质谱法进行高通量蛋白鉴定的主要方法

蛋白质组(Proteome)指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定,可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析(如Edman降解法)费时费力、通量低,存在不容易实现规模化和自动化,结果灵敏度差等问题。当前主流的基于软电离技术的液相色谱-质谱系统(LC-MS/MS)是实现高通量蛋白鉴定的主要方法。其基本原理是:首先将纯化后的蛋白质用消化酶(如胰酶)水解成肽段,肽段混合物经过除盐后首先进入液相色谱,实现初步分离,以降低样品复杂度。经液相色谱分离后的肽段先经过质谱的第一级--离子源(ESI,MALDI)使肽段离子化并形成分散的离子。接着选择部分强度较高的肽段母离子进入质谱的第二级系统(碎裂源)做进一步碎裂,使肽段离子被打碎成更小的、有规律的碎片离子。理论上蛋白质序列经过酶解后形成肽段,肽段再经过......阅读全文

四种蛋白鉴定分析方法

传统的蛋白鉴定方法,色谱柱如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达 通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。   目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技

蛋白鉴定方法之图象分析技术

  “满天星”式的2-DE图谱分析不能依靠本能的直觉,每一个图象上斑点的上调、下调及出现、消失,都可能在生理和病理状态下产生,必须依靠计算机为基础的数据处理,进行定量分析。 在一系列高质量的2-DE凝胶产生(低背景染色,高度的重复性)的前提下,图象分析包括斑点检测、背景消减、斑点配比和数据库构建。

蛋白鉴定方法之质谱相关技术

  质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞

四种蛋白鉴定分析方法

传统的蛋白鉴定方法,色谱柱如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。 目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。1  图

为什么要进行STR鉴定?

据统计,约18%~30%细胞系被交叉污染或错误辨识,使用该细胞可能导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果等。2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者对细胞进行STR鉴定并着手建立细胞STR数据库。如今,细胞STR鉴定已是鉴别细胞身份及交叉污染的金标准。多数权威期刊也要求作者投稿时提供

怎么对提取质粒进行鉴定

首先跑一个琼脂糖凝胶电泳,观察一下带型和大小是否符合,然后根据质粒所含有的酶切位点,选择合适的限制性内切酶进行单酶切或双酶切,观察酶切后的条带数和大小是否与理论一致。

蛋白质纯化的主要方法

(1) 根据分子大小不同的分离方法:透析和超过滤(利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质);密度梯度离心(蛋白质在介质中离心时质量和密度较大的颗粒沉降较快);凝胶过滤(一种柱层析)(2) 利用溶解度差别分离:(等电点沉淀法)由于蛋白质分子在等电点时净电荷为零,减少了分子间静电斥力,因而容易聚集沉淀,此时

蛋白质纯化的主要方法

(1) 根据分子大小不同的分离方法:透析和超过滤(利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质);密度梯度离心(蛋白质在介质中离心时质量和密度较大的颗粒沉降较快);凝胶过滤(一种柱层析)(2) 利用溶解度差别分离:(等电点沉淀法)由于蛋白质分子在等电点时净电荷为零,减少了分子间静电斥力,因而容易聚集沉淀,此时

独特高通量方法改进新蛋白结构设计

根据发表在《美国国家科学院院刊》上的一项研究,美国西北大学医学研究人员使用独特的高通量方法,解决了具有挑战性的蛋白质设计难题。这种方法可促进新疗法和生物技术工具的开发。 研究的资深作者、西北大学药理学助理教授加布里尔·罗克林博士称,设计ɑββɑ蛋白质的经验教训对于任何计算蛋白

方案5-交联法和质谱法对蛋白质复合体进行拓扑学分析

实验材料纯化的蛋白质复合体试剂、试剂盒缓冲液交联试剂二甲基亚砜(DMSO)4 X SDS 上样缓冲液终止溶液仪器、耗材Bio-Spin 柱可鉴定蛋白质的质谱仪可根据蛋白质序列计算肽链的软件包超滤装置实验步骤一、交联反应条件的优化不同方法得到的同种蛋白质复合体的质量与纯度不同,因此建议进行各种实验来摸

如何用FFPE组织样品进行高通量检测?

福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的样品代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,如何从这些样品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技术有限公司针对FFPE样品的高通量分析,建立了整套的SOP 标准解决方案,帮助广

如何用FFPE组织样品进行高通量检测?

  福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded,FFPE)的样品代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料,如何从这些样品中挖掘出有效的信息呢?上海伯豪生物技术有限公司针对FFPE样品的高通量分析,建立了整套的SOP 标准解决方案,帮助广大科

《自然》:蛋白高通量定量技术

  来自美国德州大学西南医学中心的Rama Ranganathan和他的同事研发了一种能全面分析单基因突变的高通量定量技术,这对于理解蛋白结构,以及蛋白工程应用具有重要意义。相关成果公布在Nature杂志上。   生物学的一个基本原则就是蛋白的氨基酸序列能特异性构成相应的三维结构,并行使生物化

