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橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea。catas。cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到预期效果。图片来源于网络 近年来,随着基因组测序技术的进步,已有四个国家(马来西亚、泰国、中国和日本)独立绘制并公开发表了橡胶树基因组草图,其中由中国热带农业科学院橡胶研究所完成的草图版本质量最高。同时还产生了大量转录组数据。这些数据亟需一个整合的数据平台来储存、分发和共享,并进行二次挖掘利用。 2017年召开的IRC2017国际橡胶会议提出要搭建橡胶树基因组数据中心的计划。在IRRDB理事会上,中国热科院代表经过争取,获得了牵头搭建橡胶树基因组数据中心的任务,并由“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队承担开发工作。经过努力,创新......阅读全文

科学家绘制出橡胶树基因组草图

  日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图,这将有助于培育更加高产的橡胶树,提高天然橡胶的产量。  日本理化学研究所日前发布一份公报说,该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序,绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因

橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

本报讯 日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea.catas.cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到

橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

  日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea。catas。cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到预期效果。

中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种

  从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进

一国际研究小组将精度达93.7%的橡胶树基因组草图绘出

  日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。    该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度

历时6年-获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

一国际研究小组将精度达93.7%的橡胶树基因组草图绘出

  日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。  该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度解读的“

我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。

   橡胶树(Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. )是大戟科(Euphorbiaceae)植物。在植物界大约2,500种产胶植物中(如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh

给300多橡胶树重测序后,他们终于发现产量密码

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506120.shtm 将近150年前,橡胶树被英国人魏克汉引种到英国的邱园,开启了人工驯化历程。近日,中国热带农业科学院橡胶研究所教授田维敏团队联合中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员李家洋院士团队和梁

我国率先完成杜仲基因测序

  中国林业科学研究院经济林研究开发中心消息:该中心杜红岩团队、乌云塔娜团队联合中国热带农业科学院橡胶研究所李德军团队及山东贝隆杜仲生物工程有限公司高瑞文团队,历时五年,合作完成了杜仲基因测序项目。成果在国际知名学术期刊《分子植物》上在线发表。此举使我国成为世界上首个完成杜仲基因测序的国家。图片来源

我国科学家完成杜仲基因测序

  近日,我国科学家研究获得杜仲高质量基因组序列并解析了杜仲环境适应及胶生物合成机制。图片来源于网络  天然橡胶与石油、煤炭和钢铁并称为四大工业原料,是关系国计民生的基础产业和重要战略物资。杜仲是传统的名贵中药材,也是我国特有的产胶植物。在众多产胶植物中,杜仲产业化前景最大,极具开发潜力。近日,中国

橡胶树花青素合成调控研究获进展

近日,中国热科院橡胶所在橡胶树花青素生物合成的转录调控方面取得重要进展,相关成果发表于《工业作物和产品》。该成果不仅丰富了对橡胶树花青素合成转录调控的认识,也为橡胶树遗传转化体系提供了高效的选择标记。橡胶树叶片的发育过程可分为古铜期、变色期、淡绿期和稳定期四个阶段。研究团队通过高效液相色谱分析发现一

橡胶树花青素合成调控研究获进展

  近日,中国热科院橡胶所在橡胶树花青素生物合成的转录调控方面取得重要进展,相关成果发表于《工业作物和产品》。该成果不仅丰富了对橡胶树花青素合成转录调控的认识,也为橡胶树遗传转化体系提供了高效的选择标记。  橡胶树叶片的发育过程可分为古铜期、变色期、淡绿期和稳定期四个阶段。研究团队通过高效液相色谱分

我国研究发明出橡胶树籽苗芽接育苗技术

工作人员在海南橡胶树气刺微割技术示范基地割胶。  经过20多年的研究,我国热带农业科研人员在橡胶树传统芽接育苗技术的基础上,研究发明出橡胶树籽苗芽接育苗技术。这标志着我国橡胶树优良品种籽苗芽接育苗技术达到了国际领先水平。  记者从中国热带农业科学院获悉,该院科研人员这些年开展了橡胶树

