Cell重要成果：绘制凋亡蛋白质组图谱
斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱，揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。 磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。新研究联合多种技术在细胞群中绘制了所有蛋白质事件的图谱揭示了它们是如何协同作用来执行称之为凋亡的细胞“自毁程序”的。 关于细胞凋亡的这些特异的研究结果有可能促使开发出新的癌症诊断和药物，因为癌症治疗的目的往往是诱导恶性细胞发生凋亡。更为重要的是，该研究标志着开发出了一种新的“蛋白质组学”基本工具，应该会提供对于许多细胞过程的有用的见解。 “检测蛋白质调控信号间的相互串扰长期以来是一个挑战，因此利用这项新技术，我们能够开始从事过去很难或是不可能的分析，”该研究的资深调查员、斯克里普斯研究所化学生理学系主任及教授、Skaggs......阅读全文
研究人员开发定量蛋白质组学数据的下游分析工具
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm
科学家发现控制生物钟周期的关键元件
在开发治疗睡眠障碍疗法的道路上，研究人员将时差和其它健康问题同生物周期节律相联系起来，近日，刊登在国际杂志Science上的一篇研究论文中，来自达特茅斯Geisel医学研究所的研究人员通过研究鉴别出决定生物钟周期的关键决定子。 不管真菌、细菌亦或者是人类，生物钟都会影响其一生中的方方面面，在生
Science：科学家发现控制生物钟周期的关键元件
在开发治疗睡眠障碍疗法的道路上，研究人员将时差和其它健康问题同生物周期节律相联系起来，近日，刊登在国际杂志Science上的一篇研究论文中，来自达特茅斯Geisel医学研究所的研究人员通过研究鉴别出决定生物钟周期的关键决定子。 不管真菌、细菌亦或者是人类，生物钟都会影响其一生中的方方面面，在生
蛋白质磷酸化修饰的进化与功能相关性研究取得新成果
10月18日，Molecular Biology and Evolution杂志在线发表了中科院系统生物学重点实验室李亦学研究组与曾嵘研究组、日本国立遗传研究所Yoshio Tateno教授以及德国国家环境生物学研究中心流行病研究所在中科院系统生物学重点实验室的进修生Ludwig
Cell：转移性前列腺癌的磷酸化蛋白质组学研究
癌症基因组学有望通过揭示驱动个体患者肿瘤细胞的遗传突变来实现个体化癌症治疗。但解读这一基因组数据仍然是个挑战。一些突变和其他遗传改变对癌细胞的影响，呈现在与细胞生长、增殖和其他癌症生物学标志相关的复杂分子互作（信号通路）网络中。通过绘制在前列腺癌细胞中活化的一些关键信号通路，研究人员能够确定可以
水生所四膜虫蛋白质磷酸化修饰特征等研究获进展
11月7日，国际蛋白质组学领域刊物Molecular & Cellular Proteomics在线发表了题为Phosphoproteomic analysis of protein phosphorylation networks in Tetrahymena thermophila, a
高通量蛋白质组和磷酸化组分析揭示化疗药物耐药性
靶向药物具有特异性好、毒副作用少的特点，在对癌症的治疗中发挥了重要作用。然而，肿瘤对靶向药物耐药性的产生却是临床实践中遇到的一大难题。在此背景下，如何全面系统地理解耐药性产生的机理是当前癌症研究的热点之一。最近，德国慕尼黑理工大学的研究者在国际著名期刊Cancer Research发表论文，综合
没有最多，只有更多细胞外囊泡中磷酸化蛋白质组学研究
蛋白磷酸化水平的变化可指针疾病的变化，但却鲜有磷酸化蛋白被开发成为疾病诊断标记物。细胞外囊泡是由膜封闭的微环境，不受外界蛋白酶和其他酶的影响。这使得细胞外囊泡在体液中高度稳定，为开发磷酸化蛋白应用于医学诊断提供了契机。 今天为大家介绍一篇细胞外囊泡中磷酸化蛋白相关的文章： Phosp
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
权威文献告诉您—为何要做磷酸化组与普通蛋白质组联合
磷酸化修饰被很多研究者认为是修饰之王，是生物体内极为重要的一种翻译后修饰：从数量上来说，真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰；从功能上来说，磷酸化在正常生理、免疫应答、疾病的发生发展，及植物的逆境胁迫响应与激素表达等各种生物过程中均发挥至关重要的作用。 近期微信公
