科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能
早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 2019年11月21日,Paul Mischel教授团队再次在Nature杂志上发表了题为“Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression”的文章,该研究首次解析了ecDNA的结构与功能。研究团队利用超微结构电子显微镜、远程光学作图、全基因组测序、计算机分析等技术阐述了ecDNA的四大特点。一是环状结构。研究团队首先结合二代全基因组测序和光学匹配(optical mapping),从序列的角度发现,扩增出来的ecDNA形成了环状结构。进一步使......阅读全文
复制型DNA的结构特点
中文名称复制型DNA英文名称replicative form DNA;RF-DNA定 义单链核酸(DNA或RNA)病毒在复制期间所形成的由亲代单链分子与子代单链分子配对结合形成的DNA双链。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
Z型DNA的结构特点
Z-DNA又称Z型DNA,是DNA双螺旋结构的一种形式,具有左旋型态的双股螺旋(与常见的B-DNA相反),并呈现锯齿形状。
C型DNA的结构特点
中文名称C型DNA英文名称C-form DNA;C-DNA定 义在相对湿度约44%下所获得的DNA锂盐纤维所特有的构象,为右手双螺旋,螺旋每转一圈包含约9.3个核苷酸残基,螺距3.1 nm,碱基斜角呈6。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
重复DNA的定义和结构
中文名称重复DNA英文名称repetitive DNA定 义真核生物染色体基因组中含有不同拷贝数的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽,在基因组内可成簇排布,也可散布于基因组。按序列的重复程度和特点可分为低度重复DNA、中度重复DNA和高度重复DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
叶绿体DNA的结构功能特点
chloroplast DNA(cpDNA),存在于叶绿体内的DNA。高等植物叶绿体的DNA为双链共价闭合环状分子,其长度随生物种类而不同,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。叶绿体DNA不含5-甲基胞嘧啶,这是鉴定cpDNA及其纯度的
双链DNA的结构特点
中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定 义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
单链DNA的结构特点
单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。
DNA环的结构和应用
中文名称DNA环英文名称DNA loop定 义蛋白质因子和蛋白质或DNA间的相互作用而形成的DNA分子弯曲成环的结构。这种结构被广泛地用于解释蛋白质-蛋白质、DNA-蛋白质的相互作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
DNA合成仪结构和性能
(一)压力管路及输送管路每个瓶子都有一个氩气压力管道及输送管道进入瓶盖插塞,对于亚磷酰胺,1—8号瓶其压力管道也作为排气管。氩气管要保持在液体水平以上,而输送管却伸到瓶的底部。当阀门正确设置打开时,储液瓶上部空间由氩气加压,液体被推进输送管,流到其目的地。(二)压力系统 系统压力由超纯氩(99.
DNA超螺旋的结构特点
由于双螺旋DNA的弯曲,正超螺旋或负超螺旋而造成的DNA分子的进一步扭曲所形成的DNA的三级结构。有两种:当DNA分子沿轴扭转的方向与通常双螺旋的方向相反时,造成双螺旋的欠旋而形成负超螺旋;方向相同时则形成正超螺旋。生物体内一般以负超螺旋结构存在。
DNA-下游序列的结构特点
中文名称下游序列英文名称downstream sequence定 义DNA或RNA分子中,相对于某一序列的3′方向的序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)
DNA合成仪结构和性能
试剂驱动系统一般地,DNA 合成仪采用一定压力的惰性气体(氩气)或氮气及电磁阀组驱动液体试剂,也可采用氦气驱动试剂。某些合成仪采用slider block滑块系统及精密蠕动泵,可不采用气体为驱动系统。采用气体及电磁阀驱动液体试剂时,需首先将管路系统电磁阀前段,含试剂瓶组中压力加压到规定气压,通过合成
DNA的发夹结构介绍
发卡结构(hairpin structure):这些结构是由于DNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成的,称为发卡结构。又译:发夹结构。DNA分子自身回折,部分碱基彼此靠近,折叠区域内碱基互补配对,回折部分就形成了发卡结构
带切口DNA的结构特点
中文名称带切口DNA英文名称nicked DNA定 义双链DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
什么是DNA的高级结构?
DNA的高级结构,是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的更复杂的特定空间结构,包括超螺旋、线性双链中的纽结(kink)、多重螺旋等。其中,超螺旋结构是DNA高级结构的主要形式,可分为正超螺旋(右手超螺旋)与负超螺旋(左手超螺旋)两大类,负超螺旋是细胞内常见的DNA高级结构形式,正超螺旋是过度缠绕的双
什么是DNA的高级结构?
