回顾:单细胞转录组技术发展之十年历程
俗话说,十年是个风水岭,单细胞转录组技术发展至今十年间,在促进对生物学和疾病的认识上发挥出的巨大潜力有目共睹。那么,十年间单细胞转录组是如何发展至今的?又取得了哪些新的进展呢?今天,让我们跟随Sarah Aldridge和Sarah Teichmann两位大神,一起来回顾单细胞转录组学技术十年发展。一、过去十年中单细胞转录组学技术是如何发展的?单细胞转录组学技术是2009年北大汤富酬老师等人通过少数小鼠原始生殖细胞,基于高通量测序技术,实现了在单个细胞中对mRNA全基因组检测。此后,单细胞转录组学技术不断发展创新,包括标签测序方法(例如STRT-seq和CEL-seq,MARS-seq)、全长测序(例如SMART-seq / SMART-seq2)等。真正实现高通量单细胞测序技术的发展是后续开发的纳米液滴,微孔技术和原位条形码技术。这些技术的发展与完善, 使得单细胞转录组测序技术进入高通量与自动化的全新时代。图1 单......阅读全文
回顾:单细胞转录组技术发展之十年历程
俗话说,十年是个风水岭,单细胞转录组技术发展至今十年间,在促进对生物学和疾病的认识上发挥出的巨大潜力有目共睹。那么,十年间单细胞转录组是如何发展至今的?又取得了哪些新的进展呢?今天,让我们跟随Sarah Aldridge和Sarah Teichmann两位大神,一起来回顾单细胞转录组学技术十年发
单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多个发育轨迹和
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多
二十大重要知识点!回顾我国十年奋斗历程
高举中国特色社会主义伟大旗帜 为全面建设社会主义现代化国家而团结奋斗——习近平同志代表第十九届中央委员会向大会作的报告摘登新时代十年的伟大变革具有里程碑意义 新华社北京10月16日电 习近平同志在二十大报告中阐述了过去五年的工作和新时代十年的伟大变革。他指出,新时代十年的伟大变革,在党史、新中国史
20022012,analyticaChina十年成长历程回顾
2012年10月16-18日,全球分析、实验室技术和生化技术领域的顶级盛会德国analytica在华子展――慕尼黑上海分析生化展(analytica China)将在上海新国际博览中心N1、N2馆隆重召开。展会将云集国内外行业领军企业,集中展示最新科学仪器、尖端分析测试技术,提供全方位的实验
空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例
单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接
单细胞转录组制备仪的功能
fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程 -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量 -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作 -直接从单细胞开始,简化的样本制备,只需 3 小时手工操作时间,没有 片段化和纯化步骤 更节省的成
单细胞转录组重要研究文献汇总(一)
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
家蚕丝腺单细胞转录组图谱绘成
中新网重庆6月15日电 (记者 钟旖)记者15日从家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)获悉,我国家蚕研究又有新进展。该实验室徐汉福教授课题组近日在国际知名期刊Nature Communications《自然通讯》上发表相关主题研究论文,以单细胞分辨率揭示了家蚕丝腺的全细胞异质性及其基因转
单细胞转录组重要研究文献汇总(二)
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究,由于植物具有细胞壁的特点,使得植物的单细胞研究相比较难,但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8],本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
核殇:核能发展历程回顾
福岛,在核危机警报拉响的那一刻,民众与政府,欲望与理性,注定要展开一场艰难的博弈。 丁楠套上白大褂,从一间墙壁足有1米厚的屋子中取回那几只被核辐射的白鼠。它们已经在铅容器里,被关了两个多小时。 这几只小白鼠将被兰州中科院近代物理研究所核辐射生物医学研究组,用于重粒子束治疗癌症的临
新年贺词-|-四十年辉煌历程,心之所往,山海可期
——访艾杰尔-飞诺美中国区总经理章越 2022年,是艾杰尔-飞诺美(Agela & Phenomenex)正式加入丹纳赫集团的第五个年头,也是Phenomenex成立的40周年。历经大刀阔斧的优化与管理,艾杰尔-飞诺美始终不忘初心,发挥本地化优势快速响应客户需求,加快创新步伐提升研发能力,为客户提
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
单细胞转录组制备仪的技术指标
将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序,可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库,在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括: 高通量 -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备, 引入条形码序列标记(Barcode),可将测序
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
玉米单细胞转录组测序,11种细胞类型
近日,广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》(The Crop Journal)。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者,齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物,而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
高通量单细胞转录组测序发展与展望
单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计: 在刚刚发布的“十四五”规划中,“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域,近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析,帮助读者了
杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立
近日,北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式,利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱,重构了完整的杨树次生木质部细胞类群,鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子,系统解答了次生木质
冷冻电镜技术发展历程
冷冻电镜技术发展历程发展历程
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水切割的技术发展历程
便携式水切割系统是一种新型水切割设备,其具有体积小、重量轻、运输方便、切割效率高等特点,利用较低水压即可对钢板、陶瓷、大理石、水泥制品等进行切割。因此便携式水切割系统具有广大的市场应用前景,可满足客户对切割能力及作业环境的不同要求。 在过去的市场实战应用中,便携式水切割系统表现出优越的使用效果
单细胞测序新技术:同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果
人脑是由多种不同类别细胞组成的极其复杂的器官。传统的细胞分类方法只能根据少数已知的细胞的标记分子(marker)对细胞进行分类,对每一类细胞的认识也非常有限。斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其团队利用单细胞测序技术,对466个人大脑皮层的单细胞进行了转录组测序,通过数据分析发
研究人员绘制七鳃鳗单细胞转录组图谱
雷氏七鳃鳗作为现存的无颌脊椎动物代表,是一种由无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡类型,被视为研究脊椎动物演化的重要模式生物。近日,华大生命科学研究院联合辽宁师范大学七鳃鳗研究中心等单位在《自然—通讯》发表最新研究成果,团队基于华大自主研发的DNBelab C4和 DNBSEQ测序平台,采用单细胞RNA测