生物信息学技术:基因芯片实验原理与方法

本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达的有效方法的需求又是促进基因芯片技术发展的动力。由于基因芯片高速度、高通量、集约化和低成本的特点,基诞生以来就受到科学界的广泛关注,正如晶体管电路向集成电路发展的经历一样,分子生物学技术的集成化正在使生命科学的研究和应用发生一场革命。根据固定在芯片载体上的核酸分子的不同,基因芯片可以分为cDNA芯片和寡核昔酸芯片等。寡核昔酸芯片主要基于光引导聚合技术,该技术是Affymetrix公司开发的技术,由于其突出的优点,正得到越来越广泛的应用。二、原理基因芯片(Gene Chip,DNA Chip),又称DNA微阵列(DNA Mico......阅读全文

基因芯片的应用与展望

一、基因芯片产生背景人类基因组计划(HGP)是人类为了认识自己而进行的一项最伟大和最具影响的研究计划。 人类基因组测序的“工作草图”即将向全球公布,预计在2003年完成全序列分析。此外,还测定了80万个cDNA片断(ESTs),相当于4-5万个基因,占7-10万个人类总基因的50%左右。目前

基因芯片技术知识概要

生物科学正迅速地演变为一门信息科学。最明显的一个例子就是目前正在进行的HGP(human genome project),最终要搞清人类全部基因组的30亿左右碱基对的序列。除了人的遗传信息以外,还有其它生物尤其是模式生物(model organism)已经或正在被大规模测序,如大肠杆菌、啤酒酵母、秀

基因芯片技术的主要应用

  1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一,足见其在科学史上的意义。现在,基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组

采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息

The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno

凯氏定氮实验的原理与方法

凯氏定氮实验的原理与方法测定原理:待测天然含氮有机物与浓硫酸共热时,被氧化成为二氧化碳和水,而氮转变成氨,氨再与硫酸结合生成硫酸铵。为了加速有机物质的分解反应,在消化时常加入促进剂,硫酸铜可用作催化剂,硫酸钾或硫酸钠可提高消化液的沸点,氧化剂如过氧化氢也能加速反应。操作方法:样品处理 测定某一固体样

JAM检测技术检测原理和实验方法

JAM检测技术是用于测定细胞死亡或凋亡的方法,如51Cr稀放法事基于细胞死亡往往伴随有细胞膜破裂及细胞质的释放,用51Cr或125I标记相关的靶细胞,与效应细胞共培养一定时间后,测定一定体积的培养上清中的放射性计数,以反映细胞损伤情况。而人们发现,细胞死亡的早期反应,细胞内DNA被酶裂解成180kb

多肽合成的技术原理与合成方法

多肽合成又叫肽链合成,是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。多肽的合成主要分为两条途径:化学合成多肽和生物合成多肽。多肽合成的原理多肽合成就是如何把各种氨基酸单位按照天然物的氨基酸排列顺序和连接方式连接起来。由于氨基酸在中性条件下是

多肽合成的技术原理与合成方法

  多肽合成又叫肽链合成,是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。多肽的合成主要分为两条途径:化学合成多肽和生物合成多肽。   多肽合成的原理   多肽合成就是如何把各种氨基酸单位按照天然物的氨基酸排列顺序和连接方式连接起来。由于

多肽合成的技术原理与合成方法

  多肽合成又叫肽链合成,是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。多肽的合成主要分为两条途径:化学合成多肽和生物合成多肽。   多肽合成的原理   多肽合成就是如何把各种氨基酸单位按照天然物的氨基酸排列顺序和连接方式连接起来。由于

基因芯片实验操作流程图

   芯片实验操作流程包括样本DNA或RNA制备、标记、杂交及洗涤等步骤基因芯片实验操作流程图     1.样本DNA或RNA制备    芯片实验中核酸的抽提没有特殊之处,参照常规的分子生物学实验手册就可以。但对于RNA样本,由于RNA的稳定性很差,在活体内的半衰期也很短,因此取材一定要新鲜,取材后

表达谱基因芯片实验操作流程

一、试剂1. TRIzol2. 异丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 无水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 杂交试剂110. 标记试剂I11. 杂交试剂212. 标记试剂II13. 反转录酶14. 

