碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库

近日,中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作,系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器(baseeditor)的效能差异,并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库(BEable-GPS, Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs),相关成果以Comparison of cytosine base editors and development of the BEable-GPS database for targeting pathogenic SNVs 为题,于10月22日在线发表在国际学术期刊Genome Biology上。 由CRISPR/Cas基因编辑酶(如Cas9, Cpf1等)与胞嘧啶脱氨编辑酶(如APOBEC等)整合而成的胞嘧啶碱基编辑系统,可在单碱......阅读全文

水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度获调节

广东省农业科学院水稻研究所副研究员谭健韬/研究员刘琦团队与华南农业大学教授祝钦泷团队合作,研究开发出植物精准碱基编辑器实现水稻重要农艺性状蛋白功能活性的梯度调节。近日,相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。基于精准碱基编辑的植物内源蛋白功能梯度调节。研究团队供图该研究在国家

基因编辑器:编出新生命

          细菌也有敌人,其最大的敌人之一是噬菌体,因为后者可以进攻和吞食细菌。面对攻击,细菌最有效的还击是,“祭”出一种武器CRISPR,以保护自身。CRISPR有些拗口,称为规律成簇间隔短回文重复,实际上就是一种基因编辑器(又称为CRISPR-Cas9系统),是细菌用以保护自身对抗病毒的

科学家开发出基因编辑新工具对DNA和RNA进行有针对性改变

科学家开发出基因编辑新工具。  如今,基因编辑的工具箱又增添了两样新工具。两个美国研究小组宣布的新技术使研究人员能够对脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)进行有针对性的改变。  在一项研究中,在10月25日出版的美国《科学》杂志上,美国布罗德研究所张锋团队报告说,他们在CRISPR工具基础上开

中国科学家实现线粒体致病突变体内原位纠正

华东师范大学教授李大力、刘明耀团队联合临港实验室青年研究员陈亮团队,开发出高性能线粒体腺嘌呤碱基编辑器(eTd-mtABEs),并利用eTd-mtABEs成功构建了感音神经性耳聋和Leigh综合症大鼠疾病模型。此外,团队使用重新改造的DdCBE变体,首次实现线粒体致病突变的体内原位纠正,成功逆转了l

中国科学家培育出单碱基突变遗传性疾病动物模型

记者从吉林大学了解到,近日吉林大学动物医学学院赖良学团队利用新型单碱基编辑系统成功对家兔实现单碱基精确突变,培育出具有白化病、早衰症等遗传性疾病模型兔,这代表人类距离基因治疗时代更近一步。 团队成员、吉林大学动物医学学院博士李占军介绍,白化病、早衰症等遗传性疾病都是由于基因组发生单碱基突变

Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑

  近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生

Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑

  近年来,微生物组研究揭示了体内的共生细菌表达的基因通过多种机制影响我们的健康。例如,体内的细菌还能够影响癌症免疫疗法的效果;细菌蛋白质与神经退行性疾病和自身免疫性疾病有关;细菌毒素能够引发包括癌症在内的一系列急性和慢性疾病;细菌能够改变或隔离药物,影响治疗效果。这些研究和发现激发了人们对操纵微生

科学家找到基因治疗新利器

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503037.shtm6月16日,华东师范大学生命科学学院教授李大力团队在《自然-生物技术》发表论文,报道了一系列新型腺嘌呤颠换编辑工具(AXBEs和ACBEs),并证明了ACBEs在不同细胞系与小鼠胚胎中

最新!农业与植物生物技术中CRISPRCas应用综述文章

  现代农业面临着诸多困境与挑战,现有的农作物栽培品种亟需改良与优化,以应对日益恶化的环境问题以及不断增长的世界人口。相比于传统育种,来自于原核生物的CRISPR-Cas系统可以准确、高效、可编程地对农作物基因组进行编辑,为未来农业发展提供新机遇。  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组致力

科研人员利用人工智能开发出新型碱基编辑工具

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物表观基因组学创新团队运用人工智能(AI)来挖掘新型胞嘧啶脱氨酶,开发了高效、无序列偏好的胞嘧啶碱基编辑工具。相关研究成果发表在《自然—生物医学工程》(Nature Biomedical Engineering)上。挖掘新的功能性蛋白在生物医药和农业应用等领

基因编辑大牛Nature子刊发文:CRISPR单碱基编辑准确!

