研究揭示H2AK119ub1在染色质蔓延以及跨细胞周期继承机制
3月23日，中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室李国红课题组在Nature Cell Biology上发表了题为RYBP/YAF2-PRC1 complexes and histone H1-dependent chromatin compaction mediate propagation of H2AK119ub1 during cell division 的文章。该研究系统阐述了组蛋白修饰H2AK119ub1在染色质上蔓延以及跨细胞周期继承的具体机制。 真核细胞内，染色质是表观遗传信息的主要调控界面。诸多表观遗传因子通过调节染色质结构的开放与关闭，控制了基因的表达与沉默，从而维持了不同谱系细胞内基因的差异表达。其中，多梳抑制复合物1（PRC1）是一类重要的表观遗传调控因子，它主要通过压缩染色质结构和催化形成H2AK119ub1修饰这两种途径促进了兼性异染色质的形成，并以此维持了PRC1靶基因的沉默状态。H......阅读全文
聚胺法分离染色质
聚胺法分离染色质试剂、试剂盒：秋水仙胺、聚胺缓冲液实验步骤：有丝分裂中细胞的同步化37℃，用合适的含有 FCS，抗生素和其他必要成分的培养基培养细胞。2. 收集有丝分裂细胞前 10~16 小时在培养基中以 0.06 μg/ml 的浓度加入秋水仙胺。收获细胞并在聚胺缓冲液中裂解3. 收获细胞。对于悬浮
水相法分离染色质
水相法分离染色质试剂、试剂盒：水相裂解缓冲液仪器、耗材：离心机实验步骤：像聚胺法的第 1、2 步中讲的那样诱导悬浮或单层培养细胞的中期阻遏状态。2. 细胞在 4℃，1000 g 离心 10 分钟然后重悬浮，典型的制备量为 10 ml 新鲜培养基含 108 个细胞。3. 将浓的细胞悬液在冰上放置至少
常染色质的外形介绍
一般来说，常染色质通过G显带技术表现为浅色带状，这样的结构在光学显微镜下可见，其颜色与异染色质较深的染色不同。其染色较浅是由于其聚集程度较低导致的。常染色体的基本结构是一条细长且开放未折叠的10纳米长微纤维。在原核细胞中，常染色质是其染色质的唯一存在形式；这表明异染色质是一种与细胞核一同在原核细胞之
染色质的组装模型介绍
人的每个体细胞所含DNA约6×109bp分布在46条染色体中，总长达2米，平均每条染色体DNA分子长约5厘米，而细胞核直径只有5~8微米，这就意味着从染色质DNA组装成染色体要压缩近万倍，相当于一个网球内包含有2千米长的细线。 多级螺旋模型由DNA与组蛋白组装成核小体，在组蛋白H1的介导下核小体彼此
关于x染色质的简介
x染色质曾称巴氏小体或x小体，为紧贴细胞核膜内面的团块状结构，直径约1um，染色程度较其他染色质深。其形态不一，常呈三角、半圆、平凸或球形。利用放射自显影技术的研究发现，女性的两条x染色体中有一条DNA复制延迟，称迟复制x。迟复制的x染色体在间期时表现为x染色质。当细胞内有一条以上x染色体时，在
异染色质的分类介绍
异染色质着色较深，常位于细胞核的边缘和核仁周围，构成核仁相随染色质的一部分。可以分为结构性异染色质（constitutive heterochromatin）和兼性异染色质（facultative heterochromatin）两种。1.结构性异染色质 是各类细胞的整个发育过程中都处于凝集状态的染
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
关于染色质消减的基本介绍
在细胞分裂过程将部分染色质放于核外而失掉的过程 chromatin diminution 指向体细胞分化的细胞，在细胞分裂过程将部分染色质放于核外而失掉的过程。某种蛔虫在卵裂过程中放出复合染色体的末端部分，产生了染色质消减，对将来可成为生殖细胞的细胞则无此消减现象。仅生殖细胞所保持的染色质，
染色质的实验依据介绍
