m6ARNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)
接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks取交集后,发现共有将近30%的peak(图5 g),IGV结果表明:YTHDF1的m6A位点与突触形成关键蛋白(如Gira1,Grin1和Camk2a等)的m6A位点相近,二者可能通过m6A位点结合,调控蛋白的合成(图5 h)。5. 首次绘制电休克小鼠的m6A RNA甲基化谱最后,作者建立了电休克小鼠模型,对海马体的齿状回结构的组织进行m6A RNA甲基化测序和转录组测序联合,快速找到许多既发生m6A 甲基化表达量又发生巨大变化的基因,以供后续研究。总结:本篇文章表明小鼠海马体中m6A RNA甲基化能够调控......阅读全文
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)
接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(一)
目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。文章导读:2018年10月31日,美国芝加哥大学何川团队,上海科技大学
Nature-|-m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成
目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。 文章导读: 2018年10月31日,美国芝加哥大学何
m6A修饰的长链非编码RNA调控神经元的发育及机制
近日,Cell Reports在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)鲍岚研究组的最新研究进展(m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF
2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰
2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点
19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
科学家发现RNA甲基化识别蛋白YTHDF1的重要功能
10月25日,《自然-通讯》(Nature Communications)以YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression 为题,在线发表了中国科学院昆明动物研究所陈勇彬学科组的最新研究成果。该
m6A文章盘点(一)
19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响(二)
为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用,作者对过表YTHDF1的A2780细胞,进行了eCLIP-seq,并鉴定了2,343个目标转录物,这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集,产生175个基因,将其确定
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,例如癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等。2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子的辉煌。2020年1月何川教授团队再次带领m6A登上顶级期刊Science,预示着m6A等RNA修饰
RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表观遗传研究热点(二)
那么如何检测RNA的甲基化水平呢?Epigentek推出市场上唯一一款RNA甲基化定量检测试剂盒:·EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(比色法)是一组优化的、完整的的试剂组合,可以通过比色的方法定量RNA中N6-甲基腺嘌呤(m6A)。它可以直
广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展
9月8日,中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研
Nature文献解读mRNAm6A甲基化调控对学习记忆功能机制的...
Nature文献解读-mRNAm6A甲基化调控对学习记忆功能机制的影响学习和记忆是大脑的基本功能,长时记忆的形成被认为需要神经元活动诱导下的蛋白质合成。以往的研究表明,m6A参与调节神经功能,包括小鼠中脑多巴胺能信号传导、飞虫飞行行为、成年小鼠神经生成和轴突再生。在大脑发育、行为体验和记忆形成过程中
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育
文章导读: 胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)
那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢? 首先,提取病毒RNA 无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...2
4. LCs中的睾酮合成受m6A mRNA修饰调控根据前期研究数据显示m6A修饰可以参与胚胎发育,那么是否也能够影响LCs发育呢?作者利用比色法检测整体甲基化水平(云序生物提供此服务),发现在LCs发育过程中m6A整体水平逐渐下降,同时ALKBH5(Eraser)和FTO(Eraser)表达逐渐增加
m6A文章盘点(二)
是不是甲基化一定发生在mRNA的3’UTR区域才能有重要作用呢?在这篇Nature Communication文章当中的故事则有所不同。上皮间质转换(epithelial-mesenchymal transition)是癌细胞转移的重要步骤,在这一过程当中发现mRNA的m6A水平会有所升高,
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观遗传研究热点:RNA-甲基化(m6A)研究
随着表观遗传学研究的不断深入,组蛋白修饰(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中,遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
一文了解甲基化研究领域新进展!
本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展,分享给大家!图片来源:Vossman/ Wikipedia 【1】Nature:母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生 doi:10.1038/s41586-019-1536-1 发育通常被认为是在
RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R
m6A“RNA甲基化”研究汇总—癌症篇
一个月发表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小编先来介绍一下m6A RNA甲基化。m6A是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学
m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化研究
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B