引物二聚体的形成于消除

什么是引物二聚体?怎样消除引物二聚体?引物二聚体是引物的3'端间相互错配扩增形成的。引物二聚体的出现是必然的,只是或多或少的问题,电泳时看不到引物二聚体带也不代表没有二聚体出现,只是含量低我们 的肉眼看不到而已。提高PCR 严谨性(包括提高退火温度 ,降低引物浓度等)可大大降低二聚体的浓度。减少PCR产物中引物二聚体的方法:1从引物自身 着手,重新设计引物,这是最根本解决这一问题的办法;2.可能模板有问题;模板浓度过小,适当加大模板量;3.Taq酶,引物,Mg2+ 浓度可能过高,可 降低它们的浓度;4.取你所要加的上下游引物混合后,在100摄氏度下的沸水中煮5分钟,然后迅速拿出至于冰块之上瞬时冷却,这时再加入反应体系当中,引 物二聚体就会消失的;理由:引物可能会发生发夹结构,自身环化等结构,在100摄氏度下的沸水中煮5分钟可使引物变为单链,以减少二聚体。不过有人认为在 PC......阅读全文

解决荧光定量PCR引物探针问题

荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR,qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。    实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确

研究提出黄河可能形成于五百万年前

  黄河流域是中华文明的摇篮,黄河的形成与演化是地貌学的重要科学问题,历来受到研究者重视,但关于黄河形成的年代仍没有定论。近日,《三古》杂志发表了南京大学地理与海洋科学学院助理研究员张瀚之等的研究成果,他们提出了黄河可能形成于约五百万年的新认识。 张瀚之及其合作者基于黄河上游和中游联通后,河流沉

PCR新手指南系列:PCR产物电泳条带分析

PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产物与引物二聚

聚合酶链式反应(PCR)PCR产物电泳条带分析

PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产物与引物二聚

小知识:pcr电泳条带图的解读

  PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:  1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。  2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产

PCR新手指南系列:PCR产物电泳条带分析

PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产物与引物二聚

引物设计重点因素及设计技巧

想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:一、GC含量引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC 含量以及Tm

引物设计重点因素及设计技巧

  想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:   一、GC含量   引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC

引物设计重点因素及设计技巧

  想把引物合成的比较好,除了前引物和后引物的Tm不能相差太大,我们还要重点考虑以下因素:   一、GC含量   引物的GC含量一般为40-60%,以45-55%为宜,过高或过低都不利于引发反应。有一些模板本身的GC含量偏低或偏高,导致引物的GC含量不能在上述范围内,这时应尽量使上下游引物的GC

研究表明原始细胞壁形成归功于雨水

  关于生命起源的一个主要未解之谜是,地球“原始汤”中漂浮的RNA液滴究竟如何演变成了被膜包裹的生命体——细胞。美国芝加哥大学和休斯敦大学生物学家和工程师在发表于《科学进展》杂志的论文中提出了新见解。论文演示了38亿年前雨水如何帮助原始细胞形成网状壁,这是从微小的RNA珠滴演变为细菌、植物、动物和人

有力证据表明地球大陆形成于陨石撞击

  据最新一期《自然》杂志,澳大利亚科廷大学的新研究提供了迄今为止最有力的证据,证明地球大陆是由巨大的陨石撞击形成的,在地球45亿年历史的最初10亿年左右,这种撞击尤为普遍。  科廷大学地球和行星科学学院的蒂姆·约翰逊博士表示,大陆最初形成于巨型陨石撞击地的想法已经存在了几十年,但此前几乎没有确凿的

D二聚体升高就一定是血栓形成吗?

血浆D二聚体测定是了解继发性纤维蛋白溶解功能的一个试验。            检查原理:抗D-D单克隆抗体包被于胶乳颗粒上,受体血浆中如果存在D-二聚体,将产生抗原-抗体反应,乳胶颗粒发生聚集现象。但是,凡有血块形成的出血,本试验均可呈阳性,故其特异性低,敏感度高。 D-二聚体在体内的来源有两个 

如何对pcr扩增电泳条带分析

  PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:  1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。  2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产

PCR电泳图怎么分析?

PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:  1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。  2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产物与

怎么看PCR扩增电泳条带分析?

  PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析,电泳后一般有以下几种条带:  1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有,一般不呈现为细带,为发散状;如果目的扩增产物带和引物带都很亮,可以考虑适当降低引物量。  2、引物二聚体带。比引物跑得慢一点,条带清晰,但如果扩增产物小于100bp时,产

荧光定量PCR中溶解曲线的意思

溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般

怎么设计引物

选择引物的一般规则设计和选择引物时有5个要素必需注意。1 引物的3′末端不互补 引物的3′末端一定不能有很大的互补性,因为它们的互补会形成引物二聚体,这就会带来很大的问题,例如合成出非专一的产物,极大地减少所期望产物的得量。有实验表明,3′末端双链的ΔG是0~-2 kcal/mol时,PCR产量几乎

PCR检测方法(二)

3.实验操作注意事项:尽管扩增序列的残留污染大部分是假阳性反应的原因,样品间的交叉污染也是原因之一。因此,不仅要在进行扩增反应是谨慎认真,在样品的收集、抽提和扩增的所有环节都应该注意:(1)戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套。(2)使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不

荧光定量PCR-阴性对照曲线上扬为什么

荧光定量PCR 阴性对照曲线上扬为什么溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

PCR污染与对策

PCR反应的最大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生.污染原因  (一)标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污

PCR实验污染与对策

PCR反应的zui大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。一、污染原因1、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪

PCR检测方法

PCR反应的zui大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。污染原因一、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染

PCR实验中的污染预防及处理(二)

       (二)环境污染:在排除试剂污染的可能性外,更换试剂后,若不久又发现试剂被污染了,如果预防措施比较严密,则考虑可能为环境污染。       环境污染中常见的污染源主要有:       1. 模板提取时真空抽干装置;       2. 凝胶电泳加样器;       3. 电泳装置;    

日本研究人员认为熔岩流可能形成于地幔下部

  日本东京大学的研究人员日前通过分析地震波发现,美国夏威夷地下的熔岩流可能是在地幔下部形成的。这一发现与传统观点相左,如该推断成立,将有助于帮助人们了解地球的演化过程和地球磁场抵御太空射线危害的机制。   地幔位于地壳和地核之间,厚度为2800多公里,其物质状态至今还不十分明了。据专家推测,火山