利用实时定量PCR分析基因相对表达量

METHODS 25, 402–408 (2001)Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2-△△CT MethodKenneth J. Livak* and Thomas D. Schmittgen¶,1*Applied Biosystems, Foster City, California 94404; and ¶ Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy,Washington State University, Pullman, Washington 99164-6534原文下载摘要:现在最常用的两种分析实时定量PCR 实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝......阅读全文

实时荧光定量PCR原理

所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,zui后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法. 1.在荧光定量PCR技术中,有一个很重要的概念—— Ct值.C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号到

实时荧光定量PCR仪

在普通PCR仪的基础上增加一个荧光信号采集系统和计算机分析处理系统,就成了荧光定量PCR仪。其PCR扩增原理和普通PCR仪扩增原理相同,只是PCR扩增时加入的引物是利用同位素、荧光素等进行标记,使用引物和荧光探针同时与模板特异性结合扩增。扩增的结果通过荧光信号采集系统实时采集信号连接输送到计算机分析

荧光定量PCR的相对定量的特点

  相对定量特点    从字面上来理解,相对定量就是“相对而言的量的关系”,它并不关注样本中含有的靶标的绝对数量,而更关注实验样本相对于对照样本的靶标的量的变化,通常用倍数关系来表示。常规的基因表达和拷贝数变异CNV实验就属于这个范畴,略有不同的是,CNV实验考量的是样本内靶标基因对内参基因的倍数关

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时定量PCR的结果是怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算。2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。3、举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。4、首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用deltadeltaCT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用deltadeltaCT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

如果有标准曲线,按照标准曲线计算。一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算。举例如下:对照组基因A的CT值为20, 内参:比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

如何解读实时荧光定量pcr结果分析?

  实时荧光定量PCR技术是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。  基线在PCR扩增反应的最初数个循环里,荧光信号变化不大,接近一条直线,这样的直线即基线。光域值threshold的设定,一般将PCR反应前15个循环的

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

实时荧光定量PCR的结果该怎样分析

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算;3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价

普通PCR、实时荧光定量PCR和数字PCR对比分析(二)

模板 DNA 量越多,荧光达到域值的循环数越少,即 Ct 值越小。Log 起始模板浓度与 Ct 呈线性关系,通过已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,根据样品 Ct 值,就可以计算出样品中所含的模板量。目前常用荧光标记方法 方法 优点

普通-PCR、实时荧光定量-PCR-和数字-PCR-对比分析(一)

提起 PCR,在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳,无人不知无人不晓,其影响之深,应用之广可见一斑。1985 年,美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应(PCR),实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而,采用 E-coli DNA 聚合酶进行 PCR,由于该酶不

荧光定量PCR“相对定量”与“绝对定量”的区别

  相对定量    相对定量,顾名思义,它的结果是一个相对的值,没有单位。与谁相对呢?就是传说中的“内参基因”,又名“持家基因”,即housekeeping gene。    那为什么在相对定量里一定需要它呢?    打个比方:假如你要研究某个基因,提取完样品的RNA然后逆转录再做PCR,发现结果是

实时荧光定量PCR仪和基因扩增仪的区别

荧光定量PCR仪比普通的PCR仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统,实时荧光定量PCR仪主要是用来定量分析和确定基因转录水平的,而普通的PCR仪是做定性分析和扩增基因片段,定量PCR仪可以做普通PCR仪的工作,而反之就不行了,况且这样代价太大了,一般的实验室都不允许这样做的。总之两者的功能不能

PCR反应绝对定量和相对定量的差别?

绝对定量目的是测定目的基因在样本中的分子数目,即通常所说的拷贝数,应用于taqman探针法检测。相对定量的目的是测定目的基因在两个或多个样本中的含量的相对比例,而不需要知道它们在每个样本中的拷贝数,应用于sybr green染料法检测。

荧光PCR/实时定量PCR技术应用简介

一.荧光PCR原理1.荧光共振能量传递 (FRET)某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。2.荧光化学:荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加