4月5日《自然》杂志精选
封面故事: 怎样提高研究经费的使用效率 全球范围内国家预算和公司预算都在缩减，这样所带来的不可避免的后果是研究预算的缩减。本期Nature上三篇Comment文章介绍了怎样提高研究经费使用效率的问题。Thomas Marty指出了学术机构三个最常见的缺乏效率的问题：对自主性的误解；不适当的治理结构；领导能力差。Paula Stephan认为，科研机构所提供的经济刺激会起反作用，同时解释了为什么会是这样。Pierre Azoulay介绍了科学方法何以可用于研究经费支持模式的研究。棘鱼物种分化的基因组学研究 三刺鱼已成为研究适应性演化的分子基础的一个强大模型。这篇论文提供了一个高质量的参照基因组序列，同时提供了来自全球海洋和淡水种群的另外20个个体的基因组。基因组分析显示，全球共享的持久性基因变异的再使用，在截然不同的棘鱼（三刺鱼是其中一种）种群的重复性演化中、在生殖隔离早期阶段的趋异生态......阅读全文
1月23日《自然》杂志精选
科学家发现癌症新基因 大多数癌症基因都是以中等频率发生突变的，在某一具体肿瘤类型的五个样本中发生突变的不到一个，所以对癌症基因的准确识别需要基于大规模取样，以便将突变率的这种异质性考虑进去。这项研究对来自超过4700个“肿瘤—正常对”的21个肿瘤类型进行了统计分析。作者识别出33个以前不知
8月7日《自然》杂志精选
8月7日《自然》杂志精选 植物生产力对气候的反应 净初级生产受到温度和降水的影响，但这是对植物代谢的一个直接效应，还是由生长季长度和植物生物质的变化所介导的一个间接生态效应？在这项研究中，Sean Michaletz等人建立了一个代谢比例理论，来测试直接和间接气候效应的相对重要性。 通过将他
7月18日《自然》杂志精选
神经活动的一种新型传感器 基因编码的钙传感器将神经记录手段带进了无脊椎动物的微小大脑中，但这种方法在脊椎动物中却落在了传统的电生理方法后面。现在，Douglas Kim及其同事通过选择性“诱变”获得一种新的超灵敏的探针，即GCaMP6，它在活体中的时空分辨率从果蝇到斑马鱼都有所提高
8月16日《自然》杂志精选
一种新型抗癌目标 这篇论文介绍了癌症基因组中“附带损伤”作为新型治疗策略一个可能基础的概念。Ronald DePinho及其同事研究了在功能上冗余的、具有“做家务”作用（比如说在细胞代谢中）的成对的“乘客”基因。他们假设，癌症中包含这样一个基因的基因删除（由于靠近肿瘤抑制基因而造成
1月31日《自然》杂志精选
封面故事：DNA碱基对引导结晶的思想被付诸实践 DNA碱基对可以引导有用材料结晶的思想，对纳米技术专家来说是一个很有诱惑力的思想。现在，在首次发现与纳米颗粒相结合的DNA可以影响它们聚合10年之后，两个研究小组已将这一概念付诸实践。Park等人发现，结合到金纳米颗粒上的DNA分子以及用来连接
7月10日《自然》杂志精选
为什么城市比农村热？ 一个城市的气温经常要比其周围农村地区高，这种城市热岛效应的普遍解释是由城市地区蒸发冷却率较低造成的。但Xuhui Lee及同事在这项研究中通过气候模拟发现，对北美各地的城市来说，白天的城市热岛效应随地表和低层大气之间热对流的效率发生变化。这种对流效应随气候条件不同而不同
11月25日《自然》杂志精选
封面故事：“黏着斑”的分子架构 细胞外基质与一个细胞的肌动蛋白细胞骨架之间的物理联系由被称为“黏着斑”（focal adhesion）的细胞器组成，它们通过“整联蛋白”（或称整合素）发挥作用。它们在人体生理中具有根本的重要性，因为它们调控细胞黏附、机械传感和控制细胞生长及分化的信
3月4日《自然》杂志精选
封面故事： 人肠道微生物的基因目录 人体是大约100万亿微生物细胞的宿主，其中大部分在肠道中，在那里它们对人的生理和营养都有深远影响，而且现在还被认为对人的生命非常关键。肠道微生物帮助人从食物中摄取能量，肠道微生物群落的变化还可能与肠道疾病或肥胖症有关。现在，一个国际合作课题组(
7月22日《自然》杂志精选
