DNA斑点杂交方法(二)
核酸杂交法检测病原微生物 核酸杂交技术是根据两条互补的核苷酸单链可以杂交结合成双链的原理所建立,用一段已知序列的放射性或非放射性标记的核苷酸单链做探针,与待检标本中的DNA杂交来探查待检标本中有无与之相互补的核酸。该方法特异性高,但敏感性低于PCR方法。 本实验学习用非放射性标记物-地高辛(DIG)标记DNA片段作探针,用斑点杂交法检测病原微生物DNA的方法。 【原理】 用地高辛(DIG)类固醇半抗原标记特异DNA片段做探针,与待检标本中DNA杂交,然后加入碱性磷酸酶标记的抗-DIG抗体(抗DIG-AP),再加入碱性磷酸酶的作用底物(NBT/BCIP),若待检标本中有与探针同源的DNA序列,则探针与其杂交并与抗DIG-AP结合,碱性磷酸酶催化底物呈色,则在杂交膜上出现兰色斑点或条带。该探针可用于斑点杂交,菌落原位杂交及Southern blot杂交。 (一)DIG-DNA探针的制备(随机引物法标记) 【材料......阅读全文
斑点杂交的技术特点和应用
斑点杂交是指将待测的DNA变性后点加在硝酸纤维素膜(或尼龙膜、NC膜)上,用已标记的探针进行杂交,洗膜(除去未接合的探针),放射自显影,判断是否有杂交及其杂交强度,主要用于基因缺失或拷贝数改变的检测。
关于RNA斑点杂交方法的介绍
与上法类似,每个样品至多加10μg总RNA(经酚/氯仿或异硫氰酸胍提取纯化),方法是将RNA溶于5μl 焦碳酸二乙酯(DEPC)水,加5μl 甲醛/SSC缓冲液(10×SSC中含6.15mol/L甲醛),使RNA变性,然后取5-8μl点样于处理好的滤膜上,烘干。
斑点杂交技术的方法和步骤
斑点杂交是指将DNA或RNA样品直接点在硝酸纤维素滤膜上,然后与核酸探针分子杂交,以显示样品中是否存在特异的DNA或RNA。同一种样品经不同倍数的稀释,还可以得到半定量的结果。所以它是一种简便、快速、经济的分析DNA或RNA的方法,在基因分析和基因诊断中经常用到,是研究基因表达的有力工具。但由于目的
关于斑点杂交的基本信息介绍
斑点杂交是指将待测的DNA变性后点加在硝酸纤维素膜(或尼龙膜、NC膜)上,用已标记的探针进行杂交,洗膜(除去未接合的探针),放射自显影,判断是否有杂交及其杂交强度,主要用于基因缺失或拷贝数改变的检测。
分子杂交技术斑点杂交的操作步骤
(1) 10μl样品与20μl 100%甲酰胺、 7μl 37%甲醛、2μl 20×SSC混合。混合置于68℃,15分钟后置冰浴中。 (2) 用0.1mol/L NaOH清洗点样器,再用无菌水充分冲洗。将一张经20×SSC浸润的滤纸铺在点样器上,上面再铺上一张经20×SSC浸润1小时的硝酸纤维
分子杂交技术斑点杂交的实验简介
斑点杂交是指将DNA或RNA样品直接点在硝酸纤维素滤膜上,然后与核酸探针分子杂交,以显示样品中是否存在特异的DNA或RNA。同一种样品经不同倍数的稀释,还可以得到半定量的结果。所以它是一种简便、快速、经济的分析DNA或RNA的方法,在基因分析和基因诊断中经常用到,是研究基因表达的有力工具。但由于
关于完整细胞斑点杂交方法的介绍
应用类似检测细菌菌落的方法,可以对细胞培养物的特异序列进行快速检测,将整个细胞点到膜上,经NaOH处理,使DNA暴露、变性和固定,再按常规方法进行杂交与检测。有人曾用此法从105个培养细胞中检测到至少5pg的Epstein-Barr病毒DNA。完整细胞斑点印迹法可以用于筛选大量标本,因为它使细胞
斑点杂交方法——优化抗原和抗体浓度
斑 点 杂 交 方 法——优 化 抗 原 和 抗 体 浓 度 对于一个给定的抗原,最佳的抗体浓度依赖的抗原和抗体本身。抗原和抗体的亲和力,以及一抗与二抗的特异反应都是不同的。最优抗原和抗体浓度可通过免疫印迹实验中使用不同浓度的抗原和抗体作用确定。另外,更快和更简单的方法是进行斑点印迹实验。以下是使用
斑点杂交方法——优化抗原和抗体浓度
对于一个给定的抗原,最佳的抗体浓度依赖的抗原和抗体本身。抗原和抗体的亲和力,以及一抗与二抗的特异反应都是不同的。最优抗原和抗体浓度可通过免疫印迹实验中使用不同浓度的抗原和抗体作用确定。另外,更快和更简单的方法是进行斑点印迹实验。以下是使用超敏感信号底物进行的斑点印迹的操作方法。注:所有的抗体稀释度假
非结核分枝杆菌肺病的细菌学研究的几种方法
1、Bactec 460 TB系统 在含有C14-棕榈酸为底物的7H12培养基内加入选择性抑制剂NAP(ρ-硝基-α-乙酰氨基-β-羟基丙酮)5μg/ml,培养后经Bactec 460 TB检测,结核分枝杆菌群对NAP l00%敏感,非结核分枝杆菌99.5%耐药,从而达到快速鉴别的目的。表明N
常用的固相杂交方法介绍
常用的固相杂交方法有斑点杂交法、夹心杂交法和原位杂交法等。下面简单介绍几种常用的核酸分子固相杂交方法。①斑点杂交法(dot blot hybridization):最常用的杂交模式.将样品DNA直接点在硝酸纤维素膜或尼龙膜上,在严格的条件下杂交后进行检测。斑点杂交法简单、迅速,不需要限制性核酸内切酶
Southern印迹法的基本原理
Southernblot的基本原理是:硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的
Southern印迹法的原理和功能特点
Southernblot的基本原理是:硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DN
细胞因子分子生物学方法
