水生所发现基因组可编码藻胆体降解蛋白的无尾噬藻体
噬藻体是侵染蓝藻的病毒。噬藻体与宿主的相互作用以及对蓝藻高度专一的致死性感染，可调节控制水华蓝藻的密度与种群结构，减少蓝藻水华的形成与危害，有助于蓝藻细胞溶解物参与地球生物化学循环。作为一种潜在控制有害蓝藻水华的生物效应因子，噬藻体成为水生病毒学和水环境科学研究的热点对象。 近日，中国科学院水生生物研究所张奇亚团队和桂建芳团队共同阐明了首株无尾噬藻体PaV-LD(Planktothrix agardhii Virus from Lake Dong -hu) 全基因组结构及其编码的藻胆体降解蛋白(NblA)的生物学功能。PaV-LD是从武汉东湖水样中培养分离的水华丝状蓝藻噬藻体，其基因组为双链DNA，共有95299个碱基对，含有142个推导基因。质谱分析从PaV-LD中鉴定出13个分子量大小范围在 27KDa 至 172KDa 的主要结构蛋白，但缺少已知噬藻(菌)体必备的几种尾结构蛋白。系统进化分析揭示，PaV......阅读全文
上海有机所在仿藻胆体构建人工光合组装体研究中获进展
藻胆体（phycobilisome）是蓝细菌和红藻光合系统的关键结构，通过蛋白骨架定位色素团分子（bilins）高效捕获光能并传递到光系统I/II及反应中心，进而实现光能到化学能转化。利用超分子组装策略模拟光合细菌或藻类的光捕获及反应中心结构，对探索新型人工光合系统具有重要意义，其核心是构建人工
窃取CRISPR的免疫“黑客”
英属哥伦比亚大学的研究人员发现，一种感染主要淡水细菌的病毒使用“偷来”的CRISPR劫持宿主的免疫系统。这种病毒黑客在控制宿主免疫系统之后，迅速给系统打上补丁，以确保其他黑客无法闯入。这项研究发表在美国微生物学会旗下的mBio杂志上。 细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防
衣藻的遗传技术(四分体分析)－实验——交配
实验材料mt+ 和 mt- 配子仪器、耗材96 孔皿相差显微镜或 DIC 显微镜实验步骤1. 在 96 孔皿的 1 个孔中混合基本等量的 mt+ 和 mt- 配子。2. 光照 2 小时，用相差显微镜或 DIC 显微镜取 1 滴交配混合液分析交配效果。3. 将 1 滴交配混合液滴到琼脂平板中心。4.
研究团队揭示叶绿体蛋白转运与质量控制的新机制
叶绿体是光合作用的场所，也是重要的生物反应器。作为半自主细胞器，叶绿体含有3000多个蛋白，其自身基因组仅编码100个左右蛋白，其他蛋白由核基因组编码并通过叶绿体被膜上的TOC和TIC复合体转运。大部分核基因编码的前体蛋白以未折叠状态进入转运复合体，分子伴侣和蛋白酶组成的质量控制系统可确保所有进
与溶酶体相比自噬体在膜结构的主要区别
与溶酶体相比自噬体在结构上的主要特点是双层膜。自噬体包含溶酶体、内质网、线粒体三种细胞器的结构。
11篇！Science最新研究成果概览
1.Science：N-豆蔻酰化蛋白质量控制机制 doi:10.1126/science.aaw4912 人们早就知道蛋白的稳定性受其N-末端氨基酸残基的影响，并且在过去三十年中大量的研究工作已描述了一系列N-端规则（N-end rule）途径，这些途径通过N-末端的蛋白降解子基序让其所在的
自噬性死亡的自噬机制
细胞为维持正常新陈代谢，其生长过程始终都有自噬现象，这已在形态学中得到证实。但自噬的消长受多种因素影响，营养缺乏、胰高血糖素可诱导自噬，胰岛素抑制自噬，细胞肿胀也同胰岛素一样有抑制自噬的作用，它们的作用点在于改变氨基酸的浓度。当氨基酸浓度降低时，自噬启动可产生氨基酸，保证器官成活；相反则自噬被抑制。
自噬的自噬发生过程
在此过程中，自噬体的形成是关键，其直径一般为 300 ~ 900 nm，平均 500 nm，囊泡内常见的包含物有胞质成分和某些细胞器如线粒体、内吞体、过氧化物酶体等。与其他细胞器相比，自噬体的半衰期很短，只有 8 min 左右，说明自噬是细胞对于环境变化的有效反应。由于自体吞噬较少受到关注,而且很难
自噬的自噬的研究方法
正常培养的细胞自噬活性很低，不适于观察，因此，必须对自噬进行人工干预和调节，经报道的工具药有：（一）自噬诱导剂1）Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin ：模拟内质网应激2）Carbamazepine/ L-690，330/ Lithium Chloride
假根羽藻适应潮间带环境的基因组进化研究获进展
