昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图
新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作，已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平，具体有哪些重要的新基因起源机制，它们各自的角色是什么，却一直不清楚。 最近，马普小组的博士研究生周琦和张国捷等利用最新发表的12个果蝇种的全基因组序列，将新基因起源的研究提升到了阐明全基因组水平模式的高度。通过大规模的基因组比较，鉴定了300多个果蝇物种特异的年轻基因。对这些基因起源机制的分析发现，基因重复 (gene duplication)是产生新基因最主要的机制，80%的新生基因拷贝由串联重复产生，它们之后又可能转化成散在形式的基因重复。有趣的是，研究发现有12%左右的新基因是由非编码序列“变废为宝”而来。这一发现颠覆了该领域长期存在的“进化不可能从头......阅读全文
昆明动物所转基因动物研究取得新成果
由中国科学院昆明动物研究所季维智研究员领导的研究小组关于非人灵长类转基因动物的研究论文Transgenic rhesus monkeys produced by gene transfer into early-cleavage–stage embryos using a simi
昆明动物所举办GLP培训
4月13日上午，中科院昆明动物研究所举办GLP培训会，研究所生物产业化中心及实验动物中心相关工作人员参加了培训。 生物产业化中心副主任杨启成博士就GLP的理念、管理准则及目标等进行了深入浅出的讲解。对在GLP运行中可能出现的问题、数据可追溯的重要性作了详细解释。同时，生物产业
昆明动物所等破译山羊和绵羊基因组
在“973”项目的支持下，中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后，近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此，所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。 山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动
昆明动物所重构蚂蚁等级分化祖先基因调控网络
近日，中国科学院昆明动物研究所生物多样性基因组学团队在调控蚂蚁等级分化演化机制研究中取得进展，研究人员通过对三个亚科五个蚂蚁物种的大脑转录组演化分析，揭示了蚂蚁这类超个体组织物种（superorganism）存在的生殖等级分化的核心基因调控网络。研究成果以Towards reconstructi
昆明动物所人类从头起源新基因研究取得重要进展
基因的起源在生物界是一个普遍而又不断延续的过程，是生物由简单到复杂演化的基础。新基因产生的机制主要有基因重复、外显子重排、逆转录、基因水平转移、可移动元件、基因断裂融合和从头起源等。其中，从头起源的基因（指基因起源于没有功能的非编码区域DNA）研究甚少，主要是因为人们一直认为此机
中科院昆明动物所等发布新款基因测序软件
中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。合作团队近日正式发布了一款代号为 Sparc 的软件。 针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的问题，该团队研发出了一套“线性复杂度”（复杂性最低）的算法，Sparc软件即基于该新算法完成
昆明动物所等在疯牛病调控基因研究中取得进展
朊病毒疾病是一类致死性神经退行性疾病，已在包括人在内的十多种动物中发现，例如牛的疯牛病、羊的搔痒症、人的克雅氏症等。其中，疯牛病因具有高度传染性和致死性，且可通过食物链传染给人类而受到高度关注。25年来对朊病毒疾病的研究表明，朊病毒基因是致病的基质，但是仅此一个基因还是无法彻底澄清朊病毒疾病的致
昆明动物所家犬嗅觉受体基因研究取得新进展
家犬作为人类最亲密的朋友，在人类历史上一直扮演者重要的作用。更重要的是，家犬是人类最早驯化的家养动物，由于其经过了驯化和品种培育两个重要的群体历史阶段，并且在家养哺乳动物中形成了最具多样性的品种，因此家犬一直是研究人工选择和自然选择的重要模式生物。中国最为家犬的驯化地，不仅遗传多样
昆明动物所揭示家养动物高原适应遗传机制
青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析，不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制，也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用，为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导，进一步促进青藏高原地区生态文
昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展
近年来，家养动物线粒体DNA（mtDNA）基因组学得到了迅速发展，积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时，一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷（Shi, et al. 2014. Mol Ecol）之外，mtDNA世系划分标准不一，世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工
昆明动物所蝙蝠视觉基因通路进化研究获新进展
蝙蝠是夜行性动物。食虫蝙蝠主要用回声定位来确定方位、捕捉昆虫，其眼睛退化;旧大陆果蝠没有回声定位能力，它们主要依赖视觉和嗅觉来寻找食物，其眼睛很发达。 在之前的研究里，中国科学院昆明动物研究所沈永义副研究员在张亚平院士的指导下，克隆了视网膜上视杆细胞视紫红质的RHO基因 (Rhodop
昆明动物所新基因的功能起源和进化研究取得进展
基因复制是新基因和新功能产生的最主要的方式之一。然而，在分子水平，新产生的复制基因如何通过通路整合而获得生物学功能以及产生适应性性状却并不清楚。 为了回答以上问题，中科院昆明动物研究所中德马普进化基因组学青年科学家小组的博士生丁昀等在导师王文研究员的指导下，对黑腹果蝇亚群(Drosophi
