Enpicom完成120万欧元融资致力于开发测序数据分析平台

近日,生物医学软件开发公司Enpicom宣布完成A轮120万欧元融资。本轮融资由BOM Brabant Ventures领投,Nextgen Ventures和Arches Capital跟投,所融资金将用于ImmunoGenomix(IGX)平台的开发,以及市场推广。 Enpicom成立于2015年,总部位于荷兰北布拉班特,是一家创新生物医学软件开发公司。该公司专注于为免疫治疗开发人员提供软件技术支持,以加速新型免疫疗法的发现和开发。 2017年中期,Enpicom开发了ImmunoGenomix(IGX)平台,这是市场上第一个全套测序数据分析平台,可用于管理、储存、分析和解释T细胞和B细胞受体库的克隆测序数据。目前,该公司正处于ImmunoGenomix(IGX)平台全球推广准备工作的最后阶段。根据官网信息,4月11日至13日,该公司将在维也纳举办的第六届癌症免疫疗法会议上,推出ImmunoGenomix(IGX)平......阅读全文

校正DNA测序数据误差的一种新工具

  在过去的几年里,下一代DNA测序的快速发展,已经彻底改变了生物学和生态学研究。DNA测序成本已经大幅下降,测序机器已经成为一种标准的实验室设备。低成本的测序技术使得研究人员能够发现让一些人更易受疾病影响的基因差异;探索人类肠道或海洋底部微生物群落的基因组成;并快速识别危及生命感染的致病

精准医疗时代已至-基因测序数据分析成为关键

  随着医学技术提升、就医环境改善,困扰人们的复杂疾病是否能够得到更加有效的治疗?相关统计显示,针对城市居民死亡率较高的癌症(恶性肿瘤)、心脏病、冠心病等复杂疾病,传统医疗方案的治疗效果并不佳。据WINSymposium公布的数据显示,传统医疗在肿瘤治疗上用药无效率高达75%。人们仍然谈“癌”色变。

Nature:测序研究引发的思考,谁该拥有个人基因数据?

  大样本数据库是影响基因数据分析解读的重要因素,也是影响测序产业链发展的瓶颈之一。如今,越来越多的志愿者将自己的基因数据贡献给科研,但是对于后续的数据反馈,却是一个值得深思的问题。近日,一位遗传学研究者在Nature网站上披露了如今遗传学研究中存在的问题:是否有必要将原始数据反馈给参与者?以下为她

计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台

  我们可以在现场获得可操作信息,从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。  对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说,基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。  两三年前,位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所(NAMRU-6)的医生必须将其测序数据送往美国分析,这一过

Life-Technologies新一代测序数据解决方案中心成立

  11月3日,美国Life Technologies所属爱普拜斯应用生物系统公司,今天宣布在北京设立其大中华区新一代测序数据解决方案中心。借助生物信息技术的深化应用,该中心旨在帮助使用SOLiDTM基因测序系统的客户进行系统运行之后建立数据分析方案,从而更加有效地利用研究数据结果。  S

二代测序在肿瘤治疗研究项目中的应用及数据

GenomeWeb芝加哥讯 – 本周美国临床肿瘤学会年度会议中展示的研究项目包括了来自于部分研究项目的大量数据,这些研究项目均使用了二代测序技术来指导对肿瘤患者的治疗方法。 研究结果表明,正如之前科学界已报道的那样,NGS panel及更广泛的测序方法可以在很多情况下的少部分(有时是多数)患者中鉴别

研究开发出小分子RNA高通量测序数据整合分析软件

  高通量测序技术的普及带来测序数据的高速增加,但分析工具的发展却远远跟不上研究的需要。目前大多数高通量测序数据分析工具的用户对象是具备一定数据分析能力的研究人员,大量的数据分析任务仍然落在少数生物信息实验室上,严重阻碍了整个研究领域的发展。功能更强大、使用更方便的生物信息分析工具亟待开发

DNBSEQT7数据表现非凡,完整测序平台超强加持

由华大智造自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7(原名:MGISEQ-T7)自面世以来就备受业内关注。 近期,随着仪器陆续交付,包括华大基因科技服务有限公司(华大科技)、微基因(WeGene)、北京吉因加科技有限公司(吉因加)在内的多家公司开始投入使用,其数据表

