追问生物学本源问题:最常见的DNA突变是如何发生的?

变形怪(Shape-shifters)并不仅仅是虚构的,其实它们是真实存在的,就在我们体内的DNA里。 杜克大学,俄亥俄州立大学的一组研究人员揭示了人类DNA中鸟嘌呤和胸腺嘧啶中两个通常不匹配的碱基是如何改变形状,在螺旋DNA“阶梯”上形成一个不显眼的环,从而能够避开我们体内针对基因突变的天然防御的。这一研究成果公布在2月1日的Nature杂志上。 文章通讯作者之一,俄亥俄州立大学化学与生物化学教授Zucai Suo解释说:“当这两个碱基偶然形成氢键时,起初它们并不合适,因此会沿着DNA螺旋伸出来,这样复制DNA的酶通常就会很容易检测到它们,进行修复。但是在偶然的情况下,这些碱基在检测之前改变了形状,就好像它们能彼此‘对接’,因此可以像正常的碱基对那样安装上去,逃脱DNA修复机制。” “他们是坏人,但是假装自己是个好人来骗取生存。” 这一发现为研究其他类型的DNA突变奠定了基础,DNA突变在我们人体的衰老过程和疾病发......阅读全文

变性梯度聚丙烯酰胺凝胶的原理

双链DNA分子在一般的聚丙烯酰胺凝胶电泳时,其迁移行为决定于其分子大小和电荷。不同长度的DNA片段能够被区分开,但同样长度的DNA片段在胶中的迁移行为一样,因此不能被区分。DGGE/TGGE技术在一般的聚丙烯酰胺凝胶基础上,加入了变性剂(尿素和甲酰胺)梯度,从而能够把同样长度但序列不同的DNA片段区

人造碱基能像天然DNA那样连接-有助合成生物学研究

  美国印第安纳大学和应用分子进化基金会等机构科学家证明,他们造出的两种人造DNA“字母”Z和P,能像天然DNA那样组合连接在一起,将来有望把这两个新成员纳入到活细胞中。相关论文发表在最近的《美国化学协会会刊》(JACS)上。  合成生物学家一直在竞相研究遗传基本单位的人造版。美国应用分子进化基金会

关于组蛋白八聚体的特点介绍

  这种集合是将DNA的166对碱基对以1.75左手超螺旋形围在这个蛋白质线轴。连接组蛋白H1将核小体核心颗粒与DNA的进入位点及E位点结合,因而可以将DNA紧扣在位,并且能容许形成更高层次的结构。最基本的形状为一个10纳米的纤维或一连串的珠子。这涉及将在每一个核小体之间约50对的DNA碱基对围在这

基因组所抗癌药物分子机制研究获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员雷红星及其研究组开展的“抗癌药物的分子机制研究”取得阶段性进展,其研究论文Early stage intercalation of doxorubicin to DNA fragments observed in mol

科学家用DNA分子造出-全球最小二极管

  北京时间4月5日下午消息,佐治亚大学和以色列内盖夫本·古里安大学的研究人员利用DNA分子制造出了新型二极管。  据新浪科技报道,这被认为是全球尺寸最小的二极管。研究人员表示,这将促进DNA元件的开发,推动分子电子学的发展。  二极管的功能是实现电流的单向流动。40多年前,科学家提出,可以将二极管

热献-差示扫描量热仪解析DNA熔融的显微结构

 差示扫描量热仪解析DNA熔融的显微结构   1.   简介   担负着遗传信息的DNA,即使是归类于小种类的大肠菌,其染色体DNA的大小也巨大到约4700kb(1kb=1000碱基对),如果就这样处理的话是很困难的,染色体DNA独立地存在于细胞质,进行自律增殖数质粒DNA小到数kb到数百kb,处理