昆明动物所等在蝴蝶基因组研究中取得进展
蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的变异，自达尔文时期以来就是进化研究的好材料。然而，长期以来其高杂合的基因组难以解析，对其也缺乏有效的遗传操作技术体系，极大地限制了蝴蝶在进化学研究的深入广泛应用。 为了使蝴蝶成为研究宏观形态进化遗传基础的新模式生物，中国科学院昆明动物研究所的基因起源课题组与深圳华大
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
深圳华大基因研究院石琼教授访问昆明动物所
7月17日下午，受遗传资源与进化国家重点实验室系统进化与生物地理学组杨君兴研究员的邀请，深圳华大基因研究院海洋平台负责人石琼教授访问中国科学院昆明动物研究所，并作了题为“海洋基因科技及其产业化应用”的学术报告。 石琼首先介绍了海洋生物资源在全球的重要作用和对国家的战略意义，通过生物科技在海洋资
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所完成“一三五”国际评估工作
11月18日至20日，秋意浓浓，阳光暖人。 中国科学院组织国际专家对中科院昆明动物研究所进行了“一三五”现场诊断评估。评估专家组由来自英国、加拿大、法国、澳大利亚、美国的9位专家组成，王小凡教授任专家组组长。 中国科学院发展规划局副局长张凤代表中科院向远道而来的专家致辞；中国科学院副院长张亚
昆明动物所揭示新的肿瘤靶标
肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外，靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能，来抑制肿瘤生长，而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法，靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微
昆明动物研究所通过实验动物饲料生产认证
11月29日，昆明市科学技术局为昆明动物研究所颁发实验动物饲料生产许可证，许可生产的七种饲料包括：实验猴繁殖、维持饲料，树鼩繁殖、维持饲料，大小鼠繁殖、维持饲料，实验兔维持饲料。 根据实验动物饲料生产许可证的认证程序，首先七种饲料要通过实验动物饲料检测部门的抽样检测，且各项营
昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图
新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作，已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平，具体有哪些重要的新基因起源
昆明动物所基因家族相关性进化研究取得新进展
食物的寻找、选择和消化之间存在一定的关系，虽然宏观上的主观判断存在合理性，但缺乏遗传学上的直接证据。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、吴东东博士和David Irwin教授等研究人员分析了12种果蝇中六个和食物有关的基因家族：类胰蛋白丝氨酸蛋白酶(Tryp_SPc)（主要
昆明动物所等发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
昆明动物所保密体系建设工作通过验收
验收会现场 10月14日，中科院安全保卫保密办公室和昆明分院一行9人，对中科院昆明动物研究所保密体系建设工作进行了现场审查验收。昆明动物所领导及保密领导小组成员和涉密人员参加了会议。 会上，院安保办主任吴立光首先分析了当前保密工作的重要性和严峻性，全面推进保密管理工作的必
昆明动物所等揭示朱鹮群体演化历程
1月11日，《当代生物学》以The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested ibis为题，在线发表了中国科学院昆明动物研究所张国捷课题组、西班牙庞培法布拉大学、丹麦哥本哈根大学等单位合作的研究成果。该工作将57份博物馆
昆明动物所阐明多能干细胞基因组稳态维持新机理
多能干细胞（Pluripotent stem cells，PSCs）因在体外具无限增殖和分化为不同类型细胞的潜能，在再生医学领域中颇具应用前景，也成为目前临床上最具潜能的成药细胞。PSCs制备过程中的标准化、规模化及细胞质量稳定性是走向临床应用的先决条件，但人PSCs在体外扩增培养过程中，易出现遗传
昆明动物所RNASEL基因进化与功能的相关性研究取得进展
核糖核酸酶L（RNASEL）是免疫2-5A系统中的核酸酶，在免疫抗病毒过程中起到重要作用。另外，RNASEL也是非常重要的前列腺癌基因，在人群中RNASEL基因的多个多态性位点与前列腺癌有显著相关性。 为研究RNASEL在抗病毒以及癌症相关性之间的关联，中国科学院昆明动物研究所张亚
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
昆明动物所家养动物线粒体DNA数据分析取得进展
作为最常用的分子标记之一，线粒体DNA（mtDNA）被广泛应用在家养动物的遗传多样性评估、群体进化历史解析等诸多研究中。随着测序技术的改进，目前已有大量的mtDNA基因组序列被测定并提交到公共数据库。然而，相关数据的质量却没有得到系统有效的评估。之前的一系列研究表明，在人类mtDNA数据中存在着
昆明动物所揭示动物高原适应在分子水平的趋同性
探讨动物的高原适应是研究物种对极端环境适应机制的理想模型。以往研究中通过比较高海拔物种与低海拔近缘种，在分子及表型层面鉴定了很多高原物种的适应特征。然而，已有研究多侧重于高、低两物种的比较，而高原环境存在很大的异质性，高海拔是个较宽泛的范围，不同海拔地区（2000米、3000米、4000米、50
昆明动物所哺乳动物回声定位分子机制研究获进展
回声定位是一种基于听觉能力的特殊感觉机制。具有回声定位能力的动物利用回声定位进行导航、搜索食物和躲避障碍物等，从而对它们的生存和繁殖具有非常重要的作用。尽管人们已经在动物行为学和生理学等方面对回声定位进行了研究，但是对其产生的分子机制却知之甚少。 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重