通过序列杂交和条形码进行单细胞原位分析
现代系统生物学有两种革新技术：基因组学和单细胞生物学，前者具备同时监测生物体中所有基因和蛋白质的能力，后者则可以在自然微环境中跟踪单细胞的一些特定基因。 两种技术都很强大，但具有互补的局限性：基因组学平均了一个细胞群的异质性和空间复杂性，而单细胞技术一次只能探测几个基因。因此，将基因组学与单细胞结合的生物学方法是下一阶段的主要挑战。生物和生物工程教授Long Cai致力于开发合成基因组学与单细胞的革新方法。 通过序列杂交和条形码进行单细胞原位分析 过去几年，Cai教授实验室采用FISH的原位“测序”来分析单细胞的基因表达。为了检测每一个mRNA，他们的序贯FISH（seqFISH）策略在概念上类似于用FISH探针对单个细胞中的转录序列进行测序，用FISH探针进行序列杂交，对mRNA进行编码。在一轮杂交过程中，每个转录物都被一组标有单一荧光团的FISH探针作为目标，然后对样品进行成像，利用酶消化去除FISH探针。在随后的......阅读全文
重叠基因的调控序列
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，mRN
基因序列仪的分类介绍
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类：1. 平板型电泳：平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中，聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄，因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术，具有样品判读序列长（600-900bp）、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。2. 毛细管电泳：将凝胶高分子聚合物
什么是基因的核心序列？
中文名称核心序列英文名称core sequence定 义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
功能基因cDNA序列的分析
（一） cDNA序列的测定一．原理DNA 序列测定技术，目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法，这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'
细胞化学词汇SD序列
中文名称：SD序列外文名称：Shine-Dalgarno sequence定 义：Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA，并将核糖体比对并结合到信使RNA（m
细胞化学词汇匹配序列
中文名称：匹配序列英文名称：matched sequence定 义：在序列排比中，两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇互补序列
中文名称：互补序列英文名称：complementary sequence定 义：在双链核酸中，一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源：monticelloshop.org 近日，法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味，广受称赞，这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日，相关论文在线刊登于《自然
割裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
什么是基因的间插序列？
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
细胞化学词汇间插序列
中文名称：间插序列英文名称：intervening sequence;IVS定 义：基因间或基因内的非编码序列。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
细胞化学词汇旁侧序列
中文名称：旁侧序列英文名称：flanking sequence定 义：结构基因两侧的核苷酸序列，对基因的表达及表达水平具有调控作用。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
细胞化学词汇远侧序列
中文名称：远侧序列英文名称：distal sequence定 义：一般指处于基因上游200 bp以上位置的DNA序列。应用学科:生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇质粒维持序列
中文名称：质粒维持序列英文名称：plasmid maintenance sequence定 义：存在于重组质粒中的、与保持其在宿主中稳定复制有关的序列。如乳酸菌质粒pGT232的一段由双链复制起点和编码复制起始蛋白repA的基因所组成的1.7 kb的序列。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科）
细胞化学基础端粒DNA序列
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合，完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板，在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短，含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的
DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列
Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列，以不同器官中的mRNA为探针，检测其基因表达水平，结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列，用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红，绿荧光标记进行杂交检测，结果表明9
基因序列揭示非洲人早期历史
人类在非洲的早期历史正日益成为人们关注的焦点。一项新的研究对源自这片大陆的十几个族群的180个基因组进行了研究，其中一些基因组之前从未被分析过。 初步研究结果表明，在4万多年前，其中两个族群（桑人和巴卡人）的规模相当于当时其他族群的两倍，并且这两个族群生活在中东部非洲或南部非洲。 研究人员在
3000株水稻基因序列公开发表
近日，3000株水稻基因组测序文章在GigaScience正式发表，且整套水稻基因序列以可引用形式在该杂志的附属开放获取数据库GigaDB中公开。 该项目产生的数据是目前已公开水稻序列数据量的四倍。该成果标志着3000株水稻基因组项目第一阶段的完成，主要由中国农业科学院、国际水稻研究
首次测定玉米蛇基因组序列
在现有的5000种哺乳动物中，有超过100种已经进行了基因组测序，但是，只有9种爬行动物（在10000个物种当中）的基因组对科学界来说是可用的。最近，瑞士日内瓦大学（UNIGE）的一个研究小组，构建了一个大的数据库，其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序，这种蛇越来越多地被用来了解爬行动
结构基因的侧翼序列的介绍
1、前导区和尾部区 此二区被转录并参与成熟mRNA的组成，但不被翻译，前者位于转录起始点和第一外显子之间，相当于mRNA5’端的非翻译区(5’UT)；后者位于最末外显子和终止子之间，相当于mRNA3’端非翻译区(3'UT)。前导区和尾部区转录后的相应序列在mRNA中起维持mRNA稳定性的
概述酿酒酵母的基因组序列
1996年6月，在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序，它被称为遗传学上的里程碑。因为首先，这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列；其次，这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10] 在酿酒酵母测序计划开始之前，人们通过传统的遗传学方法已确定
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA，用cDNA作为模板扩增基因的CDS区，然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因，首先在NCBI找到它的mRNA序列，然后找到它的CDS序列，全部复制下来，在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始（比如18bp），反向引物从CDS最后一
细胞化学词汇自主复制序列
ARS（autonomously replicating sequence）。在真核生物中发现的一类能启动DNA复制的序列，含有一个AT富集区。最早在酵母中分离得到，随后在其它真核生物中也发现了ARS序列的存在。这些序列是在人工合成的环形质粒中作为复制器起作用的。
细胞化学词汇末端反向重复[序列]
中文名称：末端反向重复[序列]英文名称：inverted terminal repeat;ITR定 义：排列顺序相反的、等同的或密切相关的核苷酸序列。常出现于某些转座子的末端。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
揭示基因“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用，如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域，仍有大量是功能未知的，这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域，已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动，然而，除
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日，由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
科学家首次发现重度抑郁基因序列
【新闻事件】：本周《自然》发表了一篇重要论文。在分析5303例汉族女性重度抑郁患者和5337名对照的DNA序列后发现两个和重度抑郁相关的基因序列。一个紧靠SIRT1，另一个是LHPP的内含子。这是科学家第一次把重度抑郁和某个基因序列可靠地联系在一起，为以后药物开发打下基础。 【药源解析】：抑郁
关于断裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，m
胡萝卜基因组序列草图成功绘出
来自美国的一个研究小组称，他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序，绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称，这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程，对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。 胡萝卜和生菜