为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸。其中，丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点，因为其结构末端含有羟基，羟基很活泼，可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说，蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话，很大程度上就是磷酸化位点。
张丽华发文：N磷酸化修饰蛋白质的富集和鉴定方法
摘要 蛋白质磷酸化修饰在细胞的信号转导、代谢、发育等生命过程中发挥着重要作用。除了研究较为透彻的发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸侧链羟基的O-磷酸化修饰之外，近年来，发生在组氨酸、精氨酸和赖氨酸侧链氨基的N-磷酸化修饰受到了越来越广泛的关注。然而，由于N-磷酸化修饰具有独特的P-N键结构，导致其化
透化细胞和退化细胞器中蛋白质的磷酸化实验—试剂制备
试剂、试剂盒胞外缓冲液胞内缓冲液透化缓冲液标准裂解缓冲液裂解缓冲液SDS-PAGE 加样缓冲液双向-PAGE 裂解緩冲液实验步骤这些试剂在后面许多地方要用到，应在进行下述实验前配好。1. 胞外缓冲液（pH 7.2，37℃）110 mmol/L NaCl10 mmol/L KCI1 mmol/L Mg
磷酸化和非磷酸化的抗体什么区别
磷酸化和非磷酸化的抗体主要区别有： 1.磷酸化抗体的检测的是出于活性状态（磷酸化）的蛋白。 2.磷酸化抗体只针对磷酸化位点设计，是一种位点特异性的多抗，这到有些单抗的特性。3.普通抗体的合成（多抗）：原核表达蛋白-〉纯化-〉免疫动物-〉收获抗体。 4.磷酸化抗体合成：人工合成含磷酸化位点的
磷酸化和非磷酸化的抗体什么区别
1.磷酸化抗体的检测的是出于活性状态（磷酸化）的蛋白。2.磷酸化抗体只针对磷酸化位点设计，是一种位点特异性的多抗，这到有些单抗的特性。3.普通抗体的合成（多抗）：原核表达蛋白-〉纯化-〉免疫动物-〉收获抗体。4.磷酸化抗体合成：人工合成含磷酸化位点的多肽-〉人工体外磷酸化-〉链接半抗原-〉免疫动物-
抗体磷酸化与非磷酸化的区别与关系
非磷酸化是测该蛋白的含量，不能知道其活性状态，抗体磷酸化是测该蛋白的磷酸化水平如何，侧重于了解该蛋白的一种活性状态。很多信号通路的蛋白在受到某些刺激后都是通过改变其磷酸化水平的改变而引起细胞的一系列反应，其蛋白含量并不见得会有多大的变化。首先要说明的就是检测的蛋白质在你检测的组织或者细胞中是表达的,
睡眠剥夺仪如何发挥对睡眠的作用
据外媒《连线》报道，在研究了睡眠剥夺小鼠和Sik3突变小鼠的大脑化学状况后，筑波大学国际综合睡眠医学研究所的一个研究小组已确定有80种蛋白质出现了状态差异，在睡眠充足的正常老鼠中却未发现这些差异。科学家们认为，这一发现或许是从分子层面理解人类需要睡眠和感到困倦的原因的关键。 两年前，日本科
10标串联质谱标签（TMT）能更快速定量肿瘤蛋白
在过去十年中，基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变，但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟（CPTAC）的蛋白组学研究表明，将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合，才能改善癌症通路的鉴定。图片来源于网络 然而，实体瘤组织在组成上比细胞系要复
上药所揭示KRAS突变肿瘤的分子分型和精准治疗新策略
8月9日，中国科学院上海药物研究所研究员谭敏佳和研究员黄敏团队合作，在Molecular Cell上在线发表了题为A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination th
Nature：乳腺癌的第一次大规模蛋白组基因组研究成果
基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据，美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组（proteogenomic）”研究，将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行，包括贝勒医学院、MIT和哈佛的
