生化与细胞所等在生物学通路分析方法研究中取得新成果

许多基因组学的工作常常涉及到这样的问题:哪些通路可能参与了所研究的生物学过程?近年来,围绕这一问题,已经发展出了大量的生物信息学分析方法,尤其是基于基因表达谱数据的生物学通路分析方法。 相关工作常常是利用经典的通路数据库(如KEGG,Biocarta和Gene Ontology 等)对基因表达谱数据进行统计学分析,以得到在特定的生物学过程中发生显著变化的通路。在这些方法中,用于分析的生物学通路往往被简化成一系列基因的简单集合,而忽略了特定通路中不同基因之间潜在的功能联系。这种将复杂的生物学通路简化为简单的基因集合的处理对于生物信息学分析方法的建立是非常有利的,但忽略基因之间的功能联系显然不利于更加准确地评估相关通路的改变。 9月6日,Cell Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组和复旦大学生命科学学院田卫东研究组合作完成的生物学通路分析方法上的最新研究成果。该工作是博......阅读全文

细胞生物学的研究方法

  细胞生物学广泛地利用相邻学科的成就,在技术方法上是博采众长,凡是能够解决问题的都会被使用。例如用分子生物学的方法研究基因的结构,用生物化学、分子生物学的方法研究染色体上的各种非组蛋白和它们对基因活动的调节和控制或者利用免疫学的方法研究细胞骨架的各种蛋白(微管蛋白、微丝蛋白、各种中等纤维蛋白)在细

毛囊干细胞的生物学特性

  毛囊干细胞是毛囊中的,和其它成体干细胞一样,具有慢周期性、未分化性、自我更新和体外增殖能力强等特点。毛囊干细胞分化经毛囊干细胞(hair follicle stem cells,FSC)、短暂增殖细胞(transit amplifying cells,TAC)有丝分裂后分化细胞(postmito

树突状细胞的生物学特性

  树突状细胞(Dendritic cells, DC)是机体功能最强的专职抗原递呈细胞(Antigen presenting cells, APC),它能高效地摄取、加工处理和递呈抗原,未成熟DC具有较强的迁移能力,成熟DC能有效激活初始T细胞,处于启动、调控、并维持免疫应答的中心环节。

细胞因子的生物学作用

细胞因子还有其他的生物学作用,比如促进细胞凋亡和促进创伤组织修复。肿瘤坏死因子超家族中的一些细胞因子可以直接杀伤或者诱导靶细胞的凋亡,比如TNF-a和LT-α可以杀伤被病毒感染的靶细胞或肿瘤细胞。转化生长因子一B(TGF-B)可以刺激成纤维细胞和成骨细胞而促进损伤组织的修复,表皮生长因子可促进上皮细

细胞因子生物学活性检测

实验方法原理 白细胞介素1是一种重要的细胞因子,主要由单核-巨噬细胞产生,IL-1不仅对多种免疫活性细胞有重要的调节功能,而且与发热、炎症发生以及某些疾病的病理变化有关。目前对IL-1产生水平的检测主要应用生物学活性检测的方法。一、ConA刺激小鼠胸腺细胞检测IL-1生物学活性 小鼠胸腺细胞在丝裂原

细胞生物学的相关简介

  细胞生物学是以细胞为研究对象,从细胞的整体水平、亚显微水平、分子水平等三个层次,(斯。诺。美。A11-走在生物医学的最前沿)以动态的观点, 研究细胞和细胞器的结构和功能、细胞的生活史和各种生命活动规律的学科。细胞生物学是现代生命科学的前沿分支学科之一,主要是从细胞的不同结构层次来研究细胞的生命活

细胞因子的生物学活性

  细胞因子具有非常广泛的生物学活性,包括促进靶细胞的增殖和分化,增强抗感染和细胞杀伤效应,促进或抑制其它细胞因子和膜表面分子的表达,促进炎症过程,影响细胞代谢等。  一、免疫细胞的调节剂  免疫细胞之间存在错综复杂的调节关系,细胞因子是传递这种调节信号必不可少的信息分子。例如在T-B细胞之间,T细