这是一类利用细胞因子的基因探针检测特定细胞因子基因表达的技术。目前所有公认的细胞因子的基因均已克隆化,故能较容易地得到某一细胞因子的cDNA探针或根据已知的核苷酸序列人工合成寡聚核苷酸探针。利用基因探针检测细胞因子mRNA表达的方法多种多样,常使用斑点杂交、Northernblot、逆转录PCR
Th细胞的核酸杂交法检测
这是一类利用细胞因子的基因探针检测特定细胞因子基因表达的技术,绝大多数细胞因子mRNA在T细胞中只短暂存在,其存在的量与T细胞产生细胞因子的量有很好的相关性,所以,在大多数情况下,细胞内mRNA的量可以反映细胞产生细胞因子的情况,反有公认的细胞因子的基因均已克隆化,故能较容易地得到某一细胞因子的
原位杂交(In-Situ-Hybridization,ISH)与荧光原位杂交(三)
(1)DAN斑点杂交①先将膜在水中浸湿,再放到15×SSC中。②将DNA样品溶于水或TE,煮沸5min,冰中速冷。③用铅笔在滤膜上标好位置,将DNA点样于膜上。每个样品一般点50μl(2~10μg DNA)。④将膜烘干,密封保存备用。(2)RNA斑点杂交:与上法类似,每个样品至多加10μg总RNA(
原位杂交和核酸杂交是一种吗
核酸杂交方法是一种分子生物学的标准技术,用于检测DNA或RNA分子的特定序列(靶序列).经典的核酸杂交方法是将DNA或RNA先转移并固定到硝酸纤维素或尼龙膜上,与其互补的单链DNA或RNA探针用放射性或非放射性标记,在膜上杂交时,探针通过氢键与其互补的靶序列结合,洗去未结合的游离探针后,经放射自显影
常用DAN探针制备的方法介绍随机引物标记
随机引物标记(random primer labeling)是利用单链 DNA 与六核苷酸(hexamer)退火结合,以六核苷酸为引物,加入4种 dNTP,其中1种标有同位素或生物素,用 Klenow 片段催化合成带有标记的互补 DNA 链,标记率高而且不受琼脂糖影响。该法不适于标记 RNA。Fei
简述拉米夫定的适应症
乙肝、乙型肝炎病毒复制的慢性乙型肝炎。 1、适合治疗对象:慢性乙型肝炎;按全国病毒性肝炎防治方案,确诊为慢性乙型肝炎,性别不限,年龄16岁或以上,并且符合下列标准。 (1)HBeAg阳性,HBV DNA阳性(HBV DNA阳性系指斑点杂交法,不是PCR法阳性,有条件者可作HBV DNA定量测
关于分子杂交技术的基本原理介绍
分子杂交的基本原理是根据双链DNA经高温解链成两条互补的单链,降温后又可恢复原来的双链。两条不同的单链分子可根据碱基配对的原则,只要它们的碱基序列同源或部分同源,即可全部或部分复性,此称核酸杂交。用来探测DNA的已知互补片段称为DNA探针,通常是应用已预先经放射性标记或非放射性标记的DNA单链来
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3
2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同
核酸杂交法检测病原微生物
核酸杂交技术是根据两条互补的核苷酸单链可以杂交结合成双链的原理所建立,用一段已知序列的放射性或非放射性标记的核苷酸单链做探针,与待检标本中的DNA杂交来探查待检标本中有无与之相互补的核酸。该方法特异性高,但敏感性低于PCR方法。 本实验学习用非放射性标记物-地高辛(DIG)标记DNA片段作探针,用
核酸杂交法检测病原微生物
核酸杂交技术是根据两条互补的核苷酸单链可以杂交结合成双链的原理所建立,用一段已知序列的放射性或非放射性标记的核苷酸单链做探针,与待检标本中的DNA杂交来探查待检标本中有无与之相互补的核酸。该方法特异性高,但敏感性低于PCR方法。 本实验学习用非放射性标记物-地高辛(DIG)标记DNA片段作探针,用
DNA重组技术(DNA-Recombination)
一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定2
(1)CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子(如Ca2+、Mg2+等)低渗溶液中时,细菌细胞膨胀成球形,处于感受态;此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面,在丰富培养基中生长数小时后,球状细胞恢复原
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶,将不同来源的DNA分子进行特异地切割,获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接,从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞,在宿主细胞中进行无性增殖,获得大量的目的基因或DNA片段,此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时,破坏此酶的N端阅读框架,产生无α互补功能的N端片段,因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色,见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短,不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框,有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与