什么是磷酸化
磷酸化是将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质（protein）上的过程。其中除去磷酸基团的酶称为磷酸酶。 蛋白质磷酸化可发生在许多种类的氨基酸（蛋白质的主要单位）上，其中以丝氨酸为多，接着是苏氨酸。除了蛋白质以外，部分核苷酸，如三磷酸腺苷（ATP）或三磷酸鸟苷（GTP）的形成，也是经由二磷酸腺苷
美研究人员发布报告称发现埃博拉感染的关键蛋白质
美国研究人员26日发布报告说，他们发现埃博拉病毒必须与一种蛋白质相结合，才能感染宿主，这一发现将有助于预防埃博拉病毒传播并治疗其导致的埃博拉出血热。 研究人员在最新一期美国《微生物学》杂志上指出，老鼠实验显示，埃博拉病毒必须通过一种代号为NPC1的蛋白质才能进入体细胞，一旦阻止埃博拉病毒与该蛋
美研究人员发布报告称发现埃博拉感染的关键蛋白质
美国研究人员26日发布报告说，他们发现埃博拉病毒必须与一种蛋白质相结合，才能感染宿主，这一发现将有助于预防埃博拉病毒传播并治疗其导致的埃博拉出血热。 研究人员在最新一期美国《微生物学》杂志上指出，老鼠实验显示，埃博拉病毒必须通过一种代号为NPC1的蛋白质才能进入体细胞，一旦阻止埃博拉病毒与该蛋
北京蛋白质组研究中心招聘博士后和研究人员
北京蛋白质组研究中心蛋白质翻译后修饰研究室招聘博士后和研究人员 实验室概况： 北京蛋白质组学研究中心是由军事医学科学院与北京大学、清华大学等单位于2005年成立的综合性研究机构，是人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)的国际总部和蛋白质组学国家重点实验室的主体。在国家相关部门的大力支持和
捕集离子淌度质谱带来磷酸化蛋白质组研究新的深度
Yasushi Ishihama 教授 京都大学分子与细胞生物分析实验室 2021年1月发表于www.ddw-online.com 目前，在蛋白质生物化学和蛋白质组学相关研究中，质谱（MS）已广泛应用于鉴定和表征蛋白质。且随着技术的不断发展，质谱已经实现了更高的覆盖深度、更快的分析速度和更
Science：磷酸化，进化的另一条路径
EMBL-EBI和华盛顿大学的研究人员发现，蛋白质修饰变化为进化提供了显著的生物多样性。相关论文发表在十月十三日的Science杂志上，有助于更好的理解物种对环境的适应。 遗传多样性研究过去往往针对的是基因表达。而这项研究表明，蛋白磷酸化也对遗传多样性做出了重要的贡献。蛋白磷酸化属于翻译后修饰
磷酸化的和非磷酸化的抗体有什么不同
通常来说，磷酸化抗体芯片上检测某一个磷酸化位点会设置一对抗体，即：磷酸化的和非磷酸化的抗体。说到区别，可能从制备讲起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位点的保守性，对某一个磷酸化位点周边20个氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定带有磷酸基团，非磷酸化多肽就掉了这个磷酸基团。然后就是
磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定
磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化 实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一
磷酸化的和非磷酸化的抗体有什么不同
通常来说，磷酸化抗体芯片上检测某一个磷酸化位点会设置一对抗体，即：磷酸化的和非磷酸化的抗体。说到区别，可能从制备讲起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位点的保守性，对某一个磷酸化位点周边20个氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定带有磷酸基团，非磷酸化多肽就掉了这个磷酸基团。然后就是
使用Azurespot分析软件定量非磷酸化与磷酸化蛋白
在上期我们回顾了使用多重来成像磷酸化蛋白的技巧，在这部分中，我们将介绍使用Azurespot分析软件进行定量。 背景去除 背景扣除对于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五个自动后台选项和三个手动选项。 > 如果背景不均匀，请使用 Rolling Bal