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液体核磁与小角度X射线散射刻画CTCF多点识别DNA动态特性

中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in Multivalent Recognition of DNA As Revealed by NMR Spectroscopy”为题在线发表在The Journal of Physical chemistry Letters上。 多功能转录因子CTCF含有11个串联锌指,在基因表达过程中起着关键性的作用。它在基因组中有着多种结合位点;通过与这些不同的结合位点结合,CTCF可以使得线性的染色质成环,形成拓扑结构,并在此基础上进一步架构为染色质的三维空间构象。 虽然CTCF的11个串联锌指的可塑性是其识别基因组中多个位点的必要因素,但这1......阅读全文

我国学者应用液体核磁刻画CTCF多点识别DNA的动态特性

  稳态强磁场实验装置(SHMFF)用户中科大生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果在线发表在《物理化学快报杂志》上。CTCT与DNA相互作用示意图  多功能转录

大跃进 | 中国学者CNS发表超过100篇生命科学领域研究成果

  【50】2019年4月12日,中科院上海药物所徐华强,王明伟,浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

Nature 表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

染色质高级结构变化调控细胞凋亡的新机制

  真核生物DNA通过缠绕组蛋白八聚体形成以核小体为重复单元的串珠结构,再通过形成远距离的染色质环等高级结构而存储于细胞核中。近年来研究表明染色质高级结构在维持基因表达和细胞命运决定等方面发挥重要作用,且染色质高级结构的形成和维持需要特定转录因子的介导。多功能转录因子CCCTC结合因子(简称:CTC

重磅 | 3篇Nature背靠背发表,科学家发现新型的致癌机制

  在所有真核细胞中,基因表达分三步进行,分别由RNA聚合酶(RNA polymerase)、剪接体(Spliceosome)、和核糖体(Ribosome)执行。首先,储存在遗传物质DNA序列中的遗传信息必须通过RNA聚合酶的作用转变成前体信使RNA (precursor messenger RNA

Naure揭示失活X染色体惊人发现

  马萨诸塞大学医学院、居里研究院和斯坦福大学的科学家们,详细地查看了磁性哺乳动物失活X染色体紧密包装的小结构——巴尔氏小体(Barr body)的内部,并开发出了一个模型系统,其有可能成为了解染色体结构和基因表达的一个重要工具。  长期以来人们都认为失活的X染色体是一种相当无组织的紧密结构,但发表

动则2米长的DNA,为什么不像耳机线那样容易打结?

  一个简单的过程似乎能解释庞大的基因组是如何保持有序的,但人们无法就这一过程由何驱动达成一致。  Leonid Mirny在办公椅上转了一圈,抓起自己笔记本电脑的电源线。他用手指绕出了一个甜甜圈大小的环,兴奋地坐立难安:“这就是马达蛋白不断挤压成环的动态过程!”Mirny说。他是美国麻省理工学院的

Nature:新研究详细揭示染色体的自我重新组装机制

  在一项新的研究中,美国费城儿童医院儿科血液学主任Gerd A. Blobel博士及其同事们发现了一种基本生物学过程---细胞核及其染色体物质在细胞分裂后如何自我重新组装---的关键机制和结构细节。这些新的发现为人类健康和疾病提供了重要的新见解。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为

染色体在细胞分裂后的自我重新组装机制

  在一项新的研究中,美国费城儿童医院儿科血液学主任Gerd A. Blobel博士及其同事们发现了一种基本生物学过程---细胞核及其染色体物质在细胞分裂后如何自我重新组装---的关键机制和结构细节。这些新的发现为人类健康和疾病提供了重要的新见解。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为

揭示染色体在细胞分裂后的自我重新组装机制

  在一项新的研究中,美国费城儿童医院儿科血液学主任Gerd A. Blobel博士及其同事们发现了一种基本生物学过程---细胞核及其染色体物质在细胞分裂后如何自我重新组装---的关键机制和结构细节。这些新的发现为人类健康和疾病提供了重要的新见解。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为

Science发表单分子成像新应用 年前将入职西湖大学

  真核生物基因组极具复杂性。如何将宏观尺寸的基因组DNA包装入微米级的细胞核中是生命科学的基本问题之一。在细胞周期中,基因组具有高度组织性。在细胞周期间期,基因组形成不同的区室(Compartment)和结构域(Domain),而在有丝分裂期,基因组被高度凝聚成X形染色体。一类高度保守的ATP酶多

中科院JBC文章揭示转录调控新机制

  来自中科院广州生物医药与健康研究院、吉林大学等机构的研究人员证实,凝集蛋白复合体负向调控了基因组调控蛋白CTCF介导的核糖体RNA基因转录。这项工作发表在7月24日的《生物化学杂志》(JBC)上。   中科院广州生物医药与健康研究院的姚红杰(Hongjie Yao)是这篇论文的通讯作者。其主要

两位华人教授最新Cell介绍新技术 胚胎干细胞中的核小体

高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性,因此也是科学家们关注的研究领域之一。近日,来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法,为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一个宝贵的

