四维核酸杂交技术介绍

四维核酸杂交技术[ 1 ](4DH),即在传统核酸杂交三维空间(XYZ:表征DNA片段的长度、碱基组成和碱基的排列)的基础上引入温度作为第四位参数所构成的四维温度空间平台上建立的核酸杂交技术。背景 基因组(genome)是指人类细胞中所有遗传信息的总和。基因组信息是由脱氧核糖核酸(又称为DNA)携带的。基因组的DNA是一种由4种碱基(A,G,C和T)组成的双链聚合体,这种双链结构的每条单链核苷酸链都以磷酸核糖为骨架,其碱基顺序称作DNA的一级序列结构。基因组DNA的两条链是通过每条链上互补碱基间氢键的相互作用而连结在一起的。碱基的化学结构显示,A与T相互作用形成两对氢键(而不与其他任何碱基作用),G与C相互作用形成三对氢键(而不与其他任何碱基作用)。DNA固有的内部双链以及碱基对相互作用的精确性在杂交过程中被利用。杂交是两条互补的单链核苷酸链之间形成一条稳定的双股螺旋双链结构的过程。杂交反应可以在溶液中两个互......阅读全文

核酸杂交的概念和发生条件

具有互补序列的不同来源的单链核酸分子,按碱基配对原则结合在一起称为核酸杂交(hybridization)。杂交可发生在DNA-DNA、RNA-RNA和DNA-RNA之间。杂交是分子生物学研究中常用的技术之一,利用它可以分析基因组织的结构,定位和基因表达等,常用的杂交方法有Southern印迹法,No

关于核酸的分子杂交的简介

  核酸的分子杂交是定性或定量检测特异RNA或DNA序列片段的有力工具。它是利用核酸分子的碱基互补原则而发展起来的。在碱性环境中加热或加入变性剂等条件下,双链DNA之间的氢键被破坏(变性),双链解开成两条单链。这时加入异源的DNA或RNA(单链)并在一定离子强度和温度下保温(复性),若异源DNA或R

核酸探针标记及原位杂交

一、核酸探针标记核酸探针分子杂交是指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据标记物不同,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针两大类;根据是否

核酸探针标记及原位杂交

一、核酸探针标记 核酸探针分子杂交是指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。 核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据标记物不同,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针两大

分子杂交技术菌落原位杂交的实验相关介绍

  对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行克隆筛选时,可采用本方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张硝酸纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。  1、材料:待检测的细菌平皿,已标记好的探针,硝酸纤维素

关于酵母单杂交的技术介绍

  酵母单杂交技术最早是1993年由Li等从酵母双杂交技术发展而来,通过对报告基因的表型检测,分析DNA与蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表达调控。由于酵母单杂交方法检测特定转录因子与顺式作用元件专一性相互作用的敏感性和可靠性,现已被广泛用于克隆细胞中含量微弱的、用生化手段难以纯化的特定转

斑点杂交技术的方法介绍

斑点杂交(Dot blot)是将被检标本点到膜上,烘烤固定。这种方法耗时短,可做半定量分析。一张膜上可同时检测多个样品,为使点样准确方便,市售有多种多管吸印仪(Manifold),如MinifoldⅠ和Ⅱ、Smart Blotter(Wealtec)、Bio-Dot(Bio-Rad)和Hybri-D

以菌落原位杂交为例介绍原位杂交技术

对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行克隆筛选时,可采用该方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张硝酸纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。将少数菌落转移到硝酸纤维素滤膜上(1) 在含有选择性抗生素的琼

EMA-常温核酸扩增技术介绍

基于分子仿生学的原理,把生物体内(如大肠杆菌,酵母或人体等)多酶介导的核酸复制机理在体外再现,使痕量的核酸靶标在普通生物耐受的条件下(常温下)进行快速的扩增,同时利用特异性荧光探针结合扩增产物,通过荧光检测仪实时监测荧光信号,实现核酸靶标的快速扩增和检测。 常温核酸扩增技(简称EMA技术),是由点晶

核糖核酸干扰技术(RNAi技术)介绍

转录后基因沉默(PTGS, post- transcriptional gene silencing)-最初被认为仅限于矮牵牛花和其它一些植物中的奇异现象,是目前分子生物学研究中一个最热门的话题。过去几年中,科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中,在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中

核酸突变分析方法抉择:PCR、杂交、NGS?

日前,以“精细管理、精准医疗”为主题的2016届CSCO学术年会在厦门落下帷幕,精准检测作为临床实践中实施精准医学的第一步,成为本届CSCO学术年会的热点话题。来自不同企业的分子诊断技术百花齐放百家争鸣,面对新技术与成熟技术的较量,在“精准医学”时代下,如何选择合适的检测技术,实现精准治疗成为新医学

核酸探针标记及原位杂交4

(三)试剂配制配制溶液过程中均需戴手套,液体配制均用超净水,所用瓶子均经160℃烘烤4h,主要目的是去除RNA酶。1.DEPC水 将DEPC按1‰浓度加入超净水中,充分混合后静置过夜,15~20min高压消毒,之后室温避尘存放。2.0.1mol PBS pH 7.4A液:0.1mol NaH2PO4

