青岛能源所首次实现蛋白质中范德华作用的定量解析
蛋白质是生命体重要组成成分和生命活动的重要执行者,在蛋白质中存在多种非共价相互作用协同工作进而稳定蛋白质结构及实现蛋白质的功能。其中,范德华作用是一种不可忽视的作用力。通常范德华作用可以根据蛋白质中结构参数如侧链基团之间的距离来推断,但是在科学实验中实现定量测量十分困难。 J-耦合常数的检测为研究范德华力提供了新的信息,理论计算方面已有相关报道,但直接的实验检测还未能实现。中国科学院青岛生物能源与过程研究所蛋白质设计研究组研究出一种新的核磁共振方法,通过检测蛋白质甲基基团碳原子与其它脂肪族侧链碳原子之间的跨范德华力的J-耦合常数,首次实现了对蛋白质中范德华作用的定量解析。相关研究成果已发表于《美国化学会志》杂志上(JACS 2018,140: 3194.)。 该研究以IgG结合蛋白质GB3为研究对象,通过对亮氨酸、异亮氨酸和缬氨酸的甲基进行[13C, 1H]选择性标记(对其它氨基酸进行[13C, 2H]标记),设计HM......阅读全文
亚基的结构特点和功能
亚基(subunit)是生物学术语,指有些蛋白质分子含有两条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构。亚基与亚基之间呈特定的三维空间排布,并以非共价键连接,它是具有四级结构的蛋白质中最小的共价单位。亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是离子键、氢键和范德华力。
关于蛋白质结构的相关内容
蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子,蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。所有蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成的多聚体,在形成蛋白质后,这些氨基酸又被称为残基。蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰,有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为,若残基
蛋白质结构的相关介绍
蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。作为一类重要的生物大分子,蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫等化学元素组成。所有蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成的多聚体,在形成蛋白质后,这些氨基酸又被称为残基。蛋白质和多肽之间的界限并不是很清晰,有人基于发挥功能性作用的结构域所需的残基数认为,若残基
ACS-Nano:范德华层-CrSBr-中作为磁有序指纹的强激子朋耦合
来自密歇根大学-上海交通大学联合研究所的Kaiman Lin教授及其团队利用温度依赖性聚光光谱和激子寿命测量法确定了纳米厚 CrSBr 中的强激子-光子耦合。 激子-声子耦合是激子与晶格振动(声子)之间的相互作用,在决定材料的光学和电子特性方面起着关键作用,为了解光物质之间的相互作用提供了宝贵
物理所发现范德华异质结间的强耦合超快电荷传输
近年来,以石墨烯为代表、靠层间范德华力结合的二维材料已经成长为一个非常大的家族。这些范德华材料呈现出从绝缘体、半导体、金属,到超导体等各不相同的电子性质。以二硫化钼(MoS22)和二硫化钨(WS22)为代表的过渡族金属硫族化合物,因其合适的能带结构和光学性质,在光电子器件等用途中有着很好的应用前
蛋白质折叠的驱动力
折叠是一种自发过程,主要由疏水相互作用,分子内氢键的形成,范德华力引导,并且与构象熵相反。折叠的过程通常始于共翻译,使N末端的蛋白质的开始而折叠C-末端的蛋白质的部分仍然被合成由核糖体; 但是,蛋白质分子在生物合成过程中或之后可能会自发折叠。这些大分子可能被视为“自身折叠”,其过程还取决于溶剂(水或
发展生命科学新质生产力-引领蛋白质科学创新
提到生命科学,大多数人会想到“基因”。然而,随着基因组学的飞速进展,生命科学研究领域逐渐发现了决定基因在细胞内功能的必要性。在“中国药谷”的上海张江科学城,中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究(上海)设施(以下简称“蛋白质设施”)作为全球生命科学领域首个综合性的大科学装置,不仅是我国蛋白质科学
发展生命科学新质生产力-引领蛋白质科学创新
