转录组学方介导的多效调控蛋白SprA作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期，浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了题 为"Transcriptome-guided identification of SprA as a pleiotropic regulator in Streptomyces chattanoogensis”的论文。该文以基因芯片为手段，揭示了恰塔努加 链霉菌一个多效调控蛋白 SprA 的作用机制。浙江大学生命科学学院的博士生周振兴和李永泉教授分别为本文的第一作者和通讯作者。 背景介绍 抗生素是链霉菌次级代谢过程的重要产物。γ-丁酮内酯(GBL)作为链霉菌中 广泛存在的群体感应信号分子，影响菌体的形态分化及次级代谢过程。当细胞内浓度达到一定阈值，GBL 同过与其受体结合，使受体从基因启动子上脱落，从而 起始目标基因的......阅读全文
上科大蛋白质组学研究揭示抑郁行为的新调控因子
大脑是生物体内结构和功能最复杂的组织。近年来蓬勃发展的脑蛋白组学研究是绘制大脑功能分子图谱、全面理解大脑生理病理机制的必经途径。跨膜蛋白家族在突触信号传递和神经可塑性调节中扮演重要角色，许多跨膜蛋白与精神类疾病和神经退行性疾病的发生发展密切相关。然而对动物组织中跨膜蛋白家族的组学解析仍面临巨大的
研究新机制|磷供给调控土壤有机碳库的氮介导机制
近日，中国科学院华南植物园磷素生物地球化学研究组的科研人员在国家自然科学基金和广东省基础与应用基础研究基金等项目的共同资助下，研究发现磷供给调控土壤有机碳库的氮介导机制。相关成果发表于《土壤生物学与生物化学》。罗先真为该论文第一作者，侯恩庆为通讯作者。 在（近）自然陆地生态系统中，土壤总磷含量
Bap蛋白调控淀粉样纤维以及介导生物被膜形成的机制
近年来，由多重耐药性金黄色葡萄球菌引起的院内感染已对全人类的健康构成极大威胁。全球每年有近100万人死于无法用传统抗生素治疗的细菌感染，其中，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌造成的死亡病例远超过由艾滋病和肺结核引起的死亡病例总和。金黄色葡萄球菌的耐药性往往与其能形成生物被膜密切相关。人们很早就在奶牛源金
多效基因的定义的作用
中文名称多效基因英文名称pleiotropic gene定 义能产生彼此不同的，且明显无关的多重遗传性状的基因。当其发生突变后会引起多种性状的改变。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
MT介导的萝卜肉质根Pb累积与解毒调控机制的研究
萝卜(Raphanussativus L.)是十字花科重要根菜类蔬菜作物，以膨大肉质直根为主要产品器官，营养丰富，在我国蔬菜生产和周年供应中占有重要地位。据报道，我国受重金属污染的土壤面积约占土壤污染总面积的21.7%，重金属污染元素主要包括铅(Pb)，镉(Cd)等。Pb作为生物体的非必需元
胡红雨课题组JBC解析蛋白调控机制
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员，在新研究中证实NUB1L蛋白通过P97UFD1/NPL4复合物促进了将NEDD8运送到蛋白酶体进行降解。这一研究发现在线发表在9月9日的《生物化学杂志》(JBC)上。 领导这一研究的是中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的胡红雨(Hon
蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制
慢性乙肝病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是导致我国肝癌发生的最主要原因，约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程，受到机体的系统性调控，基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响，目前这方面的研究报道较少，亟待深入探究。同时，新药研
蛋白质组学研究技术
可以说，蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/ 4）， 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外，
北大长江学者Science揭示基因沉默新机制
RNA干扰保护细胞抵御了诸如病毒或转基因等入侵的遗传因子。然而在侵入RNAs遭到攻击的同时，是什么保护了细胞正常的內源RNAs呢？来自北京大学的研究人员在拟南芥中发现了一个重要的监控系统：细胞通过双向细胞质衰减(RNA-decay)在抑制內源基因沉默保护正常转录组的同时，将攻击焦点集中放在了入侵
蛋白组学的研究方法
蛋白组学的研究方法如下：蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/4）, 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很
张余研究组等揭示不依赖DNA相互作用的转录激活机制
12月18日，eLife 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究组、赵国屏研究组，上海科技大学杨贝研究组和浙江大学冯钰研究组合作的题为Crl activates transcription by stabilizing active conformation
研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程
中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上，发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现，HYL1蛋白除了介导m
北大学者朱健发表两项表观遗传学成果
北京大学生命科学学院的朱健研究员带领的课题组，运用经典发育遗传学与细胞生物学和生物化学紧密结合的研究手段，揭示在表观遗传学、小RNA、RNA可变剪切、蛋白修饰及跨膜转运等多个层次上调控信号转导途径的关键因子及其作用机理。近期，该课题组先后在国际学术期刊《Developmental Cell》和《
研究发现磷供给调控土壤有机碳库的氮介导机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507615.shtm近日，中国科学院华南植物园磷素生物地球化学研究组的科研人员在国家自然科学基金和广东省基础与应用基础研究基金等项目的共同资助下，研究发现磷供给调控土壤有机碳库的氮介导机制。相关成果发表于
