应用OrbitrapFusion对TMT标记样本进行MS2定量方法...(一)

应用Orbitrap Fusion对TMT标记样本进行MS2定量方法以及SPS MS3定量方法的比较1. 前言目前,蛋白质组学研究已经由传统的大规模鉴定逐步转向了靶向蛋白质组学,研究内容已经由蛋白质鉴定扩展到了蛋白质相对和绝对定量,蛋白质相对定量方法中应用最普遍的为标记定量,包括:ICAT,DIART,ICPL,TMT,iTRAQ 等等,其中又以TMT 以及iTRAQ 的应用最为广泛。 传统的TMT 以及iTRAQ 标记实验均使用MS2 碎片报告离子来进行定量,但是Steven P Gygi 等人发现该方法由于母离子筛选过程易受到基质干扰,因而定量结果与真实值相比偏低,而使用MS3 碎片报告离子来进行定量,则可以很好的解决这一问题,该方法的基本原理为:母离子碎裂产生的MS2 子离子用于定性,同时挑选碎片离子中强度最高的一个或者多个碎片离子,使用HCD 进行进一步的碎裂,产生的报告离子用于定量,虽然质......阅读全文

对物质进行定量定性分析的仪器

除了你上面提到的这些,还有X荧光光谱仪,X荧光光谱仪主要是用来进行元素分析的仪器,由于快速、无损等优点,被广泛应用在地质采矿、金属合金分析、水泥、考古、环境土壤、航空航天,他的检测原理是通过X射线对物质进行透射产生X射线荧光光谱而进行分析,不需要任何的化学试剂,属于物理检测,目前能量色散型X荧光光谱

赛默飞ASMS发布两款Orbitrap系列液质-一款小巧一款“高大上”

  分析测试百科网讯 6月2-6日,全球质谱界盛会—第67届美国质谱年会(67th ASMS,以下简称ASMS)在美国亚特兰大盛大举行。会议期间,赛默飞发布了两款Orbitrap系列新液质,并举办了媒体发布会和Thermo Fisher Happy Night!媒体发布会现场  赛默飞在本届ASMS

20242025年液质联用新品-多级串联多种碎裂-操控离子随心所欲(上篇)

  掌控质谱奥秘的关键两大要素,一是离子源,产生气态离子使其飞进质谱;二是分析器,操控离子产生各种分离。离子源在前几年的创新达到井喷,还有继续的创新不断涌现;质量分析器产生串联后,又可产生不同的碎裂方式。质谱、尤其是高分辨液质联用近两年主要的创新趋势就是:多级串联多种碎裂,让科学家可以随心所欲地操控

TSQ-Quantum-Discovery对微量氯霉素进行定量分析的方法

氯霉素因其价廉高效,并且同时对格兰氏阳性菌和阴性菌具杀伤性而成为一种很受欢迎的抗生素。但氯霉素本身有一个严重的缺点,就是可仪器人类致命性的再生性障碍贫血。 最近,政府机构在检测食物样品,尤其在检测来源于部分东亚地区的海洋视频和蜜蜂时,发现有相当水平含量的氯霉素存在。 这就需要我们建立一种新的分析

注重实践经验!Urimarker-2020线上会前培训率先登场

  分析测试百科网讯 2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学

赛默飞液相色谱和质谱新产品介绍

  液相色谱和质谱   探索新的产品,旨在改善性能并提高色谱实验室的工作效率。如果您正在从事医药,临床研究,法医毒理学,环境检测,身处各类科学研究实验室,正在使用HPLC和LC/MS,请关注我们的相关活动。UHPLC能够提供更快的运行、更高的分离度以及更低的运行成本,

赛默飞Orbitrap-Exploris-480-高分辨质谱仪申报ANTOP奖

  洒下的汗水是青春,埋下的种子叫理想。守在悉心耕耘的“大地”,用创新留下丰碑,静待收获的时节。2019 ANTOP奖正方兴未艾,多家科学仪器企业竞相参与申报,这里将为您介绍ANTOP奖项“打榜”产品。  赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪开始申报ANTOP奖!  Orb

