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NGS序列捕获大比拼

在二代测序(NGS)过程中,构建基因文库和目的序列捕获富集是制约测序进程的瓶颈。上期我们介绍了针对于建库工作的自动化解决方案,这里我们针对靶序列捕获富集,提供自动化解决方案。空白近几年来,第二代测序逐渐向提高通量和降低费用的方向发展。为了节省分析时间,找到经济合算的方法,罗氏诊断开发了SeqCapEZ捕获试剂盒,允许用户富集所感兴趣的区域或者全外显子组。但是二代测序是一项非常耗时耗力的工作,常常要耗费专业的技术人员4天的工作时间来完成。而且测序过程中的一些重要的注意事项也要求技术人员在整个操作过程中要保持高度集中精力,比如捕获目标序列,加热试剂盒样品,孵育时间的控制等。空白受到这些限制,将序列捕获自动化就成为大多数实验室的需求。法国罗氏诊断公司与专业的自动化平台生产商派玛·迪格(PrimaDiag)公司合作,为罗氏NimbleGen外显子捕获测序产品提供自动化解决方案 — ACSIA NGScapture自动化捕获系统......阅读全文

美国FDA关于提交抗病毒药物二代测序数据要求概述

  2019年7月,美国食品药品监督管理局(FDA)发布了关于抗病毒药物产品提交二代测序数据的指南。指南为抗病毒药物产品向FDA提交二代核苷酸序列分析程序以及支持耐药性评估数据提供了意见。  一、背景信息  为保护公共卫生、避免出现可能传染他人并导致不能通过已批准药物产品控制疾病暴发的新型耐药和交叉

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

基因测序前景:上游市场增速放缓 中下游市场潜力巨大

  基因测序服务市场增速快,预计2016年超过测序仪器市场。据Markets&Markets预测,2014-2020年上游市场中测序仪的复合增长率是15.4%。中游测序服务市场重资产、技术附加值低,将是产业链中增速最快的,据BCC Research预测2011-2016年复合增长率为29%。

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 1

随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

NGS检测试剂生产应获得《医疗器械生产许可证》

  为加强第二代测序技术检测试剂的规范和指导,进一步保证和提高相关产品的质量,8月8日,中国食品药品检定研究院(中检院)组织制定了《第二代测序技术检测试剂质量评价通用技术指导原则》(下称《指导原则》)。  该文件是中检院发布的首个质量评价技术指导原则,旨在对产品设计、研发及验证的各关键环节进行规范,

基因检测:NGS在病原微生物检测中的应用

文章导读  感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。目前,全球感染性疾病的发病率有所上升,病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势。近年来快速发展的NGS技术因其不依赖于已知核酸序列,无需特殊探针设计,可直接对未知病原微生物进行检测,打破了传统微生物检验的局限性,在临床微生物领域展现了广阔的前景。

中检院发布二代测序试剂质量评价通用原则

  一.前言  本指导原则主要针对第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术检测试剂(以下简称“NGS检测试剂”)产品质量提出指导性要求,涉及基本原则、主要原材料、检测流程及性能评价等方面。  本指导原则是对企业和检验人员的指导性文件,但不包括注册审批所涉及的行政

安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能

安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能 GeneSpring 现可实现通路水平的多组学及新一代测序数据分析   2012 年 3 月 27 日,加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日发布了其广受欢迎的生物信息学软件的重要扩展版本

靶向序列捕获和新一代测序前对石蜡包埋组织及...(一)

靶向序列捕获和新一代测序前对石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行DNA质控靶向序列捕获和新一代测序前对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行 DNA 质量控制 作者Melissa Huang Liu安捷伦科技有限公司美国加利福尼亚州拉霍亚Maria Celeste Ramirez安捷伦科技有

细胞遗传学家的新工具和新希望

  细胞遗传学意在确定一个基因组中与众不同的结构特征。这说起来容易,做起来难。多年来,研究人员手头的工具很有限,只有吉姆萨染色、FISH和DNA芯片。新兴的DNA测序技术将细胞遗传学的分辨率提高到前所未有的水平,缩小了分子细胞遗传学和分子遗传学之间的距离。   然而,测序,想说爱你不容易。测序读长

新方法准确检测Lynch综合征相关突变

  贝勒医学院等机构的研究人员近日开发出一种更准确的方法,检测PMS2基因中的突变。这个基因的突变与遗传性非息肉结肠直肠癌(Lynch综合征)和Turcot综合征相关。研究结果在线发表于《the Journal of Molecular Diagnostics》上。  为了提高PMS2基因突变检测的

Illumina发布癌症研究的新产品

       Illumina继年初推出NextSeq 500和HiSeq X Ten测序系统之后,日前再次推出新产品,能从与癌症相关的血液和组织中发现基因组变异。这些新产品将充分利用该公司的新一代测序和芯片扫描系统,为基础和临床癌症研

胚胎植入前染色体筛查的新技术

  尽管体外受精(IVF)已经彻底改变了不孕不育的治疗,但这个过程本身不够高效,成功率很低。染色体非整倍体,是造成体外受精失败的主要原因,因为大多数非整倍体胚胎无法植入,或在孕早期流产。因此,提高成功率的关键,是选择染色体数目正常的胚胎。为此,人们开始采用胚胎植入前染色体筛查(PGS)。  他们最早