上海生科院产溶剂梭菌功能元件发掘和设计改造研究获进展
1月27日，Metabolic Engineering 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所姜卫红研究组题为Molecular modulation of pleiotropic regulator CcpA for glucose and xylose coutiliz
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（二）
3. PHB与HIRA复合体相互作用为了研究清楚PHB在hESC中如何发挥作用，研究者采用IP和MS的技术发现除了线粒体的一些相关蛋白外，HIRA也与PHB相互作用。进一步研究发现，PHB结构域介导了PHB与HIRA的结合。由于HIRA复合体的成员还有UBN1和CABIN1，研究者继续研究了PHB
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（三）
5. PHB与HIRA复合体共同作用控制着IDH的表达研究者随后探究了PHB，HIRA对IDH-a-KG代谢通路的影响。研究发现，PHB，HIRA缺失导致了IDH表达显著减低，并伴随着细胞内α酮戊二酸的显著降低。而α酮戊二酸对于hESC干性的自我维持具有重要的作用。6. PHB和HIRA共同调控H3
探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究（一）
ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞，在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而，hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚，妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此，对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。研究思路 研究结果
研究揭示生长素信号途径调控植物差异性生长的分子机制
4月3日，《自然》（Nature）杂志在线发表了原中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心徐通达（现福建农林大学海峡联合研究院园艺中心教授）研究组完成的题为TMK1-mediated auxin signalling regulates differentia
生长素信号途径调控植物差异性生长的分子机制
4月3日，《自然》（Nature）杂志在线发表了原中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心徐通达（现福建农林大学海峡联合研究院园艺中心教授）研究组完成的题为TMK1-mediated auxin signalling regulates differentia
新研究揭示可变剪接调控光形态建成的分子机制
太阳光不仅是植物光合作用的能量来源，也是一种重要的环境信号，调节植物的生长发育进程。其中幼苗光形态建成受光质、光量的精确调控，涉及不同的光受体和一系列信号调控因子。COP1是光形态建成的一个明星蛋白，它作为一种E3泛素连接酶，与目标蛋白互作并促进其降解，COP1在植物和动物中广泛存在。真核生物
研究揭示喹诺酮抗性蛋白介导的细菌耐药机制
细菌抗生素耐药性是预防传染病的重大威胁，通常是由质粒转移或基因突变引起的。当细菌暴露于抗生素环境中会通过提高细菌的突变率筛选出适应抗生素环境的基因突变，结果导致临床环境中耐药菌株的出现。质粒驱动抗生素抗性基因的水平转移，引发细菌耐药性的产生。此外，质粒和细菌染色体之间的相互作用会影响抗生素抗性的
冯银刚课题组揭示新细菌转录调控因子的结构功能机制
近年来，在一些梭菌和杆菌中发现一类广泛存在的σ因子及其共转录的抗σ因子——SigI和RsgI，它们的一些结构域和已知蛋白没有同源性，代表了一类新的特殊的细菌σ/抗σ因子。热纤梭菌等一些产纤维小体细菌具有8-16对的SigI/RsgI因子，这在其他已知类型的σ/抗σ因子中比较少见。已有的研究表明这
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一，是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展，但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想，我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来，随着宏基因组测序等研究手段的不断进展，人们发现肠道菌群能广泛
揭露了精神分裂症的遗传调控潜在机制
精神分裂症是严重的、高度遗传性的精神疾病。目前，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已报道了200多个与精神分裂症显著相关的风险基因座，而这些基因座内的风险变异如何影响疾病发生知之甚少。为了鉴别风险基因座内的功能变异，中国科学院昆明动物研究所研究员罗雄剑团队前期利用功能基因组学（Function
研究揭示生长素信号途径调控植物差异性生长的分子机制
4月3日，《自然》（Nature）杂志在线发表了原中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心徐通达（现福建农林大学海峡联合研究院园艺中心教授）研究组完成的题为TMK1-mediated auxin signalling regulates differentia
分子生物学常用数据库汇总及推荐
分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式；主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用，可能参与哪些生物学行为等进行一些初步
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
于晓方课题组Nature子刊揭示蛋白活化机制
来自天津大学、天津大学第一附属医院、中科院高能物理研究所等机构的研究人员，在新研究中报告了分辨率为1.8埃，同源四聚体SAMHD1与变构激活体及底物dGTP/dATP的复合物晶体结构，由此揭示了dGTP依赖性四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸酶(dNTPase) 活化的结构机制。这一成果发表在