封面故事 气候变化对动物种群的影响气候变化影响植物和动物生命中定期发生的事件，如发芽、迁徙和冬眠以及种群动态和形态变化。同时对所有这些相互作用的因素进行监测是困难的，但对一种冬眠型哺乳动物（美国科罗拉多州一个亚高山环境中的一种黄腹土拨鼠种群）所作的一项长期生命史研究，
1月24日《自然》杂志精选
封面故事： 木星大气层的最新观测结果 从2007年2月开始，在以冥王星为目的地的“新地平线”探测器掠过木星的时候，木星也成为了一组地基望远镜及哈勃太空望远镜密切观测的目标。该项目进行了几星期之后的2007年3月25日，位于北纬23度的木星最强喷射流中出现了一个强烈扰动，并一直持续到2007年
8月23日《自然》杂志精选
完美“库仑拖拽”的实验演示 从一个导体中流过的电流，能够通过被称为“库仑相互作用”的电子—电子排斥力在另一个与第一个在空间上分开的导体中诱导产生电流。这样所产生的“拖拽电流”通常较小，但人们一直认为，在某些情况下这一电流有可能与驱动电流具有相同的量级。现在，这一预测通过在一个双
7月15日《自然》杂志精选
封面故事： 猴与人的分化 灵长类的化石记录很稀少，仍然存在实质性的缺口。其中一个缺口是“旧世界”的猴子与“新世界”高等灵长类的类人猿和人类的分化。这种分化以前仅限于“非洲—阿拉伯大陆”的渐新世，但在沙特西北一个新的、处在进化树根部的狭鼻猿的发现缩小了这个缺口。沙特发现的
9月18日《自然》杂志精选
丽鱼科鱼基因组适应性辐射的标志 在非洲大裂谷的湖泊和河流中发现的2000种左右的丽鱼科鱼，是适应性辐射的经典例子。这一大规模国际合作项目，对5个截然不同世系的非洲丽鱼科鱼的基因组和转录组进行了测序和分析。所获数据显示，与其他鱼种相比，它们的基因复制过多。存在大量非编码要素分化、加速的编码序列演
12月8日《自然》杂志精选
“混合型”纳米光子器件的微型化 现代技术的发展在很大程度上仍是由微型化推动的，在电子器件之后，现在光学器件又在朝着单分子功能的方向发展。将不同的、彼此分离的光子元件组合起来，以生成“混合型”纳米光子器件，这种方式可能会产生一系列有用的功能，但利用传统组装过程却难以实现
7月31日《自然》杂志精选
肺癌基因组的分析结果 来自“癌症基因组图谱研究网络”的这篇报告发布了230个切除的、未处理过的肺腺癌样本的分子特征。对转录组、基因组、甲基化组和蛋白质组所作的综合分析识别出了高速度的体细胞突变、包括RIT1和MGA在内的显著突变的基因以及由体细胞基因组变化驱动的剪接改变，并且说明存在使MAPK
6月7日《自然》杂志精选
预测全球变化的生物学影响 对生物圈将会怎样响应于人类活动而变化的大部分预测都植根于预测轨迹。这样的模型倾向于不去预测临界变化或临界点，虽说最近的研究工作表明这些情况发生的概率很高。而且，在地方尺度上，当过了临界阈限时，生态系统已知会在不同状态之间突然变化。这些作者们对生态
5月27日《自然》杂志精选
封面故事： 呼吸链Complex I的结构被确定 Complex I是呼吸链的第一种酶，它通过将NADH和苯醌之间的电子转移同质子转位耦合起来，而在线粒体中的细胞能量生产中扮演一个中心角色。这个巨大的复合物是呼吸链的最后环节，其机制和完整结构过去并不为人们所知。现在，来自大肠杆菌
4月29日《自然》杂志精选
封面故事： 寻找同卵双胞胎的遗传差别 同卵（或更准确地说“单合子”）双胞胎被广泛用来研究遗传和环境对人们疾病的贡献。对三对单合子双胞胎（其中一对有多发性硬化，另外两对没有）所作的一项研究，将最新基因组测序和分析方法应用到了这一领域，并且偶然性地发布了首批人类女性基因组序列。
12月2日《自然》杂志精选
封面故事： 阿尔法病毒包膜糖蛋白的结构 阿尔法病毒是重要的动物和人类的病原体，而且是可以致命的。比如由蚊子传播的Chikungunya病毒所造成的感染最近在印度和东南亚地区暴发。 阿尔法病毒的E1和E2糖蛋白在这种病毒感染宿主细胞的方式中居中心地位。形成病毒表面上尖状物
3月3日《自然》杂志精选