假根羽藻（Bryopsis corticulans）是在北温带海洋潮间带广泛分布的大型绿藻。假根羽藻生存需适应不断变化的潮汐、温度和紫外线辐射等环境因素。涨潮时，假根羽藻的光合蛋白可在蓝绿光和绿光为主的弱光环境中捕获光能以满足自身生长需要，并在落潮时进行光保护，以抵御高光强胁迫。近20年来，中国科学
衣藻的遗传技术(四分体分析)－实验——合子萌发
实验材料合子仪器、耗材平板立体解剖显微镜实验步骤1. 打开平板包装，将表面用灭菌的单刃剃刀片刮几次。2. 平板光照至少 18 小时。3. 用立体解剖显微镜将合子放到平板上，用纤维光源照亮平板。4. 用圆头玻璃针，将萌发的四分体的 4 个细胞推压分开大约 5 mm，形成一个圆圈。5. 平板光照 1 周
衣藻的遗传技术(四分体分析)－实验——配子发生
实验材料细胞苔层试剂、试剂盒蒸馏水仪器、耗材培养基实验步骤1. 在含 M 或 TAP 培养基的琼脂平板上生长细胞苔层。配子最容易从成熟但不老的细胞苔层获得。2 周以内的培养物最好，但较老的平板培养物常与一些细胞株一起使用。2. 用接种环取 1 环细胞，重悬在 1 ml 灭菌蒸馏水中。3. 光照下 3
衣藻的遗传技术(四分体分析)－实验——合子成熟
实验材料合子仪器、耗材平板铝箔实验步骤1. 光照 18~24 小时孵育合子。2. 再强力塑料包装材料包裹平板，再用铝箔封好，放黑暗中至少 5 天。平板可在黑暗中数月保持活力，也不会干燥。如果 5 天后所有合子萌发形成八细胞，将细胞在黑暗处放更长的时间。黑暗孵育更长时间通常会得到更高的四细胞萌发百分率
南京农大PLoS－Genet发表文章：自噬体闭合的“门控开关”
来自南京农业大学生命科学学院的研究人员发表了题为“A Rab5 GTPase module is important for autophagosome closure”的文章，首次鉴定到参与调控自噬体闭合这一重要步骤的调控因子（门控开关）。 这一研究成果公布在PLoS Genetics杂志上
PNAS重要成果：可移动遗传元件
在一位使用了隐形眼镜液的法国女性的红肿眼睛中，科学家们发现了几个新型寄生虫，这些寄生虫能像俄罗斯套娃一样相互嵌套。 来自法国国家科学研究中心等处的Bernard La Scola 和Christelle Desnues发现这一护理液被一种新型巨型病毒污染了，他们将这种病毒命名为Lent
蓝藻门、裸藻门、黄藻门、硅藻门鉴定——裸藻门鉴定
实验材料裸藻属藻类试剂、试剂盒I-KI 溶液0.1%而甲基蓝溶液浓KOH溶液仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤裸藻门 Euglenophyta裸藻绝大多数为无细旋壁、具鞭毛能游动的单细胞种类。细胞质外层特化为周质，有的周质较硬，使细胞保持一定的形态，有的周质较软，细胞能变
蓝藻门、裸藻门、黄藻门、硅藻门鉴定－——黄藻门鉴定
实验材料黄丝藻属无隔藻属藻类试剂、试剂盒I-KI 溶液0.1%而甲基蓝溶液浓KOH溶液仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤黄藻门 Xanthophyta1. 黄丝藻属 Tribonema(图 2-18-4)隶属于异丝藻目，黄丝藻科。藻体为单列不分核的丝状体，细胞长圆柱形或两
Autophagy（自噬）
自噬是近年来很热门的领域，搜了一下园子，发现没有这方面系统的介绍或讨论，但很多战友有这方面的疑问，加上本人最近对此也非常感兴趣，因此，借本版来专门讨论一下自噬（说实在的，自噬属于丁香园哪一个版块的范围我也选不好），与各位同行或有志于研究自噬的战友共同学习，也欢迎大家提出自己的看法，本人的目的就是交流
噬粒（phagemid）
Phagemid Related Protocol (Erik)provides procedures for phagemid lysate preparation, titering phagemid, determining uracil incorperation and SS DNA pr
Autophagy（自噬）
自噬是近年来很热门的领域，搜了一下园子，发现没有这方面系统的介绍或讨论，但很多战友有这方面的疑问，加上本人最近对此也非常感兴趣，因此，借本版来专门讨论一下自噬（说实在的，自噬属于丁香园哪一个版块的范围我也选不好），与各位同行或有志于研究自噬的战友共同学习，也欢迎大家提出自己的看法，本人的目的就是交流
