项目获准立项
中科院昆明动物所以项目第一承担单位申报的3项国家重点基础研究发展计划项目(973),历经函评、复评、综合评审等环节的严格评审后获准国家立项。 其中,2项为国家重点基础研究发展计划,分别是张亚平院士作为首席科学家主持的“中国-喜马拉雅地区生物多样性演变和保护研究”项目、中德马普青年科
昆明动物所等揭示核仁应激导致脂肪积累机理
脂滴(lipid droplets)是重要的细胞器,对维持细胞正常的能量代谢和生理功能至关重要。脂滴与其它细胞器相互作用,响应细胞内外环境变化,动态调节细胞的脂类代谢和能量平衡。当细胞器功能改变时,不仅会引起细胞器应激反应(如内质网非折叠蛋白反应、线粒体非折叠蛋白反应),还将导致能量代谢变化(肥
昆明动物所等完成脂高鲮的分类修订
原文地址:http://www.cas.cn/syky/202103/t20210325_4782317.shtml 高鲮属Altigena Burton 1934是一类分布于中国和东南亚地区的底栖性大中型鱼类,属于鲤科Cyprinidae,野鲮亚科Labeoninae。Kottelat(200
昆明动物所等揭示普洱茶减肥降脂机制
云南普洱茶是由云南大叶种晒青毛茶经后发酵,包括自然发酵(非酶性氧化)和渥堆发酵(微生物酶促氧化)制成的发酵茶。普洱茶不仅具有悠久的发展历史和丰富的文化内涵,而且广受海内外的欢迎。其广受海内外欢迎的一个重要原因是:传统上认为它具有减肥、降脂、防止心血管疾病等多种保健功效。然而,对普洱茶诸多保健功能