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癌症为什么发生在特定细胞里?单一细胞测序可以解答!

我们都知道癌症的起源离不开细胞突变,我们体内很多细胞的突变都可能会引起癌症,但相应的是,也有很多突变并不会导致癌症的发生,而如何辨别这些突变会不会引起癌症便是一个癌症早期防治的关键问题,在最新发表的一篇研究报告中,研究人员们探究了视网膜母细胞瘤与特定细胞突变的关系。Frolov 与 Ariss以及单一细胞测序仪 该研究结果发表于 2018 年 11 月 27 日的 Nature Communications,由来自美国伊利诺伊大学芝加哥医学院的生物化学和分子遗传学教授 Maxim Frolov 的团队完成。 研究背景 视网膜母细胞瘤蛋白(pRB)的功能失活通常被认为是该处癌症发生发展过程中一个必不可少的事件,研究者通常认为这种联系是因为它通过夫调控 E2F 转录因子阻断细胞周期进程的能力导致。当 E2F 与 pRB 结合后,它自身的转录活性会被抑制并终止细胞周期同时,pRB 则会释放 E2F 并允许 S-phase ......阅读全文

《自然—方法学》年度方法:单细胞测序

  2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道,将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。   近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重

谢晓亮院士:单分子技术透视生命之谜

  2012和2013年,由北京大学多个研究团队合作完成的世界首个高精度人类男性和女性个人遗传图谱相关论文相继发表于《科学》和《细胞》杂志。这一工作采用的单细胞DNA扩增技术MALBAC,与以前的技术相比,该技术将单细胞全基因组测序的精确度大幅度提高,以至于能够发现个别细胞之间的遗传差异。  MAL

新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7

北大谢晓亮教授:单分子技术透视生命之谜

2012和2013年,由北京大学多个研究团队合作完成的世界首个高精度人类男性和女性个人遗传图谱相关论文相继发表于《科学》和《细胞》杂志。这一工作采用的单细胞DNA扩增技术MALBAC,与以前的技术相比,该技术将单细胞全基因组测序的精确度大幅度提高,以至于能够发现个别细胞之间的遗传差

Cell子刊:癌症研究的八大问题

  最近,Cell出版社推出旗下新子刊《Trends in Cancer》,作为创刊号的一部分,该杂志邀请世界领先的癌症研究学者,列出了目前癌症研究领域所面临的八大问题。  1、对于致癌突变的了解,如何才能指导治疗?  科学家们花了几十年时间,来了解可导致细胞分裂失控的精确基因突变。现在癌症患者可以

霍普金斯大学拉尔夫·赫鲁班:癌症的发生只是概率问题

  癌症早期检测无疑是当今最热门的研究方向之一。借助人类基因组计划打下的基石,和对癌症中基因突变的相关研究,科学家终于即将实现这一伟大的目标。拉尔夫·赫鲁班  约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)多个跨学科团队联合开发的 CancerSEEK 就是这类测试之一。Ca

Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序

  四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。  研究人员用G&T-se

BBC:癌症是进化过程的副产品

  人类能够最终打赢“癌症战争”吗?  最新的数据表明,人类离赢得“癌症战争”还有太远的距离。根据美国癌症协会(American Cancer Society)的最新数据统计,在美国,一个男性一生中患癌症的风险是42%,女性是38%。在英国,这一数字甚至更糟。根据英国癌症研究所(Cancer Res

近期基因测序研究领域新成果!

  本文中,小编整理了多篇研究报道,共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Nature  【1】Nature:中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密  doi:10.1038/s41586-019-1500-0  近日,中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测

Nature子刊:新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  近年来,随着精准医疗的发展,癌症治疗已经取得了长足的进步,其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功,但大多数只对部分患者有效,并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此,了解免疫系统在癌症治疗中的表现,准确筛选最有可能获益

活体成像:把癌症抓个现行

  在我们展示影片时,当人们看到肿瘤病变如何演化,都惊讶地站了起来。这是一种认知上的改变。活小鼠体内癌症细胞的影像显示了黑色素瘤细胞如何侵入皮肤组织  当Mikala Egeblad完成第一个活鼠体内肿瘤细胞的活动影片时,她兴奋不已。在那之前,她已经对显微切片上的样本进行了研究。不过在活的动物体内观

Guardant 360:用血液检测5大癌症 获千万融资

  美国Guardant Health公司近期开发出一种非侵入性的筛选血液样本新技术,开辟了癌症诊断新疗法。Guardant 将这种技术命名为“Guardant 360”,旨在帮助患者避免危险和昂贵的活检。   活体组织昂贵的检测成本   在不含保险的情况下,活检的成本高达10000美元。相

单核测序和共聚焦显微技术辨别癌细胞

  肿瘤是由各种不同的细胞类群组成的,这往往会导致治疗失败,理解这种癌症异质性将能改善化疗的治疗疗效。细胞具有不同的形状和大小,有四四方方的上皮细胞,圆饼状的红细胞,细长丝状的神经细胞,还有巨大的肉眼可见的人类卵细胞。即使是相同基本类型的细胞,也没有两个是完全一样的,同样癌变的肿瘤细胞中也是如此,这

【经典回顾】Cell子刊,癌症研究的八大问题!

  10月,Cell出版社推出旗下新子刊《Trends in Cancer》,作为创刊号的一部分,该杂志邀请世界领先的癌症研究学者,列出了目前癌症研究领域所面临的八大问题。  1.对于致癌突变的了解,如何才能指导治疗?  科学家们花了几十年时间,来了解可导致细胞分裂失控的精确基因突变。现在癌症患者可

多篇文章解读近期测序领域重要研究成果!

