生化与细胞所揭示YB1调控3’剪接位点识别的重要功能

6月22日,国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所惠静毅研究组题为YB-1 binds to CAUC motifs and stimulates exon inclusion by enhancing the recruitment of U2AF to weak polypyrimidine tracts的研究论文。该研究结果揭示了YB-1蛋白在调控3’剪接位点识别中的重要功能。 YB-1蛋白是一个多功能的DNA/RNA 结合蛋白,它在转录和翻译调控中均能发挥重要作用。近年来的一些报道表明,YB-1是一个剪接体相关蛋白并参与可变剪接,但是它调控剪接的分子机制并不清楚。本项研究发现,YB-1能够特异地结合含有CAUC或CACC核心序列的RNA,并证明了CAUC序列是一类新的剪接增强子。利用细胞表面吸附分子 CD44基因作为模型,研究阐明YB-1通过结合C......阅读全文

细胞凋亡检测:生化特征的检测方法

根据调亡的生化特征的检测方法一、琼脂糖凝胶电泳1)常规的琼脂糖凝胶电泳方法一:1.收集细胞(5×106)1000r/min,离心5min,去上清。2.PBS洗一次,1000r/min,离心5min,去上清。3.加细胞核裂解液500μl重悬细胞,50℃水浴,3~5h,不时振摇或37℃过夜。4.加0.5

细胞凋亡的形态:生化性质实验

使用活体荧光染料的显微镜定量凋亡指数和细胞活力(台盼蓝染色) 吖啶橙染色 吖啶橙或溴化乙锭染色             实验方法原理

概述癌细胞的生化学原理

  中国国家级有突出贡献的癌症研究家戴乾环在他的致癌“双区理论”和“转录基因”研究成果中,也进一步证实了“致癌作用的关键步骤是互补碱对之间的交连”(《人民日报》1993年8月15日)、“致癌的机理则是互补移码变异”并且,戴乾环还通过大量的量子化学计算法,发现“化合物在体内发生致癌作用的必要条件是它在

生化检测项目唾液中的细胞介绍

唾液中的细胞介绍:  唾液(saliva)是腮腺、颌下腺、舌下腺和散在小唾液腺的分泌液。其分泌受神经反射的调节。唾液成分中水占99%以上;固体成分占约0.7%,其中有机物约占0.5%,无机物约占0.2%,此外,还有少量白细胞、上皮细胞(来自口腔黏膜和唾液腺)、痕量食物以及口腔中的微生物。唾液中的细胞

形成癌细胞的生化学原理

中国国家级有突出贡献的癌症研究家戴乾环在他的致癌“双区理论”和“转录基因”研究成果中,也进一步证实了“致癌作用的关键步骤是互补碱对之间的交连”(《人民日报》1993年8月15日)、“致癌的机理则是互补移码变异”并且,戴乾环还通过大量的量子化学计算法,发现“化合物在体内发生致癌作用的必要条件是它在体内

细胞凋亡的形态:生化性质实验

实验方法原理 实验材料 细胞试剂、试剂盒 染料混合物:0.01%台盼蓝l00μg ml吖啶橙或 100μg ml吖啶橙+100 μg ml溴化乙锭所有试剂都在PBS中制备约5×105〜5×106细胞 ml的细胞悬浮液在完全的RMPI 1640培养基仪器、耗材 12 mm×75 mm的玻璃试管显微镜载

上海生化细胞所公共技术平台

孙爱龙  副研究员/技术支撑主管,中国科学院上海生科院生化细胞所  中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所成立于2000年5月,由原中科院上海生物化学研究所(1950-2000年)与原中科院上海细胞生物学研究所(1950-2000年)整合而成。在王应睐、朱洗等前辈科

关于外显子捕获的操作步骤介绍

  (1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。  (2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋

分子遗传学词汇外显子跳读

中文名称:外显子跳读英文名称:exon skipping定  义:跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Nature发布外显子组测序新成果

