CellRes:CRISPR/Cas12a切割ssDNA的新活性
CRIPSR/Cas12a切割单链DNA的示意图(A)和三元复合物的结构模拟图(B)。 中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所赵国屏研究组的最新研究成果,以CRISPR-Cas12a has both cis -and trans-cleavage activities on single-stranded DNA(《Cas12a兼具顺式和反式单链DNA切割活性》)为题,在线发表在Cell Research上。论文深入系统地研究了Cas12a对于靶标单链DNA和非靶标单链DNA的切割特性。 作为生命的基本遗传物质,DNA的精准编辑和快速检测一直以来受到高度重视。近年来,随着CRISPR/Cas9系统的发现和开发,人们对基因治疗重新燃起了新希望;尽管存在一些潜在的安全风险和一定的伦理之争,CRISPR/Cas9系统出于其相对精准和高效,已开始被应用于临床的研究。同时,科学家开始将CRISPR系统引入核酸快速......阅读全文
抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的参考值及临床意义
参考值 正常人:阴性,酶标法 临床意义 抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性,除SLE患者有较高检出率(50%~60%)外,其他风湿病如混合性结缔组织病(mixel connective tissue disease,MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征,类风湿性关节炎等
NSMB背靠背丨黄志伟-揭示其抑制type-V型Cas12a活性的新机制
CRISPR-Cas适应性免疫系统为细菌和古细菌对抗噬菌体和质粒入侵提供了核酸序列特异性的防御机制【1】。CRISPR-Cas系统分为6个亚型,其中II型CRISPR-Cas9和V 型CRISPR-Cas12a(Cpf1)系统被广泛应用于基因组编辑和多种多样的生物技术应用【2,3】。在噬菌体感染
微生物所噬菌体抑制细菌CRISPRCas系统机制研究中获进展
原核生物通过一系列的防御系统来抵抗噬菌体等寄生生物的攻击。与真核生物的免疫系统类似,原核生物的防御系统也可以分为天然免疫系统和获得性免疫系统。天然免疫系统又包括限制性修饰(Restriction-Modification, R-M)系统、DNA干扰、毒素-抗毒素系统等,是非特异性的防御措施;而获
可编程的CRISPR反应性智能材料
CRISPR-Cas系统已成为科学家们在不断增加的有机体中研究基因的首选工具,并且正被用于开发潜在地校正基因组中单个核苷酸位点上的缺陷的新型基因疗法。它也被用于正在进行的诊断方法中,用于检测患者体内的病原体和致病突变。 如今,在一项新的研究中,来自美国哈佛大学威斯生物启发工程研究所和麻省理工学
我国科学家在CRISPR研究中获突破性进展
作为生命的基本遗传物质,DNA的精准编辑和快速检测一直以来都受到高度的重视。近年来,随着CRISPR/Cas9系统的发现和开发,人们对基因治疗重新燃起了新希望;尽管存在一些潜在的安全风险和一定的伦理之争,CRISPR/Cas9系统出于其相对精准和高效,已经开始被应用于临床的研究。与此同时,科学家
研究提出幽门螺旋杆菌的高敏高精检测方法
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员李志远团队联合南方医科大学附属东莞医院,通过环介导等温扩增(LAMP)结合最新的CRISPR/Cas12a技术,提出针对高致病性幽门螺旋杆菌菌株的高敏感度检测方法。相关研究发表于Biosensors and Bioelectronics。该论文第一作
最新Nature,Nature子刊公布CRISPR两项突破性成果
近年来,CRISPR/Cas9系统的发现和开发带来了许多新希望。最新Nature和Nature Communications杂志公布了两项重要成果,分别报道了首次哺乳动物CRISPR-Cas9基因驱动,以及第三种CRISPR-Cas系统。 作为生命的基本遗传物质,DNA的精准编辑和快速检测一直
CRISPR可以做分子诊断
