分子对接技术研究化合物1与受体PARP1的结合模式(蛋白...

分子对接采用分子对接技术研究化合物1与受体PARP1的结合模式(图1)。 图1.化合物1的化学结构 2.计算方法从RCSB Protein Data Bank(http://www.rcsb.org)下载PARP1的X-ray晶体结构(PDB 编号:4RV6,分辨率:3.19 Å),以第一个构象作为受体结构。 [1].采用UCSF Chimera软件建立化合物1的三维结构,并进行能量优化。 [2,3].采用Dock Prep模块添加氢原子,并分别添加AMBER ff14SB力场和AM1-BCC电荷。采用Chimera中的DMS工具以半径为1.4 Å的探针生成受体的分子表面。 [4,5].X-ray晶体结构显示有1个合理的结合位点,对于该结合位点,使用sphgen模块生成围绕活性位点的球状集合(Spheres),使用Grid模块生成Grid文件,该文件用于基于Grid的能量打分评价......阅读全文

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式-二

4、 准备受体分子与配体不同,受体分子通常是生物大分子,无法通过手绘准备。平台提供了其他输入方式。点击上传文件,选择刚才下载的4cb4.pdb文件,然后按提示进行下去。通常来说,从PDB库下载的晶体结构文件里边包含了很多组分,不仅有(单条或多条)肽链,通常还有有机小分子和溶剂分子(水分子、金属离子)

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式-二

6、 提交计算任务Dock6方案为我们提供了多种对接计算模式,这里稍微解释一下。在各种模式中,蛋白受体都是刚性不动的。因为Dock6的Grid算法实际上并非直接采用蛋白结构进行对接,而是采用其模型(正是前面生成的格点)。根据配体运动的方式,分为下面几种情况:1) 柔性配体对接,即配体在对接过程中是柔

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式--一

【前言】从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数

前沿金融科技与场景需求在京对接

2024中关村论坛系列活动——“向新而行”2024场景赋能新质生产力系列活动“金融科技”领域供需对接会近日在西城区举办,为企业找市场、找合作、找资金、找场景,推动前沿科技赋能金融发展。我国企业数量庞大,融资与贷款需求也巨大。金融机构针对科技企业的贷前尽职调查需要大量的工作投入,不但需要专业的金融领域

我国首次实现月球轨道交会对接

  北京时间12月6日5时42分,嫦娥五号上升器成功与轨道器和返回器组合体交会对接,并于6时12分将样品容器安全转移至返回器中。这是我国首次实现月球轨道交会对接。 从上升器进入环月飞行轨道开始,通过远程导引和近程自主控制,轨道器和返回器组合体逐步靠近上升器,以抱爪的方式捕获上升器,完成交会对接。

吉林:化工新材料项目“产学研金”对接

  12月15日,吉林省化工新材料主题项目对接会在吉林省科技大市场举行。吉林省政府此前拿出19.2亿元的产业发展基金,与国内知名基金公司合作,基金规模可达到150亿元左右。对接成功的企业,既可以寻求银行贷款,亦可找基金公司进行股权投入、风险投资。   对接会上有53个可转化的科技成果,主要是高性能高

沈阳分院与鞍钢集团开展技术对接

  8月1日,在辽宁省科技厅组织下,中国科学院沈阳分院、金属研究所、沈阳自动化研究所等单位院士、专家团队赴鞍钢集团公司开展定向科技成果发布和专题对接。中国工程院院士柯伟、沈阳分院副院长马越红、金属所副所长谭若兵等14位沈阳分院系统院士、专家参加了对接活动。来自鞍钢集团公司、鞍山钢铁公司、鞍钢矿业公司

创新券京津冀对接会召开

   为落实全国科技创新大会精神,推动京津冀协同创新发展,9月19日,由北京市科委牵头的创新券京津冀对接会召开。   此次会议讨论了建立共同支持互相衔接的创新券合作机制,科技部资源配置与管理司、财政部相关负责人、北京市科委、天津市科委、河北省科技厅相关负责人与工作人员出席,并就构建合作机制、明确重点

镇江50家高校院所对接科技合作

  近日江苏镇江举办科技合作对接会,推进与宁镇扬三地近50家高校院所的科技合作。会上,镇江市政府与江苏大学、江苏科技大学、南京师范大学、南京工业大学、南京邮电大学、扬州大学6家高校签订全面合作协议,新一代新能源汽车电控系统关键技术开发”等36个科技合作项目集中签约。   “十二五”期间,镇江市加快企

