在Matlab中探索基因表达数据分析

DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学 工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA 探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱,微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下,如两种不同的肿瘤类型,是否存在统计显著的基因表达量的变化进而确定差异表达基因的生物学功能。 本文利用一个公共数据集来说明计算过程,这个数据集包括42个胚胎中枢神经系统肿瘤组织(CNS, Pomeroy et al. 2002),样本采用Affymetrix 公司出品的HuGeneFL基因芯片进行杂交 。 这些CNS数据集(CEL文件)可在CNS实验网站获得,42个肿瘤样本包括10个10 个髓母细胞瘤, 10个横纹肌样脑膜瘤, 10个胶质瘤, 8个幕上原始神经外胚层肿瘤和4个正常人小脑,CNS原始数据集用......阅读全文

MATLAB的编程规范总结

好的编程习惯,可以提高编程效率,不仅可以使代码容易修改,也容易给别人看懂,便于交流。我们不仅要写出“给机器读懂的代码”,也写出“给人看得懂的代码”。 本文根据一些目前搜索到的文献和自己的一些使用心得,整理出这个文档,大家可以根据经验提出自己的心得,相互促进,共同提高。 1,命名规则 (1)变量

激光雷达matlab程序

激光雷达是以发射激光束探测目标的位置、速度等特征量的雷达系统。从工作原理上讲,与微波雷达没有根本的区别:向目标发射探测信号(激光束),然后将接收到的从目标反射回来的信号(目标回波)与发射信号进行比较,作适当处理后,就可获得目标的有关信息,如目标距离、方位、高度、速度、姿态、甚至形状等参数,从而对飞机

大咖谈Matlab被禁:凡事不能期望速成

  6月10日,Mathworks 称,迫于美国政府的政策,禁止向哈尔滨工业大学、哈尔滨工程大学提供技术以及客户支持服务。此后,这一言论被证实,两校师生无法使用该公司旗下数据分析、图像处理软件 Matlab。  近日,来自中科院计算所研究员、先进计算机系统研究中心主任包云岗在中国计算机学会青年计算机

在Matlab中探索基因表达数据分析

DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学  工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA  探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱,微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下,如两种不同的肿瘤

基于Matlab的均匀平面电磁波的仿真

0、引言“电磁场与电磁波”是电子与通信类专业本科生必修的一门专业基础课,课程涵盖的内容是电子与通信类专业本科阶段所应具备的知识结构的重要组成部分。在教学过程中,学生普遍反映该门课程比较抽象,包含了大量的数学公式推导,很多概念难以理解。无论是电磁场还是电磁波,都是看不到、摸不着的,教师难讲、学生难懂是

如何用matlab拟合级配曲线顺便求出中值粒径

如何用matlab拟合级配曲线?分析了题主给出的数据,其数据能够较好的符合Richards模型,所以该系数拟合问题可以来处理。1、p系数的初值。由于该模型表达式为y=p1*(1-p2*exp(-p3*x))^(1/(1-p4)),所以p系数的初值应这样来确定,即p0=[1.01 -0.01 0.01

基于Matlab的DDS线性调频信号的仿真应用(三)

  4 实验结果  根据上面的程序,取调频斜率为400,频率控制字为10,幅度量化为10位(和所使用的D/A配合),相位累加器为24位,用Matlab仿真得到的线性调频信号的波形和相应的幅频响应如图3和图4所示。图3 K=400,Kc=10,N=10,L=24的情况下的线性调频信号图4 针对

基于Matlab的DDS线性调频信号的仿真应用(一)

  直接数字频率合成( DDS)是近年来得到迅速发展的一种新的频率合成方法,具有频率切换速度快,很容易提高频率分辨率、对硬件要求低等优点。 可编程全数字化便于单片集成、有利于降低成本、提高可靠性并便于生产等有点。DDS技术从相位的概念出发进行频率合成,存储了数字采样波形表,可以产生点

基于Matlab的DDS线性调频信号的仿真应用(二)

  脉冲压缩雷达最常见的调制信号是线性调频信号,接收时采用匹配滤波器(Matched Filter)压缩脉冲。它的数学表达式如下:(2)  式中fe为载波频率,K=B/T是调频斜率,于是,信号的瞬时频率为。  其对应的量化公式如下(此式是以图2实现的原理公式):(3)  式中N为相位累加器的