  一项新遗传学研究揭示了与严重儿童癫痫相关的两个新基因,并为确定治疗靶点提供了一种新策略。这项研究采用了一种称之为外显子组测序(exome sequencing)的先进遗传学技术,来搜寻不遗传的新突变。研究结果表明,它或许是发现及证实许多致病基因突变的一种高效的方法。相关论文发表在8月11日的

外显子测序揭示复发突变的预后

  研究人员对肿瘤做了外显子测序,并且将其与超过450名骨髓瘤患者获得的正常样品进行了匹配,这450名患者都是通过国家癌症研究所的骨髓瘤XI实验招募的,这是一个使用依靠临床结果、分子细胞遗传学和数据等等进行的精密或者不精密骨髓瘤治疗项目的临床3期实验。  在所有骨髓瘤样本中出现的基因突变频率,他们发

Science大型低成本,外显子测序成果

  来自华盛顿大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员利用一种新型技术,完成了多达2446个样品外显子测序分析,找到了自闭症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的多个频发突变,不仅为治疗ASD疾病提供了新思路,而且也提出了一种低成本,多基因测序新方法。相关成

分子遗传学词汇外显子捕获

中文名称:外显子捕获外文名称:exon trapping定义:外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体

分子遗传学词汇外显子混编

当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。中文名称:外显子混编定    义:混编而成基因片段可能就是外显子

分子遗传学词汇外显子互换

中文名称:外显子互换英文名称:exon exchange定  义:通过交换外显子进行基因重排的方式。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Proton和HiSeq外显子组平台比较

Proton和HiSeq外显子组平台比较:单核苷酸变异检测均表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检

关于外显子的基本信息介绍

  断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。  既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序

外显子的基因捕捉的相关介绍

  外显子捕捉(exontrapping)是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕捉外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体(shuttlevector),即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体(见图5—14)。因为凡是有内含

关于外显子基因识别的基本介绍

  许多基因中遗传上的“无义”片段——即内含子,会妨碍基因指导蛋白质的合成。现在,一篇发表于3月11日期的《自然遗传学》杂志上的文章提出了基因识别这些内含子的新机制。  细胞产生一种蛋白质时,首先需要将编码蛋白质的基因转化成RNA分子,接下来,通过细胞的剪接机制除去有潜在破坏作用的内含子,再把基因序

生化检测项目羊水脂肪细胞出现率介绍

羊水脂肪细胞出现率介绍:  羊水中脂肪细胞检查,随妊娠期羊水中脂肪细胞数量逐渐增多,可作为胎儿皮脂腺成熟程度的指标。羊水脂肪细胞出现率正常值:  油溶红O:  早期妊娠:50%)。  硫酸尼罗蓝:  早期妊娠:0 (0%)。  足月妊娠:>0.20 (20%)。羊水脂肪细胞出现率临床意义:  >0.

生化检测项目红细胞膜磷脂介绍

红细胞膜磷脂介绍:        含磷的脂质称为PL。磷、脂肪酸和醇类可形成各种不同的PL,如卵磷脂、溶血磷脂(磷脂酰胆碱)、脑磷脂(磷脂酰乙醇胺)和心磷脂(二磷脂酰甘油),它们都是构成生物膜脂质双层的基本骨架。磷脂也是构成和维持细胞膜成分、功能的重要物质。红细胞膜磷脂正常值:  薄层层析法: 磷脂

慢性肝细胞损伤的检验指标临床生化

慢性肝细胞损伤的检验指标:(一)慢性肝细胞损伤的酶学指标γ-GT在反映慢性肝细胞损伤及其病变活动时较转氨酶敏感。γ-GT活性75%存在于肝细胞微粒体,当慢性肝病有活动性病变时,诱导微粒体酶合成增加。在急性肝炎恢复期ALT活性已正常,如发现γ-GT活性持续升高,即提示肝炎慢性化;慢性肝炎即使ALT正常