细胞生物学术语衣被蛋白Ⅰ

中文名称衣被蛋白Ⅰ英文名称coatomer proteinⅠ;COPⅠ定  义由7个亚基组成的复合体,是组成COPⅠ衣被的主要成分。其包被的小泡将蛋白质从高尔基体反面反向运输到内质网;或是从反面高尔基扁囊运往顺面的高尔基扁囊。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学词汇胞质环流

在胞质环流中,细胞周质区(cortical region)的细胞质是相当稳定的不流动的,只是靠内层部分的胞质溶胶在流动。在能流动和不流动的细胞质层面有大量的微丝平行排列,同叶绿体锚定在一起。胞质环流是由肌动蛋白和肌球蛋白相互作用引起的。在胞质环流中,肌动蛋白的排列方向是相同的,正向朝向流动的方向,肌

细胞生物学术语反应中心

中文名称反应中心英文名称reaction center定  义叶绿体光系统中由一对中心叶绿素分子和其他色素分子以及蛋白质组成的复合物,是将捕获的光能转化为化学能的结构。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

概述干细胞的生物学特性

  在成体动物中许多组织如皮肤、血液和小肠上皮的细胞寿命很短,需要不断地被相应的新细胞替换。成熟个体产生新的分化细胞的途径之一是通过已存在的分化细胞的简单倍增形成新的分化细胞,即分化细胞经分裂形成相同类型的两个子代细胞,如血管中新的内皮细胞就是通过这种方式产生的。但是,在分化的过程中,细胞往往因为高

肝星状细胞的生物学特征

  正常情况下肝星状细胞处于静止状态。当肝脏受到炎症或机械刺激等损伤时,肝星状细胞被激活,其表型由静止型转变 为激活型。肝星状细胞位于肝窦周Disse 腔内,约占肝脏所有细胞的13%。在规HE染色的肝组织切片中,不能显示星状细胞,但可用免疫组织化学将其定位,并可将其分离进行体外细胞培养。正常情况下肝

细胞生物学术语回收运输

中文名称回收运输英文名称retrieval transport定  义应在内质网中起作用的蛋白质,进入了高尔基体后,又被包装成COPI有被小泡送回内质网的运输方式。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学术语微胞饮

中文名称微胞饮英文名称micropinocytosis定  义质膜内陷形成直径小于100 nm的胞饮小泡进行的胞饮作用。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学词汇呼吸链

呼吸链(respiratory chain)是由一系列的递氢反应(hydrogen transfer reactions)和递电子反应(electrontransfer reactions)按一定的顺序排列所组成的连续反应体系,它将代谢物脱下的成对氢原子交给氧生成水,同时有ATP生成。实际上呼吸链的

细胞自噬的生物学概念

属于丝氨酸/苏氨酸类蛋白激酶的ATG1/ULK1是启动自噬作用的关键蛋白激酶。自噬的初始阶段主要是诱导自噬和形成自噬膜,然而自噬膜的形成需要自噬前体(即自噬调控的重要节点)的形成。Beclin1-Vps34复合体是哺乳动物自噬的核心复合物。AtG4参与自噬泡的形成,而UVRAG作用于自噬泡成熟及其运

成体干细胞的生物学特点

成体干细胞是指存在于不同组织中的未分化细胞,它保持自我更新的能力和分化成该组织各种类型细胞的能力。其生物学特点为:1、具有自我更新和分化潜能2、数量少3、存在于特地的微环境中4、处于静止状态5、体积小,细胞浆少,细胞核较大6、成体干细胞的数量与活性随年龄的增大而减少7、肿瘤起源于肝细胞突变

树突状细胞的生物学特性

  树突状细胞(Dendritic cells, DC)是机体功能最强的专职抗原递呈细胞(Antigen presenting cells, APC),它能高效地摄取、加工处理和递呈抗原,未成熟DC具有较强的迁移能力,成熟DC能有效激活初始T细胞,处于启动、调控、并维持免疫应答的中心环节。

