研究揭示人胚胎发育转录组
原始态（Naïve state）多能性相关研究是近年来干细胞及重编程领域的研究热点和难点，与传统的primed状态相比，Naïve态捕获了体内植入前胚胎发育的阶段，具有更强的可塑性，在早期胚胎发育研究及未来临床应用中具有更广阔的前景。在近10年的研究中，科学家们取得了一系列重要进展，已建立了较为稳定的人naïve 态多能干细胞的培养和诱导条件【1,2】，并通过抗体库筛选，发现了一系列能够用来分离、指征和鉴定naïve态多能干细胞及中间细胞群体的特定细胞表面蛋白【3】，为naïve态多能干细胞的纯化、分离以及naïve态诱导和培养体系的进一步优化提供重要基础。然而，目前所鉴定的表面抗原多在 naïve 态建立及维持过程中不发挥重要功能，而其在该过程中的动态及发生的分子机制也仍不清楚。 2020年3月17日，同济大学 高绍荣教授团队在 Cell Reports发表题为 “Identification of ALPPL2 as ......阅读全文
空间转录组学研究案例简析
01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子：11.878发表时间：2018.06发表期刊：Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里，研究人员使用空间转录组学（ST）技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法，分析12个区域的近6
花生转录组denovo测序揭示果针发育相关的功能基因
近日，由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士，山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology
百万线虫细胞研究揭示胚胎发育具有“纠错潜能”
线虫胚胎发育之路。从中心到外缘胚胎细胞不断分裂，走向成熟。 杜茁团队供图生命发育往往并非一帆风顺。很多胚胎在不同发育阶段都会出现各个种类、不同程度的细胞行为异常，但这并不会影响胚胎的最终存活。其背后原因是什么呢？利用单细胞高精度实时追踪技术对秀丽线虫胚胎细胞进行追踪研究，中科院遗传与发育生物学研究所
颉伟组分析卵子向胚胎转换过程中转录组、翻译组、蛋白质组关系
生命起始于卵子和精子的结合，终末分化的配子在受精后重编程为具有全能性的胚胎。然而，卵子发育晚期至合子基因组激活之前，基因组一直处于转录沉默状态。在此阶段发生的诸如卵子减数分裂、母源RNA去除和合子基因组转录激活等重要生物学事件都高度依赖于转录后调控。颉伟实验室前期研究表明，人和小鼠卵母细胞向胚胎
胚胎发育的基本过程
胚胎发育一、胚胎发育过程（蛙的受精卵发育）二、特征⒈卵裂期细胞数量不断增加，但胚胎的总体积并不增加，或有所缩小⒉桑椹胚时期及其以前的细胞，每一个细胞都具有发育成完整胚胎的潜能，属于全能细胞。当胚胎细胞数目达到32个左右时，胚胎形成致密的细胞团，形似桑葚，叫做桑葚胚（morula）。⒊囊胚中有一个含有
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞转录组重要研究文献汇总（二）
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究，由于植物具有细胞壁的特点，使得植物的单细胞研究相比较难，但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
利用CRISPRdCas13系统追踪发育胚胎中的转录记忆和mRNP出核
1月19日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组在Genome Biology上，发表了题为CRISPR-dCas13-tracing reveals transcriptional memory and limited mRNA export in de
利用CRISPRdCas13系统追踪发育胚胎中的转录记忆和mRNP出核
1月19日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组在Genome Biology上，发表了题为CRISPR-dCas13-tracing reveals transcriptional memory and limited mRNA export in de
揭秘胚胎发育奥秘！为何发育中胚胎细胞彼此并不相同？
近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自纽约大学的科学家们通过研究阐明了在胚胎发育（embryogenesis）过程中细胞变得彼此不同的分子机制，相关研究结果或能帮助阐明胚胎发育的遗传规律，同时也能帮助理解疾病发生和出生缺陷的原因。图片来源：commons.wik
我国科学家首次系统揭示人类消化道发育细胞图谱
为消化道器官相关癌症的机理研究提供重要参考 我国科学家日前在学术期刊《自然—细胞生物学》（Nature Cell Biology）在线发表研究论文，在国际上首次从单细胞分辨率和全转录组水平，全面、系统、深入地阐明了食道、胃、小肠和大肠这4种器官在人类胚胎发育过程中的基因表达图谱及其信号调控机制
我国科学家首次系统揭示人类消化道发育细胞图谱
我国科学家日前在学术期刊《自然—细胞生物学》（Nature Cell Biology）在线发表研究论文，在国际上首次从单细胞分辨率和全转录组水平，全面、系统、深入地阐明了食道、胃、小肠和大肠这4种器官在人类胚胎发育过程中的基因表达图谱及其信号调控机制，揭示了这4种器官不同细胞类型之间