DNA的高级结构,是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的更复杂的特定空间结构,包括超螺旋、线性双链中的纽结(kink)、多重螺旋等。其中,超螺旋结构是DNA高级结构的主要形式,可分为正超螺旋(右手超螺旋)与负超螺旋(左手超螺旋)两大类,负超螺旋是细胞内常见的DNA高级结构形式,正超螺旋是过度缠绕的双
卫星DNA的结构和功能
卫星DNA(satelliteDNA)是一类高度重复序列DNA。在介质氯化铯中作密度梯度离心(离心速度可以高达每分钟几万转)时,DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层。从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带。根据荧光强度的分析,可以看到在
B型DNA的结构特点
1.两条反向平行的互补双螺旋链,一条方向为5‘→3’,另一条方向为3‘→5’,围绕同一中心纵轴,从右向上盘旋。2.双螺旋磷酸-脱氧核糖主链在外,位于内的碱基平面与中心轴垂直。3.每个碱基相距0.34nm,同条链相邻碱基夹角36度,每10个碱基形成螺旋1周,螺距3.54nm。4.露于螺旋外的磷原子离中
线粒体DNA的结构和作用
线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。它们携带着自己的DNA——mtDNA,而这些基因的突变能引起线粒体疾病。虽然疾病症状是多变的,但大脑、肌肉和心脏
“无用”DNA的结构和功能
中文名称“无用”DNA英文名称junk DNA定 义基因组中不负责编码蛋白质和RNA,因而被认为不具有任何功能的DNA。也被认为是一种分子寄生物,是经过许多世代而插播在基因组中的序列。存在于真核基因组中的大量重复序列即属于其列。但近年来的研究已发现越来越多的“无用”DNA是具有各种不同的功能。应用
双链DNA的结构特点
中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定 义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
DNA双螺旋结构的特征
(1) DNA由两条反向平行的多聚脱氧核苷酸链形成右手螺旋:一条链的5’-3方向是自上而下,而另一条链的3’-5’方向是自下而上,称为反向平行,它们围绕着同一个螺旋轴旋转而形成右手螺旋。(2)由脱氧核糖和磷酸基团构成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧,而疏水的碱基位于内侧。。(3)位于DNA双链内侧的
关于原核基因组的基本内容介绍
原核基因组:原核生物和真核生物基因组由DNA组成。古细菌有一个环状染色体组成的DNA基因组 [2]。大多数细菌也有一个环状染色体,然而,一些细菌物种含有线性染色体 [3]或多个染色体。大多数原核生物基因组中不含有重复DNA [4]。一些共生细菌基因组种含有高比例的假基因,例如Serratia s
多层染色质模型或帮助揭示癌细胞中染色体的畸变结构
目前研究者并不能从实验角度来研究分析细胞分裂期间染色体中DNA的组装机制,近日,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究论文中,来自西班牙公立巴塞罗那自治大学 (Universitat Autònoma de Barcelona)的研究人员通过研究发现了癌细胞的易位结构,这
质粒DNA提取技术
实验概要通过本实验,学习和掌握碱裂解法提取质粒的方法和技术。实验原理质粒是基因工程中常用的载体之一。质粒是染色体外小型双链环状的DNA,大小在1~200kb之间。碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们的。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线
真核生物基因组3
第二节 基因组结构与疾病一、人类染色体的结构与疾病(一) 人体染色体数目、结构和形态人类体细胞中有46条染色体,其中44条(22对)为常染色体,另两条为性染色体(女性为XX,男性为XY)。生殖细胞中卵细胞和精子各有23条染色体,卵细胞为22+X,精子为22+X或22+Y。为便于鉴别人类的每一条染色体
“X”档案破解
据最新一期《自然·结构与分子生物学》杂志报道,荷兰癌症研究所研究人员揭示了为什么人的DNA是X形的,并发现了一种普遍存在的机制,通过这种机制,细胞可决定DNA的形状。这一发现或对了解人类细胞行为产生更广泛的影响。 在人体里,细胞不断分裂成新的细胞。在此过程中,一个细胞复制自己的DNA,并在两个
细胞内共价闭合环状DNA(cccDNA)的抽提与纯化的介绍
最常用的抽提细胞内共价闭合环状DNA(cccDNA)的方法是蛋白质-去污剂沉淀法,其原理是基于rcDNA和共价闭合环状DNA(cccDNA)与蛋白质结合能力的差异。rcDNA能与蛋白质共价结合,与绝大多数细胞染色体DNA一起形成沉淀,而共价闭合环状DNA(cccDNA)不能与蛋白质结合故游离于上
Nature重磅新星eccDNA的物种发现史(二)
3.非洲爪蟾染色体外环状DNA的形成与端粒DNA相关发表期刊:EMBO reports影响因子:8.383发表时间:2002.10.15文章链接:Formation of extrachromosomal circles from telomeric DNA in Xenopus laevis端粒D
如何将染色体上DNA与组蛋白分离
用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.TE 缓冲液琼脂糖凝胶电泳或紫外分光光度计