热献-差示扫描量热仪解析DNA熔融的显微结构

  差示扫描量热仪解析DNA熔融的显微结构   1. 简介   担负着遗传信息的DNA,即使是归类于小种类的大肠菌,其染色体DNA的大小也巨大到约4700kb(1kb=1000碱基对),如果就这样处理的话是很困难的,染色体DNA独立地存在于细胞质,进行自律增殖数质粒DNA小到数kb到数百

细胞化学词汇DNA三链体

中文名称:DNA三链体英文名称:DNA triplex定  义:DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对

DNA三链体的结构特点

中文名称DNA三链体英文名称DNA triplex定  义DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对,C必

抗组蛋白抗体的基本信息介绍

  组蛋白是核内最丰富的蛋白质,它与DNA构成的复合物称为染色质。染色质最基本的亚单位结构是核小体(nucleosome),它由146个碱基对组成的DNA链缠绕8个组蛋白分子(2个H2A-H2B杂二聚体之间夹着2个杂二聚体H2-H4)2圈构成的核心和核心外的组蛋白H1与连结DNA(约60个碱基对)组

-利用荧光DNA探测分子-单个碱基突变也能被发现

  DNA序列中最轻微的变异也会影响深远,无论对研究还是医学应用,可靠识别这些序列都非常重要。据物理学家组织网近日报道,美国华盛顿大学和莱斯大学研究人员合作,开发出一种荧光DNA探测分子,能检查出一段目标DNA链中单个碱基的变化。而这些微小突变可能是造成某些疾病的根源,或耐抗生素细菌的原因。这一成果

人造DNA能像自然版本连接在一起

  最新研究发现,两个人造DNA“字母”能像其自然版本那样连接起来,从而为把后来者融入活的细胞奠定了基础。  合成生物学家正在竞相研制构成生命的基本成分的人造版本。“我们已基本上完全再造了遗传字母表。”来自美国佛罗里达州应用分子进化基金会的Steven Benner介绍说。对这类假DNA的期待包括开

追问生物学本源问题:最常见的DNA突变是如何发生的?

  变形怪(Shape-shifters)并不仅仅是虚构的,其实它们是真实存在的,就在我们体内的DNA里。  杜克大学,俄亥俄州立大学的一组研究人员揭示了人类DNA中鸟嘌呤和胸腺嘧啶中两个通常不匹配的碱基是如何改变形状,在螺旋DNA“阶梯”上形成一个不显眼的环,从而能够避开我们体内针对基因突变的天然

基因检测的原理

  1) 基因检测的基础及适用人群:  人类基因组由23对染色体组成,其中包括22对常染色体和1对性染色体(包括1条X染色体和1条Y染色体)。染色体由 DNA 和核糖体蛋白组成,人类基因组含有31.6亿个DNA碱基对。相同碱基对位置上的单核苷酸产生变异(这种情况称之为单核苷酸多态性,简称 SNP )

测序大拿指出广泛使用的人类基因组缺失3亿个DNA

  在过去的17年间,全球大多数科学家们一直都以来自单个个体的基因组DNA信息集合,作为一种“基线”来比对遗传突变。  比如,人类基因组参考基因组:GRCh38就是来自定期更新的个体DNA序列。但是在一项最新研究中,约翰霍普金斯大学的科学家们发现,910名非洲人后裔的集体基因组中出现了很大一块的缺失

最新测序的完整的人类基因组图谱

    最新测序的完整的人类基因组图谱。  图片来源:英国《新科学家》网站  20年前,科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸(DNA),其实,他们漏掉了少许。现在,由于读取DNA方法的改进,科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了!据生物预印本网站(biorxiv)近日报道,美国科学家对全部

前所未有的分辨率准确定位人类基因组中的特定碱基对

  来自南加州大学的一名研究人员已经确定了在人类疾病中起重要作用的DNA碱基对。南加州大学凯克医学院人口和公共卫生科学助理教授Steven Gazal博士正在执行一项任务,回答一个令人困惑的问题: 为什么尽管经过数百万年的进化,人类仍然遭受疾病的困扰?  作为一个国际研究小组的成员,Gazal有了一