​Science-|-群体测序数据揭示人类生殖细胞突变新分类

  人类生殖细胞突变背后的生物学机制很大程度上并不清楚,近几十年的实验研究揭示出了各种各样DNA复制和修复的可能错误模式【1】,但是还没有哪种机制被阐明可能是人类生殖细胞突变的主要原因。为了对人类生殖细胞系中的突变进行全面分类和理解,美国哈佛医学院Shamil Sunyaev研究组在Science发

5大玩家竞逐下一代基因测序数据游戏

  【导语】美国化学学会(ACS)出版的新闻周刊C&EN以基因测序为主题发表了封面文章“下一代基因测序是一场数据游戏”,文中指出:2013年基因测序市场规模为13亿美元,其中Illumina市场占有率为71%;被赛默飞世尔收购的Life Tech居第二;罗氏排名第三;另外文中还公布了影响用户购买测线

数据分析与报告解读,未来将在基因测序行业里愈加重要

  人类基因组测序工作的完成为人类生命科学研究开辟了一个新纪元,对整个生物学研究以及我们自身都具有深远的影响和重大意义。对于生命奥秘的探索,如果说此前人们还一直在混沌中碰壁,那么人类基因组计划的完成无疑是一线曙光,它开辟了从基因组层面上整体研究生命现象的新领域,并为这一领域的研究照亮了方向,带动了整

300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示

  5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息

Illumina平台测序文库精确定量试剂盒的实用数据对比

       生命体遗传信息的快速获得对于生命科学的研究有着十分重要的意义。 第一代测序仪对电泳分离技术的依赖,使其难以进一步提高分析的速度和并 行化程度,也难以通过微型化降低测序成本。经过不断的技术开发和改进, 21世纪初,以Roche454技术、illumina公司的GenomeAnal

DNA测序PCR测序反应

  1. 取0.2 ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待测的质粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 双链DNA - 1 μl  待测DNA的正向引物 1 μl -  M13(

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

DNA测序的测序原理

DNA测序的测序原理是:利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

迄今最大全基因组测序数据公布-有望带来新的诊断方法

  经过历时5年、超35万小时的基因组测序以及超2亿英镑的投资,英国生物银行30日发布了迄今为止世界上最大的全基因组测序数据,完成了这一有史以来最受瞩目的同类项目。英国生物银行首席研究员罗里·柯林斯表示,对于从事健康研究的科学家来说,这是名副其实的宝库,它能为全球的诊断、治疗和治愈带来变革。  作为

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据

文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表

二代测序的焦磷酸测序,合成法测序,连接法测序和离子半导体测序原理

  不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上,这些差别可以分为4类:  焦磷酸测序,合成法测序,连接法测序和离子半导体测序。焦磷酸测序  在焦磷酸测序中,测序反应通过每个核苷酸结合过程中释放的焦磷酸来调控。释放的焦磷酸参与了一系列化学反应从而导致链光的产生。发出的光由记录基因蔟相应序列的相

简述DNA测序的测序规律

  生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。  由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。  在可以区分长度仅

DNA测序仪pcr测序反应

  pcr测序反应  (1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  bigdye mix 1μl 1μl  待测的质粒dna 1μl -  pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl  待测dna的正向引物 1μl -  

DNA测序的测序目的

确定重组DNA的方向与结构,对突变进行定位、鉴定和比较研究。

DNA测序技术的测序规律

生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因此上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。在可以区分长度仅差一个核苷酸

DNA测序——自动测序法

DNA测序可用于:(1)测定未知序列;(2)确定重组DNA的方向与结构;(3)对突变进行定位和鉴定比较研究。实验方法原理ABI  PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单

DNA测序的测序原理介绍

  化学修饰法测序原理  化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。  Sanger法测序的原理  就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定

DNA测序仪:454测序仪

454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展,科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破:首先是解决了高通量测序问题;其次它简 化了样品准备步骤,将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了;最后, 它缩小了

DNA测序技术的测序原理

化学修饰法测序原理化学试剂处理末段DNA片段,造成碱基的特异性切割,产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物,经凝胶电泳分离。化学切割反应:包括碱基的修饰,修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物

双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应

在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器