DNA不打结的秘密

  Leonid Mirny在办公椅上转了一圈,抓起电脑的电源线,用手指绕出了一个甜甜圈大小的环。“这就是马达蛋白不断挤压成环的动态过程!”美国麻省理工学院生物物理学家Mirny兴奋地说。  但让Mirny兴奋的原因并不是将电脑配件收拾整齐,而是基因组的一个核心组织原则——约2米长的 DNA 是如何

Cell重要发现:揭示基因表达调控新层面

  在几乎每个人类细胞的内部都有着一个直径为6微米(大约是人类头发宽度的1/300)的细胞核,细胞核中填满了大约3米长的DNA。DNA被紧密压缩装在细胞核内,其必须要接近细胞的转录机器才能充当指令引导所有的细胞过程。长期以来科学家们都认为DNA的包装方式影响了基因表达。现在,Whitehead研究所

Cell重大突破:科学家全面解析人类基因组3D折叠图谱

  同样的纸能折成各种各样的东西,比如起重机、昆虫等等。人类机体也面临着类似的问题,每个细胞的基因组都是一样的,但细胞需要执行不同的功能,比如免疫细胞负责抵御感染、视锥细胞感知光线、心肌细胞得不停的搏动。  Baylor医学院、Rice大学、Broad研究所和哈佛大学的科学家们在本周Cell杂志上发

人体如何发育?首次揭示人类早期胚胎染色体结构动态

   人体是如何发育的?个体差异是怎么产生的?疾病又是如何来的?科学家正一步步揭开其神秘面纱。  12月5日,《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果,该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化,并发现CTC

中科院发表Cell Res文章:三维基因组组装重要新机制

  来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心,中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,阐明了染色质架构蛋

广州生物院在抑制宫颈癌细胞增殖机理方面取得新进展

  CCCTC结合因子(下简称CTCF)是含有11个高度保守的锌指结构蛋白,具有多种生物学功能,包括启动子的激活与抑制、基因印记、基因沉默与绝缘、X染色体的失活等。已有研究发现,CTCF可以抑制c-Myc基因的表达,在细胞生长与增殖、系统发生以及肿瘤发生等方面都有着重要的作用。   最近,中科院广

肖锐教授揭示RNA结合蛋白与转录因子具有广泛的关联作用

  越来越多的证据表明,转录控制和染色质活性在很大程度上涉及调节类的RNA,这可能会产生特定的RNA结合蛋白(RBPs)。尽管多个RBP与转录控制有关,但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色质。  2019年6月27日,加州大学圣地亚哥分校付向东及武汉大学医学研究院肖锐共同通讯在Cell 在线发表题

Cell杂志最受关注十篇文章(7月)

  Cell创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:   1. Therape

两位华人教授最新Cell介绍新技术 胚胎干细胞中的核小体

  高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。核小体的组织影响了基因活性,因此也是科学家们关注的研究领域之一。  近日,来自美国西北大学的研究人员的研究人员介绍了一种新研发的化学生物学方法,为研究哺乳动物细胞中核小体如何介导基因调控提供了一

科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

  早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。  201

Science:中美科学家揭示大脑发育机制

  上海交通大学系统生物医学研究院吴强教授与美国哥伦比亚大学教授、分子生物学先驱 Tom Maniatis 研究团队合作,发现原钙粘蛋白基因簇表达的一个特定异构体决定5-羟色胺神经环路的组装和轴突空间规则排列(axonal tiling and even spacing),这一研究成果于2017年4

Science:端粒酶的调控

  对于所有多次分裂的细胞来说,维持染色体两端端粒(telomere)的长度是至关重要的。一种称作端粒酶(telomerase)的酶可使两端得以延长,以抵消每次染色体拷贝所发生染色体缩短。端粒酶是细胞生存的必要条件,端粒酶功能丧失可导致干细胞自我更新障碍,从而引起诸如先天性角化不良、再生障碍性贫血和

8月2日《自然》杂志内容精选

髓母细胞瘤基因组的测序分析   髓母细胞瘤是儿童罹患的最常见恶性脑瘤。2012年8月2日的Nature杂志上发表的4篇论文,采用全基因组和其他测序方法,为我们提供了关于这种疾病的遗传学和基因组学的一幅详细画面。主要发现包括:识别出了以前没有被发现与髓母细胞瘤相关的基因的复发性突变,同

上海交大教授参与发表最新成果:5-羟色胺作用新机制

  来自哥伦比亚大学,上海交通大学等处的研究人员发表了题为“Pcdhαc2 is required for axonal tiling and assembly of serotonergic circuitries in mice”的文章,发现5-羟色胺能神经细胞基本上只表达一种单一的原钙粘蛋白异

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

高低温冷热冲击试验箱操作方法 科文为您讲解

  高低温冷热冲击试验箱是用来测试复合材料及材料结构,在瞬间下经极高温和极低温的连续环境下所能忍受的程度,即以在最短时间内试验其因热胀冷缩所引起的化学变化或物理伤害。冷热冲击试验箱适用于电子芯片IC、半导体、LED显示屏、LED照明灯具、汽车零部件、锂电池新能源、塑胶料、金属五金、PCB基板等产品和