RIP技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合到核糖核蛋白(Ribonucleoprotein,RNP)复合物中,形成RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex, RISC),然后通过不完全的碱基互补靶向到目标mRNA的3’UTR区,再通过引导酶切影响了mRNA的稳定性,或直接阻碍翻译过程,从而介导特异mRNA靶标的转录后基因沉默。 miRNA参与转录后调控网络。miRNA靶向到目标mRNA的3’UTR区,抑制靶mRNA的蛋白表达。(摘自Chatterjee & Pal, Biol Cell. 2009)miRNA对许多生理过程产......阅读全文

PNAS:揭开感光细胞死亡之谜

  哈佛附属的麻省总医院眼耳专科血管生成实验室的研究人员,首次在视网膜色素变性RP动物模型中确定了视锥感光细胞的死亡模式。由哈佛医学院眼科教授麻省总医院眼科主任Joan W. Miller和Demetrios G. Vavvas博士领导的这项研究,进一步指出RIP激酶通路能够作为治疗视网膜色

长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略

长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作

免疫沉淀法的基本原理

1. 用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白。2. 防止非特异性的RNA的结合。3. 免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来。4.结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。

Nature颠覆传统认知,解答免疫学谜团

  来自St. Jude儿童研究医院的科学家们现在不仅解开了SHP-1基因突变导致多种炎症和自身免疫性疾病的谜团,还发现了一种药物可以在小鼠模型中预防某一炎症性皮肤病。   研究人员还发现:不同形式的白细胞介素-1(IL-1)通过不同的线路促进了炎症。这一发现颠覆了当前普遍认为IL-1α和IL

2018国自然研究热点二:-RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。   图:

我国科学家从玉米中提取出抗艾蛋白酶突变体

可选择性杀伤HIV感染细胞,为HIV药物生产提供新思路  经过多年的科技攻关,近日,香港中文大学教授邵鹏柱学科组与中科院昆明动物研究所研究员郑永唐学科组合作,从玉米中获得了一种能够选择性地杀伤艾滋病病毒(HIV)感染细胞的蛋白酶突变体。该研究成果为研发特异性靶向HIV感染细胞的新型抗HIV

RNA-Immunoprecipita...

实验概要Interest in RNA-protein interactions is booming as we begin to appreciate the role of RNA, not just in well-established processes such as tran

关于细胞坏死的内容简介

  细胞坏死(necrosis)是极端的物理、化学或其他严重的病理性因素诱发的细胞死亡,是病理性细胞死亡。坏死细胞的膜通透性增高,致使细胞肿胀,细胞器变形或肿大,早期核无明显形态学变化,最后细胞破裂。坏死的细胞裂解释放出内含物,引起炎症反应;在愈合过程中常伴随组织器官的纤维化,形成瘢痕。长期以来学界

Cell挑战原有观点:ESCRT样程序性细胞坏死

  神经细胞凋亡是由MLKL介导的细胞膜破坏引起的程序性细胞死亡高度炎症形式。近期来自圣犹大儿童医院(St. Jude Children's Research Hospital)的研究人员提出了不同于传统观点的新发现,指出被称作ESCRT-III的蛋白能过修复质膜中的破裂而延缓或阻止坏死性凋

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(一)

文章导读m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA

厦大团队在《Nature》杂志发文!

  2020年3月25日,细胞应激生物学国家重点实验室,厦门大学生命科学学院莫玮教授课题组和韩家淮院士课题组合作在Nature杂志上发表题为“Gut stem cell necroptosis by genome instability triggers bowel inflammation”的研究

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰

m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响

  m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰

教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)

从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛

揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...(二)

图5. 荧光定量证实miRNA不管在人源还是鼠源都在糖尿病组中低表达;与靶基因的表达成反比;miRNA低表达促进糖尿病患者血管内膜增生5.构建VSMC损伤修复模型作者首次提出VSMC损伤修复机制模型,机制的参与成员主要包括VSMC、内皮组织和血小板,如下图所示。在未受伤个体中,内皮组织完整,VSMC

为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有

三大类的非编码RNA(ncRNA),miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点,大部分的研究人员在立项之初,通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析,获得了合适的研究对象,但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因:1. 找错了转录本;2. ncRN

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(四)

1)m6A修饰PCR芯片 new!云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测,高效一次性检测m6A相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,m6A PCR 芯片基因列表(34 个基因)-human如图:  2)RNA修饰PCR芯片 new!云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次

模式动物研究进展

  在生命科学与人类健康领域中,实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型,对分析疾病的发病机制,解答特定人群对某种疾病的易感性,及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而,由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别,而疾

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

第六届AOHUPO大会报告集锦(一)

  第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会于2012年5月5日下午在北京国家会议中心开幕。这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。有20多个国家和地区的1000多名专家学者参会,提交相关领域学术论文近400篇。大会报告现场   来自以

LRP6基因编码功能及结构描述

该基因编码低密度脂蛋白(ldl)受体基因家族的一个成员。ldl受体是参与受体介导的脂蛋白和蛋白配体内吞的跨膜细胞表面蛋白。该基因编码的蛋白质作为wnt的受体或与frizzled一起作为wnt的共同受体,从而传递典型的wnt/β-catenin信号级联。通过与wnt/beta-catenin信号级联的

LRP6基因突变与药物因子介绍

该基因编码低密度脂蛋白(ldl)受体基因家族的一个成员。ldl受体是参与受体介导的脂蛋白和蛋白配体内吞的跨膜细胞表面蛋白。该基因编码的蛋白质作为wnt的受体或与frizzled一起作为wnt的共同受体,从而传递典型的wnt/β-catenin信号级联。通过与wnt/beta-catenin信号级联的

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

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云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...4

2)RNA修饰PCR芯片 new!    云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次性检测6种RNA修饰相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,最全面的RNA修饰相关基因覆盖,RNA 修饰芯片基因列表(68 个基因)-human如图:  3)m6A相关酶预合成的慢(腺)病毒

模式动物研究进展

  在生命科学与人类健康领域中,实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型,对分析疾病的发病机制,解答特定人群对某种疾病的易感性,及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而,由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别,而疾

Collection-of-Peritoneal-Cells

Prepare a 10ml syringe fitted with a 26G short needle and filled with 5 to 7 ml of medium and 2 to 3 ml of air. Air is important.Prepare a Pasteur pip

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Prepare a 10ml syringe fitted with a 26G short needle and filled with 5 to 7 ml of medium and 2 to 3 ml of air. Air is important.Prepare a Pasteur pip

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

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