环渤海色质谱学者精彩报告纷呈-贯彻“绿色化学”理念

  分析测试百科网讯 2016年8月11日,由辽宁省分析测试协会,辽宁省分析科学研究院主办的“第四届环渤海色质谱学术报告会暨辽宁省第十届学术年会分会”在丹东召开(相关报道:第四届环渤海色谱质谱学术会在丹东开幕 首次发布徽标)。大会上,众位环渤海的

赛默飞推出可定制的软件和基于云的解决方案

  分析测试百科网讯 2017年6月5日,在ASMS2017上,赛默飞发布了新型软件和基于云的解决方案,帮助生命科学研究人员从其代谢组学和蛋白质组学数据中获得更多信息,从而提高生产力。  赛默飞色谱和质谱部生命科学质谱软件平台管理高级总监Mark Sanders说:“我们致力于不断开发完整和动态的工

qPCR-和-Crystal-dPCR-进行复杂生物样本DNA/RNA绝对定量的比较

复杂生物样本(含PCR抑制剂)中DNA/RNA绝对定量的解决方案: Crystal dPCR更耐受抑制剂dPCR和qPCR(Real-time PCR)技术定量检测DNA/RNA时抑制剂的影响对比众所周知,数以千种的化学物质会抑制PCR反应有作用,而生物样本往往都会含有类似的化合物,在DNA/RNA

应用非标记探针法进行基因分型(五)

用相似的方法分析外显子11(表3;补充图2;补充表3;http://jmd.amjpathol.org),且所有外显子11的RET序列变化用扩增子高分辨率熔解分析进行检测(没有显示数据)。外显子11的主要实验用一个在致病密码子630和634上的野生型探针。检测的外显子11的8个序列变化均有一个等位基

应用非标记探针法进行基因分型(四)

外显子10和11:多重突变热点MEN2A和FMTC的主要突变位于外显子10(密码子609、611、618和620)和11(密码子630和634),且野生型半胱氨酸的密码子DNA序列“TGC”发生单核苷酸改变。外显子10和11报道的序列变化>40(表1)。RET10外显子的主要实验包括两个单独的实验和

应用非标记探针法进行基因分型(二)

材料和方法样品      此报道中用到的野生型RET基因的DNA基因组样品或有RET序列变化的样品在以前描述过。RET基因序列变化改变RET蛋白的功能引发MEN2综合症的是突变,然而RET序列改变不会引发MEN2综合症是多态。不能确定意义的稀有的或不会引起MEN2综合症的RET基因序列变化成为“序列

应用非标记探针法进行基因分型(七)

一般来说,用特定突变探针产生1/3结果。首先,当突变序列与特定突变探针互补时,突变等位基因的熔解Tm要高于野生型(△Tm为-2℃至-5℃)。第二,当突变在相同位置但是与特定突变探针序列不互补时,突变等位基因被野生型等位基因相似的Tm值及稳定性所遮蔽(野生型等位基因Tm±0.5℃)。在这种情况下,没有

应用非标记探针法进行基因分型(三)

高分辨率熔解 在高分辨率熔解仪器HR-1(爱荷华科技,盐湖城,犹他州)上进行分析,将LightCycle毛细管加入HR-1中,0.3℃/s加热。主要的实验中,RET外显子的扩增及非标记探针熔解数据从60℃到95℃采集。主要实验分析了每个外显子的扩增子及探针数据,除了外显子14。因为所有报道的外显子1

应用非标记探针法进行基因分型(六)

外显子14:多重探针分析       主要实验的外显子14, 两个野生型的探针同时用于一个反应,用来检测所有已报道的外显子14的突变,同时消除密码子836(p.S836S)多态性(图4;a和b;表3;补充表5;http://jmd.amjpathol.org)。WT14A探针在65℃-76℃

Orbitrap技术发明人Makarov做客上海药物所

  2013年9月16日,赛默飞世尔科技Orbitrap技术发明人Alexander A. Makarov来到中国科学院上海药物所,为到场的专家、学生等带来一场精彩的报告《Orbitrap前沿》。报告现场报告现场Alexander A. Makarov  orbitra

“QExactive-蛋白质组学研究综合平台”视频讲座进行中......