胚胎发育研究新成果－将助不孕不育疾病诊治
从北京大学第三医院获悉，该院乔杰教授团队与北京大学生命科学学院汤富酬研究员团队合作，系统阐述了人类生殖细胞及胚胎发育过程中的基因表达图谱及调控机制，这将为不孕不育等生殖相关疾病的诊断、治疗提供靶标。目前这一最新研究成果已在《Cell Stem Cell（细胞干细胞）》杂志在线发表。 在全球范围
最新研究打开了人类胚胎早期发育的“黑匣子”
临床上，大约30%~40%的情况下，胚胎会出现无法着床或正常发育的现象，部分原因来自胚胎，然而具体机制尚不清晰。阐明胚胎从着床开始的早期发育情况，对不孕症的干预、试管婴儿技术成功率的提升至关重要。 然而人类胚胎在植入子宫后的早期发育情况，由于伦理和技术的限制而长期处于“黑匣子”般的状态。 1
我国研究人员发现六亿年前的胚胎发育机制
动物（特指后生动物，即包括最简单的海绵动物到最复杂的脊椎动物在内的所有多细胞动物）无疑是整个地球生态系统中不可或缺的组成。作为动物界的成员，人们对动物究竟是何时并如何起源的抱有天然的好奇心，但直到今天，这仍然是演化生物学领域悬而未决的重大科学难题。 现代动物界包括三十多个动物门类，已有研究表明
Cell：新研究揭示胚胎时期神经回路是如何发育的
神经元细胞的发育成熟最初需要从胚胎开始，直至到达神经系统。然而，我们目前并不清楚其中的详细过程。霍华德·休斯医学研究所的科学家Yinan Wan说：“我们目前猜测的很多过程是无法被观测的”。如今，Wan和她的同事们已经开发出了可以直接观察动物活动的工具。（图片来源：Wan et al, Cell
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
转录组测序原理
而转录组测序即是利用高通量测序技术，将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq，也就是转录组测序，可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括：正常组织与肿瘤组织；药物治疗前后的表达差异；发育过程中，不同发育阶段，不同组织的表达
人工胚胎高通量方式揭示早期胚胎的发育机制
美国索尔克（SALK）生物学研究所Belmonte课题组、德克萨斯大学西南医学中心吴军课题组及北京大学第三医院于洋课题组等在Cell杂志发表题为“Generation of blastocyst-like structures from mouse embryonic and adult ce
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
胚胎发育先成说的概念
先成说（也称预成说）：关于胚胎发育的一种假说，认为卵细胞或是精子中存在生物体发育的雏形，即生物体的各种组织和器官。十八世纪预成论vs渐成论之争，随着细胞理论的出现、哺乳动物卵子的发现以及授精过程的显微观察而尘埃落定—先成说被彻底抛弃。
胚胎发育之谜？刘江揭开面纱
DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰。以高等动物为例，个体从受精卵发育成成体的过程中，DNA甲基化图谱都是动态变化的，会调控不同的细胞往不同的方向分化。因此，建立DNA甲基化图谱对理解生殖细胞形成和胚胎发育至关重要。刘江（中）团队合影 在基金委“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划中，
胚胎发育后成说的概念
后成说（也称渐成说）是关于胚胎发育的一种假说。认为无论卵细胞还是精子中都不存在生物体发育的雏形，生物体的各种组织和器官都是在个体发育过程中逐渐形成的。在授精过程发现（于十九世纪后期）之前，人类对生物个体发育的认识就是两种截然不同观点—预成论（先成论）与渐成论（后成论）之争的历史。
探讨胚胎发育的调控机制
发育生物学是生命科学的前沿领域，在最近几十年里，对发育生物学的某些基础领域有了较为深入的认识。但是发育生物学领域依然存在许多未解的问题，例如，一个单细胞——受精卵细胞是如何发育成复杂的组织、器官、系统乃至完整的有机个体。生命最大的奥秘就是探讨一个受精卵如何发育成复杂的生物体，但是，由于受精卵植入子宫
Nature－|－胚胎干细胞悬浮培养首次构建体外类囊胚
哺乳动物的发育起源于受精卵，受精卵通过分裂，经历了2-cell、4-cell、8-cell、桑葚胚（Morula）再到囊胚（Blastocyst）阶段，称之为着床前胚胎（pre-implantation）。随后胚胎植入子宫壁，诱导子宫内膜蜕膜化（decidualization）预示着成功着床（i
Nature－|－胚胎干细胞悬浮培养首次构建体外类囊胚
哺乳动物的发育起源于受精卵，受精卵通过分裂，经历了2-cell、4-cell、8-cell、桑葚胚（Morula）再到囊胚（Blastocyst）阶段，称之为着床前胚胎（pre-implantation）。随后胚胎植入子宫壁，诱导子宫内膜蜕膜化（decidualization）预示着成功着床（i
研究揭示人类基因组如何发生变化
很多人认为，进化需要几千年或者上百万年，但生物学家知道，它能很快发生。如今，由于基因革命，研究人员实际上可以追踪标志着进化正在进行的种群水平上的基因漂移，并且他们正在人类当中这么做着。近日，在基因组生物学会议上得以展示的两项研究证实了人类基因组如何在几个世纪或几十年间发生变化，并且描绘了自罗马时