蛋白质纯化-主要方法

(1) 根据分子大小不同的分离方法:透析和超过滤(利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质);密度梯度离心(蛋白质在介质中离心时质量和密度较大的颗粒沉降较快);凝胶过滤(一种柱层析)(2) 利用溶解度差别分离:等电点沉淀法(由于蛋白质分子在等电点时净电荷为零,减少了分子间静电斥力,因而容易聚集沉淀,此时溶

ABO血型鉴定的鉴定方法

  生理盐水凝集法  ①玻片法:操作简单,适于大量标本检查,但反应时间长;被检查者如血清抗体效价低,则不易引起红细胞凝集,因此,不适于反向定型。  ②试管法:由于离心作用可加速凝集反应,故反应时间短,而且,借助于离心力可以使红细胞接触紧密,促进凝集作用,适于急诊检查。  红细胞亚型抗原性弱,如抗A抗

AB-Sciex视频讲座“QTRAP系统进行代谢物鉴定方法”

  3月24日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“在药物发现和开发阶段代谢物鉴定的高级解决方案”的网络视频讲座。AB Sciex 的资深应用专家张克荣老师简单介绍了代谢物鉴定的应用和仪器概述,随后重点讲解用QTRAP®系统进行代谢物鉴定的方法。   代谢物鉴定的应用和仪器概述

大豆高蛋白主要控制基因的鉴定和分析获新进展

6月1日,一支国际联合团队在大豆高蛋白主要控制基因的鉴定和分析取得新进展,相关研究成果发表于《自然·通讯》(Nature Communications)。中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员张恒友为论文共同第一作者。 联合团队的研究利用经典连锁QTL分析结合基因组测序数据联合分析,鉴定到位于

利用化学方法对胶原蛋白进行改性

  化学方法比物理方法改性交联度高,且能获得均匀一致的交联,对调节、控制胶原的各性质均有效。已广泛应用于各种化学试剂交联胶原,以提高其交联度、力学性能及生物相容性。化学改性法具体又可分为使用化学试剂交联、侧链的修饰、生理活性物的固定化三种方法。  化学试剂交联法中常用的化学交联剂有戊二醛、己异二氰酸

相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(LacZ的活性分析)

实验方法原理捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为一种稳定蛋

高通量组织研磨器的-主要特点

1、研磨器具有自锁装置可以防止适配器在粉碎过程中松开脱落;  2、当需要低温研磨环境,可将放有样本的适配器浸入液氮中冷却1-2分钟,取出后移至主机快速固定即可开始研磨,不需要进行再次冷冻处理,节省液氮。  3、不易导致交叉污染,使用封闭式一次性离心管;  4、高重复性,同一组织样本设定相同程序,获得

凯氏定氮法进行蛋白质分析的主要步骤

操作方法  1、 样品处理:精密称取0.2-2.0g固体样品或2-5g半固体样品或吸取10-20ml液体样品(约相当氮30-40mg),移入干燥的100ml或500ml定氮瓶中,加入0.2g硫酸铜,6g硫酸钾及20毫升硫酸,稍摇匀后于瓶口放一小漏斗,将瓶以45度角斜支于有小孔的石棉网上,小火加热,待

Rh系统血型鉴定如何进行?

红细胞Rh表型可用特殊的具有抗D、C、c、E和e抗血清检测来鉴定。虽然Rh血型系统中有许多种抗原,但常规只用抗D血清检查有无D抗原。1.低离子强度盐水试验:可提高抗D抗体与D阳性红细胞结合率,并提高其灵敏度。2.酶介质法:木瓜酶或菠萝蛋白酶可以破坏红细胞表面的唾液酸,使红细胞膜失去电荷,缩小红细胞间

Rh系统血型鉴定如何进行

  红细胞Rh表型可用特殊的具有抗D、C、c、E和e抗血清检测来鉴定。虽然Rh血型系统中有许多种抗原,但常规只用抗D血清检查有无D抗原。  1.低离子强度盐水试验:可提高抗D抗体与D阳性红细胞结合率,并提高其灵敏度。  2.酶介质法:木瓜酶或菠萝蛋白酶可以破坏红细胞表面的唾液酸,使红细胞膜失去电荷,

痕量分析方法质谱法介绍

  利用射频火花离子源双聚焦质谱计测定高纯度材料中痕量杂质,其优点是:灵敏度高,测定下限达μg至ng级,一次可分析70多个元素。如有标样,可进行高纯金属和半导体定量分析、粉末样品或氧化物(制成电极后需镀导电高纯银膜)的分析;如无标样,采用加入内标元素的方法也可进行定量分析。若粉末样品或溶液样品的分析

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝 G-250

利用纳升级液相色谱--串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料 修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒 消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材 多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤 3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料:修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒:消化缓冲液                                                                  萃取液                                                          

质谱法的的方法特点及应用目的

质谱法(Mass Spectrometry,MS)即用电场和磁场将运动的离子(带电荷的原子、分子或分子碎片,有分子离子、同位素离子、碎片离子、重排离子、多电荷离子、亚稳离子、负离子和离子-分子相互作用产生的离子)按它们的质荷比分离后进行检测的方法。测出离子准确质量即可确定离子的化合物组成。这是由于核

蛋白质组学技术的功能介绍

“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是

蛋白质组学技术的功能介绍

  “读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。    自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大