PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛选,形成了3000个株系的文库,表达了1777amiRNA。通过鉴定基因型和量化表型,其中80个株系表现出可重复的茎生长表型。在这个种群中,研究者发现并描述了未研究过的ABCB6和ABCB20基因在激素运输和响应方法的重要作用。这一研究成果发表在《Nature Communications》。这一研究工作的关键点之一是对大量的样品进行定量化表型测量与分析,通过表型鉴定来确定研究的功能基因。如果使用传统的表型测量技术,工作量将是非常巨大的,而且数据结果中可能会有各种因素造成的大量误差。而本研究中使用的PlantScreen高通量植物表型......阅读全文
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...
PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛
PlantScreen高通量表型组学平台研究叶片衰老
韩国大邱基础科学研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等,利用PlantScreen大型高通量表型组学研究平台,对植物叶片衰老进行了系列研究(参见论文:Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study
PlantScreenSC植物表型分析技术方案
植物表型分析系统PlantScreen-SC包括传送系统、成像系统、环境传感器、服务器等硬件及配套软件,适用于高70cm、宽幅50cm以内的植株。该系统是可用于生物农药、植物源生物刺激剂及土壤调理剂研发的大型表型系统。 成像系统包括叶绿素荧光成像单元和RGB成像单元。前者采用脉冲调制式叶绿素荧光成像
PlantScreen植物表型应用——高通量种子萌发活力与表型监测
种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。 种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工
Isoseq全长转录组测序助力拟南芥蛋白质异构体的发现
背景 植物科学中常以高通量的方式(组学)研究生物体不同层次的复杂性,通常整合多组学数据以获得生物体发育或在不同环境条件下的生物学的准确图像。目前,全长异构体测序(Iso-Seq)与短读长转录组学和蛋白质组学的整合已经成功地用于增加蛋白质异构体的表征,不仅有助于提高基因组和转录组的质量,而且有助于通
利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...
利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predi
PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂...
PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂种优势的贡献杂交在促进作物生长与产量上效果显著,因而被广泛应用于农业生产。但杂交的分子机制仍然不是很清楚。最新的证据表明,水杨酸水平降低调节的相关基因表达,会造成某些杂交种基础防御能力降低,从而影响到这些杂交种的活力。澳大利亚联邦科学与工
PlantScreen(紧凑版)植物表型成像分析解决方案
PlantScreen紧凑版植物/作物表型成像分析平台为温室或实验室用高通量植物表型成像分析系统,由带自动传送系统和光适应/暗适应的主机箱体和成像单元组成,广泛应用于基因组学表型组学研究、遗传育种、作物胁迫与抗性筛选、种质资源检测、生物安全监测等,其主要技术特点:全自动、高通量、非损伤植物表型分析叶
种子萌发率高通量检测与活力评估
种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工计数来测量
PlantScreenSC植物表型分析系统顺利安装运行
日前,由国际植物表型专家PSI公司提供、北京易科泰生态技术有限公司安装培训的植物表型分析系统PlantScreen-SC在四川成都顺利装机运行。该系统包括传送系统、成像系统、环境传感器、服务器等硬件及配套软件,适用于高70cm、宽幅50cm以内的植株。 该系统也是国内首套由公司购买使用,用
PlantScreen植物表型成像分析系统气孔运动调节机制与相...
PlantScreen植物表型成像分析系统-气孔运动调节机制与相关表型分析叶片表面的保卫细胞能够调节气孔开放,从而使植物与大气间进行气体交换,让植物的光合作用与蒸腾作用之间达到平衡。保卫细胞的新陈代谢活性又主要依赖来源于叶肉的糖分。而参与到这一过程中的转运蛋白及其对保卫细胞功能的贡献还不清楚。
遗传所在植物microRNA生物生成机制研究中获进展
MicroRNA(miRNA)是一类真核生物中广泛存在的内源非编码小分子RNA。它主要通过碱基互补配对的形式在转录后水平上负调控靶mRNA,从而广泛地参与动植物各种生物学过程的调控。在植物miRNA生成通路中一些主要因子的功能已经被鉴定,其中Dicer-Like 1(DCL1)是主要负责切割
拟南芥转基因植株的鉴定
实验概要本实验介绍了拟南芥转基因植株的初步鉴定方法,包括:阳性苗的筛选,GUS基因表达分析,组织PCR和RT-PCR分析。主要试剂0.2%的Triton X-100,10%的次氯酸钠,含20 mg/L Hygromycin的MS培养基,X-Gluc,75%乙醇,0.25 N NaOH,0.25
植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例
植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对
利用PlantScreen动态表型成像研究大麦种群水分亏缺响应...
