液体核磁与小角度X射线散射刻画CTCF多点识别DNA动态特性

中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in Multivalent Recognition of DNA As Revealed by NMR Spectroscopy”为题在线发表在The Journal of Physical chemistry Letters上。 多功能转录因子CTCF含有11个串联锌指,在基因表达过程中起着关键性的作用。它在基因组中有着多种结合位点;通过与这些不同的结合位点结合,CTCF可以使得线性的染色质成环,形成拓扑结构,并在此基础上进一步架构为染色质的三维空间构象。 虽然CTCF的11个串联锌指的可塑性是其识别基因组中多个位点的必要因素,但这1......阅读全文

CTCF:-First-Multivalent-Nuclear-Factor

CTCF is central to signaling pathways in immature B cells elicited by cross-linking the Ig BCR and stimulation with TGF?. Both stimuli result in induc

核受体信号通路相关因子CTCF

该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(hd

CTCF基因编码功能及结构描述

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CTCF的结构特点和生理作用

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CTCF基因突变与药物因子介绍

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核受体信号通路CTCF基因的临床解释

该基因属于boris+ctcf基因家族,编码一个具有11个高度保守的锌指结构域的转录调节蛋白。这种核蛋白能够利用zf结构域的不同组合来结合不同的dna靶序列和蛋白质。根据所述位点的上下文,所述蛋白质可结合包含组蛋白乙酰转移酶(hat)的复合物并作为转录激活剂发挥作用,或结合包含组蛋白脱乙酰基酶(hd

我国学者应用液体核磁刻画CTCF多点识别DNA的动态特性

  稳态强磁场实验装置(SHMFF)用户中科大生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果在线发表在《物理化学快报杂志》上。CTCT与DNA相互作用示意图  多功能转录

液体核磁与小角度X射线散射刻画CTCF多点识别DNA动态特性

  中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得重要进展。相关成果以“Dynamic Nature of CTCF Tandem 11 Zinc Fingers in M

染色质高级结构变化调控细胞凋亡的新机制

  真核生物DNA通过缠绕组蛋白八聚体形成以核小体为重复单元的串珠结构,再通过形成远距离的染色质环等高级结构而存储于细胞核中。近年来研究表明染色质高级结构在维持基因表达和细胞命运决定等方面发挥重要作用,且染色质高级结构的形成和维持需要特定转录因子的介导。多功能转录因子CCCTC结合因子(简称:CTC

调控基因表达的“染色质环”新因子筛选获进展

  中国科学院广州生物医药与健康研究院、生物岛实验室研究员姚红杰课题组通过系统性筛选在基因组上与CTCF共定位的转录因子,鉴定出大量与CTCF存在高共定位率的新转录因子,并选取了转录因子BHLHE40进行后续的功能验证,发现BHLHE40可以调控CTCF在基因组上的结合,进而影响其介导的远距离染色质

中科院发表Cell-Res文章:三维基因组组装重要新机制

  来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心,中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,阐明了染色质架构蛋

染色质高级结构调控细胞命运机制研究中获进展

真核生物基因组DNA缠绕在组蛋白八聚体上形成染色质,并在染色质架构蛋白的作用下逐级折叠形成远距离的染色质相互作用(或染色质环)、拓扑相关结构域和染色质区室等染色质高级结构。远距离染色质互作可以调控基因表达,在细胞命运决定过程中具有关键作用。CCCTC结合因子(简称CTCF)最早被认为是绝缘子结合蛋白

染色质架构蛋白CTCF结合人类基因组位点的机制研究取得..

  近日,国际著名学术期刊《Cell Research》杂志在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强课题组和中科院北京生物物理所王艳丽课题组合作研究成果,“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver

新研究揭示导致神经发育障碍的分子机制

7月1日,《自然-通讯》刊发了广州国家实验室研究员姚红杰团队与合作者最新成果。他们综合运用小鼠模型和人源类器官模型,揭示了染色质架构蛋白CCCTC结合因子(简称CTCF)的精氨酸567突变为色氨酸(R567W)点突变通过调控CTCF在染色质上的结合和局部三维基因组结构,进而导致神经发育障碍的分子机制