生殖细胞的生物学特性

分化在单细胞生物群体中已有生殖细胞分化的迹象。如团藻科的杂球藻有4个较小的细胞失去分裂能力,专司运动和代谢,称为营养个体,其余28个细胞具有分裂能力,称为生殖个体;团藻则在大多数小型营养细胞间出现了少数大的生殖细胞。极质,其中富含核糖核酸(RNA)的小颗粒叫极颗粒。经过受精、卵裂,含有极颗粒的细胞称

细胞生物学术语胞吐[作用]

中文名称胞吐[作用]英文名称exocytosis定  义运输小泡或分泌颗粒与质膜融合,将内容物释放到细胞外的现象。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学术语Rab蛋白

中文名称Rab蛋白英文名称Rab protein定  义存在于质膜和细胞器膜中的一类调节型的小分子GTP结合蛋白Ras超家族中最大的亚家族。能够结合GTP并将GTP水解,通过GTP-GDP的循环来调节小泡的融合。与Rab效应子一起参与运输小泡到靶膜的停靠过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理

细胞生物学术语质子动力

中文名称质子动力英文名称proton motive force定  义穿膜的质子(H+)浓度梯度和电位梯度所含有的势能。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学术语膜电位

膜电位(Membrane Potential)通常是指以膜相隔的两溶液之间产生的电位差。一般是指细胞生命活动过程中伴随的电现象,存在于细胞膜两侧的电位差。膜电位在神经细胞通讯的过程中起着重要的作用。1791年意大利解剖学家加伐尼(L.Galvani)偶然发现,如果将蛙腿的肌肉置于铁板上再用铜钩钩住蛙

单细胞生物的生物学特征

  第一个单细胞生物出现在35亿年前。单细胞生物在整个动物界中属最低等最原始的动物。包括所有古细菌和真细菌和很多原生生物。根据旧的分类法有很多动物,植物和真菌多是多细胞生物。变形虫算作单细胞动物,它的一些种类却算作粘菌,带鞭毛的鞭毛虫如眼虫有时被归为单细胞藻类或者是单细胞动物。新的分类法中,所有的真

细胞因子生物学检测法

  生物学检测又称生物活性检测,是根据细胞因子特定的生物活性而设计的检测法。由于各种细胞因子具有不同的活性,例如IL-2促进淋巴细胞增殖,TNF杀伤肿瘤细胞,CSF刺激造血细胞集落形成,IFN保护细胞免受病毒攻击,因此选择某一细胞因子独特的生物活性,即可对其进行检测。生物活性检测法又可分为以下几类:

细胞生物学术语异体吞噬

中文名称异体吞噬英文名称heterophagy定  义细胞吞噬感染的病毒、细菌或其他一些颗粒等的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学词汇同型融合

中文名称同型融合英文名称homotypic fusion定  义来源于相同细胞器的小泡互相融合的现象。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)

细胞生物学词汇胞质运动

胞质运动(cytoplasmic movement)指的是在生活中胞基质处于不断的运动状态,能够带动其中的细胞器,在细胞内作有规则的持续的流动。

细胞生物学的发展历史

细胞生物学的发展历史大致可以分为以下四个主要阶段:细胞发现和知识积累阶段(16 世纪后期到 19 世纪 30 年代):通过对大量动植物的观察,人们逐渐意识到不同的生物都是由形形色色的细胞构成的。期间的重要事件包括:1590 年,荷兰眼镜制造商詹森父子制作了第一台复式显微镜;1665 年,英国的罗伯特

藻类环境生物学国际研讨会在水生所召开

  4月10至20日,由中国科学院水生生物研究所刘永定研究员、李敦海副研究员组织的藻类环境生物学国际研讨会在水生所召开。本次研讨会由水生所和淡水生态与生物技术国家重点实验室联合资助。会议由刘永定研究员主持,水生所副所长徐旭东研究员致欢迎辞。来自意大利、法国、斯洛文尼亚、德国和英国等相