京津冀产业协同发展对接加速

  随着京津冀协同发展战略的不断深入,北京、天津、河北三地如何实现产业协同发展更加备受瞩目。8月19日,京津冀协同发展国家(玉田)农业园区招商推介会在北京举行。包括洛娃科技实业集团、北京首农物流有限公司、庆丰包子等10家农业产业化龙头和中华老字号企业与当地政府签订了投资或战略合作协议,总投资25.6

2020郑州工博会线下供求对接信息展示墙

2020郑州工博会线下供求对接信息展示墙 活动背景:随着中部崛起、一带一路政策、东部产业转移等的强劲实施,河南以其较强的工业基础、较全的产业链体系,促使工业领域市场占有比重越来越高,且政府对企业智能化改造力度的加大,使企业对各类工业设备的需求不断升级,加之外部环境正面领重大变化,全球制造业供应链体系

世界最大跨度铁路转体连续梁成功对接

  8月19日凌晨3:20,由铁道部第三勘察设计院设计、中铁十二局集团承建的京石铁路客运专线滹沱河特大桥分别平行于京广铁路两侧的单体主跨128米、转体重量12000吨预应力混凝土连续梁,通过千斤顶的连续牵引,相向转过25度和18度之后在京广铁路上空成功对接,标志着我国高速铁路桥梁施工技术取

“神九”有望有人对接“天宫一号”

  据中国军网8月6日消息,执行天宫一号飞行任务的各大系统参试人员和飞行产品此前已集结酒泉发射场,目前各项准备工作进展顺利。   据了解,长征二号F运载火箭运抵酒泉卫星发射中心,与“天宫一号”会合。据中国载人航天工程网消息,酒泉卫星发射中心已对载人航天发射场设施设备进行全面检修检测和质量评审,完成

青岛市全面开展产学研对接专项行动

  为贯彻落实新旧动能转换重大工程总体部署,深化产学研结合,实现科技成果供给与企业需求精准对接,加快科技成果本地转化,青岛市首次组织全要素、广渠道、多形式的产学研对接专项行动,5月份,召开了新闻发布会和动员部署会,在全市迅速掀起开展产学研对接活动的热潮。   开展产学研对接是促进高校院所科技成果走出

美载人绕月任务飞船完成与火箭对接

  美国航天局代理局长肖恩·达菲24日表示,执行“阿耳忒弥斯2号”载人绕月飞行任务的“猎户座”飞船已与美国新一代登月火箭“太空发射系统”完成对接,为执行载人任务做好准备。  达菲当天在社交媒体平台X上发文称,代号为“诚信号”(Integrity)的“猎户座”飞船与“太空发射系统”完成对接,标志着“阿

海西研究院项目专场对接会举办

  为了充分发挥中科院在福建省科技成果转化的重要窗口作用,为福建省光电产业的健康快速发展提供科技支撑,福建省光电行业协会于7月18日举办了中科院海西研究院项目专场对接会。福建省光电行业协会会长邓电明,海西研究院建设工作组常务副组长、中科院福建物质结构研究所副所长、省光电行业协会常务副会长兰国政以及福

深圳空气质量对接国际标准

   在空气质量率先全面达到国家标准的基础上,广东省深圳市又把空气质量目标对准了国际高标准。  深圳市人居委近日在其组织召开的大气治理专题研讨会上提出,至2020年,空气质量优良天数比例达到98%以上,力争大气各项污染物浓度全面达到世界卫生组织空气质量准则的第二阶段过渡目标值(PM2.5浓度达到25

高端芯片领域技术创新对接会举行

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519629.shtm高端芯片是人工智能等产业高质量发展的重要硬件基础,成都高端芯片产业如何加快发展形成新质生产力?围绕这一问题,3月22日,由成都市科学技术局、成都高新区科创局主办的高端芯片领域技术创新对

中青报:高校志愿服务亟需与公益项目对接

  “我们学校不缺有公益心的志愿者,但是特别缺乏好的公益项目。”在11月16日举办的北京高校志愿服务社团联谊活动上,来自北京科技大学青年志愿者协会的陈伟杰说。   北京高校志愿服务社团联谊活动由中国青年报社主办,中青公益、海巢HOT社区青年汇承办。北京航空航天大学、北京科技大学、中国传媒大学、北京

