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最近在Nature1及其他刊物中发表了多篇与人类微生物菌落项目(Human Microbiome Project)有关的文献，该项目已历时5年旨在发现人体不同部位的微生物菌落特征。而最近的这些文献的发表只是该项目大量数据的初步分析结果，随之而来的将是从更多分析方法角度带来的新的思路和起始。 数据中最主要是16S rRNA基因的序列。从美国的两个城市挑选的数百名男女，通过身体检查，最终选择了129名健康男性和113名健康女性，然后分别在男性的15个身体部位和女性的18个身体部位采集微生物样本，利用454的进行16S rRNA扩增子测序，测序区域覆盖16S rRNA的V3-V5区域，部分样本增加了V1-V3区域的测序。测序结果用三种不同的方法进行微生物系统分类，并对人类微生物菌落进行了比较。同时，利用短读长平台获得了部分样本中的完整微生物基因序列。 分析结果表现了从研究对象采集的微生......阅读全文
生命是“能够自我营养并独立生长和衰败的力量”，这是亚里士多德（Aristotle，公元前384—322）通过动物、植物的研究对生命的哲学概括。动物也成为古代先哲们探索生命奥秘的主要对象之一，盖伦（Galen，公元130—200）开创了动物解剖学和实验生理学，他将来源于动物的知识推广到对人体的认识
芥菜型油菜作为一种广泛种植的作物，能产生不同颜色的种子。种子的着色是由于内皮细胞原花色素（proanthocyanidins，PA）的沉积，该终产物是通过一条类黄酮化合物合成的途径形成。为了进一步了解芥菜型油菜种子着色的基因信号网络，研究者采用Illumina/Solexa测序平台检测近交系黄
CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统，其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。 CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly inte
美国农业部对采用基因编辑技术的新型作物网开一面，是由于基因编辑后的作物，不含任何新引入的遗传物质或外源DNA。当技术飞奔时，既面临重新定义转基因，也要思考监管如何收放。 在不到一周的时间里，美国农业部相继豁免了一种基因编辑蘑菇和一种基因编辑玉米的监管。 它们都采用了一种名为CRISPR
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序
6 基因组信息6.1 数据库6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome数据库收录了850多种微生物、3100多种病毒以及1600多种真核生物细胞器的完整基因组数据以及将近50种动物、绿色植物和真菌的700多条染色体信息，总共收录有6200多条序列，其中有882条是去年新增的序列
近日，广东省质监局组织省标准化研究院（以下简称省标院）等单位，帮助深圳华大基因研究院（以下简称华大基因）将“基因测序技术规范、混合肉类鉴定方法及基因合成质量要求”3项科研专利技术转化为广东省地方标准，使基因测序产业实现有标可依，为规范检测市场奠定基础。 基因测序被誉为生命科学领域的高新技术
近日，广东省质监局组织省标准化研究院（以下简称省标院）等单位，帮助深圳华大基因研究院（以下简称华大基因）将“基因测序技术规范、混合肉类鉴定方法及基因合成质量要求”3项科研专利技术转化为广东省地方标准，使基因测序产业实现有标可依，为规范检测市场奠定基础。 基因测序被誉为生命科学领域的高新技术服务
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenza
分子生物学检验技术的理论基础是什么？:一、病原生物基因与医学检验网人类感染性疾病 严重影响人类健康的病原微生物如结核杆菌、肝炎病毒、人免疫缺陷病毒、SARS相关冠状病毒、人禽流感病毒和原虫等，目前受到广泛关注。 二、病原生物基因与人类感染性疾病对于这些病原生物基因和基因组的研究已经成为消灭病原生物、
由深圳华大基因研究院联合中国微生物领域顶尖研究机构、院校和企业组成的“万种微生物基因计划”，八月一日在深圳启动。 据悉，该计划是深圳华大基因研究院在“国际千人基因组计划”后启动的又一重大基因组计划，目前该计划的地位为亚洲第一、世界第三。 该计划预计在三年内完成一万种微生物物种全基因组
6月17日出版的《自然》（Nature）杂志，在NEWS and VIEWS栏目刊登了上海交通大学教授的文章。 应该刊编辑部的邀请，针对《自然》和《科学》杂志最近发表的有关人体元基因组的论文，赵教授评价了这些论文在理解肠道菌群与慢性病的关系的意义。文章指出，下一阶段人体元基因组学研究
由美国、英国、中国等12国科学家参加的大洋钻探旨在打穿地球壳幔边界。1月16日，美国微生物学家在“决心”号大洋钻探船上分析微生物样品。5月22日，在西南印度洋执行大洋科考任务的“向阳红10”科考船上，科考队员顺利回收我国首个深海沉积物微生物原位培养系统。欧洲航天局和俄罗斯联邦航天署于3月1
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
