双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应
在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材离心机离心管微量滴定板实验步骤1. 对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4)加水至10 μl(5)用吸管上下抽吸轻轻混匀(避免产生气泡)。于65℃温育6 min,然后于37 ℃温育20 min,转到步骤3。 2. 对于每个双链DNA模板:以下列混合液重溶含0.5 pmol 变性双链模板的干燥沉淀物。(1)1 pmol 引物(2)1 μl 10×测序酶缓冲液(3)加水至10......阅读全文
双脱氧法DNA测序实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材 离心机离心管微量滴定板实验步骤 1. 对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4
双脱氧法DNA测序实验
测序酶进行标记测序反应 α-标记核苷酸进行热循环测序反应 实验材料 DNA
DNA测序——双脱氧链末端终止法
实验方法原理DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3'-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3'-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3'-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理,将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体,
双脱氧核苷酸末端终止法
双脱氧核苷酸末端终止法也称 Sanger法,是常用的方法进行核算序列分析。其原理是利用四种2’,3‘双脱氧核苷三磷酸(ddNP)代替部分脱氧核苷三磷酸(dNP)作底物参与DNA的合成。 ddNTP与普通dNP的不同之处在于其脱氧核糖的3′位置缺少一个羟基。 ddNTP可以在DNA聚合酶作用下通过其5
简述双脱氧核苷酸末端终止法
双脱氧核苷酸末端终止法也称 Sanger法,是常用的方法进行核酸序列分析。其原理是利用四种2’,3‘双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)代替部分脱氧核苷三磷酸(dNP)作底物参与DNA的合成。 ddNTP与普通dNP的不同之处在于其脱氧核糖的3′位置缺少一个羟基。 ddNTP可以在DNA聚合酶作用下通
双脱氧核苷酸末端终止法的概念
双脱氧核苷酸末端终止法也称 Sanger法,是常用的方法进行核酸序列分析。其原理是利用四种2’,3‘双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)代替部分脱氧核苷三磷酸(dNP)作底物参与DNA的合成。 ddNTP与普通dNP的不同之处在于其脱氧核糖的3′位置缺少一个羟基。 ddNTP可以在DNA聚合酶作用下通过其
什么是双脱氧核苷酸末端终止法?
双脱氧核苷酸末端终止法也称 Sanger法,是常用的方法进行核算序列分析。其原理是利用四种2’,3‘双脱氧核苷三磷酸(ddNP)代替部分脱氧核苷三磷酸(dNP)作底物参与DNA的合成。ddNTP与普通dNP的不同之处在于其脱氧核糖的3′位置缺少一个羟基。 ddNTP可以在DNA聚合酶作用下通过其5′
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
试剂、试剂盒 乙酸铵氯仿异戊醇DMSO乙醇NaOH酚测序反应缓冲液琼脂糖凝胶寡核苷酸引物闭环双链质粒 DNA仪器、耗材 干冰-乙醇浴65°C 水浴实验步骤 材料缓冲液和溶液试剂、缓冲液、储液的组成参见附录 1, 储液使用前稀释到适当浓度。乙酸铵(5mol/L, 非缓冲,pH~7.4)氯仿:异戊醇(2
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
试剂、试剂盒 乙酸铵 氯仿 异戊醇 DMSO 乙醇 NaOH酚 测序反应缓冲液 琼脂糖凝胶
关于双脱氧核苷酸末端终止法的介绍
双脱氧核苷酸末端终止法也称 Sanger法,是常用的方法进行核酸序列分析。其原理是利用四种2’,3‘双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)代替部分脱氧核苷三磷酸(dNP)作底物参与DNA的合成。 ddNTP与普通dNP的不同之处在于其脱氧核糖的3′位置缺少一个羟基。 ddNTP可以在DNA聚合酶作用下通过其
双脱氧法DNA测序实验——测序酶进行标记测序反应
在基本的双晩氧测序反应中,寡核苷酸引物退火于单链DNA摸板,在4种脱氧核糖核酸三磷酸存在时,引物为DNA聚合酶所延伸。反应混合物中也含有4种双脱氧核糖核苷三磷酸的其中一种,当它掺入到DNA的生长链时,可终止链的延伸。实验材料DNA试剂、试剂盒寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
双脱氧链终止法变性模板 分子克隆实验指南(第三版)下册 第12章 方案2下面通过碱变性质粒 DNA 的方法应与方案 3 联合使用,因在此过程中采用测序酶催化双脱氧测序反应。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒乙酸铵氯仿异戊醇DMSO
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert-...
