Roche454(GSFLXTitaniumSystem)超高通量测序技术原理
Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。2007年又推出了性能更优的第二代基因组测序系统——Genome Sequencer FLX System。2008年10月,454推出了全新的GS FLX Titanium系列试剂和软件,让GS FLX的通量一下子提高了5倍,准确性和读长也进一步提升。GS FLX 测序原理GS FLX系统的测序原理和GS 20一样,也是一种依靠生物发光进行DNA序列分析的新技术;在DNA聚合酶,ATP硫酸化酶,荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP的聚合与一次荧光信号释放偶联起来 (图 1)。通过检测荧光信号释放的有无和......阅读全文
上海伯豪三代测序服务助力梭状芽胞杆菌研究
研究背景: 含碳气体,如CO、CO2等,是重要的碳资源。构建能够高效利用含碳气体的人工细胞工厂,实现将其生物转化为石油基化学品,将为解决全球资源和能源问题开辟一条新路,对工业可持续发展具有重大意义。梭菌是一类重要的可利用含碳气体产生各类化学品的厌氧微生物。而其中,Clostridium c
罗氏最新推出可检测甲型H1N1流感病毒的完整试剂盒
2009年5月14日,罗氏应用科学部宣布已成功研制开发了一款可检测甲型H1N1 流感病毒的检测试剂盒,目前也正在向卫生组织申请获取批准用以突发事件。 该试剂盒可应用于罗氏LightCycler® 480,2.0 和1.5荧光定量PCR平台上,经过阳性病毒样本检测,证明能特异性检测出最新
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
数字盘点:中国高通量测序、生物信息服务公司表
1. 华大基因 137台HiSeq;3台MiSeq; 31台Proton。 全方位高通量测序应用。 2. 药明康德基因中心 4台HiSeq;4台MiSeq;1台Proton;2台PGM;1台Affymetrix。 是目前中国唯一的美国CLIA认证实验室。 科研服务、测序和芯片外包服务、
高通量测序技术的应用
测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测
高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat
二代测序(Next-generation-sequencing)的定义
二代测序也被成为高通量测序指的是现代不同的测序技术,不同于之前的Sanger测序,它的速度更快,价格也更为便宜,主要有以下几个平台: - Illumina (Solexa) sequencing - Roche 454 sequencing - Ion torrent: Proton
DNA测序技术的比较表
第X代 公司 平台名称
中国高通量测序、生物信息服务公司表
1. 华大基因。 137台HiSeq;3台MiSeq; 31台Proton。 全方位高通量测序应用。 联系方式:400-706-6615,info@bgitechsolutions.com 2. 药明康德基因中心。 4台HiSeq;4台MiSeq;1台
2013新一代测序仪将走向何方
尽管今年的摩根大通保健大会没有出现去年的新品频发的盛况,但新一代测序仪仍在不断进步。读长、准确性、通量、软件,无一不在变化,让测序更高、更快、更强。 Illumina公司在2012年第三季度推出了HiSeq 2000的升级版――HiSeq 2500。它是Illumina第一台特有两种运
浙江大学最新评述:深度测序技术发掘植物病毒资源
科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献
高通量测序平台及其性能参数介绍
Roche 454、Illumina、Solexa和ABI SOLiD为主的三个测序平台,目前最主流的二代测序平台是 Illumina 所生产的测序仪,包括 MiSeq 系列、 HiSeq 系列、 NextSeq系列等。另外的还包括罗氏公司的 454 测序仪(目前已关闭)、华大基因的 BGI-C
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆) 历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
一代测序、二代测序及三代测序的应用对比
一、初现庐山真面目 一代测序:又称Sanger测序(多分子,单克隆) 历史:第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用
454用于西红柿基因组测序
最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发
数字盘点:中国高通量测序、生物信息服务公司表
1. 华大基因 137台HiSeq;3台MiSeq; 31台Proton。 全方位高通量测序应用。 联系方式:400-706-6615,info@bgitechsolutions.com 2. 药明康德基因中心 4台HiSeq;4台MiSeq;1台Proton;2台PGM;1台Affy
三代测序服务助力梭状芽胞杆菌研究
研究背景:含碳气体,如CO、CO2等,是重要的碳资源。构建能够高效利用含碳气体的人工细胞工厂,实现将其生物转化为石油基化学品,将为解决全球资源和能源问题开辟一条新路,对工业可持续发展具有重大意义。梭菌是一类重要的可利用含碳气体产生各类化学品的厌氧微生物。而其中,Clostridium carboxi
第二代DNA测序技术
DNA总的说来,第一代测序技术的主要特点是测序读长可达1000bp,准确性高达99.999%,但其测序成本高,通量低等方面的缺点,严重影响了其真正大规模的应用。因而第一代测序技术并不是最理想的测序方法。经过不断的技术开发和改进,以Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa,His
全球进入后基因组新时代
最新一期的Nature News发表了一篇基因组学方面的新闻,该文章称,不论体型,外表,不论是将灭绝或是已灭绝,新的基因组计划即将对全球的各种动物进行测序。全球进入基因组新的时代。 关注基因组学的读者都知道,现存的多种动物,植物,人类的基因组都已经被科学家破解,甚至那些已经灭绝的动物的基因
高通量测序技术总结与展望
第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率,适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补,但是成本昂贵,而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中,454序列片段最长,比较适合对未知基因组从头测序,搭建主体结构,但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454
高通量测序技术核酸片段分选
近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量
罗氏宣布推出目标基因组测序的新技术
罗氏应用科学部(Roche Applied Science)旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商业化的NimbleGen序列捕获技术(NimbleGen Sequence Capture technology),以帮助那些希望对基因组选定目标区域进行高通量测序的科学家们。这项新技术使
一代测序技术,二代测序技术具有哪些优点
相比一代测序技术,二代测序技术优点如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势:Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题,它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短(200bp-500bp)也让其应用有所局
相比一代测序技术,二代测序技术具有哪些优点
相比一代测序技术,二代测序技术优点如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势:Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题,它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短(200bp-500bp)也让其应用有所局
第二代基因测序的意义
基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。 基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要孕妇5毫升血,通过化验血液中甲型胎儿蛋白(AFP)、人类绒毛膜促性腺激素(β-hCG)的浓度,就可以算出胎儿出现唐氏综合征的危险性。最近公众关注的H7
新一代测序技术(下)SOLiD-(ABI)
【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代
如何提高NGS样品制备成功率
NGS样品制备指南之自动化篇编辑推荐:在经历了几年的高速发展之后,新一代测序仪终于放慢了脚步。如今,样品制备成为NGS中新的亮点。新试剂、新仪器不断涌现,以缩短时间,提高通量。同时,新方法也在不断被开发,以处理更少的样本,如单细胞。这一次,生物通带您走近NGS的样品制备,看看有哪些新工具能帮助我们应