CRISPR-Cas系统背景回放面对噬菌体的威胁,细菌进化出了一套专门针对噬菌体或外源性遗传物质的CRISPR-Cas免疫系统。CRISPR全称为“簇状、规律间隔的、短回文重复序列”(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repe
除了Cas9以外,经改造的Cas12b也加入基因编辑领域
近年,CRISPR基因编辑技术及其相关应用成为生命科学领域备受关注的热点研究方向。基于这种技术,科学家们可高效、快速、便捷地对感兴趣的基因进行编辑,从而在基础科研、农业和医学的发展中具有重要应用。 目前CRISPR系统中有两类效应蛋白家族(Cas9和Cas12a/Cpf1)被成功改造成哺乳动物
张锋团队重新设计了Cas12b,带来第三个基因组编辑系统
《自然-通讯》本周发表的一篇论文Engineering of CRISPR-Cas12b for human genome editing报告了第三个可以编辑人类细胞基因组的CRISPR-Cas系统。嗜高温核酸酶Cas12b的鉴定。 CRISPR-Cas9是一个多功能基因组编辑系统,但Cas9
CRISPR分子诊断技术(四)
19 由于其高灵敏度和特异性,CRISPR诊断技术或CRISPR-Dx可以有很多用途:病毒检测和病毒亚型区分,病菌识别和耐药性基因确认,即时检测(POCT), 患者基因分型,以及癌症突变分析和液体活检。这篇论文也初步展示了CRISPR-Dx在这些方面的应用前景。图片来源:参考资料320 比
核酸检测新技术问世,有望提升疾病的筛查、诊断效率
近日,国际生物医学专业期刊MedComm(IF:9.9)在线发表中南大学、湖南家辉遗传专科医院邬玲仟、梁德生教授课题组在遗传病检测领域的最新研究成果:课题组开发出了一种创新的核酸检测平台,并申请了2项国家发明专利。它是一种集无PAM限制、多重与定量核酸检测于一身的强大新技术,其优势在于使用通用型
关于细胞凋亡的其他检测方法介绍
1、ssDNA 单抗法 把抗单链DNA(ssDNA) 单克隆抗体用于细胞凋亡的检测,是一种偶然发现,因为在应用ssDNA 单抗(荧光法) 检测细胞毒性药物诱导DNA 损伤中,观察到凋亡的白血病细胞(MOL T24) 有较强的荧光,后来经过适当的改进,证明ssDNA 单抗可以特异地识别凋亡细胞。
新型编辑酶:“CRISPR工具箱”又一利器
英国《自然》杂志近日发表了一项遗传学最新研究:美国加州大学伯克利分校科学家报告了一种能调控人类基因组的新型酶CasX,其编辑功能与先前已描述的CRISPR-Cas系统都不相同,这为人类的“CRISPR工具箱”再添一员。图片来源于网络 有“基因魔剪”之称的CRISPR于上个世纪90年代初被发现
基因传感器的分类
电化学基因传感器电化学式基因传感器是以电极为换能器,也就是将ssDNA探针固定在金电极、碳糊电极或玻璃电极等表面上,然后浸入含有目标ssDNA分子的溶液中,此时电极上的ssDNA探针与溶液中的互补序列的目标DNA单链分子杂交。 质量基因传感器质量式基因传感器是以石英晶体振荡器(QCM)为换能器,与电
抗单链DNA抗体的概述
抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。
RPA1基因突变因子与药物介绍
该基因编码异三聚体复制蛋白A(RPA)复合物的最大亚单位,与单链DNA(SSDNA)结合,形成核蛋白复合物,在DNA代谢中起重要作用,参与DNA复制、修复、重组、端粒维持,并通过激活共济失调毛细血管扩张症和RAD3相关蛋白(ATR)激酶来协调细胞对DNA损伤的反应。核蛋白复合物保护单链dna免受核酸
RPA1基因编码的功能和结构描述
该基因编码异三聚体复制蛋白A(RPA)复合物的最大亚单位,与单链DNA(SSDNA)结合,形成核蛋白复合物,在DNA代谢中起重要作用,参与DNA复制、修复、重组、端粒维持,并通过激活共济失调毛细血管扩张症和RAD3相关蛋白(ATR)激酶来协调细胞对DNA损伤的反应。核蛋白复合物保护单链dna免受核酸
突破!CRISPR基因编辑成功治愈先天性失明
1月23日,CRISPR-Cas基因编辑系统的先驱之一张锋教授在《自然》子刊《Nature Communications》发布一项重要进展,报告了第三个可以编辑人类细胞基因组的CRISPR-Cas系统:CRISPR-Cas12b。 同时,张锋领衔的Editas Medicine公司开发的编号为
