研究揭示Cas9切割DNA及其被AcrIIC3抑制的分子机理

CRISPR/Cas系统是广泛存在于细菌和古菌中抵抗病毒、质粒等外源核酸的获得性免疫系统。II型的Cas9在RNA的介导下可以特异性识别、切割dsDNA,具有可编辑性,因此被广泛用作基因编辑工具。由于其重要性,Cas9被系统地研究,大量的文献报道了Cas9的原子分辨率结构、单分子测量结果、分子动力学模拟计算结果,阐明了Cas9切割DNA的分子机理。但是,之前发表的Cas9结构中,切割目的DNA的HNH催化口袋远离切割位点,Cas9处于非活性的状态。而活性状态下的结构是真正理解Cas9切割DNA的作用机制所必需的。另外,目前被广泛使用的SpyCas9,因受其大小的限制,很难与sgRNA一起通过单一AAV病毒导入。而近年来新鉴定的NmeCas9则由于其相对比较小和脱靶率低的原因,有望成为一个更好的编辑工具,但其分子机制尚未被揭示。 噬菌体编码的具有抑制CRISPR-Cas系统功能的蛋白被称为anti-CRISPR蛋白,这些蛋白......阅读全文

沸石分子筛的双相转变机理简述

  在人们对于沸石分子筛晶化究竟是通过液相转变机理还是通过固相转变机理争执不清时,八十年代之后,又有科学家提出了双相转变的机理。双向转变机理认为液相转变和固相转变同时存在沸石分子筛晶化过程中,既可以分别发生在两种晶化反应体系中,也可以同时发生在一个体系中。  Gabelica等人从对ZSM-5分子筛

深入解析猪肉质性状形成的分子机理

  近日,四川农业大学动物科技学院猪遗传育种团队在《自然—通讯》上在线发表了题为《猪不同组织基因转录调控图谱揭示组织特性及转录进化动态》的研究论文。  该研究为深入解析猪肉质性状形成的分子机理,并为下一步分子育种的开展提供了重要基础数据和理论支撑,同时也为促进猪作为人类生物学和疾病的生物学模型奠定了

pd1抗体治疗肿瘤的分子机理

  PD-1全称为细胞程序性死亡受体1,最初认为该分子与细胞死亡相关。随着研究的深入,科学家发现PD-1并非与细胞程序性凋亡相关,其具有负向调节免疫的功能。PD-1是一种主要表达在T细胞上的抑制性受体,在正常生理情形下,PD-1会通过与它的两个配体(PD-L1 / PD-L2)结合抑制T细胞的活化及

双分子亲核取代反应的反应机理

SN2反应最常发生在脂肪族sp3杂化的碳原子上,碳原子与一个电负性强、稳定的离去基团(-X)相连,一般为卤素阴离子。亲核试剂(Nu)从离去基团的正后方进攻碳原子,Nu-C-X角度为180°,以使其孤对电子与C-X键的σ反键轨道可以达到最大重叠。然后形成一个五配位的反应过渡态,碳约为sp2杂化,用两个

鉴定80个蛋白-揭示分子机理-睡眠相关潜在分子靶点出现

  据英国《自然》杂志近日在线发表的一项神经科学研究,美国科学家团队发现,大脑中的蛋白质磷酸化水平可能驱动着睡眠欲望。该研究揭示了睡眠需求的分子基础,强调了与睡眠有关的疗法的潜在分子靶点。同时,也让人们距离揭开睡眠的奥秘又近了一步。图片来源于网络   昼夜节律可以使我们感知到地球自转所引发环境的改变

清华大学Nature子刊:将Cas9应用于分子克隆

  在4月21日的《自然实验手册》(Nature Protocols)杂志上,清华大学的朱听(Ting Zhu)研究员与博士生姜文君(Wenjun Jiang)撰文,详细介绍了利用一种叫做Cas9辅助靶向染色体片段(CATCH)的方法,靶向分离及克隆100kb微生物基因组序列的优化实验方案。  朱听

分子排阻色谱法的分离机理

样品分子与固定相之间不存在相互作用,色谱固定相是多孔性凝胶,仅允许直径小于孔径的组分进入,这些孔对于溶剂分子来说是相当大的,以致溶剂分子可以自由的扩散出入。样品中的大分子不能进入凝胶孔洞而完全被排阻,只能沿多孔凝胶粒子之间的空隙通过色谱柱,首先从柱中被流动相洗脱出来;中等大小的分子能进入凝胶中一些适

分子排阻色谱法的分离机理

样品分子与固定相之间不存在相互作用,色谱固定相是多孔性凝胶,仅允许直径小于孔径的组分进入,这些孔对于溶剂分子来说是相当大的,以致溶剂分子可以自由的扩散出入。样品中的大分子不能进入凝胶孔洞而完全被排阻,只能沿多孔凝胶粒子之间的空隙通过色谱柱,首先从柱中被流动相洗脱出来;中等大小的分子能进入凝胶中一些适