广州生物院在抑制宫颈癌细胞增殖机理方面取得新进展

  CCCTC结合因子(下简称CTCF)是含有11个高度保守的锌指结构蛋白,具有多种生物学功能,包括启动子的激活与抑制、基因印记、基因沉默与绝缘、X染色体的失活等。已有研究发现,CTCF可以抑制c-Myc基因的表达,在细胞生长与增殖、系统发生以及肿瘤发生等方面都有着重要的作用。   最近,中科院广

染色质高级结构调控多能干细胞诱导机制获进展

中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员姚红杰课题组联合美国加州大学圣地亚哥分校教授付向东课题组,运用体细胞重编程到诱导多能干细胞为模型结合多维组学技术并联合生物信息分析,揭示了CCCTC结合因子(以下简称CTCF)介导的染色质绝缘和染色质结构变化协同调控干细胞多能性获得的新机制。相关研究4月5日发

中科院JBC文章揭示转录调控新机制

  来自中科院广州生物医药与健康研究院、吉林大学等机构的研究人员证实,凝集蛋白复合体负向调控了基因组调控蛋白CTCF介导的核糖体RNA基因转录。这项工作发表在7月24日的《生物化学杂志》(JBC)上。   中科院广州生物医药与健康研究院的姚红杰(Hongjie Yao)是这篇论文的通讯作者。其主要

中国医学科学院最新文章解析HOX基因表达模式

  “核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英

第二军医大学发表癌症表观遗传学研究

  近年来人们发现,γ-氨基丁酸(GABA)对肿瘤的发生和发展有调控作用。在肿瘤组织中,GABA及其合成酶GAD1(谷氨酸脱羧酶1)的表达水平显著增加。不过,人们对这一现象背后的机制还知之甚少。  第二军医大学的研究团队最近在Oncogene杂志上发表文章,揭示了癌细胞中DNA甲基化重新激活GAD1

Nature:人类早期胚胎发育过程中的染色体结构动态变化

   染色体三维结构是重要的表观遗传因素,与基因的表达调控密切相关。研究染色体三维结构在人类精子及早期胚胎中的动态变化和调控分子对于深入理解人类胚胎发育有重要的理论和临床意义。  人类个体发育从精卵结合形成受精卵开始,经历早期胚胎发育过程,由一个细胞逐渐分裂分化形成一个含有上百种细胞类型、多种器官的

JEM:饮食干预改善2型糖尿病胰岛β细胞功能损伤分子机制

  营养过剩和运动缺乏引起的肥胖和2型糖尿病(T2D)已成为全球性公共卫生突出问题之一,严重危害人类健康的同时造成了巨大的社会负担和经济损失。然而最新的统计数据显示,目前全球仅有不到一半的 T2D 患者接受治疗,且其中超过半数患者的血糖控制不佳,最终引起多种并发症。胰岛β细胞功能损伤是 T2D 发生

研究发现影响血液干细胞中特殊基因表达的关键元件

  基因转录通常会被启动子和调节元件(比如增强子和沉默子)之间的染色质环来进行调节,不同的转录因子(TFs,transcription factors)能够与这些调节元件结合,并以一种细胞类型特异性的方式来调节启动子-增强子环。尽管其在控制基因表达方面发挥着重要作用,但转录因子如何促进启动子-增强子

一般在共定位中用到免疫荧光,“共定位”是什么

共定位的定义:共定位是对样品内两种荧光标记的信号共同分布的位置进行分析。 共定位就如字面意思上所说的,只能够表明蛋白A和B都在此细胞有表达,并且在同样的细胞内位置/细胞器。相关短语:共定位通道 PDM Channel细胞共定位 Cellular co localization细胞内共定位信息 cel

免疫荧光共标记怎么计算共标记的细胞个数

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共定位(免疫荧光)是什么

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共定位中用到免疫荧光,“共定位”是什么

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首次揭示人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化

  《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组研究所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果。  该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化,并发现CTCF蛋白对于早期胚胎发育中拓扑相关结构域(TAD结构)有着重要的调控功能,为进一步揭示人类胚胎发育机

热带爪蟾表明染色质重塑对从头-TAD-建立有重要影响

  动物间期染色体被组织成拓扑关联域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。  2021年6月7日,南方科技大学侯春晖,陈永龙,华中农业大学李立及澳门大学张仲荣共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Three-dimensional folding dynamics of