经历了数百万年的进化后，地球上的所有生物都拥有64个遗传基因密码子。但是哈佛大学的科学家认为他们可以改变这一现状，近日他们发表文章称，在实验室里他们创造了一个只含有57个密码子的完整的细菌基因组。这一实验对生物基因学来说具有十分重要的意义。 乍一看，这个实验对转基因细菌培育药物有很好的推进作用
在深圳，背靠盐田青翠的北山，有这样的一家基因测序机构，基因测序规模在全球达到最大。 它是华大基因。有人说它会是下一个华为，下一个腾讯。 它的员工平均年龄不到27岁，每个月平均却有3份学术论文登上“CNNS（即《Cell(细胞)》、《Nature（自然）》、《NEJM（新英格兰医学杂志）》、《
基因敲除可以说是基因组 学、细胞分离培养以及转基因技术的组合。那么基因敲除的原理是什么呢？ 基因敲除的方法有哪些呢？在此，做个小结，以供大家学习。一.概述：基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子 生物学技术，是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用D
科学家发现，侵入细菌的一种病毒中潜伏着很多能表达出毒性蛋白的基因。这些基因本非病毒基因组的基因，而是来自于黑寡妇毒液基因以及其他一些动物的DNA。研究者们认为，要么是病毒偷窃了其他生物的基因，要么是其他生物的DNA入侵了病毒基因组。 病毒是一种充满争议的生物。他们几乎可以入侵感染三界（动物、植
我们也必须记住，自然界本身就是一名已经存在的专家，她在创造可对人类造成极大危害的微生物。合成生物学的最新进展并不一定会把我们带到比现有技术或自然界本身更接近伤害的道路。 慎重的民主就要听不同的观点，考虑对方的论点，最好找到共同点，至少要尊重不同观点，然后作出决定。面对复杂问题各
近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成生物学等领域的重要工具菌株，是生产重组蛋白、氨基酸、有机酸、能源物质和一些重要化工产品的主力微生物之一。为使大肠杆菌获得新的性状和生产能力， 基因敲除及基因敲入是构建新型大肠杆菌的重要手段。 近几十年来， 大肠杆菌是基因工程、 代谢工程和合成
1. 华大基因 137台HiSeq；3台MiSeq； 31台Proton。 全方位高通量测序应用。 2. 药明康德基因中心 4台HiSeq；4台MiSeq；1台Proton；2台PGM；1台Affymetrix。 是目前中国唯一的美国CLIA认证实验室。 科研服务、测序和芯片外包服务、
来自中科院动物所研究员的研究人员以皮肤真菌犬小孢子菌为对象，利用生物信息学和实验生物学方法鉴定了一个新型的真菌来源的防御素(命名为孢子霉素)，首次表明皮肤真菌为一种新的抗感染药物资源，为治疗耐药性细菌引起的感染带来了新的希望，这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文
深圳生物产业又有重磅好消息。1月30日，国家发改委已批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库，这是中国首次建立国家级基因库，首期投资为1500万元。 目前，全球仅美国、日本和欧洲建有三个国家级基因库。业内人士预计，随着深圳国家基因库的组建，中国在生命科学研究及生物信息安全领域的水
人类走出非洲的时间比预想的要早 一项新的研究报告说，在阿拉伯联合酋长国出土的史前器物可以回溯到10万年前，这意味着现代人第一次离开非洲的时间比研究人员所预想的要早得多。现代人走出非洲的时间和其弥散到各地的时间一直是人们长期以来争辩的源头，尽管大多数的证据指向他们是在大约
从环境宏基因组中挖掘功能基因通常有两条技术路线，一条是建立克隆文库后直接用筛选压力筛选阳性克隆，一条是通过设计引物，从宏基因组中克隆目标基因，然后进行功能研究。近日，李小方研究员团队发展了第三条技术路线，实现了规模化、回避筛选压力的功能宏基因组路线，并用于了金属硫蛋白基因的高通量挖掘。该研究以“
高温干热空气灭菌是到现在为止世界公认的最管用的灭菌技术，能彻底消泯全部微有生命的物质污染源(涵盖耐高温的芽孢杆菌)；湿热灭菌一般用于高压蒸汽灭菌中，比较少用在CO2培养箱上，湿热灭菌在常压下又叫煮沸法，煮沸的水温普通至少需为100℃，球菌蕃息体煮沸5分钟，但芽胞常需煮沸2钟头以上才可；紫外灯映射法的
经过十多年的发展，中国深海生物资源勘探开发在深海生物勘探、深海微生物资源库规范化建设、深海生物学基础研究等方面取得重要成果。 中国国家海洋局副局长孙书贤22日在厦门举行的新闻发布会上表示，中国大洋协会自上世纪90年代末起，率先在中国部署大洋生物资源勘探工作，获得大量在医药、环保、工农业等方面有
2月18日下午，中国科学院深圳先进技术研究院院长樊建平带领60余位科研管理骨干参观走访位于深圳盐田的华大基因研究院。“感受华大创业激情，交流科学管理问题，相互促进可持续发展”是此行的目的。华大基因研究院院长汪健接待了樊建平一行。 座谈会上，汪建介绍了华大近年的发展情况，阐释了
合成和编辑DNA技术的进步已经使得成本下降，同时带来更高的精确性，帮助生物学家从零开始或重新设计微生物基因组。 扫描电子显微镜下的人类染色体。图片来源：科学图片图书馆 在典型的实验室条件下，大肠杆菌菌株JF1看起来彼此没有什么区别——都表现为琥珀色琼脂板上的少量黄色菌落。但若将菌落置于红