华人科学家Nature公布核小体分布图
来自美国西北大学分子生物学系，统计系等处的研究人员发表了题为“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章，通过建立了一种新方法，在全基因组范围内分析核小体分布的位置，这将有助于揭示体内与转录相关的核小体作用机制。相关成果公布在6月28日Nature杂志上。 文章的通讯作者是西北大学统计系王吉平(Ji-Ping Wang，音译)博士，王博士2003年毕业于宾州州立大学，主要研究方向包括生物信息学，基因组学等方面。 真核基因组在活体中不以裸露DNA形式存在，但在被称为染色质的蛋白-DNA复合物中是以裸露DNA形式存在的。其中的核小体能帮助扭曲或者封闭基因组DNA，影响DNA片段与DNA结合蛋白的接触，而且核小体的精确位置也会影响染色质纤维的结构。核小体中即使是单个碱基对位置的变化，都会改变染色质构象，以及蛋白结合动力......阅读全文
染色质蛋白非组蛋白的介绍
非组蛋白主要是指与特异DNA序列相结合的蛋白质,所以又称序列特异性DNA结合蛋白（sequence specific DNA binding protein)。利用凝胶延滞实验（gel retardation assay）,可以在细胞抽提物中进行检测。首先制备一段带有放射性标记的已知特异序列的D
染色质非组蛋白锌指模式简介
负责 5S RNA、tRNA 和部分 snRNA 基因转录的RNA聚合酶Ⅲ所必须的转录因子。TFⅢ A 是首先被发现的锌指蛋白,由344个氨基酸组成。TFⅢ A 含有9个有规律的锌指重复单位,每个单位30个氨基酸残基,其中一对半胱氨酸和一对组氨酸与Zn2+形成配位键。每个锌指单位是一个DNA结合
染色质蛋白组蛋白的相关介绍
组蛋白是构成真核生物染色体的基本结构蛋白,富含带正电荷的Arg和Lys等碱性氨基酸,等电点一般在pH10.0以上,属碱性蛋白质,可以和酸性的DNA紧密结合,而且一般不要求特殊的核苷酸序列。 用聚丙烯酰胺凝胶电泳可以区分5种不同的组蛋白：H1、H2A、H2B、H3和H4。几乎所有真核细胞都含有这
简述染色质蛋白非组蛋白的特性
①酸碱性：组蛋白是碱性的,而非组蛋白则大多是酸性的。 ②多样性：非组蛋白占染色质蛋白的60%~70%,不同组织细胞中其种类和数量都不相同,代谢周转快。包括多种参与核酸代谢与修饰的酶类如DNA聚合酶和RNA聚合酶、HGM蛋白（high mobility group protein）、染色体支架蛋
染色质非组蛋白HMG框结构模式
在发现一组丰富的高速泳动族蛋白（high mobility group protein）以后,首先命名HMG框结构模式。该结构由3个α螺旋组成 boomerang-shaped 结构模式,具有弯曲DNA的能力。因此,具有HMG框结构的转录因子又称为“构件因子（architectural fact
华人科学家Nature公布核小体分布图
来自美国西北大学分子生物学系，统计系等处的研究人员发表了题为“A map of nucleosome positions in yeast at base-pair resolution”的文章，通过建立了一种新方法，在全基因组范围内分析核小体分布的位置，这将有助于揭示体内与转录相关的核
染色质非组蛋白亮氨酸拉链模式
在构建转录复合物过程中,普遍涉及蛋白与蛋白之间的相互作用,形成二聚体是识别特异DNA序列蛋白的相互作用的共同原则,亮氨酸拉链就是富含Leu残基的一段氨基酸序列所组成的二聚化结构。这类序列特异性DNA结合蛋白家族,包括酵母的转录激活因子（GCN4）、癌蛋白Jun、Fos、Myc以及增强子结合蛋白（
染色质蛋白非组蛋白α螺旋转角α螺旋模式介绍
这是最早在原核基因的激活蛋白和阻抑物中发现的。迄今已经在百种以上原核细胞和真核生物中发现这种最简单、最普遍的DNA结合蛋白的结构模式。这种蛋白与DNA结合时,形成对称的同型二聚体（symmetric homodimer）结构模式。构成同型二聚体的每个单体由20个氨基酸的小肽组成α螺旋-转角-α螺
染色质非组蛋白螺旋环螺旋结构模式
HLH这一结构模式广泛存在于动、植物DNA结合蛋白中。HLH由40~50个氨基酸组成两个两性α螺旋,两个α螺旋中间被一个或几个β转角组成的环区所分开。每个α螺旋由15~16个氨基酸残基组成,并含有几个保守的氨基酸残基。具有疏水面和亲水面的两性α螺旋有助于二聚体的形成。α螺旋邻近的肽链 N 端也有
抗组蛋白抗体的基本信息介绍
组蛋白是核内最丰富的蛋白质，它与DNA构成的复合物称为染色质。染色质最基本的亚单位结构是核小体(nucleosome)，它由146个碱基对组成的DNA链缠绕8个组蛋白分子(2个H2A-H2B杂二聚体之间夹着2个杂二聚体H2-H4)2圈构成的核心和核心外的组蛋白H1与连结DNA(约60个碱基对)组
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究获进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对，线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长（人类一条染色体的DNA长度约为2米），生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元，其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈，完成对DN
Polycomb组蛋白与染色质相互作用的关键机制
2021年6月，Genome Research杂志在线发表了法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授为通讯作者题为“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