  本次讲座主要介绍Q-Exactive高性能台式四极杆—轨道阱系统的基本组成以及其特点,着重讲解了Q-Exactive在蛋白质组学应用的优势。   点击参加:http://www.antpedia.com/ant_video/thermo/thermo9-10/page2.h

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

去芜存菁,让您的分析更精准|-2018ASMS赛默飞再推新品

  2018年6月3-7日,全球质谱界的盛会-美国质谱年会( 66th ASMS,以下简称ASMS)在美国加利福尼亚州圣地亚哥会议中心San Diego Convention Center举行。  在这新旧技术碰撞、创新思想交流,传承与发展并序的全球质谱工作者的盛宴上,赛默飞世尔科技在世界知名的质谱

赛默飞世尔科技在ASMS-2025推出多组学、生物制药与环境工作流流程前沿解决方案

2025年6月2日,美国马萨诸塞州沃尔瑟姆—— 为助力客户推进科学发现,赛默飞世尔科技今日在马里兰州巴尔的摩举行的美国质谱学会(ASMS)质谱及相关主题年会上,重磅发布一系列前沿解决方案。这些新一代的仪器与软件产品标志着分析性能的范式变革,旨在揭示复杂生物过程与对疾病机制的关键洞见,全面革新多组学、

标记获救法进行基因定位的方法介绍

这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别转化受体细

标记获救法进行基因定位的方法介绍

每一种转导噬菌体有一定的大小,只能携带一定长度的供体细菌的 DNA。例如大肠杆菌噬菌体PI的头部中只能包装大约分子量为5.8×10的DNA,大肠杆菌的染色体DNA的分子量是2.5×10,所以PI所能包装的 DNA至多相当于大肠杆菌的遗传学图上相距两分钟这样一段DNA分子。如果两个基因能同时被转导,这

Fusion-and-Cloning

Author: Nanci DonackiSource: Contributed by Nanci DonackiAbstract: Procedure for establishing hybridoma in one stepReagents(StemCell Technologies, Inc

Fusion-and-Cloning

ReagentsMedium A - Pre-fusion Medium and Hybridoma Expansion MediumMedium B - Fusion Medium Medium C - Hybridoma Recovery MediumMedium D - Hybridoma S

应用LIBS技术对砂岩型铀矿进行元素分布测量......(一)

应用LIBS技术对砂岩型铀矿进行元素分布测量(Mapping)和伴生分析矿物岩石的研究中,传统的地学分析仪器对于贫矿石元素检测较为困难:例如光学显微镜、电子探针、电子扫描显微镜、LIF或XRF技术等。主要原因是矿物中的金属相较小(μm),或者其中的胶态组分中元素难以检测,或者二者兼有;并且要经过相当

iTRAQ技术常见问题与答疑

1、什么是iTRAQ?    iTRAQ技术,即同位素相对标记与绝对定量技术。该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究,具有较好的定量效果、较高的重复性。由于其能够同时对多达8种样品进行标记分析,故在生命科学的各个领域得到了广泛的应用。2、iTRAQ的原理是什么?   

赛默飞在ASMS-2017推出一系列创新质谱产品

   分析测试百科网讯 第65届美国质谱年会 (ASMS 2017) 上,赛默飞世尔科技有限公司(NYSE:TMO)推出了一系列新技术,推动尖端研究,改进应用市场。   分析仪器高级副总裁兼总裁Dan Shine表示:“在ASMS期间,客户将了解我们的新型质谱技术将如何推动生物研究、转化医学、食品和

Orbitrap-Exploris-480:丰富的定量流程介绍(二)

平行反应监控(Parallel Reaction Monitoring, PRM)是Orbitrap系列仪器上的高分辨靶向定量方法,类似于三重四极杆质谱上的选择反应监控(Selected Reaction Monitoring, SRM),其是进行潜在标志物验证的金标准方法之一。 但是PRM

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(三)

由上图可以看到,ETD 碎裂产生的肽段 P1 和 P2 在后续的三级 CID 碎裂中,产生大量的 b、y 碎片离子,可以有效的确定肽段 P1 和 P2 的组成,并且结合 ETD 的信息,从而确定肽段 P1 和 P2 之间通过二硫键被连接在一起。 3.2 以肽段 P1:CSPGQHAK -肽段 P2: