上海科技大学研制出新一代DNA编码化合物库
近日，上海科技大学免疫化学研究所Richard Lerner教授和杨光教授研究团队合作，研制出富含天然产物的新一代DNA编码化合物库（DNA-Encoded Library, DEL），以Functionality-Independent DNA Encoding of Complex Natural Products为题发表在国际顶级化学期刊Angewandte Chemie International Edition。 DNA编码化合物库的设计及筛选是当前新药发现领域最前沿的技术之一，这种筛选是将目标靶点蛋白和整个DNA编码化合物库(亿级)进行筛选。筛选体系中，数量巨大的化合物对同一靶标蛋白的竞争性结合，而非传统的单个化合物逐一筛选，因此这样的筛选方式具有显著的速度和成本优势；其次，DNA编码化合物库具有非常大的库容量（百万到数百亿数量级），可以涵盖更为广泛的化学空间，对于一些用传统方法难以筛选的靶点，如蛋白-蛋白相互......阅读全文
DNA重组（DNA－recombination）技术：工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶（restriction endonucleases，RE）是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶，能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。（一）命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现，根据来源进行命名，限制酶的第一个字母（大写，斜体）为宿主菌的属名，第二、第三
首次解析丨由非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的多构象结构
II型DNA拓扑异构酶是一种普遍存在的酶，在调控双链DNA的拓扑结构中起着关键作用，参与了一系列最基本的DNA代谢过程，包括DNA复制、转录及重组等，并在原核和真核生物中得到了广泛的研究--它们被分类为IIA型（包括gyrase，topo IV和topo II）和IIB型（topo VI），虽然
DNA提取方法DNA－提取后纯化：将－DNA－与色谱柱结合
离液盐对于裂解至关重要,而且对于将 DNA(或 RNA)与色谱柱结合也是如此。此外,为了增强和影响核酸与二氧化硅的结合,还添加了酒精。大多数情况下这是乙醇,但有时可能是异丙醇。乙醇百分比和体积有很大的影响。太多,你会带入大量降解的核酸和小物种,这会影响 A260 读数并降低你的一些产量。太少,可能难
Phage－DNA
IntroductionThe phage lysate from the plate contains bacterial DNA and RNA, as well as phage DNA encased in the phage coat. The following procedure, d
DNA重组
目的：简单介绍了DNA重组技术的一些方法。包括重组质粒、PCR等。包括细胞结构、DNA，DNA如何改点等。
DNA定量
Characterization of dnaLEVEL IMaterialsDNA sampleSSC bufferUV spectrophotometer 3 and quartz cuvettesProcedureDissolve a small quantity of your extrac
DNA－Laddering
I. Protocol1. Harvest cellsOptional: wash plate with 37°C PBS (gently, so as not to lose cells); check on microscope,after aspirate PBS or mediaPlace
DNA标记
DNA标记（主要内容如下） DNA Labeling by Nick Translation Random Primed Labeling End-Labeling Purification of Labeled DNA Non-isotopic Labeling OthersDNA L
DNA测序
实验方法原理 ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法)，因此通过单引物PCR测序反应，生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DN
DNA克隆
DNA克隆（主要内容如下）· General Procedure· PCR Cloning· Subcloning· ET Cloning· Vector Preparation· Ligation Re
DNA转染
DNA转染· Transfection of Mammalian Cells Using Lipofectamine (LTI)· Guide to Eukaryotic Transfections with Cationic Lipid Reagents (PDF)
DNA转化
DNA转化Chemical Transformation· Transformation of Competent Cells (RbCl2 Method) (Goldberg Lab)Very nice protocol for E. Coli transformation inc
electrophoresis－of－DNA
Agarose Gel Electroporesis of DNA Making the gel: 1. Place casting platform with well former sideways in gel stand where you wish to pour
DNA测序
自动测序法 双脱氧链末端终止法 非同位素银染 鸟枪法 Maxam-Gilbert化学修饰法 实验方法
DNA电泳