哈工大、哈工程被禁用MATLAB,美国“实体名单”影响持续加深

哈尔滨工业大学  哈工大、哈工程的老师和学生们最近无法使用 MATLAB 了,这一消息迅速成为了人们关注的热点。  近日,在知乎等社交网络上,有哈工大学生表示收到了正版软件取消激活的通知,而在与 MATLAB 开发公司 MathWorks 交涉之后,人们得知因为美国政府实体名单的原因,相关授权已被中

AFM基于其他商业数学软件的图像处理

基于其他商业数学软件的图像处理尽管诸如Gwyddion等图像处理软件已经足够强大,但其并不能完全支持所有数据格式,同时其并不允许用户对数据进行真正随心所欲的分析处理。为此,获取AFM图像所包含的所有“数据”,并用数学计算的方式进行图像处理成为必需。在此,介绍利用商业数学软件Matlab对AFM数据进

高校合成新生平均脸,同时公布平均身高数据

  近日,北京航空航天大学发布该校今年本科新生大数据。其中2张头像,引发关注。这2张头像分别是该校2021级本科男女新生“平均脸”(由上千副面孔叠加而成)。此外,该校今年本科男女新生平均身高分别是177.3cm、164.4cm。  据了解,今年,本科新生“平均脸”的合成由该校学生处学生大数据中心完成

飞秒激光触发光电导天线产生太赫兹波技术

研究了光电导天线产生太赫兹波的辐射特性,利用麦克斯韦方程及其边界条件,计算了近远场的电场强度;采用电磁波时域有限差分方法(FDTD),在Matlab系统软件中,用C语言编写程序计算光电导偶极天线的辐射太赫兹波的空间电磁场分布,并在计算机上以伪彩色图形显示,这种电磁场的可视化结果为天线的设计和改进提供

实验数据与处理方法

实验数据为美国加州圣地亚哥北部岛屿某海军飞机场的AVIRIS高光谱影像数据,如图8.2所示。该数据光谱范围是0.4~1.8μm,像元分辨率为3.5m,共有137个波段,有效波段126个。该影像区域内人工建筑占主导地位,相对比较规整。实验的编程环境为Matlab2010,进行高光谱影像的SVM分类时,

2025年EPR应用培训计划发布!国仪顺磁学院诚邀参会

3月19-23日 | EPR用户交流会为切实提高电子顺磁共振技术的应用水平,增强仪器使用效果,国仪量子将于2025年3月19日至23日邀请国内电子顺磁共振领域知名专家苏吉虎教授,携手国仪量子应用专家团队,在合肥举行“国仪量子电子顺磁共振用户培训会”。本次培训将聚焦连续波和脉冲谱仪的基础理论与设备实操

基于微功耗IC设计功能更齐全心率监护仪(HRM)(三)

  事实上,导联脱落检测电路是一个比较器,迟滞利用一个 放大器实现。用一个高增益比较器来确定输入电压是高于 还是低于基准电压,并输出一个代表净差符号的电压。迟 滞通过少量正反馈消除噪声导致的不稳定性。单电源供电 时,需要偏移基准电压,使电路完全在第一象限工作。图 4显示了实现方法。电

恒温培养箱的温度模糊控制

恒温培养箱的温度模糊控制针对恒温培养箱中温度控制对象的时滞以及模型参数不确定的特性,提出了一种温度模糊控制方法。该方法不需要的系统模型,并克服了对象延迟滞后的特性。介绍了温度模糊控制器的设计,给出了系统实现电路,并通过Matlab进行了仿真。实验结果表明,该方法控制精度高、响应快,能满足恒温培养箱温

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恒温培养箱的温度模糊控制针对恒温培养箱中温度控制对象的时滞以及模型参数不确定的特性,提出了一种温度模糊控制方法。该方法不需要的系统模型,并克服了对象延迟滞后的特性。介绍了温度模糊控制器的设计,给出了系统实现电路,并通过Matlab进行了仿真。实验结果表明,该方法控制精度高、响应快,能满足恒温培养箱温

强流二极管产生脉冲X射线能谱场稳定性研究

根据二极管结构及运行参数与出射电子、光子能谱的关系,采用Matlab数据处理软件和蒙特卡罗粒子输运计算方法,建立了二极管阳极靶表面出射光子能谱的计算方法。通过多次对二极管单次脉冲运行参数的比较研究,分析了强流二极管多炮运行参数的波动,对所产生的脉冲X射线能谱场稳定性的影响。计算结果表明:电子能谱的差

