3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature Communications》上，欧洲生物信息学研究所欧洲分子生物学实验室的研究人员用10x Genomics平台对成年和幼年发育期间小鼠的睾丸进行了单细胞转录组测序和分析[3]。该研究精确分类了生殖细胞发育不同阶段的细胞，包括稀有体细胞和精原细胞。值得一提的是，为精确捕获低转录活性的细胞类型，研究人员应用一种新的统计工具EmptyDrops，识别到了先前研究没有发现的细线期和偶线期精母细胞。此外，通过CUR和RUN实验，研究人员对减数分裂后X染色体重新激活的时间动态模式进行了分析，确定了减数分裂后经历了大量的染色质重塑现象。该研究为......阅读全文
新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作，在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl
花生光暗幼苗的单细胞转录组图谱构建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，广东省农业科学院作物研究所花生研究团队与合作者，在花生光暗形态转变的单细胞基因表达谱研究方面取得进展，成功构建的花生光暗幼苗的单细胞转录组图谱。相关成果发表于《植物生物技术杂志》
GentleMACS/单细胞悬液制备文献集锦
种属 处理组织 文章名称 human
研究揭示人胚胎发育转录组
原始态（Naïve state）多能性相关研究是近年来干细胞及重编程领域的研究热点和难点，与传统的primed状态相比，Naïve态捕获了体内植入前胚胎发育的阶段，具有更强的可塑性，在早期胚胎发育研究及未来临床应用中具有更广阔的前景。在近10年的研究中，科学家们取得了一系列重要进展，已建立了较为
空间转录组学研究案例简析
01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子：11.878发表时间：2018.06发表期刊：Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里，研究人员使用空间转录组学（ST）技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法，分析12个区域的近6
安诺开年力作：单细胞转录组测序登陆Nature子刊
X染色体失活（XCI）是指雌性哺乳类细胞中，两条X染色体的其中之一失去活性的现象，过程中X染色体会被包装成异染色质，进而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引发X染色体沉默的长片段ncRNA，尽管Xist对XCI是必要的，但其对胚胎植入前的印记XCI的精确作用尚存争议。近日，安诺优达与法国
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多
单细胞转录组测序（scRNAseq）的十个问答解惑
高通量组学研究已经发展了快20年，从最开始的基因芯片到二代测序，从编码基因到lncRNA，circRNA，从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热，相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火，但是不是所有的研究都适用，是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢？本期小编
回顾：单细胞转录组技术发展之十年历程
俗话说，十年是个风水岭，单细胞转录组技术发展至今十年间，在促进对生物学和疾病的认识上发挥出的巨大潜力有目共睹。那么，十年间单细胞转录组是如何发展至今的？又取得了哪些新的进展呢？今天，让我们跟随Sarah Aldridge和Sarah Teichmann两位大神，一起来回顾单细胞转录组学技术十年发
单细胞转录组测序（scRNAseq）的十个问答解惑
高通量组学研究已经发展了快20年，从最开始的基因芯片到二代测序，从编码基因到lncRNA，circRNA，从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热，相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火，但是不是所有的研究都适用，是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢？本期小编带来
利用单细胞空间转录组揭示猕猴大脑皮层的细胞类型
阐明大脑皮层的细胞类型组成对于理解大脑结构和功能至关重要。中国科学院脑智卓越中心利用单细胞空间转录组揭示猕猴皮层的细胞类型。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上，题为：Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organizati
科学家发表跨物种小脑皮层单细胞空间转录组图谱
9月27日，《科学》（Science）在线发表了题为Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex的研究论文。该成果由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心联合杭州华大生命科学研究院、
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术，可以全面获取样本中转录产物信息，结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制， 进行联合分析，深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
单细胞光学微手术研究获重要进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472640.shtm 近日，暨南大学纳米光子学研究院教授辛洪宝等在单细胞光学微手术研究中取得重要进展。他们利用热等离激元与光学捕获相结合的方法实现了单个癌细胞的微手术和细胞内细胞器的精准操控。相关研究
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）
针对稀有样本——新方法提高单细胞转录组测序的效率
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作，在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基...
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基化组 单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，由于细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。 近日，加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授
曹雪涛院士团队重要研究成果汇总
【1】Science：南开大学曹雪涛团队揭示hnRNPA2B1识别病毒DNA并促进IFN-α/β产生 doi：10.1126/science.aav0758 通过模式识别受体（pattern recognition receptor， PRR）识别病毒核酸可触发宿主对病毒的先天免疫应答。这导
转录组测序原理
而转录组测序即是利用高通量测序技术，将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq，也就是转录组测序，可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括：正常组织与肿瘤组织；药物治疗前后的表达差异；发育过程中，不同发育阶段，不同组织的表达
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
1000篇气相色谱应用文献汇总（三）
201 SCTB9403 0 接种根瘤菌的三叶草在煤矸石风化物中的效应 202 SCTB9403 0 衍生化预处理－气相色谱法测定水中酚类污染物 203 SCTA9405 0 毛细管气相色谱法分析土壤中的优先有机污染物 204 SCTB9407 0 北京地区大气中非甲烷碳氢化合物（NMHC）的人为源
1000篇气相色谱应用文献汇总（四）
301 SCTB9606 0 气相色谱法测定中国菜油中的挥发性硫化合物 302 SCTB9606 0 黑米色素分子结构解析 303 SCTA9506 0 超临界CO_2抽提在食品业中的应用 304 SCTC9501 0 食品分析方法的协同试验 305 SCTA9506 0 测定掺伪“菜油”中菜油
1000篇气相色谱应用文献汇总（六）
501 SCTB9602 0 煤自燃倾向性色谱吸氧鉴定法与应用 502 SCTB9602 0 我国风化煤利用现状与展望 503 SCTB9604 0 饱和烃单体化合物稳定碳同位素测定方法 504 SCTB9701 0 山西朔县矿区4＃煤层煤岩及有机地球化学特征研究 505 SCTA9604 0 油藏
1000篇气相色谱应用文献汇总（十）
901 SCTC9701 0 利用头孢氨苄废液制备六甲基硅脲的研究 902 SCTB9602 0 第40届CIPAC年会和第26届FAO农药规格非正式会议情况介绍 903 SCTC9608 0 甲苯氯化制备苯甲醛的研究 904 SCTB9607 0 CF_2ClBr的火花等离子体降解 905 SCT
1000篇气相色谱应用文献汇总（五）
401 SCTB9406 0 DNP－TWEEN－80混合固定液填充柱用于分析低沸点有机酸的新方法 402 SCTB9406 0 氢焰检测器上四大酯校正因子的预测 403 SCTB9406 0 再谈耐高温活性干酵母在清香型大曲酒酿造中的应用 404 SCTB9406 0 AADY用于浓香型大曲酒生产
1000篇气相色谱应用文献汇总（二）
101 SCTB9507 0 探讨基层实验室如何开展VOC分析 102 SCTB9507 0 测定低浓度污染物精密度和检出限的评价 103 SCTB9507 0 大气中有机污染物的色质联分析 104 SCTB9502 0 RT倍司还原废水的处理 105 SCTC9506 0 山梨醇系凝油剂合成及其在
1000篇气相色谱应用文献汇总（七）
601 SCTB9604 0 济源凹陷油源追踪及烃类垂直运移作用 602 SCTA9606 0 吐鲁番拗陷二叠系─三叠系烃源岩研究 603 SCTA9702 0 胜利油田下第三系沙河街组烃源岩热解产物初析 604 SCTB9604 0 吐哈盆地煤系烃源岩特征与油气分布关系初探 605 SCTB970