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

呼吸科什么是ngs检测

  做好相应技术和知识准备以后,就可以入行NGS检测了。  1、首先要解决的就是做什么的问题。  临床遗传疾病最常见的就是拷贝数变异(CNV)与点突变(SNV)。在以往,我们用Sanger测序检测SNV、用CMA做CNV检测。用Sanger方法测一个人的序列得好多年,好多好多万美金,NGS就便宜多了

斯坦福大学借助PacBio首次临床全基因组测序

  在Ricky Ramon 7岁时进行一次例行检查中,犹豫不决的儿科医生送他去拍一张胸部X光片,结果显示在他心脏左上腔里有一个良性肿瘤。对于Ramon来说,这是长达二十年的痛苦而漫长的就医史的开始——伴随他20年的,是没完没了的预约、诊断、和手术。  在此期间,非恶性肿瘤不断重新出现在Ramon的

专家经验谈:如何追踪癌症的生物学指标

  癌症的生物学指标可以帮助研究者们诊断疾病、预测治疗效果、选择合适的治疗方案、和跟踪疾病的进程。目前,癌症指标的检测大多在集中在染色体异常上,例如染色体倍增、染色体缺失和染色体重排。染色体异常能影响蛋白的表达和功能,进而引发肿瘤或者为细胞癌变创造条件。  随着基因组技术的发展,出现了许多检测癌症指

基因测序产业百家争鸣 测序仪器市场被欧美垄断

  基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场,中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等,医疗领域可分为医疗和非医疗两个领域。人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学(诊断筛查与治疗、靶向用药、伴

基因测序:上游三四代技术是趋势,下游样本积累是关键

  基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场,中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等,可分为医疗和非医疗两个领域。  医疗领域可分为人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学(诊断筛查与治疗、靶

测序仪:一台也许并不够

  如今,基因组测序的新闻已变得司空见惯,不像几年前,基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探,你也考虑购入一台。挑来选去,不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel告诉你,一台也许并不够。  新一代测序仪在上市之初,价格高昂,仅限“土豪

基因检测,一台测序仪并不够

  如今,基因组测序的新闻已变得司空见惯,不像几年前,基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探,你也考虑购入一台。挑来选去,不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel告诉你,一台也许并不够。  新一代测序仪在上市之初,价格高昂,仅限“土豪

“高通量、低成本”NGS市场规模超百亿

  近日,FDA批准了泛癌种靶向药拉罗替尼上市,意味着不管什么癌种,只要存在NTRK基因融合,就可以用这个药物治疗,这一消息在朋友圈刷屏。2018年,肿瘤靶向药物一再给我们惊喜,肝癌的仓伐替尼开售、K药在中国大陆上市等,肿瘤的精准医疗时代已经到来。而这均离不开对基因的突变或融合检测,本文将对不可或缺

WGS 鉴别复发性麻风病患者的复发源头

  自从1980年开始系统性的采用联合治疗 (MDT) 方法诊治麻风病以来,麻风病的患病率显著降低,但全世界每年仍有20万新发麻风病案例困扰人类。本研究采用NGS技术鉴别3例复发性麻风病的复发源头,区分是由于耐药菌株出现导致治疗失效,还是由于再次感染新菌株导致疾病发生,帮助临床医生评估诊疗效果以及采

安捷伦推出高灵敏度NGS 靶向序列捕获解决方案

安捷伦科技公司推出全新的高灵敏度 NGS 靶向序列捕获解决方案全新解决方案可简化工作流程并消除测序误差  2017年7月19日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所: A)今日宣布推出最新的新一代测序 (NGS) 文库制备解决方案 Agilent SureSelectXT HS,这是一款完整的靶向序列

第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展

  目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。  何为NGS?它面临着哪些问题?  NGS已经成为一个研究平台

NGS检测的理性回归

  继Illumina公司高通量测序仪销售第三季度低于预期导致股票大跌事件之后,知名基因检测公司23andMe也于近日宣布放弃NGS业务,这一系列事件引起了行业对NGS检测的热烈讨论,也预示着行业对NGS技术的临床应用和市场化推广进入了重新评估的阶段。  精准医疗与NGS检测  精准医疗概念的提出,

安捷伦在 2018 Analytica 以创新解决方案突出实验室效率

  2018年4月12日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前在Analytica上展示为专为实验室效率推出的创新解决方案系列,展会于 4 月 10–13 日在德国慕尼黑举办。  今年的第26届实验室技术、分析与生物技术国际贸易展会上,安捷伦以“实验室效率解决方案”为参展主题,主推 Cros

NGS检测的理性回归

    继Illumina公司高通量测序仪销售第三季度低于预期导致股票大跌事件之后,知名基因检测公司23andMe也于近日宣布放弃NGS业务,这一系列事件引起了行业对NGS检测的热烈讨论,也预示着行业对NGS技术的临床应用和市场化推广进入了重新评估的阶段。    精准医疗与NGS检测    精准医疗