抗单链(变性)DNA抗体检测的临床意义
抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性,除SLE患者有较高检出率(50%~60%)外,其他风湿病如混合性结缔组织病(MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征,类风湿性关节炎等也都有10%~70%的检出率。当抗dsDNA阴性而SLE的诊断尚未明确时,高滴度抗ssDNA的存在对诊断也有参
MIT科学家开发CRISPR智能凝胶材料,能够感应DNA改变特性
现在还有什么CRISPR不能做的吗? 这是近期《自然》杂志上刊发的一篇评论里开头的一句话,也是我现在的心情。 我们知道,CRISPR是一种(超)好用的基因编辑工具,除了给基因序列修修补补、帮助治疗疾病,它还能追踪动物的发育过程,快速检测和诊断疾病,改良农作物,控制蚊子防疟疾……如今,CRIS
单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件
海藻病毒(Marine algae viruses)是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分,在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里,我们关注的是一个主要的海藻病毒群,单链DNA(ssDNA)病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus
微量热泳动仪MST分析幽门螺杆菌DprA-结合单链DNA结构模型
细菌间的自然转化(NT)是一个复杂的过程,包括结合,吸收,运输和将外源DNA重组到染色体中,因此产生了基因多样性并推进了进化。DNA加工蛋白 A(DprA)几乎存在于所有细菌种类中,其主要参与结合内部单链DNA和在NTs期间促进RecA结合到ssDNA上。这篇文章分别介绍了幽门螺杆菌 DprA蛋白
单链DNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪
RPA1基因的结构特点和生理作用
该基因编码异三聚体复制蛋白A(RPA)复合物的最大亚单位,与单链DNA(SSDNA)结合,形成核蛋白复合物,在DNA代谢中起重要作用,参与DNA复制、修复、重组、端粒维持,并通过激活共济失调毛细血管扩张症和RAD3相关蛋白(ATR)激酶来协调细胞对DNA损伤的反应。核蛋白复合物保护单链dna免受核酸
Nature-Methods-可在体内大规模研究基因互作新方法
肿瘤转移是一个复杂的过程,受到多基因的调控,也是实体瘤患者死亡的主要原因之一【1】。目前系统性理解影响肿瘤转移的基因间相互作用仍是一个挑战。相比于Cas9系统,CRISPR-Cas12a(Cpf1)不需要tracrRNA(trans-activating CRISPR RNA),可同时在多位点进
浙江大学Cell子刊解析DNA损伤修复
维持基因组DNA的稳定对于细胞存活和肿瘤抑制至关重要。浙江大学生命科学研究院的科学家们对DNA修复机制中的一个重要复合物进行了研究,阐述了该复合体组装和发挥作用的结构基础。文章于三月十三日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。 细胞基因组的完整性,持续受到多种内外因素的挑
基因编辑进展梳理-Part-I-CRISPR系统拓展及机制研究篇
基因编辑技术是指对目标基因进行编辑,实现对特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因编辑技术问世以来,取得了一系列重大突破,并相继在2012、2013、2015和2017年被Science杂志评为十大科学进展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作简便和成本低廉等优势受到了众多
核酸的光谱学性质
减色性:dsDNA相对于ssDNA是减色的,而ssDNA相对于dsDNA是增色的。DNA纯度:通过测量A260/A280和A260/A230进行判断。
核酸的光谱学性质
减色性:dsDNA相对于ssDNA是减色的,而ssDNA相对于dsDNA是增色的。DNA纯度:通过测量A260/A280和A260/A230进行判断。