1、用温和的方法裂解细胞核,将染色质铺展在电镜铜网上,通过电镜观察,未经处理的染色质自然结构为30nm的纤丝,经盐溶液处理后解聚的染色质呈现一系列核小体彼此连接的串珠状结构,串珠的直径为10nm。 2、用非特异性微球菌核酸酶消化染色质时,经过蔗糖梯度离心及琼脂糖凝胶电泳分析,发现绝大多数DNA
关于活性染色质的简介
活性染色质是指具有转录活性的染色质。活性染色质的核小体发生构象改变,具有疏松的染色质结构,从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合酶在转录模板上滑动。 活性染色质主要特征活性：染色质具有DNase I超敏感位点（DNase I hypersensitive site）；活性染色质很
关于染色质重塑的过程介绍
在核小体重塑过程中，重塑因子复合物的作用非常重要。这些复合物都具有ATP酶活性。SWI/SNF复合物和ISW I 复合物家族是最先从酵母和果蝇体内发现的两种。SWI/SNF中的组分BRG1、hBRM 和ISW I相关复合物中的组分Hsnf2L、Hsnf2h 具有ATP 酶活性。人的SWI/SNF
染色质的组成DNA的简介
细胞中编码和控制的信息是与DNA分子紧密地联系在一起的。DNA与染色质有着重大联系。DNA是一种高分子聚合物，即由重复单位构成的大分子。每一单位都由三种较小分子组成，它们彼此结合形成核苷酸。碱基共有四种：胸腺嘧啶(T)，胞嘧啶(C)，腺嘌呤(A)，鸟嘌呤(G)。人的碱基比例 A:T:G:C是29
染色质的基本结构单位介绍
20世纪70年代以前，人们关于染色质结构的传统看法认为，染色质是组蛋白包裹在DNA外面形成的纤维状结构。直到1974年Kornberg等人根据染色质的酶切和电镜观察，发现核小体是染色质组装的基本结构单位，提出染色质结构的“串珠”模型，从而更新了人们关于染色质结构的传统观念
染色质免疫共沉淀技术（ChIP）
真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细
染色质的相关形态等介绍
染色体的组成 一个染色体一般呈棍棒状，包含一个着丝点（c）和两个臂（a、 b）。着丝点是纺锤丝附着的地方，少数染色体的着丝点位于一端。一个染色体只有一个着丝点。因此，对染色体计数时就是看着丝点的数目。 染色体的形态 在细胞周期中，染色体的形态有两种，并且通过一定的方式相互转化。A是通常所说
染色质的结构组成及功能
染色质是指间期细胞核内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA 组成的线性复合结构，是间期细胞遗传物质存在的形式。染色体是指细胞在有丝分裂或减数分裂过程中，由染色质聚缩而成的棒状结构。实际上，两者化学组成没差异，而包装程度即构型不同，是遗传物质在细胞周期不同阶段的不同表现形式。在真核细胞的细胞周期中，
常染色质的结构和特点
常染色质是染色质（由DNA、RNA和蛋白质组成）的一种松散聚集的形式，这种聚集方式在基因中大量存在，并且相应的片段通常处于活跃的转录当中（但并非必要，即常染色质部分不一定都是高表达的序列）。常染色质构成了细胞核基因组中表达最活跃的一部分。人类基因组中92%为常染色质。
什么是兼性异染色质？
在一定时期的特种细胞的细胞核内, 原来的常染色质可转变成兼性异染色质。如雄性个体的细胞含有一个瘦小的Y染色体和一个大的X染色体, 由于X和Y染色体上很少有共同的基因, 对于雄性来说, X染色体上的基因就只有一个拷贝。虽然雌性细胞有两条X染色体, 也只有一条具有转录活性, 另外一条X染色体像异染色质一
染色质的结构成分介绍
通过分离胸腺、肝或其他组织细胞的核，用去垢剂处理后再离心收集染色质进行生化分析，确定染色质的主要成分是DNA和组蛋白，还有非组蛋白及少量RNA。大鼠肝细胞染色质常被当作染色质成分分析模型，其中组蛋白与DNA含量之比近于1:1，非组蛋白与DNA之比是0.6:1，RNA与DNA之比为0.1:1。DNA与
染色质免疫沉淀DNA分析