水稻穗顶部小花退化遗传和分子机理揭示

   据中国农科院最新消息,由万建民院士领衔的水稻功能基因组学研究团队,揭示了水稻穗顶部小花退化的遗传和分子机理,为高产品种选育以及在生产上避免因穗顶部退化引起的减产提供了理论基础。相关研究成果在线发表于最新一期《植物细胞》上。 万建民介绍,水稻、玉米、小麦、谷子等主要农作物穗顶部小花退化,对其

科学家揭示花粉—柱头识别的分子机理

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/4/455730.shtm 肽抑制柱头受体激酶信号通路调控水合的模式图 华东师范大学生命科学学院李超课题组以模式植物拟南芥为研究对象,揭示了花粉通过其覆盖物中的PCP-B小肽竞争柱头里的RALF3

甲醛单分子光解中的”漫游”机理获解析

   “漫游”是化学反应中不寻常但有趣的机理,通过“漫游”机理会产生意想不到的产物,并且其呈现的产物末态分布与传统的最小能量路径呈现的分布完全不同。  自2004年,西北大学物理所谢长建教授等通过实验和理论共同验证了甲醛(H2CO)单分子光解中的”漫游”机理以来,“漫游”反应逐渐成为被人们所熟知的一

沸石分子筛的液相转变机理介绍

  液相转变机理首先由Kerr和Ciric提出,与固相转变机理的提出几乎是在同一个时期。他们认为:沸石分子筛晶体的成核和生长是在溶液中直接进行,初始凝胶慢慢的溶解到溶液中,生成了活性物种硅铝酸根离子,然后再发生缩合,慢慢的形成了沸石分子筛所需要的结构单元,再进一步生成了沸石分子筛。  首先,沸石分子

结肠癌分子发病机理的新发现

  根据凯斯西储大学医学院发表在Nature Communications上的最新研究,科学家们发现,在结肠癌基因外的增强子能够助长肿瘤增长。并且该区域基因的变异在肿瘤样品中高度保守,暗示着一个可以用于药物开发的常见机制。  增强子是一段短DNA序列,能够充当开关,调节基因、激活基因。它们散布在整个

关于双分子亲核取代反应的反应机理

  SN2反应最常发生在脂肪族sp3杂化的碳原子上,碳原子与一个电负性强、稳定的离去基团(-X)相连,一般为卤素阴离子。亲核试剂(Nu)从离去基团的正后方进攻碳原子,Nu-C-X角度为180°,以使其孤对电子与C-X键的σ反键轨道可以达到最大重叠。然后形成一个五配位的反应过渡态,碳约为sp2杂化,用

分子排阻色谱法的分离机理

样品分子与固定相之间不存在相互作用,色谱固定相是多孔性凝胶,仅允许直径小于孔径的组分进入,这些孔对于溶剂分子来说是相当大的,以致溶剂分子可以自由的扩散出入。样品中的大分子不能进入凝胶孔洞而完全被排阻,只能沿多孔凝胶粒子之间的空隙通过色谱柱,首先从柱中被流动相洗脱出来;中等大小的分子能进入凝胶中一些适

物理所利用超高精度单分子荧光研究分子马达步进机理

  从测量角度看,实验科学的发展就是一个不断提高测量精度的过程。精度提高一步,科学就前进一步。这一点在分子生物物理中也不例外。有一类生物分子,一般称为分子马达,利用ATP水解产生的能量做轨道运动,完成其重要功能。以DNA解旋酶为例,一般的理解是:解旋酶消耗一个ATP,打开一对碱基,并沿着DNA向前移

我国发展出界面超分子手性传递分子机理新方法

手性在自然界中无处不在。界面所具有的非中心对称性为分子在界面的聚集和组装过程产生对称性破缺创造了先天条件,因此相比于体相,研究界面手性传递、自组装手性动力学对于理解手性起源、探寻生命起源、制备手性材料具有重要意义。 界面手性超分子自组装是近年来备受瞩目的研究领域之一。它不仅与手性生命系统密切相关

化学所发展出界面超分子手性传递分子机理研究新方法

  手性在自然界中无处不在。界面所具有的非中心对称性为分子在界面的聚集和组装过程产生对称性破缺创造了先天条件,因此相比于体相,研究界面手性传递、自组装手性动力学对于探索手性起源、探寻生命起源、制备手性材料具有重要意义。  界面手性超分子自组装是近年来备受瞩目的研究领域之一。它与手性生命系统密切相关,