事件相关脑电位仪的技术指标

  技术指标  放大器  1、A/D Resolution:20 Bit  2、带宽(Bandwidth):DC ~ 2500 Hz  3、输入范围(Full Scale Input Range)(DC Mode):+/ -200 mV  4、灵敏度(DC模式):24 nv/bit  5、阻抗:1K

EZDSO虚拟示波器的特点

  1.体积小巧,携带方便。  2.功能丰富。集成时波器,信号发生器,逻辑分析仪。  3.512K采样点(单通道),256K采样点(双通道)。  4.触发方式:上边沿触发,下边沿触发,电平触发,眼图触发。  5.光标测量电压,时间。  6.自动测量频率,周期,最大值,最小值,峰峰值,有效值。  7.

怎么看ADF单位根检验的结果

检验方法:平稳序列I(0),一阶差分 I(-1),仍然是平稳的,ADFtest 仍然会拒绝原假设。这个现象叫做over differencing。不能因为一阶差分是平稳的就确定原序列是非平稳的。你可能over difference了。我说作者可能是用EVIEWS,因为他原文我找到了,看他画那几个图,

球磨机钢球级配您必须要了解的几个问题

对现有球磨机的加工原理及机械结构进行深入研究,及分析影响球磨机加工精度和加工效率的因素,并从中发现探讨球磨机存在的缺陷。   球磨机钢球是经常磨损的配件,一些客户朋友在网络上咨询一些问题,我们在这里就一些关于球磨机钢球磨损的问题,进行一些介绍!   球磨机各个仓的钢球级配问题?   制定球磨机钢球级

用什么软件可以处理质谱图

每一个品牌的质谱仪软件都不一样,出来的数据也就不一样,但是所有的质谱仪一定都是可以导出一个文本文件,里面包含数据的。我们实验室要求用Igor pro,用matlab, origin, python甚至excel都可以迅速的导入数据然后出图。因为我们仪器是自己定制的,所以的到的就是原始数据,有些质谱仪

安捷伦推针对先进射频和微波应用的分析仪

  10 月 21 日,安捷伦科技公司宣布推出 N9030A PXA 信号分析仪――Agilent X 系列信号分析仪中性能最高的分析仪。PXA 提供高达 26.5 GHz 的频率范围,通过可选的测量功能和硬件可扩展性能够确保当前和未来的灵活性。该分析仪还包括广泛的代码兼容特性,能够更加轻松地替代现

实验设计与软件分析的总结

在日常的实验室“江湖”中有很多的高手,实验结果准确,效率又高,文章高产,接下来我们就来探秘这些中的流式“高手”。      日常的工作量,其实也是“小马过河”的故事。很多人建立方案,设置补偿可能就已经占用了几乎全部预约时长。而很多高手,或许你只看到仪器在采集样本,而高手已经去做其他实验了。即便是花了

台式核磁共振波谱成像设备可开展的核磁共振代表性实验

(1)核磁共振原理:核磁共振成像原理、核磁共振现象、核磁共振弛豫时间、自旋回波、核磁共振脉冲序列、拉莫尔频率、核磁共振信号的空间定位、核磁共振图像重建等等; (2)实际测量及成像试验:电子匀场、横向弛豫时间T2测量、纵向弛豫时间T1测量、90°脉冲测量试验、180°脉冲测量试验

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声学多普勒流速仪的几何形状和坐标系统

  几何形状  MicroADV主要由三部分组成:量测探头、信号调理、信号处理。量测探头由三个10MHz的接收探头和一个发射探头组成, 三个接收探头分布在发射探头轴线的周围,它们之间的夹角为120°,接收探头与采样体的连线与发射探头轴线之间的夹角为30°,采样体位于探头下方5cm或10cm,这样可以

2018中科院遥感与数字地球研究所实验室招聘研究生公告

  为满足工作需要,拟招收客座实习生若干名,协助完成遥感考古相关课题的资料收集、数据处理、代码开发等工作。  一、申请条件:  1、地理学、遥感、地信、计算机等相关专业,能熟练使用ENVI、ARCGIS、Grass GIS等专业软件,熟悉C++/IDL/Matlab编程者优先考虑;具有较强的英语读写