提到生命科学,大多数人会想到“基因”。然而,随着基因组学的飞速进展,生命科学研究领域逐渐发现了决定基因在细胞内功能的必要性。 在“中国药谷”的上海张江科学城,中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究(上海)设施(以下简称“蛋白质设施”)作为全球生命科学领域首个综合性的大科学装置,不仅是我国蛋
毛细管电泳的结合常数
生物体内,蛋白质是必不可少的生命物质,是药物的重要靶点之一。研究药物与蛋白质之间的相互作用,有助于了解药物在体内的运输和分布的情况,对于阐明药物的作用机制、药代动力学以及药物的毒性都有非常重要的意义。药物分子与蛋白质分子相互结合的主要部位是蛋白质上的碱性氨基酸残基,相互作用力主要有静电作用、氢键、疏
蛋白质冷变性的原因
蛋白质一般认为有三级结构。一级结构是氨基酸顺序,由肽键控制,因为肽键是化学键,十分牢固,低温下很难解开。二级结构是部分氨基酸形成的区域结构,如螺旋,折片等,主要有氢键来维系,一般来说低温下也不易解开。但是三级结构有范德华力约束,控制蛋白质整体外形构造,对蛋白质活性十分重要,低温下三级结构可能发生变化
关于蛋白质三级结构的简介
蛋白质三级结构:指一条多肽链在二级结构或者超二级结构甚至结构域的基础上,进一步盘绕,折叠,依靠次级键的维系固定所形成的特定空间结构称为蛋白质的三级结构。 蛋白质三级结构(protein tertiary structure):蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。三级结构是在二级结构的基础
作用力分类
范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用。其能量计算的经验方程为:U =B/r12- A/r6 (对于2 个碳原子间,其参数值为B =11.5 ×10-6 kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3 kJ·nm6/mol;不同原子间A、B 有不同取值)当两原子彼此紧密靠
细胞化学基础作用力分类
定义:范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用。其能量计算的经验方程为:U =B/r12- A/r6 (对于2 个碳原子间,其参数值为B =11.5 ×10-6 kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3 kJ·nm6/mol;不同原子间A、B 有不同取值)当两原子彼此
关于分子间作用力的分类介绍
定义:范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用。其能量计算的经验方程为:U =B/r12 -A/r6 (对于2 个碳原子间,其参数值为B =11.5 ×10-6 kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3 kJ·nm6/mol;不同原子间A、B 有不同取值)当两原子
分子间作用力的分类
定义:范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用。其能量计算的经验方程为:U =B/r12- A/r6 (对于2 个碳原子间,其参数值为B =11.5 ×10-6 kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3 kJ·nm6/mol;不同原子间A、B 有不同取值)当两原子彼此
三种类型分子作用力的相互关系
极性分子与极性分子之间,取向力、诱导力、色散力都存在;极性分子与非极性分子之间,则存在诱导力和色散力;非极性分子与非极性分子之间,则只存在色散力。这三种类型的力的比例大小,决定于相互作用分子的极性和变形性。极性越大,取向力的作用越重要;变形性越大,色散力就越重要;诱导力则与这两种因素都有关。但对大多
关于氖化合物的基本信息介绍
(来自英文维基,其中Van der Waals Molecule不知如何翻译,暂译为范德华力分子,怀疑就是所谓包合物。) 低温高压下,氖可以与很多物质形成“范德华力分子”,例如NeAuF和NeBeS,原子被隔离在惰性气体母体中。NeBeCO3固体可以在氖气氛围中利用红外光谱法检测到。它是由铍气
分子间作用力的相互关系
极性分子与极性分子之间,取向力、诱导力、色散力都存在;极性分子与非极性分子之间,则存在诱导力和色散力;非极性分子与非极性分子之间,则只存在色散力。这三种类型的力的比例大小,决定于相互作用分子的极性和变形性。极性越大,取向力的作用越重要;变形性越大,色散力就越重要;诱导力则与这两种因素都有关。但对大多
黑曲霉絮凝剂的作用原理是什么?