实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法，来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性 DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布（用芯片或 DNA 测序）。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀 (X-ChIP) 实验的具
异染色质的概念和特征
异染色质是指间期细胞核中，染色质纤维折叠压缩程度高，处于聚缩状态，用碱性染料染色时着色深的那些染色质。异染色质又分为结构异染色质（组成型异染色质）和兼性异染色质。结构异染色质指的是各种类型的细胞中，除复制期以外，在整个细胞周期均处于聚缩状态，DNA组装比在整个细胞周期中基本没有较大变化的异染色质。兼
染色质免疫共沉淀技术（ChIP）
真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细
染色质的前期组装过程
①最开始是H3·H4四聚体的结合,由CAF-1介导与新合成的裸露的DNA结合。 ②然后是两个H2A·H2B二聚体由NAP-1和NAP-2介导加入。为了形成一个核心颗粒,新合成的组蛋白被特异地修饰。组蛋白H4的Lys5和Lys12两个位点典型地被乙酰化。 ③核小体最后的成熟需要ATP来创建一个
关于染色质重塑的基本介绍
染色质重塑chromatin remodeling ：基因表达的复制和重组等过程中，染色质的包装状态、核小体中组蛋白以及对应DNA分子会发生改变的分子机理。 DNA 复制、转录、修复、重组在染色质水平发生，这些过程中，染色质重塑可导致核小体位置和结构的变化，引起染色质变化。ATP 依赖的染
Y染色质的临床意义
临床上检查Y小体，也关联到X连锁遗传病，如血友病等只在男性发病，而女性为致病基因携带者，其他意义可参阅X小体检查节。此外，对两性畸形的鉴别也有帮助。男性假两性畸形的Y小体阳性；XYY综合征的Y小体为双阳性；先天性睾丸发育不全的Y小体阳性；女性假两性畸形的Y小体为阴性。
染色质免疫沉淀DNA分析
实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法，来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性 DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布（用芯片或 DNA 测序）。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀 (X-ChIP) 实验的具
常染色质的概念和特征
常染色质是指间期细胞核内染色质纤维折叠压缩程度低，相对处于伸展状态，用碱性染料染色时着色浅的那些染色质。在常染色质中，DNA组装比为1/2 000~1/1 000，即DNA实际长度为染色质纤维长度的1 000~2 000倍。构成常染色质的DNA主要是单一序列DNA和中度重复序列DNA。常染色质并非所
荧光染色显示Y染色质法
实验方法原理在间期细胞核中，女性X染色质和男性Y染色质均可用特殊染色法显示出来。女性的两个X染色体中的一个，在间期时的染色质呈异固缩（Heteropyconosis），呈深染的小体称Barr氏体。Barr氏体位于间期细胞核内面，呈三角形或半月形小体，易为碳酸复红或硫堇等染料着色。正常女性Barr氏体
Y染色质的概念和指标
男性Y染色体长臂远侧由异染色质构成，如用荧光染料染色时，可出现强荧光。可数100个细胞，计算阳性率，男胎的Y小体＞50％，大于10％判为男胎；女胎的Y小体占0％-1％，小于5％则判为女胎。
关于染色质的结构要点介绍
1、每个核小体单位包括 200 bp左右的DNA超螺旋和一个组蛋白八聚体以及一个分子的组蛋白H1。 2、组蛋白八聚体构成核小体的盘状核心颗粒,相对分子质量100 000,由4个异二聚体组成,包括两个H2A-H2B和两个H3-H4。 3、146 bp的DNA分子超螺旋盘旋组蛋白八聚体1.75圈