NatureCell两大顶级杂志获表观遗传研究突破
来自美国宾州大学与西北大学的两个研究组，近期分别在Nature和Cell这两大顶级期刊上发表文章，分别取得了表观遗传学核小体研究方面的突破性进展，这两项的关键点都来自其重要的研究新技术――宾州大学的研究人员发展了超高分辨率ChIP-exo技术，而西北大学的研究人员则研发了一种基于改造后组蛋白的化
什么是碱基对？
碱基对，是一对相互匹配的碱基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度（尽管RNA是单链）。它还与核苷酸互换使用，尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。 碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T
常染色质的结构简介
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个
常染色质的结构介绍
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
常染色质的结构特点
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
物理所SM1组基于单分子力谱技术解析泛素修饰对基因调控
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对，线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长（人类一条染色体的DNA长度约为2米），生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元，其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈，完成对DN
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究的新进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对，线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长（人类一条染色体的DNA长度约为2米），生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元，其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈，完成对DN
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲基化
关于基因沉寂的作用介绍
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”（Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4，这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白，其中，Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶，而Sir1/3/4则负责与甲基化
关于组蛋白八聚体的特点介绍
这种集合是将DNA的166对碱基对以1.75左手超螺旋形围在这个蛋白质线轴。连接组蛋白H1将核小体核心颗粒与DNA的进入位点及E位点结合,因而可以将DNA紧扣在位,并且能容许形成更高层次的结构。最基本的形状为一个10纳米的纤维或一连串的珠子。这涉及将在每一个核小体之间约50对的DNA碱基对围在这
染色体的类型介绍
原核生物细菌和古细菌通常具有单个环状染色体，但染色体大小存在显著变异。大多数细菌染色体的大小从13万个碱基对到 1400 万个碱基对不等 。疏螺旋体属的螺旋体是个例外，仅含有单一线性染色体 。序列结构与真核生物相比，原核染色体含有更少的基于序列的结构。细菌通常具有一个复制起点，而一些古菌含有多个复
千碱基对的结构
千碱基对为kbp，或简写作kb（对于双链核酸、单链核酸，kb指千碱基）。是DNA片段的长度单位，一千个碱基对相当于两千个核苷酸。
千碱基对的定义
千碱基对kilobase (kb)定义：DNA片段的长度单位，一个千碱基对相当于2000个核苷酸。
细胞化学基础碱基对
碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说，碱基对是一对相互匹配的碱基(即A：T，G：C，A：U相互作用)被氢键连接起来。然而，它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用，尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和
碱基对的组成结构
碱基对，是一对相互匹配的碱基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度（尽管RNA是单链）。它还与核苷酸互换使用，尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。
组蛋白分子伴侣DAXX和染色质重塑蛋白ATRX相互作用模式
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈勇研究组的最新研究成果，以Structural basis for DAXX interaction with ATRX为题，发表在Protein & Cell上，该成果揭示了组蛋白分子伴侣DAXX蛋白与染色质重塑蛋白ATRX相互作用