选择随机定向测定策略的影响因素(1)计算设备 任何大规模的测序计划将在很大程度上依赖计算机程序对原始序列资料进行分类、整理和排列(Staden,1986)。在权衡随机法的利与弊之时,必须将与适当的计算机设备进行联机的问题放到压倒一切的位置上来考虑。如果这些设备尚无从适当的计算机设备进行联机的问题
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...3
3.DNA 聚合酶通常用于双脱氧法序列测定的有几种不同的酶,其中包括大肠杆菌DNA 聚合酶I的Klenow片段(Sanger等,1977),反转录酶(见文献,如Mieredorf和Prfeffer,1987)经过修饰消除了 3'→5'外节酶活性的T7噬菌体DNA 聚合酶(
双脱氧法DNA测序实验——α标记核苷酸进行热循环测序反应
实验材料DNA试剂、试剂盒DNA测序缓冲液dATPDNA聚合酶仪器、耗材热心换反应装置离心机实验步骤1. 对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。2. 分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。 3. 对于单链模板:在0.5 ml 微量
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...4
序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA 化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...2
二、Maxam-Gilbert DNA 化学降解法与包括合成反应的链终止技术不同,Maxam-Gilbert法要对原DNA 进行化学降解。这一方法是在体外研究lac阻抑制与lac操纵基因相互作用时酝酿发展起来的。时至今日,可以探测DNA 构象的蛋白质-DNA 相到作用,仍然是Maxam- G
化学发光双脱氧DNA测序实验
标准的双脱氧DNA测序可以很容易和很有效地使用非同位索标记的化学发光法进行检测。在测序反应中,使用生物素标记的引物。用非同位素标记如生物素衍生化的引物,可用于为5’-末端标记引物而设的入测序反应的工作方案。实验材料DNA试剂、试剂盒生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPd
化学发光双脱氧DNA测序实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPdTTP仪器、耗材 热循环仪尼龙膜滤纸离心机实验步骤 1. 在微量离心管中混匀下列试剂,配制DNA摸板混合物(1)1 μg 单链DNA模板或1~3 μg 变性双链DNA模板(2)0.5 pmol 生物素
双脱氧链终止法测定DNA序列
[目的] 掌握双脱氧链终止法测定DNA序列的原理与方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3’-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3’-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。本实验根据此原理,将待测DNA片段插
化学发光双脱氧DNA测序实验
利用生物素标记引物 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
细胞化学词汇双脱氧核苷酸
中文名称:双脱氧核苷酸英文名称:常被简写为ddNTPs(ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP)定 义:双脱氧核苷酸。这些核苷酸亦被称为2',3'-双脱氧核苷酸,常被简写为ddNTPs(ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP)。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学
细胞化学词汇双脱氧核苷三磷酸
中文名称:双脱氧核苷三磷酸英文名称:dideoxyribonucleoside triphosphate;ddNTP定 义:非天然的核苷三磷酸,其中核糖单位的第2位碳原子和第3位碳原子位上的羟基都被氢原子取代。有双脱氧腺苷三磷酸(ddATP)、双脱氧鸟苷三磷酸(ddGTP)、双脱氧胞苷三磷酸(dd
双脱氧ATP末端标记双链DNA的3突出端
实验材料 限制性内切核酸酶 小牛胸腺末端转移酶 模板 DNA 试剂、试剂盒 乙酸铵
双脱氧核苷三磷酸的基本信息
中文名称双脱氧核苷三磷酸英文名称dideoxyribonucleoside triphosphate;ddNTP定 义非天然的核苷三磷酸,其中核糖单位的第2位碳原子和第3位碳原子位上的羟基都被氢原子取代。有双脱氧腺苷三磷酸(ddATP)、双脱氧鸟苷三磷酸(ddGTP)、双脱氧胞苷三磷酸(ddCTP
双脱氧核苷酸的基本信息
双脱氧核苷酸。这些核苷酸亦被称为2',3'-双脱氧核苷酸,常被简写为ddNTPs(ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP)中文名:双脱氧核苷酸外文名:Dideoxynucleotide
双名法
双名法是指对每一种植物(或动物、微生物)的名称,都由 2 个拉丁词(或拉丁化形式的词)所组成,前面一个词为属名,代表该植物所从属的分类单位,第二个词为种加词(以前常称为“种名”,这种叫法欠妥)。一个完整的学名,双名的后面还应附加上命名人的姓名或姓名的缩写。例如银杏的学名为 Ginkgo bilob
制备DNA测序模板实验——双脱氧测序的双链质粒DNA的碱变性
实验材料DNA试剂、试剂盒NaOHEDTA乙酸钠乙醇仪器、耗材离心管离心机摇床实验步骤1. 加入约0.5 pmol 重组质粒DNA于0.5 ml 微量离心管中,如果体积大于20 μl 应以乙醇沉淀,重溶于20 μl 水。2. 如果体积小于20 μl,用水补足20 μl。3. 加入2 μl 2
用-Taq-DNA-聚合酶进行双脱氧测序反应实验
试剂、试剂盒 去离子蒸馏水 ddNTP dNTP 甲酰胺加样缓冲液。酶和缓冲液。Taq 酶或类似的热稳定 DNA 聚合酶 Taq 酶稀释缓冲液
双脱氧核苷酸的基本结构和组成成分
双脱氧核苷酸。这些核苷酸亦被称为2',3'-双脱氧核苷酸,常被简写为ddNTPs(ddGTP、ddATP、ddTTP与ddCTP)。