生化检测项目红细胞乳酸生成率介绍

红细胞乳酸生成率介绍:  乳酸在体内的增加主要是血氧的缺乏,导致三羧酸循环中丙酮酸需氧氧化障碍,糖酵解速度增加,即丙酮酸还原成乳酸的速度增加,血中乳酸与丙酮酸比值增高及乳酸增加。出现高乳酸血症。乳酸的测定一般用全血乳酸分光光度法或血浆乳酸的比色法。红细胞乳酸生成率正常值:  全血乳酸0.5-1.7m

细胞凋亡的生化特征主要有哪些

1.形态学变化  形态学观察细胞凋亡的变化是多阶段的,细胞凋亡往往涉及单个细胞,即便是一小部分细胞也是非同步发生的.首先出现的是细胞体积缩小,连接消失,与周围的细胞脱离,然后是细胞质密度增加,线粒体膜电位消失,通透性改变,释放细胞色素C到胞浆,核质浓缩,核膜核仁破碎,DNA降解成为约180bp-20

生化检测项目红细胞己糖激酶介绍

红细胞己糖激酶介绍:  红细胞己糖激酶(HK)是细胞溶酶中的一种转移酶。红细胞己糖激酶正常值:  (1) 成人  习惯单位:1.27±0.18U/g Hb (±s)  36.8±5.2U/1012 RBC(±s)  0.43±0.06U/ml RBC (±s)  法定单位:0.08±0.01U/mo

细胞凋亡的生化特征主要有哪些

1.形态学变化  形态学观察细胞凋亡的变化是多阶段的,细胞凋亡往往涉及单个细胞,即便是一小部分细胞也是非同步发生的.首先出现的是细胞体积缩小,连接消失,与周围的细胞脱离,然后是细胞质密度增加,线粒体膜电位消失,通透性改变,释放细胞色素C到胞浆,核质浓缩,核膜核仁破碎,DNA降解成为约180bp-20

人源抗体开发——B细胞永生化-(二)

2.3 遗传修饰以促进抗凋亡因子表达原癌基因BCL-6属于抗细胞凋亡家族,具有转录抑制功能,可促进B细胞增殖,同时抑制B细胞向浆细胞分化,BCL-xL作为BCL-2家族成员蛋白,通过与促凋亡蛋白的拮抗作用从而抑制细胞凋亡。Kwakkenbos等利用逆转录病毒转导系统将BCL-6和BCL-xL基因导入

人源抗体开发——B细胞永生化-(一)

人源单克隆抗体具有免疫原性低、半衰期长等优势,成为了体内应用中不可或缺的生物制剂。人类抗体库为人源单克隆抗体的制备提供了丰富的来源,人B细胞永生化是获得人类抗体库的潜在有效方法,可应用于人源单克隆抗体的制备。由于各平台均有亟待解决的问题,基于人B细胞永生化的抗体制备尚局限在实验室研究阶段,本文以明确

生化与细胞所召开院士座谈会

  8月29日至31日,中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所在杭州召开院士座谈会。所长林安宁、常务副所长兼党委书记景乃禾、党委副书记郭金华、副所长刘小龙与中科院院士龚岳亭、中国工程院院士李载平、中科院院士洪国藩、中科院院士戚正武、中科院院士张友尚、中科院院士张永莲、中科院

生化检测项目红细胞醛缩酶介绍

红细胞醛缩酶介绍:  醛缩酶是一类催化醇醛缩合反应酶类的总称,是体内碳水化合物代谢糖酵解过程中重要酶之一。它广泛分布于人体组织中,以心脏和肝脏内最多。主要功能是将1,6二磷酸果糖分解为磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛,以及将1-磷酸果糖分解为磷酸二羟丙酮和甘油醛。ALD在红细胞和血小板内含量甚高,故送检