Southern杂交待测核酸样品的制备

  (一)制备待测DNA  基因组DNA是从动物组织(或)细胞制备。1.采用适当的化学试剂裂解细胞,或者用组织匀浆器研磨破碎组织中的细胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白质和RNA;3.用有机试剂(酚/氯仿)抽提方法去除蛋白质。  (二) DNA限制酶消化  基因组DNA很长,需要将其切割成大小

核酸探针标记及原位杂交1

一、核酸探针标记核酸探针分子杂交是指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据标记物不同,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针两大类;根据是否

核酸探针标记及原位杂交2

(二)随机引物合成法 随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400~600个,可以获得大量的有效探针。反应时对模板的要求不严格,用微量制备的质

简述核酸杂交的基本原理

  其原理是核酸变性和复性理论。即双链的核酸分子在某些理化因素作用下双链解开,而在条件恢复后又可依碱基配对规律形成双链结构。杂交通常在一支持膜上进行,因此又称为核酸印迹杂交。根据检测样品的不同又被分为DNA印迹杂交(Southern blot hybridization )和RNA印迹杂交(Nort

核酸探针标记及原位杂交3

3.注意事项(1)避光下准备反应体系:由于光敏生物素醋酸盐对光敏感,应避免光照。在分装试剂及核酸与光敏生物素混合时应在暗室安全灯下操作。(2)核酸纯度:由于光敏生物素能与任何有机物反应,因此用做标记探针的核酸要高度纯化。用作标记探针的核酸最好不用Tris溶液溶解,Tris中所含氨基会干扰标记。(3)

分子杂交技术

分子杂交技术   互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。  杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总R

Northern杂交技术

经乙二醛和二甲基亚砜变性处理后进行的RNA电泳这一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。 含有乙二醛-DMSO的凝胶比含有甲醛的凝胶更难于进行电泳,因为前者泳动速率较慢而且需将电泳液时行循环以避免电泳过程中形成过高的H+梯度。尽管上述两种凝胶具有近乎相等的分辨率(Miller,

Southern杂交技术

 SOUTHERN BLOT1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a r

分子杂交技术Northern杂交的简介

  Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝

分子杂交技术的基本信息介绍

  互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。  杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用

多彩色荧光原位杂交技术介绍

mFISH是在荧光原位杂交基础上发展起来的新技术,它不仅具有FISH的优点,而且克服了FISH的许多局限,其最大特点是可将多次繁顼的FISH实验和多种不同的基因定位在一次FISH实验中完成。mFISH能同时检测多个基因,分辨复杂的染色体易位和微小缺失,区分间期细胞多倍体和超二倍体等。mFISH用激发

关于杂交瘤技术的应用介绍

  单克隆抗体不仅在生物学和免疫学基础研究中具有重要的价值,而且在实践中的应用范围亦极为广泛。在医学中,单克隆抗体已用于疾病的诊断,其优点是诊断准确,无交叉反应。例如,单克隆抗体诊断乙型肝炎及潜伏的乙型肝炎病毒,则很少发生假阴性的漏诊。单克隆抗体还可作为治疗疾病的药物载体。单克隆抗体对靶组织有专一亲

荧光原位杂交技术的应用介绍

作为一种可视化特定DNA序列的分子细胞遗传学技术,荧光原位杂交技术目前被广泛应用于染色体畸变。如非整倍体、染色体重组。其基本流程包括探针标记、探针的变性、样本变性、杂交和荧光信号采集。荧光原位杂交技术在基因定性、定量,整合、表达等方面的研究中颇具优势,目前已经被广泛应用于遗传病诊断、病毒感染分析、产

荧光原位杂交技术的应用介绍

作为一种可视化特定DNA序列的分子细胞遗传学技术,荧光原位杂交技术目前被广泛应用于染色体畸变。如非整倍体、染色体重组。其基本流程包括探针标记、探针的变性、样本变性、杂交和荧光信号采集。荧光原位杂交技术在基因定性、定量,整合、表达等方面的研究中颇具优势,目前已经被广泛应用于遗传病诊断、病毒感染分析、产

DNA纤维荧光原位杂交技术介绍

DNA纤维荧光原位杂交技术(DNA fiber- FISH)FISH的分辨率取决于载体DNA的浓缩程度,如何提高分辨率一直是一个重要课题。Wiegant等和Heng等首先利用化学方法对染色体进行线性化,再以此为载体进行FISH,使其分辨率显著提高,这就是最初的纤维-FISH。纤维-FISH应用各种不

分子杂交技术RNA探针的相关介绍

  许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP,则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优

杂交探针的技术特点和应用介绍

杂交探针是核酸分子上带有可能被检测的信号分子,如同位素或荧光标记的核酸分子。双链DNA加热变性成为单链,随后用放射性同位素(通常用磷-32)、萤光染料或者酶(如辣根过氧化物酶)标记成为探针。磷-32通常被掺入组成DNA的四种核苷酸之一的磷酸基团中,而荧光染料和酶与核酸序列以共价键相连。分为cDNA探

多彩色荧光原位杂交技术介绍

多彩色荧光原位杂交(multicolor fluorescence in situ hybridization,mFISH)mFISH是在荧光原位杂交基础上发展起来的新技术,它不仅具有FISH的优点,而且克服了FISH的许多局限,其最大特点是可将多次繁顼的FISH实验和多种不同的基因定位在一次FIS