中科院产学研合作对接会举行

  日前,由中科院、浙江省科技厅、地方政府共同主办的产学研合作专场对接会先后分别在湖州、绍兴两地举行。   中科院与浙江省有着良好的合作传统,2009年院省签定新一轮的合作协议,双方的合作进一步加强和深化,在院省双方领导的高度重视下,院省合作关系更加紧密,合作成果丰硕喜人。目前,

京津冀多项科技成果-互动对接

  6月7日,在北京市科委和中国科学院北京分院的支持下,北京科学技术开发交流中心成功主办“京津冀科技成果转化高峰论坛”。京津冀三地科技企业、中科院在京科研院所、高校、金融投资机构以及国内外科技成果转化机构100余家单位、200余人到场参加。  本次论坛开设了“京津冀项目推介、路演和成果对接”以及“农

青岛市全面开展产学研对接专项行动

  为贯彻落实新旧动能转换重大工程总体部署,深化产学研结合,实现科技成果供给与企业需求精准对接,加快科技成果本地转化,青岛市首次组织全要素、广渠道、多形式的产学研对接专项行动,5月份,召开了新闻发布会和动员部署会,在全市迅速掀起开展产学研对接活动的热潮。   开展产学研对接是促进高校院所科技成果走出

2010年水博览会参展企业对接会

  为更好的为参展企业服务, 2010中国水博览会将组织供需双方对接活动。预报名的专业观众,将成为VIP观众。VIP观众可免费参加所有对接活动,并可获得到一份精美礼品。  对接会安排:  一、水务投资运营企业与供应商见面会  会议时间:2010年11月18日上午9:50―11:30  会议

首届粮食科技成果转化对接推介活动举行

  今天,由国家粮食局与中国科学技术协会联合主办,湖北省粮食局和武汉轻工大学承办的“第十一届粮食科技活动周——首届粮食科技成果转化对接推介活动”在武汉举行。活动主题是“加快粮食科技成果转化,促进粮食产业经济发展”。  据悉,此前,国家粮食局在全国广泛征集了企业难题和技术需求,可面向粮食企业提供转化的

京津冀技术成果交流对接会举行

   “基于吸收式换热的热电联产集中供热技术”能够从根本上取缔供暖燃煤锅炉、“低温空气源热泵系统”可以冬季供暖夏季供水”——日前,96项来自京津冀的高新技术汇聚天津,在“2016年京津冀技术成果交流对接会(天津站)”上亮相。  为推动京津冀协同创新共同体建设,促进三地产业技术联合创新,搭建产学研交流

新型金属材料研发与产业对接报告

  理财周报材料科学实验室主要关注新型金属材料,包括特种金属材料和高端金属材料。  “金属”会使人条件反射地联想到金光闪闪的“金子”,总是会招人喜欢的,更甚是具备某种特种功能的金属,资本市场也从来不缺乏对于金属的关注度。  而理财周报材料科学实验室主要关注新型金属材料,包括特种金属材料和高端金属材料

天宫与神九手控交会对接成功

  神舟九号航天员6月24日驾驶飞船与天宫一号目标飞行器顺利对接,我国首次空间手控交会对接试验成功。  这一操作是由43岁的航天员刘旺实施的。12时许,他通过手柄控制飞船的姿态、速度和方向,使神舟九号从140米外向天宫一号缓缓接近,最终成功捕获天宫一号。  24日早上刚刚分开的神舟九号与天

俄货运飞船与空间站成功对接

  俄罗斯地面飞行控制中心4日发布消息说,日前与国际空间站对接失败的俄“进步M-06M”货运飞船当天晚间与空间站成功实现对接,飞船为国际空间站送去多种给养及设备。   该中心发言人伦金介绍说,莫斯科时间4日20时17分(北京时间5日零时17分),“进步M-06M”货运飞船与国际空间

燕山大学举办对接京津高校合作发展大会

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/513980.shtm12月10日,燕山大学与北京高科大学联盟共同举办的“燕山大学对接京津高校合作发展大会”在河北省秦皇岛市举行。   ?会议现场  燕山大学供图据悉,本次大会是京津冀高校为认真学

东盟杰青网络对接系统呈现三大亮点

  广西紧扣深化“一带一路”科技创新行动计划—科技人文交流这一主线,率先启动“东盟杰出青年科学家来华入桂工作计划”(以下简称“东盟杰青计划”),截至2019年8月底,已有52名杰青来到广西,开展科研课题55个,形成了科研成果50个。“东盟杰青计划”是目前唯一一个由地方发起的面向东盟的青年创新人才专项