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA聚合酶的应用

E.coli的DNA pol Ⅰ涉及DNA损伤修复,在半保留复制中起辅助的作用。DNA polⅡ在修复损伤中也具有重要的作用。DNA polⅢ是一种多亚基的蛋白质,在DNA新链的从头合成中起复制酶的作用。复制的忠实性问题会影响到翻译的精确性,这种忠实性主要依赖于碱基的特异性配对。据估计每个碱基对将有

优化Benzonase®核酸内切酶在病毒产品纯化中的应用

生物制药生产中去除DNA的明智选择——优化Benzonase®核酸内切酶在病毒产品纯化中的使用  Benzonase®核酸内切酶——生物制药生产中去除DNA的明智选择,其价值已在过去的30多年里予以了证明。使用Benzonase®核酸内切酶的生产遵循GMP (ICH Q7),从而提供了高质可

可能的新一代丙肝疫苗

丙肝病毒(HCV)是一种感染性很强的病毒,光是在英国就干扰了多达50万人,并且其中很多人尚未被诊断出来。在英国丙肝病毒感染是导致那么多患者需要进行肝脏移植手术的最常见的原因。 近日在英国爱丁堡大学据悉的普通微生物学会第16届年会上,研究人员报道说他们发现了可能成为高效的丙肝疫苗的单克隆抗体。 肝

凝缩蛋白的研究进展

凝缩蛋白在染色体组装和压缩中起着至关重要的作用,但其实现功能的机制尚不清楚。一种观点是这种蛋白随机地抓住杂乱的DNA的某个地方,将这些DNA系在一起;另一种观点是这种蛋白将DNA向内挤压,产生一种环,2017年以标题“The condensin complex is amechanochemical

dna分子二级结构有哪些特点

结构特点:1、为右手双螺旋,两条链以反平行方式排列。2、两条由磷酸和脱氧核糖形成的主链骨架位于螺旋外侧,碱基位于内侧。3、两条链间存在碱基互补,通过氢键连系,且A=T、G ≡ C(碱基互补原则)。4、碱基平面与螺旋纵轴接近垂直,糖环平面接近平行。5、螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm,相邻两个碱基

日破译人工栽培草莓基因组

  日本研究人员27日报告说,他们破译了人工栽培草莓的基因组,这一成果将有助于开发更好看好吃并能抵抗虫害的新品种草莓。   位于千叶县木更津市的上总DNA研究所在英国《DNA研究》杂志网络版上介绍说,研究人员将人工栽培草莓品种“丽红”的染色体DNA序列分成片段,分析碱基对的排列,并与4种野生草莓进

科学家用人工细菌合成非天然蛋白质!

  合成生物学家试图创造具有自然界中所没有的形式和功能的新生命。尽管科学家们离制造出完全人工的生命形式还有很长的路要走,但他们已经制造出了半合成的生物体,它们拥有扩展的遗传密码,使它们能够制造出以前从未见过的蛋白质。在一项近日发表在《JACS》上的研究中,研究人员已经优化了一种半合成细菌,可以有效地

DNA重组技术(DNA-Recombination)

一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃

科学家利用DNA折纸术创造动态纳米机器工具箱

  慕尼黑工业大学创造的最新DNA纳米设备,包括一个具有可移动手臂的机器人,一本可以开合的书,一个可由开关控制的装置和一个致动器。这一创造是将DNA作为纳米级别的结构和机器的可编程建造材料的突破性科学进展。这项发表在期刊《科学》上的研究结果展示了一种结合以及重新排列模块化3D建造

核酸的变性、复性和杂交

变性在一定理化因素作用下,核酸双螺旋等空间结构中碱基之间的氢键断裂,变成单链的现象称为变性(denaturation)。引起核酸变性的常见理化因素有加热、酸、碱、尿素和甲酰胺等。在变性过程中,核酸的空间构象被破坏,理化性质发生改变。由于双螺旋分子内部的碱基暴露,其A260值会大大增加。A260值的增