  来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature

研究成功开发新型病毒样颗粒递送系统——ENVLPE

  在生命的蓝图中,DNA就像一本写满遗传信息的“天书”。然而,这本天书中偶尔也会出现“错别字”,导致各种遗传疾病的发生。近年来,基因编辑技术成为科学家手中的一把“分子剪刀”。它能够精准地修改DNA中的错误片段,从而有望在根本上治愈疾病。  其中,CRISPR-Cas9的出现,彻底改变了基因编辑领域

本科毕业即“711”,这位985博士生很拼

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497812.shtm 从本科普通二本学校到考上985高校的硕博,陈亮没有停下脚步,跟随导师华东师范大学教授李大力,陈亮在硕博5年期间连续攻克了4项技术突破,接连发表了4篇Nature子刊。 他说,

华东师大科研团队填补碱基编辑领域最后一块拼图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503069.shtm华东师范大学生命科学学院李大力教授团队继2022年10月在国际著名学术期刊 Nature Chemical Biology 报道新一代精准安全的腺嘌呤碱基编辑器ABE9以及11月在国际

碱基切除修复的用途

碱基切除修复(base-excision repair, BER)研究发现,所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能够特异性切除受损核苷酸上的N-β-糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

细胞化学词汇碱基修复

中文名称:碱基修复英文名称:base repair定  义:由于某些原因可导致核酸碱基错配或其他损伤,生物体内有多个系统可修复错配或损伤的碱基,如碱基切除修复。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

兆碱基接头的定义

中文名称兆碱基接头英文名称megalinker定  义一种人工合成的具有特定限制酶识别位点的双链寡核苷酸。具有的限制性核酸内切酶切位点在DNA中出现的概率为百万分之一,在基因工程中可用于获得大片段的DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

碱基比的定义

中文名称碱基比英文名称base ratio定  义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学基础兆碱基

兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。

碱基组成成分

碱基组成是指DNA中的腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶的相对含量。

基因突变碱基变化

  基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两大类。  碱基置换突变——也称为点突变,指DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。点突变分转换和颠换两种形式。如果一种嘌呤被另一种嘌呤取代或一种嘧啶被另一种嘧啶取代则称为转换嘌呤取代嘧啶或嘧啶取代嘌呤的突变则称为颠换(transversi

碱基的研究与发展

生物体中常见的碱基有5种,分别是腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U) ,2019年又人工合成了4种碱基,美国科学家StevenA. Benner将这4个新成员分别命名为“Z”“P”“S”“B”(顾名思义,前5种碱基中,腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族(缩写作R),它们具有双

碱基比的定义

中文名称碱基比英文名称base ratio定  义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学基础修饰碱基

又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成

细胞化学基础稀有碱基

又称修饰碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。

碱基配对的依据

碱基配对是DNA双螺旋结构和RNA(单链)的基础,也是复制、转录和翻译作用的依据。

混合碱基符号的概念

中文名称混合碱基符号英文名称symbols for mix-bases定  义两种或多种碱基(核苷)混合物的表示符号,或未完全确定可能属于某两种或多种碱基(核苷)的符号:R表示A+G;Y表示C+T;M表示A+C;K表示G+T;S表示C+G;W表示A+T;H表示A+C+T;B表示C+G+T;V表示A+

碱基比的定义

中文名称碱基比英文名称base ratio定  义碱基在核酸分子中的比例。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

碱基互补配对的原则

碱基互补配对是指核酸分子中各核苷酸残基的碱基按A与T、A与U和G与C的对应关系互相以氢键相连的现象。它是沃森和克里克首先在DNA双螺旋结构模型中提出来的,后来发现,不仅在DNA复制中有这种规律,在转录过程DNA和RNA关系中也有类似的规律。甚至单链RNA中凡在空间靠近、可以氢键互相结合的碱基,也能这

细胞化学基础合成碱基

在医学中,几种核苷类似物用作抗癌剂和抗病毒剂。病毒聚合酶将这些化合物与非主要碱基结合。病人服用的核苷类似物进入体内被转化为核苷酸而在细胞中被激活。