封面故事：一项持续了65年的研究 1946年，科学家开始对英格兰、威尔士和苏格兰在3月某一个星期生孩子的所有母亲进行一项研究，其目的是了解生育的社会和经济成本。近65年之后，这项研究仍在进行。1946年出生的孩子一直被跟踪到成年，主要目的是研究儿童时代的健康及一生的社会境况怎样影响
2月14日《自然》杂志精选
封面故事： 蝙蝠飞行能力先于回声定位 美国怀俄明州“绿河组”曾产生很多重要化石，包括Icaronycteris index，它在超过40年的时间里一直被认为是已知最古老的蝙蝠。它的颅腔特征表明，该动物是通过回声定位来确定猎物位置的。这一结果促使关于蝙蝠进化的“先飞行”说、“先回声定位”说和“并
3月24日《自然》杂志精选
封面故事：用斑马鱼进行黑素瘤的遗传研究 携带人类致癌基因BRAF（黑素瘤患者最常见的突变）的转基因斑马鱼，为易于进行基因操纵的黑素瘤提供了一个方便的模型。Leonard Zon及其同事的两篇论文显示了这一体系在癌症遗传学和药物开发研究中的潜力。Ceol等人筛选能与突变的B-Ra
11月15日《自然》杂志精选
胰腺癌中所涉及的新突变被发现 这项大型研究发表了对142个“胰腺导管腺癌”（最常见的胰腺癌形式）患者所做的外显子组测序结果和版本数变异体分析结果。所获得的发现包括在染色质修饰和DNA损伤修复中所涉及的基因突变，这些突变以前并没有发现与该疾病有关。重要的是，这些数据显示，在Slit
10月25日《自然》杂志精选
封面故事： 固体中电子运动的时间差别 电子在固体中能以非常高的速度运动，能在几十至几百阿秒（1阿秒=10-18秒）内穿过原子层及界面。这些非常短的运动时间最终将限制未来电子装置的运行速度。现在，物理学家对这种动态电子进行了实时实验探索。本期封面所示为，在一种固体中第一次进行的阿秒光谱测量工作
10月18日《自然》杂志精选
维生素B12转运蛋白的结构被确定 ABC转运蛋白是通过将细胞ATP的水解与基质穿过生物膜的转位耦合在一起来执行很多生理功能的膜蛋白。维生素B12穿过大肠杆菌内膜的吸收是由ABC转运蛋白BtuCD介导的，但其中所涉及的机制尚不是完全清楚。这篇文章报告了束缚在一个AMP-PNP结合状态
12月19日《自然》杂志精选
科学家呼吁对药物反应测定方法制定标准 最近，两个大型数据集编录了大量癌细胞系对治疗药物的灵敏度，并将药物反应数据与基因组特征进行了整合。John Quackenbush及同事对这两项研究进行比较，发现虽然基因表达数据在它们之间基本上是一致的，但所报告的药物灵敏度测定值及随后它们与基因组特
2月6日《自然》杂志精选
癌症免疫疗法的新目标 免疫疗法是癌症研究的一个重要领域，而且最新研究表明，以T细胞上的抑制性受体为目标进行治疗，在临床上对晚期癌症患者会有好处。这一领域的一个主要问题是，难以找到潜在治疗目标。在这项研究中，Kai Wucherpfennig及同事证明，在活体中寻找治疗目标是可行的：利用
11月13日《自然》杂志精选
与自闭症相关的遗传因素分析 泛自闭症（ASD）是一大类脑发育疾病，包括自闭症、儿童期崩解症和阿斯伯格综合征，其特征是社会交往和沟通能力降低、行为反复和兴趣有限。在本期《自然》上发表文章的两个小组采用大规模全外显子组测序方法研究了遗传新生突变和生殖系新生突变对ASD风险的贡献。Silvia D
7月30日《自然》杂志精选
封面故事 线粒体在细胞能量分布中起作用 本期封面所示为一个骨骼肌细胞中的导电性线粒体。能量在细胞内是怎样分布的？在骨骼肌中，能量分布曾被认为是通过由代谢物促进的扩散发生的，尽管遗传证据对这种分布方式的重要性提出了疑问。Robert Balaban及同事利用各种形式的高分辨率显微镜，对线粒体本
3月1日《自然》杂志精选
封面故事: 关于“最老化石森林”的最新研究成果 Goldring的“最老化石森林”（以作为上个世纪20年代纽约州博物馆一次创新展出的主题而知名）是在为纽约州Schoharie县的Gilboa堤坝和水库采石过程中发现的。古生物学家Winifred Goldri