  如今,科学家们应用测序技术在多项研究领域都取得了显著的成果,那么近期他们又取得了哪些成果呢?本文中,小编就对相关研究结果进行整理,分享给大家!  【1】Science:便携式DNA测序仪在检测病毒疫情中大显身手  doi:10.1126/science.aau9343  在一项新的研究中,来自美

Nature:单细胞测序(上)

  Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序

外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”----乳腺癌恶化新机制

外泌体是细胞间传递信号的媒介,直径在30-200nm,表面具有磷脂双分子层,内部具有丰富内含物的小囊泡,其内含物包括miRNA,环状RNA,LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology(影响因子:19)的文章为例,看一看外泌体中LncRNA的功能机制是如何研究的。

Nature技术特写:癌细胞的多样性

  肿瘤是由各种不同的细胞类群组成的,这往往会导致治疗失败,理解这种癌症异质性将能改善化疗的治疗疗效。   生物通报道:细胞具有不同的形状和大小,有四四方方的上皮细胞,圆饼状的红细胞,细长丝状的神经细胞,还有巨大的肉眼可见的人类卵细胞。即使是相同基本类型的细胞,也没有两个是完全一样的,同样癌变的肿

Nature重磅!利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱

  肝脏是人体最大、功能最多的器官之一,在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是,肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%,就能够完全再生的内脏器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一,也是导致死亡的主要原因。  尽管肝脏对人类健康极为重要,但健康

外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”---乳腺癌恶化新机制!

  文章导读:   外泌体是细胞间传递信号的媒介,直径在30-200nm,表面具有磷脂双分子层,内部具有丰富内含物的小囊泡,其内含物包括miRNA,环状RNA,LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology(影响因子:19)的文章为例,看一看外泌体中LncRNA的功

聚焦在T细胞研究领域取得的新成果!

  本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同聚焦科学家们在T细胞研究领域取得的新成果,分享给大家!  【1】Nat Immunol:鉴定出对抗特殊靶标的T细胞  doi:10.1038/s41590-019-0544-5  当接种疫苗,或者解除过敏原以及微生物病原体之后,免疫系统激活,产生的T细胞亚

单细胞测序——“刻画”肝癌免疫微环境的动态特征

  肝细胞癌是世界范围内死亡率排名第三的癌症,其中中国的肝癌发病率居世界之首【1】。HBV的慢性感染是中国肝细胞癌发生的主要原因,其感染导致肿瘤微环境常伴随慢性炎症。免疫逃逸被认为是癌症发展的标志之一,目前研究表明,肿瘤存在多种免疫逃逸机制,提出了研究肿瘤微环境中不同免疫细胞状态的重要性【2】。而单

单细胞研究在治疗儿童急性淋巴细胞白血病中的重要作用

Burroughs Wellcome 基金奖项设立以来一直坚持其宗旨:促进医学科学家的学术研究,特别是发展资金不足的领域,给予全球最有前途的研究人员大力支持,以开拓未知领域的创新研究。今年,该组织将医学奖(BWF CAMS)授予了医生Charles Gawad博士。以表彰他在斯坦福大学的研究项目

单细胞测序的重要性及应用方向(一)

单细胞测序研究一直是当今的热门话题,想知道单细胞技术有哪些重要的应用?想深入了解当今主流的单细胞测序技术吗?华大智造《单细胞测序技术讲堂》开讲啦!跟着小造一起寻找这些问题的答案。单细胞测序的重要性随着第二代测序(next generation sequencing,NGS) 技术和第三代测序(

PCAWG联盟6篇Nature、15篇Nature子刊揭示癌症的复杂性

  一项大规模的国际努力对来自38个人体组织的2600多个肿瘤基因组进行了多方面研究,从而对癌症的遗传基础产生了丰富的见解。  早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。在发表在最新

【盘点】2015年癌症领域突破性研究TOP10

  长期以来,科学家们在揭示癌症发病机制、开发治疗和预防癌症新型方法上花费了大量的精力,随着研究的深入及多种机制的发现,科学家们让癌症变成了一种可控的疾病。  近日,来自美国德州农工健康科学中心研究所的科学家就发现西兰花中名为萝卜硫素的提取物或许可以帮助治疗癌症;又有研究者发现冥想也可以帮助癌症的治

【锐赛小课堂】2015年癌症领域突破性研究TOP10

  长期以来,科学家们在揭示癌症发病机制、开发治疗和预防癌症新型方法上花费了大量的精力,随着研究的深入及多种机制的发现,科学家们让癌症变成了一种可控的疾病。   近日,来自美国德州农工健康科学中心研究所的科学家就发现西兰花中名为萝卜硫素的提取物或许可以帮助治疗癌症;又有研究者发现冥想也可以帮助癌症

基因修饰小鼠(GEM)模型在肿瘤学研究中的应用(二)

最近,CRISPR/Cas9系统也应用于靶基因的抑制(CRISPRi)或激活(CRISPRa)的遗传修饰。这类修饰系统可用于研制相应致癌基因,和/或抑制TSGs基因的诱导和可逆激活小鼠模型。比如借助CRISPRa为基础的系统,通过激活致癌基因的转录,达到研究其致癌潜力的目的。虽然CRISPR/Cas

Nature重磅!利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱

  肝脏是人体最大、功能最多的器官之一,在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是,肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%,就能够完全再生的内脏器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一,也是导致死亡的主要原因。  尽管肝脏对人类健康极为重要,但健康

全民测序时代 基因测序到底有什么用?

  近两年精准医学的概念逐渐深入人心,这是一种将个人基因、环境与生活习惯差异考虑在内的疾病预防与处置的新兴方法。2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”,希望精准医学可以引领一个医学新时代。随后习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委,要求国家成立中国精准医疗战略专家组,科