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Nature子刊:一种三维代谢模型

卢森堡系统生物医学研究中心(LCSB)的研究人员开发出了第一个人体代谢过程三维计算机模拟模型。 这一研究成果公布在Nature Biotechnology杂志上。 研究人员将已有的4,000多种代谢产物的三维结构以及近13,000种蛋白质整合到现有的计算机模型中,他们还为模拟运行的模型增加了大量的遗传和化学信息。这种新的基于计算机的工具被称为Recon3D。 越来越多的研究表明了计算机模型的重要性。这种方法能使现有的知识具体化,从而帮助科学家准确地制定和有针对性的研究问题。为了创建这样的模型,研究人员分析了他们可以找到关于某个主题的所有出版物和数据库,并将这些信息输入到他们的模型中。 比如这项研究中的人体代谢研究,卢森堡大学LCSB分子系统生理学组负责人Ines Thiele教授说:“Recon3D的前身,Recon 2就是由不同领域大型研究团队组成的研究人员将大量有关人类基因组,化学代谢活动和生理特性的数据汇集在一......阅读全文

Nature子刊:一种三维代谢模型

  卢森堡系统生物医学研究中心(LCSB)的研究人员开发出了第一个人体代谢过程三维计算机模拟模型。  这一研究成果公布在Nature Biotechnology杂志上。  研究人员将已有的4,000多种代谢产物的三维结构以及近13,000种蛋白质整合到现有的计算机模型中,他们还为模拟运行的模型增加了

Nature:计算机模型预测学术成功

电脑模型预测论文数量、任职机构及性别关乎学术成就   在发表同等数量文章的情况下,和男性生物学家相比,女性生物学家成为学术带头人的可能性更低。   最近,研究者用电脑模型证明:对事业起步期的科学家来说,“不发表就发臭”是一条黄金准则。根据计算公式,对于年轻科学家来说,以第一作者身份在知名期

DNA计算机模型检测神秘面纱揭开

   DNA计算机的研制是各国竞争的一个科技制高点。17日,记者从郑州大学信息工程学院获悉,该校朱维军副教授、周清雷教授开发出一系列算法,初步解决“DNA模型检测”这一困扰国际DNA计算机学界多年的核心技术难题。 与其他计算工具相比,计算机的本质优点在于通用性,而通用性归根结底在于千变万化的具体

计算机模型解开塑料的“基因密码”

  人们的生活离不开塑料。但迄今为止,工业上还是先开发出一种塑料,然后才去发现它的用途,或试验几百种不同的“配置”看看哪种管用,既费时又费钱。据美国物理学家组织网9月30日(北京时间)报道,最近,英国利兹大学和杜伦大学解决了这一难题,他们开发出一种计算机模型,能在化学水平预测各种高分子成型时的形状,

3D计算机模型揭开舌头的奥秘

新3D模型展示出舌头上复杂交织的肌肉。   无论何时说话或者吞咽,我们都会用到舌头。然而,关于舌头如何活动的很多问题仍然是个谜。现在,研究人员创造了一个人类舌头的3D计算机模型,并可以通过它来揭开舌头的秘密。   这个模型的创建是基于“人体可视化计划”的数据,该计划于20世纪90年代用大块明胶对

计算机模型可揭示整联蛋白的运行机制

  据物理学家组织网3月21日报道,最近,美国加利福尼亚大学(UC)伯克利分校和劳伦斯·伯克利国家实验室科学家开发出一种整联蛋白的计算机模型,只有约20纳米长,能模仿真实的整联蛋白在细胞中的活动,且对能量和其他变化产生的反应。这一成果为人们探索整联蛋白如何把细胞内外环境联系在一起开辟了新途径。相关论

计算机模型揭示猴子更适用于痴呆研究

  俄罗斯研究人员发现用老鼠开展早老性痴呆治疗研究所得出的某些结论,一旦用于人体就会出问题。为探究其中原委,俄研究人员研制出一种计算机模型,其分析结果显示,这种病在老鼠和人体内的表达有很大差别,而猴子更适合用于研究这种疾病。   医学界此前发现,大脑中贝塔淀粉样蛋白大量积聚是导致早老性痴呆的直接原

人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗方法

  近日,一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中,来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型,MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。 图片来源:theconv

Nat Mach Intell:计算机模型帮助寻找COVID19治疗方法

    根据最近一项研究,一种可以预测人类基因和药物相互作用方式的新的深度学习模型已经确定了至少10种可能有望作为COVID-19疗法的化合物。除两种药物外,所有药物均仍被认为是研究性药物,并且正在针对丙型肝炎,真菌病,癌症和心脏病进行有效性测试。该清单还包括批准的药物环孢菌素和抗真菌药阿尼芬净。

新型超级生物计算机模型问世 三磷酸腺苷驱动能耗更低

  作为人体细胞能量来源的三磷酸腺苷(ATP),也可以用来驱动下一代超级计算机。加拿大研究人员的这个新发现有望为研发只有书本大小的超级生物计算机打开大门。与动辄占地数百平方米的传统超级计算机相比,这样的设想实在诱人。  加拿大麦吉尔大学生物工程系主任丹·尼克劳带领的国际研究团队在近日出版的《美国国家