DNA电泳（主要内容如下） Preparation of Agarose Gel and Electrophoresis Extraction of DNA From Agarose Gel Extraction of DNA from Acrylamide Gels DNA Marker
DNA－Electrophoresis
What is Electrophoresis?Electrophoresis is a technique used in the laboratory that results in the separation of charged molecules. DNA is a negatively
DNA测序
DNA测序（主要内容如下）· Sequencing Gel Preparation· Preparation of Templates · DNA Sequencing by the Dideoxy Method· DNA Sequen
DNA凝胶电泳（DNA－agarose－gel－electrophoresis）
实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法，这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物，利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应，达到分离混合物的目的。DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电，在电场中向阳极移动。在一定的电场强度下，DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应，即分
DNA指纹图谱分析[DNA－Fingerprinting－]
一. 实验目的1. 掌握DNA指纹图谱技术的概念、原理和基本操作过程2. 学习DNA的限制性酶切的基本技术3. 掌握琼脂糖凝胶电泳的基本操作技术，学习利用琼脂糖凝胶电泳测定DNA片段的长度，并能对实验结果进行分析。二. 实验原理1984年英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的
超声波编码原理
是采用有编码形式长脉冲序列信号激励超声换能器，使其发射出具有相应编码形式的超声序列。超声波主要是用单频率声音信号对数据进行编，编码原理是采用有编码形式长脉冲序列信号激励超声换能器，使其发射出具有相应编码形式的超声序列。声波配置通过声音传播wifi信息，设备端解析获取信息，传输的准确性与成功率都是取决
非编码区的定义
基因是由成千上万个核苷酸对组成。组成基因的核苷酸序列可以分为不同区段。在基因表达的过程中,不同区段所起的作用不同。能够转录为相应信使RNA,进而指导蛋白质合成(也就是能编码蛋白质)的区段叫做编码区。不能编码蛋白质的区段叫做非编码区。非编码区位于编码区前后,同属于一个基因,控制基因的表达和强弱 。
编码链的概念
双链DNA中，不能进行转录的那一条DNA链，该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致（在RNA中是以U取代了DNA中的T），又称有义链（sense strand）。
非编码区的作用
非编码区虽然不能编码蛋白质,但对于遗传信息表达是不可缺少的。在它上面有调控遗传信息表达的核苷酸序列,是有遗传效应的。比如RNA聚合酶结合位点。非编码区对目的基因是不可缺少的。非编码区上有与RNA聚合酶的结合位点,具有调控作用。基因非编码区的碱基的插入、缺失和替代也属于基因突变事件,尽管大多数的研究是
A型DNA与B型DNA的结构差异
A型DNA与B型DNA是在两种环境下同种物质不同的形式。B型DNA：92%RH，钠盐，溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A型DNA：75%RH，钠盐A型DNA也是由反向的两条多核苷酸链组成的双螺旋，为右手螺旋，但螺旋体较宽而短，碱基与中心轴之倾角也不同，呈19度。
Quick－Yeast－DNA－Prep:－Isolation－of－Total－DNA－(genomic－and－plasmid)
Grow a 5 ml YPD O/N culture inoculated with a single yeast colony at 30 deg.Transfer culture to a small 13 x 100 glass tube. Spin down cells 2 min. in
高变区DNA与DNA指纹的关系
人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后，用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ，然后将样品进行
循环肿瘤DNA比循环正常DNA矮半截
如今，人们开始利用液体活检技术来诊断癌症，以及监测治疗效果，不过灵敏度是个问题。美国犹他州大学和华盛顿大学的研究人员近日在《PLOS Genetics》上发表文章，称来源于肿瘤的DNA片段比来源于正常细胞的片段要短，这个特征可用于改善液体活检。 犹他州大学的Hunter Underhill及其
DNA的酶切与连接——DNA片段连接
实验方法原理核酸片段可以通过连接酶的作用连接起来而获得重组分子。实验材料λDNA EcoT14I：由11条DNA片段组成试剂、试剂盒T4 DNA连接酶及其配套的10×连接缓冲液 0.5×TBE电泳缓冲液 6×Loading Buffer Goldview 琼脂糖仪器、耗材电泳仪 水浴锅 移液器 微波
可以DNA结合的酶DNA连接酶
DNA连接酶：是能够使用来自ATP或NAD的化学能将先前切割或断裂的DNA链聚集在一起的酶。连接酶在DNA滞后链复制中特别重要，因为它们将冈崎碎片组合成DNA链。连接酶在DNA修复和基因重组中也发挥重要作用。
DNA作图实验
多种酶消化 限制酶部分消化 实验方法原理 应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。