利用PlantScreen动态表型成像研究大麦种群水分亏缺响应和恢复大麦(Hordeum vulgare)作为全球栽培的第四大禾谷类作物,但这种作物的水分胁迫耐受和恢复能力仍然不是很清楚。现在的植物表型平台可以通过无损传感器,按照时间序列自动、快速地测量一系列与胁迫相关的表型特征。到目前为止,通过室
表型组的定义
中文名称表型组英文名称phenome定 义一个细胞、组织、器官、生物体或物种所有表型的总和。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)
转录水平的调控
该模型认为在整合基因的5’端连接着一段具有高度专一性的DNA序列,称之为传感基因。在传感基因上有该基因编码的传感蛋白。外来信号分子和传感蛋白结合相互作用形成复合物。该复合物作用于和它相邻的综合基因组,亦称受体基因,而转录产生mRNA,后者翻译成激活蛋白。这些激活蛋白能识别位于结构基因(SG) 前面的
逆境之战:调控钾/氮协同转运分子机制被发现
近几年以来,中国在植物学领域实现了质的飞跃,其植物学研究成果占到了全球的20%以上,随着国家对于基础科学研究的重视,一大批优秀的成果脱颖而出。本期介绍的这篇论文就是重要代表之一。 中国农业大学武维华院士/王毅教授课题组、李继刚教授课题组和德国明斯特大学Jörg Kudla教授课题组合作完成了拟南芥转
山东大学生科院最新发表PNAS文章
最新研究从蒺藜苜蓿Tnt1逆转录转座子突变体库中,筛选得到雄蕊和心皮器官转换为重叠花瓣和萼片的突变体,鉴定得到新基因AGAMOUS-LIKEFLOWER(AGLF)。 山东大学生命科学学院、植物发育与环境适应生物学教育部重点实验室周传恩教授课题组在豆科植物发育研究中取得重要进展。研究成果“AG
Sci-Rep:转录组水平分析子宫内膜容受性
子宫内膜容受性是哺乳动物胚胎成功着床必不可少的。然而,遗传信息的缺乏仍然是理解奶山羊从接受前期子宫内膜(PE)发育成接受期子宫内膜(RE)过程中潜在机制的一个障碍。 在这项研究中,西北农林科技大学动物科技学院曹斌云教授课题组采用转录组测序获取超过4千万高质量的读段,通过de novo组装获得了
研究发现30、50岁是女性加剧衰老分界点
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505697.shtm7月28日,中国科学院动物研究所、中国科学院北京基因组研究所和衢州市人民医院合作在Med杂志在线发表研究论文,首次系统挖掘了中国女性衰老跨5个维度的生物学标志物,建立了中国女性的多层次
EcoTech植物表型成像分析全面解决方案(二)
高光谱成像技术方案太阳光辐射照射到植物上,一部分被反射回大气中,一部分被吸收进行光合作用,一部分产生热散失。通过FluorCam叶绿素荧光成像技术可以成像测量分析植物吸收太阳能的光合利用效率等,通过红外热成像技术可以成像测量植物热时空分布进而分析气孔导度及水分利用效率等,而利用高光谱技术对植物反射光
器官边界区基因调控网络的系统生物学研究获进展
植物的侧生器官边界区将叶片等侧生器官(分化细胞)与顶端分生组织(干细胞)分隔开,确保器官的形成和干细胞的维持。此外,器官边界区产成侧生分生组织,进而形成侧芽,影响植物株型的建成。但由于边界区细胞数量较少,表型不易观察,因此对边界区形成的正反向遗传学研究都很困难,使得我们对边界区形成的调控机理知之
《科学》:基因组大规模筛选新技术助力癌症研究
3000种基因经初次筛选后,大约24个符合要求 多年来生物学家一直在搜寻癌细胞的弱点,以期找到对付癌症的线索。美国科学家近日研究出了一种基因组大规模筛选技术,有望提供一种强大的经济有效的方法以挑选出对付癌症的新药靶。相关论文发表在2月1日的《科学》(Science)上。 2005年,美国国立卫
水稻籽粒糊粉层厚度调控机制的研究进展
近日,中科院植物所刘春明研究员带领课题组成员对水稻籽粒糊粉层厚度的调控机制进行了研究,并于《美国科学院院报》(PNAS)上发表了研究成果,为水稻及其它禾本科农作物营养品质育种提供了新的理论支持和育种思路,安诺基因为本项研究提供了全基因组甲基化测序(WGBS)的实验及分析服务,助力OsROS1调控
植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学
作物表型组学研究技术方案与应用
手持式、便携式仪器无疑是作物表型分析性价比高、使用灵活方便的设备,如手持式FluorPen叶绿素荧光仪、手持式SpectraPen/PolyPen高光谱仪、IQ智能手持式高光谱成像仪、FluorCam便携式叶绿素荧光成像仪等。PlantScreen温室紧凑型或大型传送带式植物表型成像分析平台集植物自
基于LED光源的科研级植物培养方案(五)
植物培养是生物实验室最重要的常规基础实验之一。以前的研究中,只要求培养系统能够使种子萌发、基本满足植物的生长即可。但在真正严格的植物生理生态研究中,传统培养箱由于种种原因是远远不能达到要求的。本文将系统介绍一系列基于LED光源的科研级植物培养方案,包括SL3500植物培养LED光源、FytoScop
作物表型组学阐述
到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。与广泛的遗传信息相比,表型分析
PRRs通过与ABA信号途径中的关键转录因子调控ABA信号转导
2021年6月21日,The Plant Cell在线发表了中国科学院西双版纳热带植物园胡彦如研究员团队完成的题为“The Arabidopsis circadian clock protein PRR5 interacts with and stimulates ABI5 to modulat