研究解析玉米胚乳灌浆期细胞扩张的分子机理

  11月27日,Molecular Plant在线发表了来自中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员巫永睿研究组题为The O2-ZmGRAS11 transcriptional regulatory network orchestrates the coordination of cell ex

科学家揭示抗噬菌体侵染的分子机理

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517022.shtm

研究发现拟南芥表皮毛时序性发育的分子机理

  3月6日,国际学术期刊The EMBO Journal 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所王佳伟研究组题为A spatiotemporally regulated transcriptional complex underlies heteroblastic dev

科学家揭示自闭症致病的分子机理

  2月7日,国际精神疾病研究期刊《分子精神病学》在线发表了题为《孤独症相关的Dyrk1a无义突变影响神经元树突、树突棘生长及皮层发育》的研究论文。该研究由哈佛大学波士顿儿童医院、复旦大学教授吴柏林研究组与中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心仇子龙研究组合作完成。

Science:霍乱弧菌掠夺其它细菌DNA的分子机理

  当霍乱弧菌感染机体小肠时就会引发霍乱,该疾病的主要特点为急性水样腹泻引发的严重脱水,近日,来自瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)的科学家通过研究阐明,霍乱弧菌可以利用很小的“矛”可以刺穿并且杀灭周围的细菌,随后“窃取”走这些细菌的DNA,这种机制称之为水平基因转移,霍乱弧菌利用这种机制就可以变得非

Science:霍乱弧菌掠夺其它细菌DNA的分子机理

  当霍乱弧菌感染机体小肠时就会引发霍乱,该疾病的主要特点为急性水样腹泻引发的严重脱水,近日,来自瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)的科学家通过研究阐明,霍乱弧菌可以利用很小的“矛”可以刺穿并且杀灭周围的细菌,随后“窃取”走这些细菌的DNA,这种机制称之为水平基因转移,霍乱弧菌利用这种机制就可以变得非

肿瘤治疗过程中T细胞衰竭的分子机理

  细胞杀伤T细胞通常可以识别癌细胞或被病原体感染的细胞,正因如此,我们才能够活到成年。但是,整日召唤过度活跃的免疫细胞到肿瘤细胞或是感染部位,就会导致细胞衰竭疲惫,以至于它们无法再被分配到“入侵者”身边。  幸运的是,癌症专家们已经在研发有效的免疫治疗手段,来对抗免疫细胞衰竭,使免疫细胞重新激发活

科学家揭示番茄紫色果实形成的分子机理

  近日,中国农科院蔬菜花卉研究所与华南农业大学开展合作研究,揭示了番茄紫色果实形成的分子遗传基础以及果实表皮中花青素生物合成的分子调控网络,为番茄高品质分子设计育种奠定了基础。  花青素是目前所发现的清除人体内自由基最有效的天然抗氧化剂,具有抗衰老、抗辐射、抗过敏、增进视力、改善睡眠、预防癌症、预

细胞通讯与细胞信号转导的分子机理

高等生物所处的环境无时无刻不在变化,机体功能上的协调统一要求有一个完善的细胞间相互识别、相互反应和相互作用的机制,这一机制可以称作细胞通讯(Cell Communication)。在这一系统中,细胞或者识别与之相接触的细胞,或者识别周围环境中存在的各种信号(来自于周围或远距离的细胞),并将其

ALT的病因病理和分子机理的相关介绍

  1、病因病理  谷丙转氨酶偏高的原因有许多,如:急性肝炎、服用药物(尤其是对肝脏有损害的药物)、长期饮酒或一次饮用较大剂量时,以及某些胆道疾病、心脏病时的心力衰竭,发热等等病症,均可引起谷丙转氨酶偏高。  2、分子机理  在肝细胞中,GPT把丙氨酸的氨基转移给a-酮戊二酸,把酮戊二酸的羰基转移给

中国科大揭示原子分子中类FANO共振新机理

基于原子或分子体系中的窄跃迁能级的精密测量一直是众多研究的主题,并且已经被广泛应用于多个领域,如传感、计量以及光钟等。窄跃迁也可以被用于测定基本物理常数,检验基础物理学定律、寻找“新物理”。在应用中,为了克服窄跃迁自身对光吸收很弱的缺点,研究人员通常需要采用很强的激光驻波场来探测这些弱跃迁,同时消除

NMR技术揭示分子筛催化乙醇转化反应机理

  乙烯是最重要的基础化工原料之一,也是现代化学工业的基石。目前乙烯主要来源于石油裂解工艺,由于化石资源的日渐枯竭,给依赖于传统石油路线的乙烯生产带来巨大压力。生物乙醇作为一种可再生资源可以通过催化反应转化为乙烯和其它高附加值碳氢化合物,因此受到学术界和工业界的广泛关注,从而能成为代替石油生产烯烃的