自噬分类
根据细胞物质运到溶酶体内的途径不同，自噬分为以下几种。①大自噬：由内质网来源的膜包绕待降解物形成自噬体，然后与溶酶体融合并降解其内容物；②小自噬：溶酶体的膜直接包裹长寿命蛋白等，并在溶酶体内降解；③分子伴侣介导的自噬（CMA）：胞质内蛋白结合到分子伴侣后被转运到溶酶体腔中，然后被溶酶体酶消化。CMA
研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因组异源多倍化与生物钙化机制
近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员林强团队，联合厦门大学、美国康涅狄格大学等的科研人员，获得了海洋典型钙化藻——仙掌藻和叉节藻的全基因组，揭示了仙掌藻基因组异源多倍化与不对称进化机制，阐明了钙化藻生物钙化与单细胞多核发生的遗传与分子调控机理。仙掌藻是一类胞外钙化绿藻
染色体水平冬瓜参考基因组发布
近日，广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data，广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者，广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基
关于细胞自噬的自噬形式的介绍
细胞自噬主要有三种形式：微自噬（microautophagy)、巨自噬（macroautophagy）和 分子伴侣介导的自噬 (Chaperone-mediated autophagy，CMA）。 微自噬 定义 ：指 溶酶体或者液泡内膜直接内陷底物包裹并降解的过程。 作用时间：多在种子成熟
科学家揭示钙化藻“点石成礁”的演化与调控机制
9月20日，《美国科学院院报》（PNAS）在线发表了中国科学院南海海洋研究所研究员林强团队与合作者的最新研究成果。他们首次绘制出仙掌藻异源多倍体基因组草图，解析了其种化过程与历史气候变化的关联性，揭示了胞外钙化机制及单细胞多核化的遗传基础。“论文结果为一些长期困扰学界的科学问题提供了一系列答案，对藻
Science：揭示细胞再回收中心—自噬体生物合成的关键步骤
细胞自噬（autophagy）是其在压力状况下或资源有限时分离并再循环细胞组分的一种必要细胞过程，在此过程中，诸如错误折叠的蛋白质和损伤的细胞器等“货物”会被称之为自噬体（autophagosome）的一种双膜结合室所捕获并进行靶向降解，那么这些所谓的自噬体是如何在细胞中形成的呢？近日，一项刊登
重磅！科学家质疑巨病毒存在类似CRISPR/Cas的系统
在很多细菌中发现的CRISPR/Cas免疫防御系统，因其能够简单地而又优雅地编辑宿主基因组，而成为时下最火热的生物技术，在近期产生一大批发现。在今年3月，来自法国艾克斯-马赛大学的Didier Raoult和同事们发表一篇论文，指出一种被称作mimivirus的巨病毒（giant virus）拥
冷冻电镜“新玩法”－近原子分辨率助力观察完整藻胆体
近日，科技部发布了技术成果——膜生物学国家重点实验室首次揭示完整藻胆体的三维结构。其中利用近原子分辨率的冷冻电镜获得了完整藻胆体的近原子分辨率的三维结构。攻克了藻胆体在冷冻制样时盐浓度高、稳定性差、具有优势取向等难题，整体结构分辨率达到3.5，核心区域分辨率达到3.2。 光合作用是地球上的生物
“蚕姑娘”性染色体基因组密码破解
7月8日，记者从西南大学获悉，该校教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列，并揭示了鳞翅目昆虫W染色体起源与进化新机制。相关研究成果近日发表于期刊《科学进展》。家蚕性别的决定机制一直受到科学界关注。以家蚕为代表的鳞翅目昆虫性染色体在昆虫界独树一帜。不同于大多数昆虫性染色体组为XX/XY系统
染色体级别的银杏参考基因组公开
银杏果实 曹福亮供图 作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种，银杏不仅具有特殊的科学研究价值，而且具有重要的应用价值。 近日，南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组，是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。 论文共同通讯作者、中国工