基因芯片的的方法特点

基因芯片(又称DNA芯片)是以基因连锁、限制性长度的多态性及连锁不平衡等基因定位方法为基础,以同源DNA分子杂交为基本工作原理而设计的检测方法。

基因芯片数据的分析方法

研究背景:基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测,探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义,这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据,其分析方法和思路都大同小异,这里分享一个多组实验设

基因芯片数据的分析方法

研究背景:基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测,探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义,这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据,其分析方法和思路都大同小异,这里分享一个多组实验设

基因芯片的制备、应用与前景

 摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国内

基因芯片的制备、应用与前景

  摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国

原位合成的基因芯片制备技术

生物芯片制备中材料的固定方式主要包括原位合成法和点样法两种,点样法又分为接触式点样法和非接触式点样法。原位合成法主要用于基因芯片的制备,点样法可用于基因芯片和蛋白质芯片的制备。细胞芯片主要是通过细胞本身的贴壁生长来完成固定。组织芯片通过一些黏性溶剂(如石蜡)使组织切片固定在载体上。某些微流体芯片不需

基因芯片技术的应用农业发展

基因芯片技术可以用来筛选农作物的基因突变,并寻找高产量、抗病虫、抗干旱、抗冷冻的相关基因,也可以用于基因扫描及基因文库作图、商品检验检疫等领域。

MTT法实验原理与MTT-溶液的配制方法

原理:活细胞中脱氢酶能将四唑盐还原成不溶于水的蓝紫色产物甲臜,并沉淀在细胞中,而死细胞没有这种功能。DMSO能溶解沉积在细胞中蓝紫色结晶物,溶液颜色深浅与所含的formazan量成正比。再用酶标仪测定OD值。

MTT法实验原理与MTT溶液的配制方法

通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细

MTT法实验原理与MTT-溶液的配制方法

通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细

MTT法实验原理与MTT溶液的配制方法

通常,此法中的mtt浓度为5mg/ml。因此,可以称取mtt0.5克,溶于100ml的磷酸缓冲液(pbs)或无酚红的培养基中,用0.22μm滤膜过滤以除去溶液里的细菌,放4℃避光保存即可。在配制和保存的过程中,容器最好用铝箔纸包住。需要注意的是,mtt法只能用来检测细胞相对数和相对活力,但不能测定细

免疫电泳实验技术原理和操作方法

(一)原理免疫电泳是琼脂平板电泳和双相免疫扩散两种方法的结合。将抗原样品在琼脂平板上先进行电泳,使其中的各种成分因电泳迁移率的不同而彼此分开,然后加入抗体做双相免疫扩散,把已分离的各抗原成分与抗体在琼脂中扩散而相遇,在二者比例适当的地方,形成肉眼可见的沉淀弧。该方法可以用来研究:①抗原和抗体的相对应

生物芯片技术用于生物信息学研究

人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的

生物芯片技术用于生物信息学研究

人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的

一种基于随机序列数据库的密码系统的建立方法获ZL

  3月1日获悉,由中国科学院华南植物园曾纪晴、张明永等科研人员完成的“一种基于随机序列数据库的密码系统的建立方法”获国家发明ZL授权(ZL号:ZL201110364005.9)。此前,该课题组已获两项信息安全领域国家发明ZL。  植物学领域与信息安全领域似乎风马牛不相及,然而该课题组从对基因芯片和

基因芯片技术在疟疾研究中的应用

随着人类基因组( human genome p roject, HGP) 、多种模式生物(model organism)和部分病原体基因组测序的完成,基因序列数据以前所未有的速度不断增长。传统实验方法已无法系统地获得和诠释日益庞大的基因序列信息,研究者们迫切需要一种新的手段,以便大规模、高通

ELISA实验原理与类型

ELISA的原理ELISA的基础是抗原或抗体的固相化及抗原或抗体的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或抗体仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又保留酶的活性。在测定时,受检标本(测定其中的抗体或抗原)与固相载体表面的抗原或抗体起反应。用洗涤的方法使固相载体上形成的抗原抗体复合物与

FPLC技术基本实验原理

  FPLC(fast protein liquid Chromatography)为一种特殊的GX液相层析(HPLC,high pressureliquid chromatography)装置,快速分离纯化和定量测定蛋白质组分是它的主要用途。他的本原理相同于HPLC,就是在高压条件下(20—200

与骨骼相关的组织学实验技术方法

Embedding Bones for Frozen Section:Fill an ice bucket with dry ice pellets and place a 500ml beaker in the middle.Put approximately 200ml of 2-MethylB