今夏最热门的基因组测序研究,中国学者再立新功

  大千世界无奇不有,这都是进化的功劳。大航海时代,科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今,科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点,我国学者参与的两项测序研究格外引人注目。  种属:虎鲸(Orcinus orc

橡胶树树干轮廓信息自动化提取方面获进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503706.shtm近日,中国热带农业科学院橡胶研究所(以下简称橡胶所)机械装备与自动化团队在橡胶树树干轮廓信息提取方面获得新进展,成功提取了橡胶树树干轮廓曲线及其表面特征信息,不仅能提升割胶装备树干轮廓

科学家破译“橡胶草”基因组

  天然橡胶是与石油、钢铁、煤炭并重的世界四大工业原料之一,而中国是天然橡胶消费大国,目前对外依赖度超80%。记者从中国科学院遗传与发育生物学研究所了解到,我国科学家已成功绘制出橡胶草基因组草图。该成果将加快橡胶草替代橡胶树,成为新的橡胶“生产者”的进程。  据了解,巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主

新发现橡胶树是“机会主义的”水分摄取者

  三叶橡胶树原是亚马逊的热带雨林树种,其生长需要充足的热量和分配均匀的降水,大致分布于10°N~10°S,最高海拔600m。近半个多世纪以来,由于人们对橡胶需求量的剧增,其已被引种到了东南亚、南美、非洲的许多高纬、高海拔地区。对西双版纳地区而言,近30年来最显著的土地利用变化就是大面积的热带雨林被

中科院等完成橡胶草基因组序列解析

   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作,在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展,标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》(National Science Review)杂

版纳植物园发现橡胶树是“机会主义的”水分摄取者

  三叶橡胶树原是亚马逊的热带雨林树种,其生长需要充足的热量和分配均匀的降水,大致分布于10°N~10°S,最高海拔600m。近半个多世纪以来,由于人们对橡胶需求量的剧增,其已被引种到了东南亚、南美、非洲的许多高纬、高海拔地区。对西双版纳地区而言,近30年来最显著的土地利用变化就是大面积的热带雨林被

全是因为这种被联合国称为生物武器的病菌

  不知道大家有没有去过南美旅行。如果你搜索一下我国来往南美任何地方的航班,会发现没有直飞的航班,总要在某处中转,旅行时间总是超出一天。  实际上不仅是我国,东南亚大多数国家都没有直飞南美的航班。这背后的原因是一种看不见的生物,而这种生物也被联合国列为生物武器,它就是橡胶南美叶疫病菌。  和石油类似

研究揭示间种药用草本植物对老龄橡胶林水分利用的影响

  历经几十年繁荣后,西双版纳地区许多橡胶林已步入了中老龄阶段,有待于重新定植。然而,面对持续低迷的胶价,胶农们似乎已失去了重植橡胶的信心,因此少数橡胶林也转变成了其他经济种植林,但大面积中老龄橡胶林的存留与改造仍是无法回避的现实问题。针对受价格波动为导向的橡胶种植业而言,探索适宜的林下间作植物、设

天然橡胶的特性分布

橡胶树原产于巴西亚马逊河流域马拉岳西部地区,现已布及亚洲、非洲、大洋洲、拉丁美洲40多个国家和地区。种植面积较大的国家有:印度尼西亚、泰国、马来西亚、中国、印度、越南、尼日利亚、巴西、斯里兰卡、利比里亚等。我国植胶区主要分布于海南、广东、广西、福建、云南,此外台湾也可种植,其中海南为主要植胶区。常绿

中国的橡胶热潮导致“生态信贷紧缩”

橡胶树吸收了大量的水并增加地表径流   中国的原始森林正在成为橡胶种植园的受害者,而且科学家计算出了它的环境后果。   在过去的10年中,橡胶价格增加到了原来的3倍,而中国打算到2010年生产比2007年多1/3的橡胶,从而满足它的蓬勃发展的汽车和轮胎工业。   科学家正在选择性地培养橡胶

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

研究发现水稻转座子受驯化选择和抗病抗逆中的调节功能

  6月19日,Molecular Plant 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所何祖华研究组题为Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1