黑曲霉絮凝剂的作用原理主要包括以下几个方面:吸附架桥作用:黑曲霉絮凝剂分子通常具有较长的链状结构,能够同时吸附多个悬浮颗粒,就像架桥一样将它们连接在一起,形成较大的絮团。电中和作用:污水中的悬浮颗粒通常带有电荷,黑曲霉絮凝剂可以中和这些颗粒表面的电荷,减少颗粒之间的静电排斥力,从而促进颗粒的聚集。网
蛋白质组学团队揭示蜂王浆如何提高人体免疫力
近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蛋白质组学团队发现,蜂王浆中的特有不饱和脂肪酸10-羟基-2-癸烯酸(10-HDA),具有保护免疫器官的功能和促进免疫潜力。相关研究成果发表在《靶向治疗专家观点( Expert Opinionon Therapeutic Targets )》上。 据李建科
二维材料家族添加全新成员
中国科学技术大学化学与材料科学学院吴长征教授实验课题组和武晓君教授理论计算课题组合作,成功实现非范德华力层状材料精准剥离,获得保持计量比的二维材料,为二维材料家族添加全新成员。该新二维材料展现出较之块材提升三个数量级的室温超离子导电行为。相关成果于日前在线发表在《自然•化学》杂志上。 近年来,
浅析被粘材料对剥离强度的影响
济南瑞莱铂智能科技有限公司设计研发的BLJ-80N 剥离试验机是根据180º剥离测试方法来设计研发的。采用微电脑控制,卧式结构,传感器数值不受夹具重量影响,可实现无极变速,适用于各种试验标准,试验结果直接计算出来,并可通过配带的微型打印机直接打印结果。我们在上篇文章讲解了胶粘剂本身对剥离强度的影响,
可溶性蛋白质考马斯亮蓝G250法测定的原理
考马斯亮蓝G-250(GooMAssIe BrIllIAnT Blue G-250)测定蛋白质含量属于染料结合法的一种。考马斯亮蓝G-250在游离状态下呈红色,在稀酸溶液中,当它与蛋白质的疏水区结合后变为青色,前者最大光吸收在465nM,后者在595nM。在一定蛋白质浓度范围内(1~100μg)
原子力显微镜与扫描力显微术摩擦力
摩擦力显微镜(LFM)是在原子力显微镜(AFM)表面形貌成像基础上发展的新技术之一。材料表面中的不同组分很难在形貌图像中区分开来,而且污染物也有可能覆盖样品的真实表面。LFM恰好可以研究那些形貌上相对较难区分、而又具有相对不同摩擦特性的多组分材料表面。图1 摩擦力显微镜扫描及力检测示意图
生物亲和色谱仪分离模式解析
生物亲和色谱仪是利用蛋白质或生物大分子等样品与固定相上生物活性配位体之间的特异亲和力进行分离的。一、固定相:将具有生物活性的配位体以共价键结合到不溶性固体基质上制得。二、生物活性配位体:1、酶:底物及其类似物。2、辅酶:类固醇等。3、抗体:植物激素等。4、激素:糖和多糖等。5、抗生素:核苷酸等。三、
生物亲和色谱仪分离模式解析
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静电力显微镜有哪些缺点?
静电力显微镜在实际操作中,由于探针与样品之间既有范德华力,又有库仑力。即使选用较大的工作距离,有时仍不能完全忽略原子力存在。通常的解决方法是将探针与样品之间的直流电压改为交流信号。最后,在处理信号时,只处理相关频率的交流信号,就可以将范德华力的影响排除在外。 另见:开尔文探针力显微镜。
我国学者在二维材料合成方法学研究方面取得进展
图1 AgCrS2纳米片的结构与离子输运性能 在国家自然科学基金项目(批准号:21925110、21890751)等资助下,中国科学技术大学吴长征教授团队成功合成了一类二维材料AMX2纳米片(A=单价离子,M=三价离子,X=硫族元素)。该成果以“具有室温超离子导电行为的化学计量比二维非范德华力Ag
二维材料合成方法学新进展
在国家自然科学基金项目(批准号:21925110、21890751)等资助下,中国科学技术大学吴长征教授团队成功合成了一类二维材料AMX2纳米片(A=单价离子,M=三价离子,X=硫族元素)。该成果以“具有室温超离子导电行为的化学计量比二维非范德华力AgCrS2(Stoichiometric tw
细胞化学基础分子间三种力的关系
极性分子与极性分子之间,取向力、诱导力、色散力都存在;极性分子与非极性分子之间,则存在诱导力和色散力;非极性分子与非极性分子之间,则只存在色散力。这三种类型的力的比例大小,决定于相互作用分子的极性和变形性。极性越大,取向力的作用越重要;变形性越大,色散力就越重要;诱导力则与这两种因素都有关。但对大多